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新型 DNA 分离系统关键蛋白 StbA 的 DNA 结合域表征
一种新型DNA分离系统的关键蛋白StbA的DNA结合域的表征等《分子生物学杂志》，2022，434（19），第167752页。 10.1016/j.jmb.2022.167752。 hal-03837249
ihumii sp。 11月，Varibaculum Vaginae sp。十一月。和tessaracoccus timonensis sp。十一月，从健康塞内加尔妇女的阴道拭子中分离出来古老的牙纸浆：古团生物学的杰作组织
摘要简介：具有特殊结构的牙髓已成为古团生物学相关的血传体疾病的良好参考，基于核酸和蛋白质的诊断，通过不同的方法来调查许多病原体。目标：本综述旨在提出从古代牙齿收集到牙髓的有机分子提取的制备过程，并分析用于在古代微生物首次发现后20年中通过古代Dental Pulps检测败血症病原体的方法。Methods: The papers used in this review with two main objectives were obtained from PubMed and Google scholar with combining keywords: “ancient,” “dental pulp,” “teeth,” “anatomy,” “structure,” “collection,” “preservation,” “selection,” “photogra- phy,” “radiography,” “contamination,” “decontamination,” “DNA,” “protein,” “ex- traction,” “骨骼，“古细胞生物学”，“细菌”，“病毒”，“病原体”，“分子生物学”，“蛋白质组学”，“ PCR”，“ PCR”，“ Maldi-Tof”，“ LC/MS”，“ Elisa”，“ Elisa”，“ Elisa”，“ Immunol-Ogy”，“ Immunol-Ogy”，“ Immunol-Ogy”，“ Immunonoholomomatogys”，“ Immunonolomatography，” Genome Genome，“ Microbiong”，“ Microbiome”，“ Microbiome”，“ MICTAGENOM”，“ MICTAGENOME”，“”，“”。结果：对古代牙髓的分析应进行仔细的准备程序，并采用许多不同的步骤，以提供高度准确的结果，每个步骤都符合考古学和古团生物学的规则。从牙髓收集有机分子后，根据DNA和蛋白质的分析对它们进行了病原体鉴定。实际上，DNA方法在诊断中起主要作用，而蛋白质方法越来越使用。重建了二十七个古老的基因组和一个古老的B. recurrentis基因组。A total of seven tech- niques was used and ten bacteria ( Yersinia pestis , Bartonella quintana , Salmonella enterica serovar Typhi , Salmonella enterica serovar Paratyphi C , Mycobacterium leprae , Mycobacterium tuberculosis , Rickettsia prowazeki , Staphylococcus aureus , Borrelia鉴定了恢复性，Bartonella henselae）和一种病毒（Anelloviridae）。Y. pestis的数量发表最多，并且研究了该病原体的所有方法，金黄色葡萄球菌和B. recurrentis通过三种不同的方法鉴定出来，仅通过一种方法鉴定出来。有趣的组合方法有趣的是在耶尔森氏菌诊断中提高了ELISA，PCR和IPCR的正率。与古老的骨头相比，古老的牙齿在败血症诊断中显示出更大的优势。在病原体鉴定外，古代纸浆有助于区分物种。
微尺度电泳中液滴界面策略在样品处理、分离和定量中的应用：综述
Théo Liénard——市长、Myriam Taverna、Stéphanie Descroix、Thanh Duc Mai。用于样品处理、分离和定量的微尺度电泳中的液滴接口策略：综述。 Analytica Chimica Acta，2021，1143，第 281-297 页。�10.1016/j.aca.2020.09.008�。 �第 03493600 页�
神经音频编解码中的学习来源分离
摘要 - 神经音频编解码器通过有效将连续音频信号转换为离散令牌，具有显着高级的音频组合。这些编解码器可以通过对这些令牌进行训练的生成模型来保留高质量的声音，并使复杂的声音生成。但是，现有的神经编解码器模型通常在大型，未分化的音频数据集上进行训练，从而忽略了语音，音乐和环境声音效果等声音域之间的基本差异。这种监督使数据建模复杂化，并为声音发电的可控性带来了其他挑战。为了解决这些问题，我们介绍了源 - 触发性神经音频编解码器（SD-CODEC），这是一种结合音频编码和源分离的新型方法。通过共同学习音频重新合成和分离，SD-Codec明确地将来自不同域的音频信号分配给不同的代码书，以及一组离散表示。实验结果表明，SD-Codec不仅保持竞争性的重新合成质量，而且还得到了分离结果的支持，还证明了潜在空间中不同来源的成功分离，从而增强了音频编解码器中的可解释性，并提供了对音频产生过程的潜在控制。索引术语 - 神经音频编解码器，源分离，表示学习，量化。
