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小麦 CRISPR 技术能够删除过敏原基因……
参考文献 (1) Sanchez-Leon, S., 等人 (2018)。利用 CRISPR/Cas9 改造的低筋非转基因小麦。Plant Bio J 16, 902-910。(2) Camerlengo, F., 等人 (2020)。利用 CRISPR-Cas9 多重编辑 α-淀粉酶/胰蛋白酶抑制剂基因以减少硬粒小麦中的过敏原蛋白。Front in Sust Food Syst 4, 104。(3) Dodo, HW., 等人 (2008)。利用基因工程缓解花生过敏：沉默免疫显性过敏原 Ara h 2 可显着减少其含量并降低花生的致敏性。Plant Bio J 6, 135-145。(4) Dodo, HW. (2021)。 SBIR 第二阶段：利用基因组编辑技术开发无过敏原花生。SBIR-STTR。(5) Sugano, S., 等人 (2020)。利用定点诱变技术同时诱导大豆中两种过敏原基因的突变等位基因。BMC plant biol 20, 1-15。(6) You, J., 等人 (2022)。CRISPR/Cas9 介导的芝麻 (Sesamum indicum L.) 高效靶向诱变。植物科学前沿 13。(7) Chang, Y., 等人 (2022)。强大的 CRISPR/Cas9 介导的 JrWOX11 基因编辑可操纵胡桃坚果树种的不定根和营养生长。Scientia Hort 303, 111199。
碱性量子计算中碱性量子计算的删除转换rydberg原子阵列
在错误校正后的逻辑Qubits上执行量子算法是可扩展量子计算的关键步骤，但是对于当前的实验硬件，Qubits和物理错误率的必要数量和物理错误率要求。最近，针对特定物理噪声模型量身定制的错误纠正代码的开发有助于放松这些要求。在这项工作中，我们为171 yb中性原子量子A的量子编码和栅极协议提出了将主要物理误差转换为擦除，即已知位置的错误。关键思想是在亚稳态的电子水平上编码Qubits，以便门错误主要导致向不相交子空间的过渡，这些子空间可以通过荧光连续监测其种群。我们认为，98％的错误可以转换为擦除。我们通过表面代码的电路级模拟量化了这种方法的好处，从而发现阈值从0.937％增加到4.15％。我们还观察到阈值附近的较大代码距离，从而使相同数量的物理量子位的逻辑错误率更快降低，这对于近期实现非常重要。擦除转换应有益于任何错误纠正代码，并且还可以应用于在其他Qubit平台中设计新的门和编码。
利用 CRISPR-Cas9 方法构建工程酿酒酵母，删除 GPD2、FPS1 和 ADH2，以提高乙醇产量
摘要：生物乙醇作为可再生液体燃料具有重要价值，工业生产乙醇过程中甘油和有机酸的过量积累导致乙醇含量降低。本研究利用CRISPR-Cas9方法构建了GPD2、FPS1和ADH2基因缺失的酿酒酵母工程菌株，以提高乙醇产量。通过RNA测序和转录组分析研究基因缺失对基因表达的影响。结果表明，以50g/L葡萄糖为底物，通过同时缺失GPD2、FPS1和ADH2基因构建的酿酒酵母工程菌株SCGFA乙醇产量为23.1g/L，比野生型菌株提高了0.18%，每g葡萄糖的乙醇转化率为0.462g。此外，SCGFA中甘油、乳酸、乙酸、琥珀酸含量与野生型菌株相比分别降低了22.7%、12.7%、8.1%、19.9%、20.7%。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示，上调基因富集表明糖酵解、脂肪酸和碳代谢均能影响SCGFA的乙醇生产。因此，该工程菌株SCGFA在生物乙醇生产中具有巨大的潜力。
