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World File Search System分枝杆菌
发现一种新型的分枝杆菌F -ATP合酶抑制剂...
摘要：F 1 F O -ATP合酶是结核分枝杆菌的生长和生存能力所必需的。bedaquiline在临床上验证了该目标。最近我们表明，酶旋转γ亚基的分枝杆菌特异性环在酶复合物内的ATP合成中起作用。在这里，我们报告了针对此γ亚基环针对的新型抗菌细菌的发现。生化和核磁共振研究表明，GAMF1通过与环的结合抑制ATP合酶活性。gamf1是杀菌性的，并且对多剂量和耐甲喹啉菌株具有活性。脚手架上的化学努力揭示了动态结构活动关系，并与纳摩尔势力传递了类似物。将GAMF1与Bedaquiline或新颖的日二氨基喹啉类似物结合起来显示出增强的，而无需在人类胚胎干细胞报告基因测定中诱导遗传毒性或表型变化。这些结果表明，GAMF1为发现新型抗结核F-ATP合酶抑制剂提供了有吸引力的铅。1个物理和数学科学学院，南洋技术大学，新加坡637371 Nanyang Link，新加坡共和国共和国；电子邮件：roderick@ntu.edu.sg
微生物-12-01151.pdf
在某些分枝杆菌科和麻风分枝杆菌中，结核病的免疫诊断对其在结核病的特异性诊断中的应用造成了限制。因此，为了提高基于 ESAT- 6/CFP 10 的细胞介导免疫 (CMI) 检测的特异性，已将 esx-1 基因座的 RD 1 区域内外基因编码的其他蛋白质评估为 CMI 的候选抗原，以及研究与 ESAT-6 和/或 CFP 10 结合的体液反应，结果具有不同的特异性和敏感性。因此，在本研究中，我们评估了 NCBI 数据库中可用的各种非结核分枝杆菌 (NTM)、分枝杆菌、分枝杆菌和分枝杆菌种基因组，以了解 esx-1 基因座 RD1 区域的存在和组成。此外，我们还通过聚合酶链式反应 (PCR) 和测序对我们培养物保藏中的分枝杆菌科细菌进行检测，以确定编码 ESAT-6 和 CFP 10 的 esxA 和 esxB 基因的存在和序列多样性。全基因组序列 (WGS) 数据分析表明，在已发表的 100 多个除结核病以外的致病性和非致病性分枝杆菌科细菌基因组中，有 70 个存在 RD 1 基因直系同源物。在我们培养物保藏中评估的物种中，除了之前报道的某些分枝杆菌中存在 esxA 和 esxB 之外，还发现败血性分枝杆菌/分枝杆菌、猪分枝杆菌和分枝杆菌属 N845T 也含有这两个基因的直系同源物。仅在 Mycobacterium brasiliensis 、 Mycolicibacterium elephantis 和 Mycolicibacterium fluroantheinivorans 中检测到 esxA 的直系同源物，而在 Mycolicibacter engbackii 、 Mycolicibacterium mageritense 和 Mycobacterium paraffinicum 中仅检测到 esxB 直系同源物。基于 esxA 和 esxB 序列的系统发育分析将缓慢生长的细菌与快速生长的细菌区分开来。这些发现强化了先前的观点，即 esxA 和 esxB 可能在大多数分枝杆菌科中编码。Esx-1 系统在致病性和非致病性分枝杆菌科中的作用需要进一步研究，因为这些物种可能会限制结核病的免疫学检测。
测试目录 - 用于分子测试
核酸分枝杆菌诊断试剂盒（多个PCR荧光探针）结核病和六种类型的非结核结核病分子菌，Kansasii（MK），MACOBACTERIUM（MA），MACOBACTERIUM（MA），mimobabacterium（Mabacterium） （MAA），分枝杆菌亚种（MAM）和分枝杆菌内（min） div div>
分枝杆菌中 CarD 的转录调控受基础启动子动力学指导
