图 1. a. 带有 poly-A 读数的动态条形码示意图。b. 实验装置的示意图。c. 基于突变特征的条形码比例,结合两个系统的数据:对具有完整 PAM 基序的原型间隔物进行编辑(活性);不存在 PAM 基序(非活性);和未切割的 gRNA(原始)。d. 不同 gRNA 中原始条形码随时间的比例。e. 考虑不同 gRNA 之间的错配、间隙和间隙延伸,条形码随时间的变化。f. 具有 21 bp 间隔物(左)或 26 bp 间隔物(右)的 gRNA 的原始条形码随时间的比例。箱线图按不同时间点的平均间隔物长度着色(Cas9 系统)。g. 原始核苷酸随时间变化的百分比,将间隔物相对于 PAM 序列对齐(Cas9 系统)。h。考虑到按 Cas9 版本分类的所有不同 gRNA,C>T 突变随时间变化的百分比。对于所有箱线图,箱线表示四分位距 (IQR),每个箱线内的水平线表示中位数。
生成模型(例如Di usion模型)在近年来已取得了显着的进步,从而使能够综合各个领域的高质量现实数据。在这里,探索了在超分辨率显微镜图像上的分解模型的适应和训练。表明,生成的图像类似于实验图像,并且生成过程不会从训练集中的现有图像中显示出很大程度的记忆。为了证明生成模型在数据增强中的有用性,将基于基于学习的高分辨率数据训练的基于深度学习的单位图(SISR)方法的性能与单独使用实验图像或数学建模产生的图像进行了比较。使用一些实验图像,改进了重建图像的重建质量和空间分辨率,从而展示了分解模型图像产生的潜力,以克服显微镜图像收集和注释的限制。最后,该管道公开可用,可在线运行和用户友好,以使研究人员能够生成自己的合成显微镜数据。这项工作证明了显微镜任务的生成分歧模型的潜在贡献,并为其在该领域的未来应用铺平了道路。
2024 年 9 月 4 日,Windmar 提交了一份文件,题为《Windmar 关于 LUMA 加速存储添加计划的声明》(“Windmar 的评论”)。Windmar 的评论表达了他们对能源局拒绝干预该程序的决心的不同意。此外,Windmar 的评论偏离了他们原来的立场,将他们现有的公用事业规模项目纳入 LUMA 的 ASAP 计划,而是声称独立的 BESS 系统不提供弹性并增加化石燃料的消耗。Wincimar 还表示,独立的 BESS 系统无法克服黑天事件。Windmar 的评论本质上表示,对于波多黎各来说,在黑天事件下拥有可靠且有弹性的可再生能源的最佳替代方案是分布式发电(“DG”)光伏(“PV”)与电池配对。Windmar 的评论得出结论,DG PV+电池可以帮助 / ¡ 电网克服与发电相关的停电以及与输配电系统相关的停电。
抽象拓扑优化是工程设计中无处不在的任务,涉及预先涂抹的空间域中材料的最佳分布。最近,已经提出了以数据驱动的方法(例如深生AI模型)作为迭代优化方法的替代方法。但是,现有的数据驱动方法通常使用固定的网格分辨率和域形在数据集上进行培训,从而降低了它们对不同分辨率或不同域形的适用性。在本文中,我们引入了两个关键的创新 - 求解器和神经隐式现场体系结构以解决这些局限性。首先,我们引入了一个快速,可行的,迭代的基于GPU,以针对3D未经检测网格的高通量数据集的生成优化。我们的求解器生成了122K优化的3D Topologies,这是最大的公共数据集的数量级。第二,我们引入了一种新的无分辨率数据驱动方法,用于使用称为NITO-3D的神经字段,用于3D拓扑。单个NITO-3D模型训练并预测各种分辨率和宽高比。还可以消除对计算密集型物理场调节的需求,NITO-3D为3D拓扑选项提供了更快,更灵活的替代方案。平均而言,NITO-3D的拓扑结构约为2000倍,仅比最新的迭代求解器高0.3%。有10个步骤的迭代精细调整,NITO-3D的平均速度快15倍,并且产生的拓扑比SIMP的合规性高0.1%。我们在https://github.com/lyleregenwetter/nito-3d上开放与此工作关联的所有数据和代码。
摘要 - 扩散模型在各种图像生成任务(包括图像超分辨率)上实现了令人印象深刻的性能。尽管它们令人印象深刻,但由于大量的降级步骤,扩散模型的计算成本很高。在本文中,我们提出了一种新型的加速扩散模型,称为部分扩散模型(PDMS),用于磁性成像(MRI)超分辨率。我们观察到,扩散一对低分辨率和高分辨率的图像的潜力逐渐收敛,并在一定的噪声水平后变得难以区分。这激发了我们使用某些潜在的低分辨率来对相应的高分辨率潜在。使用近似值,我们可以跳过一部分扩散和降解步骤,从而减少训练和推理的计算。为了减轻近似误差,我们进一步引入了“潜在对齐”,该误差逐渐插入并接近低分辨率潜在的高分辨率潜在潜在的潜在。部分扩散模型与潜在对齐结合,基本上建立了一种新的轨迹,与原始分化模型中的那些相比,潜伏期逐渐从低分辨率转变为高分辨率图像。在三个MRI数据集上进行的实验表明,部分扩散模型可实现比起原始扩散模型比原始扩散模型更少的固定步骤。另外,它们可以与最近的加速扩散模型合并,以进一步提高效率。