雌性小鼠中MAP6赤字，母体分离和MK801的组合：具有认知缺陷的神经发育障碍的3次动物模型
Solenn Percelay，Thomas Freret，Nicole Turnbull，Valentine Bouet，Michel Boulouard。雌性小鼠中MAP6赤字，母体分离和MK801的组合：一种具有认知缺陷的神经发育障碍的3次动物模型。行为脑研究，2021，413，101016/j.bbr.2021.113473。hal-04316243
基于代谢组的多样性和生物学活性，从印度洋海绵Scopalina Hapalia分离出的微生物的优先级，以发现天然产物
1天然产品化学和生物技术实验室，科学技术学院，LaRénounionof LaréUnion，15 AvenueRenéCassin，CS 92003大道，CS 92003，CEDEX 09，97744法国SAINT-DENIS，法国2号，法国2瑞士3日内瓦大学药学学院，CMU-RUE MICHEL-SERVET 1，CH-1211 Geneva，瑞士4 4自然物质化学研究所（ICSN），CNRS UPR 2301，UNIVER 2301，UNIGERITURITUAL 2301，UNIGERITUE PARIS PARIS-PARIS-SACACLAY，1，AV。 de la terrasse，Cedex，91198法国Gif-Sur-Yvette，5药物认知实验室，药学系，中心互联网互联网，li feherche Surche surche sur s sur s sur s s s s s s s s s sur s sur s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s sur leimédicament（cirm），李氏大学，夸蒂尔·H·皮塔尔（Quartier h），pitalier h pital pital hippocrate，hippocrate，hippocrate 15，bat，bat。 b36，校园du sart-tilman，B-4000 Liege，比利时 *通信：mireille.fouillaud@univ-reunion.fr1天然产品化学和生物技术实验室，科学技术学院，LaRénounionof LaréUnion，15 AvenueRenéCassin，CS 92003大道，CS 92003，CEDEX 09，97744法国SAINT-DENIS，法国2号，法国2瑞士3日内瓦大学药学学院，CMU-RUE MICHEL-SERVET 1，CH-1211 Geneva，瑞士4 4自然物质化学研究所（ICSN），CNRS UPR 2301，UNIVER 2301，UNIGERITURITUAL 2301，UNIGERITUE PARIS PARIS-PARIS-SACACLAY，1，AV。de la terrasse，Cedex，91198法国Gif-Sur-Yvette，5药物认知实验室，药学系，中心互联网互联网，li feherche Surche surche sur s sur s sur s s s s s s s s s sur s sur s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s sur leimédicament（cirm），李氏大学，夸蒂尔·H·皮塔尔（Quartier h），pitalier h pital pital hippocrate，hippocrate，hippocrate 15，bat，bat。b36，校园du sart-tilman，B-4000 Liege，比利时 *通信：mireille.fouillaud@univ-reunion.fr
从小麦叶围中分离的 Saccharibacillus sp. 菌株 WB 17 的基因组序列草图
叶际代表一个独特的生态位，其中微生物获得了降解木质纤维素 (1) 的能力，以便在贫营养条件下生存。从叶际回收的微生物中，存在属于类芽孢杆菌科和糖芽孢杆菌属的细菌 (2)。糖芽孢杆菌属菌株 WB 17 是从 2018 年 1 月从法国香槟-阿登地区采集的小麦麸皮叶际培养物中回收的。培养在 30°C 的 1 M3 培养基 (3) 上进行，培养基中添加了小麦麸皮，有氧培养。糖芽孢杆菌属 WB 17 是根据其 16S rRNA 基因序列进行鉴定的，与糖芽孢杆菌属有关。为了进一步表征糖芽孢杆菌属的代谢潜力。 WB 17 及其分离木质纤维素的能力，对其整个基因组进行了测序。Saccharibacillus sp. WB 17 在 Luria-Bertani 培养基中在 30°C 下生长 48 小时，并使用 PureLink 基因组 DNA 迷你试剂盒（赛默飞世尔科技）提取其基因组 DNA。使用 Nextera DNA 样品制备试剂盒（Illumina，美国加利福尼亚州圣地亚哥）按照制造商的用户指南进行全基因组散弹枪测序（2 150 bp），并在 NovaSeq 系统（MR DNA [Molecular Research]，美国德克萨斯州 Shallowater）上进行测序。总共获得了 30,007,734 个读数。使用 FastQC (4) 对序列数据文件进行质量过滤，然后通过 SOAPdenovo（版本 2.04）（5）进行从头组装；所有软件均使用默认参数。