细菌病原体，如结核分枝杆菌 ( Mtb )，利用转录因子来使其生理适应宿主内的不同环境。 CarD 是一种保守的细菌转录因子，对 Mtb 的生存至关重要。与通过结合特定 DNA 序列基序来识别启动子的传统转录因子不同， CarD 直接与 RNA 聚合酶结合，以在转录起始期间稳定开放复合中间体 (RP o )。我们之前使用 RNA 测序表明，CarD 能够在体内激活和抑制转录。然而，尽管结合任何 DNA 序列，CarD 如何在 Mtb 中实现启动子特异性调控结果仍不清楚。我们提出了一个模型，其中 CarD 的调控结果取决于启动子的基础 RP o 稳定性，并使用来自具有不同 RP o 稳定性水平的一组启动子的体外转录来测试该模型。我们表明，CarD 直接激活 MTB 核糖体 RNA 启动子 rrnA P3 (AP3) 的全长转录本产生，并且 CarD 的转录激活程度与 RP o 稳定性呈负相关。利用 AP3 的延伸 -10 和鉴别器区域中的靶向突变，我们表明 CarD 直接抑制形成相对稳定 RP o 的启动子的转录。DNA 超螺旋也会影响 RP o 稳定性并影响 CarD 调控的方向，这表明 CarD 活性的结果可受启动子序列以外的因素调控。我们的研究结果为 RNA 聚合酶结合转录因子（如 CarD）如何根据启动子的动力学特性发挥特定的调控结果提供了实验证据。
在超低剂量分枝杆菌鼠模型中评估疫苗介导的保护
功能序列的缺失被预测代表了分子进化1,2的基本机制。对第2,3的灵长类动物的比较遗传研究已经确定了数千个人类特异性缺失（HDELS），并且已经使用报告基督分析4。然而，结构变异尺寸（≥50个碱基对）HDEL如何影响其天然基因组环境中的分子和细胞过程。在这里，我们设计了靶向7.2兆布序列序列的基因组尺度库，在6,358个HDELS中的序列，并呈现系统的CRIS PRPR干扰（CRISPRI）筛选方法，以识别HDELS，以识别Chimpanzee Pluripotent Pluripotent干细胞中细胞增殖的HDEL。通过将HDEL与染色质状态特征相交，并执行单细胞CRISPRI（werturb -seq）识别其顺式和反式调节靶基因，我们发现了19个控制基因表达的HDELS。我们重点介绍了两个HDEL_2247和HDEL_585，分别在肝脏和大脑中具有组织特异性活性。我们的发现揭示了在人类谱系中丢失的序列的分子和细胞作用，并为在功能上询问人类特异性遗传变异的框架建立了一个框架。
Ag85B 与 c-di-AMP 作为粘膜佐剂对小鼠持续性结核分枝杆菌感染具有免疫治疗作用
结核病 (TB) 是由结核分枝杆菌引起的，是全球单一感染病原体导致死亡的主要原因。结核分枝杆菌感染还可能导致临床慢性感染，称为潜伏性结核感染 (LTBI)。与目前有限的治疗方法相比，几种亚单位疫苗表现出免疫治疗效果，并被纳入临床试验。在本研究中，Ag85B 亚单位疫苗与新型粘膜佐剂 c-di-AMP (Ag85B:c-di-AMP) 经鼻腔内注射给持续性结核分枝杆菌 H37Ra 感染小鼠模型，该模型也表现出 LTBI 的无症状特征。与Ag85B免疫相比，Ag85B:c-di-AMP疫苗接种诱导了更强的体液免疫反应，显著更高的CD4 + T细胞募集，增强了肺中Th1/Th2/Th17谱反应，减轻了肺病理损害，并降低了小鼠体内的结核分枝杆菌负荷。总之，Ag85B:c-di-AMP黏膜途径免疫对持续性结核分枝杆菌H37Ra感染具有免疫治疗作用，而c-di-AMP作为一种有希望的潜在黏膜佐剂，可进一步用于持续性结核分枝杆菌感染以及LTBI的治疗或预防疫苗策略。
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上呼吸道感染（例如，咽炎，鼻窦炎，扁桃体炎）急性冲刺培养基在儿童皮肤和软组织感染（例如，卵泡，纤维素炎，埃里去肌炎，Erysipelas）嗜血杆菌散发或局部性mycobacecacecobacecobactiim imcobrare或Mycobrare imcobrare imcobaraim savobrare或Mycobrare。由于分枝杆菌，Fortuitum分枝杆菌或kansasii分枝杆菌引起的局部感染。在某些国家也将其用作预防性心内膜炎的替代品。在治疗方案中根除幽门螺杆菌的消化性溃疡病。已在原生动物感染中尝试过，包括弓形虫病。Clarithromycin片剂和颗粒用于预防晚期HIV感染患者中散布的分枝杆菌复合物（MAC）疾病。
使用增强型细胞破碎协议改进结核分枝杆菌的 MALDI-TOF MS 鉴定