生成高质量的艺术肖像视频是计算机图形和视觉中的重要且理想的任务。尽管已经提出了一系列成功的肖像图像图像模型模型,但这些面向图像的方法在应用于视频(例如固定框架尺寸,面部对齐,缺失非种族细节和时间不一致的要求)时具有明显的局限性。在这项工作中,我们通过引入一个新颖的Vtoonify框架来研究具有挑战性的可控高分辨率肖像视频风格转移。具体而言,Vtoonify利用了基于编码器提取的多尺度内容功能的高质量艺术肖像来利用型号的中高分辨率层,以更好地保留框架详细信息。结果完全卷积体系结构接受可变大小的视频中的非对准面孔作为输入,从而有助于完整的面部区域,并在输出中自然动作。我们的框架与现有的基于样式的图像图像模型兼容,以将其扩展到视频化,并继承了这些模型的吸引力,以使其具有柔性风格的颜色和强度控制。这项工作分别为基于收藏和基于典范的肖像视频风格转移而建立在Toonify和Dualstylegan的基于Toonify和Dualstylegan的Vtoonify的两个实例化。广泛的实验结果证明了我们提出的VTOONIFY框架对现有甲基的有效性在生成具有灵活风格控件的高质量和临时艺术肖像视频方面的有效性。代码和预估计的模型可在我们的项目页面上找到:www.mmlab-ntu.com/project/vtoonify/。
摘要:肌腱脑脊髓炎/慢性疲劳综合征(ME/CFS)是一种慢性,复杂的疾病,其特征是严重且经常使身体和精神疲劳失败。到目前为止,科学家还没有完全指出疾病的生物学原因,但它影响了全球数百万的人。为了更好地了解ME/CFS,我们将38个ME/CFS患者血浆中的代谢网络与24名健康对照参与者进行了比较。除了测量包括色氨酸及其代谢产物在内的靶向物质以及酪氨酸,苯丙氨酸,B族维生素和harbosoxanthine的测量外,这涉及一种未靶向的代谢组学方法。我们观察到几种代谢途径的显着改变,包括维生素B3,精氨酸 - 丙啉和天冬氨酸 - 天冬酰胺途径,在未靶向的分析中。与对照组相比,有针对性的分析表明,ME/CFS患者中3-羟基氰酸,3-羟基基硝酸,低黄嘌呤和苯丙氨酸的水平变化。这些发现表明ME/CFS患者的免疫系统反应和氧化应激的潜在改变。关键词:高分辨率质谱,肌电脑脊髓炎(ME/CFS),神经退行性疾病,代谢组学,靶向分析,未靶向分析,生物标志物
2 霍华德休斯医学研究所,波士顿,MA 02115 通信:ram@genetics.med.harvard.edu (RV);perrimon@genetics.med.harvard.edu (NP) 摘要 CRISPR 筛选可实现系统的、可扩展的基因型到表型映射。我们之前开发了一种用于果蝇和蚊子细胞系的汇集 CRISPR 筛选方法,使用质粒转染和位点特异性整合来引入单向导 (sgRNA) 文库,然后进行 PCR 和整合的 sgRNA 测序。虽然有效,但该方法依赖于早期组成型 Cas9 活性,这可能会导致基因组编辑和 PCR 检测到的 sgRNA 之间存在差异,从而降低筛选准确性。为了解决这个问题,我们引入了一种新方法来共转染表达抗 CRISPR 蛋白 AcrIIa4 的质粒以抑制早期 sgRNA 表达期间的 Cas9 活性,我们称之为“IntAC”(与抗 CRISPR 整合酶)。 IntAC 使我们能够构建一种由高强度 dU6:3 启动子驱动的新型 CRISPR 筛选方法。这个新库显著提高了整个基因组中适应性基因的精确度,在 5% 的误差范围内检索了 90-95% 的必需基因组,使我们能够生成迄今为止为果蝇组装的最全面的细胞适应性基因列表。我们的分析确定,IntAC 方法允许的升高的 sgRNA 水平推动了大部分改进。果蝇适应性基因与人类适应性基因表现出很强的相关性,并强调了旁系同源物对基因必需性的影响。我们进一步证明,IntAC 与靶向 sgRNA 子库相结合,能够在溶质超载下精确地正向选择转运蛋白。IntAC 是对现有果蝇 CRISPR 筛选方法的直接增强,显著提高了准确性,并且可能广泛应用于其他细胞类型(包括蚊子、鳞翅目、蜱虫和哺乳动物细胞)中的无病毒 CRISPR 筛选。
生物危害中心耦合模型对比项目第6阶段气候投影数据集(CHC-CMIP6)旨在支持最近和近乎近距离的气候相关危害分析,包括极端潮湿的热量和干旱条件。Global daily high resolution (0.05°) grids of the Climate Hazards InfraRed Temperature with Stations temperature product, the Climate Hazards InfraRed Precipitation with Stations precipitation product, and ERA5- derived relative humidity form the basis of the 1983–2016 historical record, from which daily Vapor Pressure Deficits (VPD) and maximum Wet Bulb Globe Temperatures (WBGT max ) were derived.从共享的社会经济途径2-4.5和SSP 5-8.5场景中进行的大型CMIP6合奏随后用于开发高分辨率每日2030和2050“ Delta”领域。这些三角洲用于扰动历史观察结果,从而产生0.05°2030和2050的日常降水,温度,相对湿度以及派生的VPD和WBGT最大值的投影。最后,每个时间段都得出了每个变量的极端频率计数。
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