共检测到47个contig，测序覆盖度为409倍。N 50 值为205,341 bp。组装基因组大小为5,391,836 bp。该菌株的基因组大小介于两个最接近的Saccharibacillus亲属之间（Saccharibacillus sacchari GR21 T 为6.08 Mbp，Saccharibacillus kuerlensis HR1 T 为4.69 Mbp）。Saccharibacillus sp. WB 17的GC含量为58.82％。该值在Saccharibacillus基因组已知值范围内。事实上，之前测序的基因组记录的 GC 含量值如下：58.4 mol% ( Saccharibacillus qingshengii H6 T ) (6)、57.8 mol% ( S. sacchari GR21 T ) (7)、50.5 mol% ( S. kuerlensis HR1 T ) (8) 和 55.5 mol% ( Saccharibacillus deserti WLJ055 T ) (9)。Saccharibacillus sp. WB 17 的基因组草图由 NCBI 原核生物基因组注释流程 (PGAP) ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok ) 注释；它包含 73 个 tRNA、4,826 个基因和 4,730 个编码序列 (CDS)。仅注释了 1,139 个 CDS，占基因组内容的 22%。根据碳水化合物活性酶数据库 (CAZy) 数据库 (10)，基因组共编码 236 个碳水化合物活性酶，分为五类，即糖苷水解酶 (145 个 CDS)、糖基转移酶 (31 个 CDS)、多糖裂解酶 (3 个 CDS)、碳水化合物酯酶 (31 个 CDS) 和碳水化合物结合模块 (21 个 CDS)；然而，
综合分析临床肠球菌分离株产生的细菌素及其对VRE等肠球菌的抗菌活性
肠球菌可产生具有抗菌活性的细菌素，但尚未对肠球菌菌株中的细菌素分布进行全面的分析。本研究对80株粪肠球菌和38株屎肠球菌进行了细菌素基因鉴定，并研究了它们的抗菌活性。80株粪肠球菌中鉴定出细胞溶素基因（61.3%）、肠溶素A基因（27.5%）和BacL 1基因（45.0%）。38株屎肠球菌中鉴定出肠素A基因（97.4%）、肠素B基因（2.6%）、肠素NKR-5-3B基因（21.0%）、细菌素T8基因（36.8%）和BacAS9基因（23.7%）。对所有菌株进行了针对粪肠球菌和屎肠球菌的抗菌活性测试。溶细胞素、肠溶素 A、BacL 1 、细菌素 T8 或 BacAS9 基因阳性的菌株表现出不同的抗菌活性。几种细菌素阳性菌株对其他肠球菌种表现出抗菌活性，但对葡萄球菌或大肠杆菌没有抗菌活性。此外，肠溶素 A 阳性菌株对耐万古霉素的屎肠球菌表现出抗菌活性，而细菌素 T8 或 BacAS9 阳性菌株对耐万古霉素的粪肠球菌和屎肠球菌表现出活性。我们的研究结果表明携带不同细菌素基因的屎肠球菌和屎肠球菌菌株可能会影响周围细菌群落的组成。
dentalis sp。十一月，一种从牙周炎的牙齿牙菌斑中分离出的新细菌
rieux）根据制造商的说明评估了菌株Marseille-P4122的碳水化合物代谢（表2）。Strain Marseille- P4122 T has enzymatic activities such as esterase (C4), esterase- lipase (C8), lipase (C14), acid phosphatase, naphthol-AS-BI- phosphohydrolase, α -glucosidase, β -glucosidase and urease, whereas only D -fructose and D -trehalose were positive for碳水化合物代谢。所有测试的其他反应都是阴性的。菌株Marseille-P4122 t显示过氧化酶阴性和氧化酶阴性活性。表3列出了该菌株与其他密切相关的corynebacterium物种的生化特征的比较研究。用于扫描电子显微镜，从琼脂中收集了一个菌落，并浸入2.5％的戊二醛固定溶液中。将载玻片在水中轻轻洗涤，风干并用TM4000显微镜检查。细胞以
ihumii sp。 11月，Varibaculum Vaginae sp。十一月。和tessaracoccus timonensis sp。十一月，从健康塞内加尔妇女的阴道拭子中分离出来 古老的牙纸浆：古团生物学的杰作组织
阴道是一种湿生物体，包括一个由几种类型的微生物定植的复杂生态系统[1]。döderlein杆菌或乳酸杆菌是育儿健康妇女的阴道菌群中的大多数细菌[2]。已经进行了许多研究，其中一些结论是，该综合生态系统主要由属于乳酸属的物种主导[3]。这种曲线的不平衡会导致阴道病[4]。细菌性阴道病首先由Schröder于1921年描述。他注意到营养不良的特征是乳脂核酸的降低，阴道粘膜的pH值增加以及主要是革兰氏阴性厌氧菌细菌（例如Gardnerella cardnerella cagnnerella cagnnerella cartnerella cartnerella cartnerellias cartnerella curnobobium paginae and Mobiluncus curtisii [5,5,6]）。人类阴道微生物群在