摘要：结核分枝杆菌是导致结核病的微生物，这种疾病影响着全世界数百万人。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 是一种快速、可靠且经济高效的微生物鉴定方法，已用于鉴定分枝杆菌分离株。然而，分枝杆菌细胞壁富含脂质，这使得获取蛋白质进行 MALDI-TOF MS 分析变得困难。在本研究中，比较了两种细胞制备方案：MALDI-TOF 仪器制造商 Bruker Daltonics 推荐的 MycoEx 和本文描述的 MycoLyser 方案，后者使用 MagNA Lyser 仪器通过乙醇增强细胞破碎。使用两种方案对结核分枝杆菌 H37Rv 菌株进行细胞破碎和蛋白质提取步骤，并比较 MALDI-TOF MS 结果。MycoLyser 方案可以提高结核分枝杆菌的 Biotyper 鉴定率，因为使用此方案获得的 log(score) 值大多≥1.800，并且明显高于经过 MycoEx 处理的 log(score) 值。考虑到布鲁克标准，鉴定可靠性也提高了。鉴于这些结果，可以得出结论，MycoLyser 分枝杆菌细胞破碎和蛋白质提取方案提高了 MALDI-TOF MS 方法鉴定结核分枝杆菌的效率。
Vic9 分枝杆菌噬菌体：俄罗斯分离的第一个 B2 亚簇噬菌体
分枝杆菌噬菌体是专门感染分枝杆菌属细菌的病毒。目前已分离并鉴定了大量的分枝杆菌噬菌体，为了解其多样性和进化提供了宝贵的见解。这些噬菌体在治疗应用方面也具有巨大的潜力，特别是作为抗生素的替代品来对抗耐药性细菌菌株。在本研究中，我们报告了一种新的分枝杆菌噬菌体 Vic9 的分离和鉴定，该噬菌体使用结核分枝杆菌 mc (2)155 作为宿主菌株。Vic9 被归类为 B 簇的 B2 亚簇。形态学分析显示，Vic9 具有该亚簇的典型噬菌体结构，并形成特征性斑块。噬菌体在 30 分钟内吸附到宿主菌株细胞上，根据一步生长实验，其潜伏期持续约 90 分钟，随后是 150 分钟的生长期，平均产量约为每个受感染细胞 68 个噬菌体颗粒。在宿主范围实验中，Vic9 能有效裂解宿主菌株，并且还表现出裂解结核分枝杆菌 H37Rv 的能力，尽管接种效率较低（EOP ≈ 2 × 10 − 5），这是 B2 噬菌体的典型特征。在其他测试的分枝杆菌种中未观察到裂解。Vic9 的基因组包含 67,543 bp 的双链 DNA 并编码 89 个开放阅读框。尽管 Vic9 与其他 B2 亚簇噬菌体关系密切，但我们的分析揭示了 Vic9 的独特特征，即使在密切相关的噬菌体中也突显了其独特的特性。特别值得注意的是在负责 queuosine 生物合成的基因簇内发现了一个独特的 435 bp 序列，以及在 B1、B2 和 B3 亚簇成员之间的结构盒区（Vic_0033-Vic_0035）内发现了重组事件。这些遗传特征值得进一步研究，因为它们可能揭示噬菌体-细菌相互作用的新机制及其开发新型噬菌体治疗方法的潜力。
高敏性检测舌头样品中结核分枝杆菌DNA
抽象的舌头拭子（TS）采样与定量PCR（QPCR）结合检测结核分枝杆菌（MTB）DNA是痰液测试结核病（TB）诊断的有希望的替代方法。在先前的研究中，擦拭舌头的敏感性通常低于痰液。在这项研究中，我们评估了两种提高灵敏度的策略。一方面，用于从2 ml悬浮液中浓缩舌头细菌，这些悬浮液从高容量的泡沫拭子样品中洗脱。将沉淀重悬于500 µL悬浮液中，然后在双目标qPCR之前机械裂解以检测MTB插入元件为6110，为1081。分级实验表明，可沉积分数中存在临床拭子样品中的大多数MTB DNA信号（99.22％±1.46％）。当适用于从124个具有推定性结核病的南非人收集的存档泡沫拭子时，该策略表现出83％的敏感性（71/86）和100％特异性（38/38），相对于痰液微生物学参考标准（MRS; Sputum; Sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum》;第二种策略使用了序列特异性磁捕获（SSMAC）来浓缩从MTB细胞释放的DNA。该方案是在存档的Copan floqswabs蜂拥而至的木材样品上进行了评估，这些拭子样品是从128个具有推定性结核病的南非参与者中收集的。将洗脱为500 µL缓冲液的材料机械裂解。通过蛋白酶K消化悬浮液，与生物素化的双靶寡核苷酸探针杂交，然后使用磁分离浓缩约20倍。在对浓缩物的双目标qPCR测试后，该策略相对于痰液MRS表现出90％的敏感性（83/92）和97％的特异性（35/36）。这些结果指向了用于检测TS中MTB DNA的可自动性高敏性方法的道路。