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当然，我们的资深读者知道接下来会发生什么。通常，进口价值是货物的成本保险运费 (CIF) 价值，出口价值是离岸价 (FOB)。任何额外的运费和附加费可能需要包含在其中一个或两个价值中。运费增加可能意味着所涉及的关税也增加了。海关价值波动对许多海关当局来说都是一个危险信号，他们可能会利用这一点对进口商的申报价值提出质疑。我们已经在菲律宾看到这种情况发生，我们预计其他国家也会遇到这种挑战。以前，进口商和海关当局很容易忽视运费成本的纳入，因为它们对所涉及的关税影响很小。由于额外成本的增加（我们已经看到一些运费上涨了十倍！）以及随之而来的关税增加，许多当局将更加积极主动地审查此类申报的正确性。
利用双主键编辑对大型 DNA 序列进行可编程删除、替换、整合和反转
与疾病相关的人类遗传变异范围从单碱基对替换到兆碱基重复、缺失和重排 1-3 。可以在人类细胞中安装、纠正或补充这些致病变异的基因编辑方法有可能促进对遗传疾病的了解，也可能实现新的治疗方法 4、5。过去十年来，已经开发出几种基于 CRISPR-Cas 系统的哺乳动物细胞基因编辑方法 6，包括核酸酶 7-9 、碱基编辑器 10、11 和主要编辑器 12 ，每种方法都有可能解决一组已知的致病序列变化。CRISPR-Cas 核酸酶（如 Cas9）可用于通过创建导致不受控制的插入/缺失混合的 DSB 来破坏基因。此外，配对的 Cas9 核酸酶策略可以介导长度从约 50 到 > 100,000 个碱基对的基因组 DNA 序列的靶向删除 13 。通过提供线性供体 DNA 序列，可以通过末端连接或同源性定向修复 (HDR) 过程在单个切割位点或成对切割位点之间定向插入新的 DNA 序列 14, 15。单核酸酶和成对核酸酶编辑方法虽然用途广泛，但它们也存在相当大的缺点。DNA 供体敲入伴随着高效的 indel 副产物 16，因为在大多数细胞类型中，HDR 与末端连接过程相比通常效率低下 17, 18。使用成对核酸酶进行靶向删除会产生多种副产物 13, 19，而且缺失的精确位置受到 PAM 可用性的限制。此外，在靶位或脱靶位点的 DSB 可促进大面积缺失 20-22、染色体异常 23、24 和染色体碎裂 25。 DSB 倾向于生成不良副产物和染色体改变的复杂混合物 26 - 28，这在应用基于核酸酶的编辑来操作较大的 DNA 序列时带来了相当大的挑战，特别是在治疗环境中。
crispr删除SVA逆转录座子在TRPV1/TRPV3属基因间区域的顺式调节元件
摘要：正弦 - vntr- Alu（SVA）逆转录子是仅在灵长类动物基因组中存在的可转座元素（TES）的子类。te插入可以作为顺式调节元素（CRES）选择；但是，使用生物信息学方法和报告基因测定法证明了SVA的调节潜力。这项研究的目的是证明通过CRISPR（群集间隔间隔短的腔粒重复序列）的SVA顺式调节活性），并随后测量直接对局部基因表达的影响。我们识别了17染色体上的一个区域，该区域富含人类特异性SVA。在该区域的比较基因表达分析揭示了多个人体组织中TRPV1和TRPV3的共表达，这在小鼠中未观察到，这突出了两种物种之间的关键调节差异。此外，TRPV1和TRPV3编码序列之间的基因间区域包含位于TRPV3启动子和TRPV1 3'端的上游的人类特定的SVA插入，该插入trpv1的3'端，强调了该SVA作为研究其潜在的CIS -CIS-候选者对这两种基因的候选者。首先，我们生成了SVA报告基因构建体，并证明了它们在HEK293细胞中的转录调节活性。然后，我们设计了一种双目标CRISPR策略，以促进整个SVA序列的删除，并生成编辑的HEK293克隆细胞系，其中包含纯合和杂合SVA缺失。在编辑的纯合∆ SVA克隆中，我们观察到TRPV1和TRPV3 mRNA表达的显着降低，与未经编辑的HEK293相比。此外，我们还观察到杂合∆ SVA克隆中mRNA表达水平的变异性增加。总体而言，在具有SVA缺失的编辑的HEK293中，我们观察到对TRPV1和TRPV3的共表达的中断。在这里，我们提供了人类特异性SVA的示例，其原位调节活性，支持SVA逆转座子的作用，是物种特异性基因表达的贡献者。
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