贡献分析主要由 HP、YP 和 HS 进行具体来说,AlphaFold 分析由 HP 领导,基因分析由 YP 进行,结构和功能分析由 HS 进行该研究由 HS 构思,所有作者都参与了手稿的撰写。
具有基本螺旋-环-螺旋(bHLH)结构的转录因子广泛调控植物的生长、表皮结构发育、代谢过程和对压力的反应。海薰衣草(Limonium bicolor)是一种泌盐植物,其表皮中独特的盐腺使其具有很强的抗盐胁迫能力,有助于盐碱地的改良。但海薰衣草中bHLH转录因子家族的特征尚不清楚。本文通过遗传分析系统地分析了整个海薰衣草基因组中187个已鉴定的bHLH家族基因的特征、定位和系统发育关系,以及它们的顺式调控启动子元件、表达模式和在盐腺发育或耐盐性中的关键作用。已验证的9个海薰衣草bHLH基因在细胞核中表达且编码的蛋白在细胞核中发挥作用,其中Lb2G14060和Lb1G07934编码的蛋白也定位于盐腺中。 CRISPR-Cas9 敲除突变体和过表达株分析表明,Lb1G07934 编码的蛋白参与盐腺形成、盐分泌和抗盐性,表明 bHLH 基因对盐胁迫响应和表皮结构发育具有重要影响。本研究为进一步研究 bHLH 基因在盐芥中的作用和作用机制奠定了基础,为筛选提高作物抗盐性的耐盐基因和改良盐渍土奠定了基础。
功能分析表明,关键的表皮微生物(主要是异营养)具有利用金属元素和养分的遗传能力。在与NZVI和TCEP的共污染环境中,某些表皮微生物变得占主导地位,消耗了锌,铜,锰,糖,糖和氨基酸等重要元素。这种消费导致宿主earth的营养缺乏。
101数学数学1010数学数学101001代数代数101002分析分析101003应用几何形状应用几何形状101031批准 - 理论101004 BiomAthematics 101005 Computer Elgebra 101006 101006差异几何几何几何形状101027动力学系统101007金融数学金融数学101032功能分析功能分析101008复合分析101009几何几何图形101010数学历史101011图理论图论101012组合学101013数学逻辑数学逻辑101028数学数学建模101029数学统计数学统计101014数值数学101015操作研究操作研究操作研究研究研究101016优化优化101017游戏理论101018统计统计101019随机学101020技术数学技术数学101021理论控制论理论控制论101023保险数学数学101024概率理论概率理论101025数字理论101026时间序列分析时间序列分析101030可靠性理论理论
众所周知,序列空间理论在功能分析和总结性理论中起着核心作用。的确,经典理论涉及串联和序列收敛概念的概括。目的是通过应用无限特殊矩阵代表的转换来分配非convergent系列和序列的限制。可以通过无限矩阵给出从序列空间到另一个序列空间的最通用的线性映射,因此处理矩阵而不是一般的线性映射很方便。
IV. 候选架构 ................................................................................................49 A. 功能分析 ..............................................................................................49 1. 行为分配 ..............................................................................................49 2. 功能需求 ..............................................................................................51 B. 架构综合 ..............................................................................................55 1. 功能架构 ..............................................................................................55 2. 输入 / 输出数据 ......................................................................................64 3. 物理架构 .............................................................................................66 4. 接口定义 .............................................................................................75 C. 性能特性 .............................................................................................78 1. 马尔可夫链 .............................................................................................79 2. 建模范式 .............................................................................................79 3. 仿真分析 .............................................................................................81
摘要:基因组编辑已成为多种物种功能研究和植物育种的主要工具。除了通过经典的 CRISPR-Cas9 系统产生敲除外,CRISPR 碱基编辑的最新发展为产生获得功能突变体提供了巨大而令人兴奋的机会。PAM 要求是 CRISPR 技术(如碱基编辑)的一大限制,因为碱基替换主要发生在较小的编辑窗口中。由于精确的单个氨基酸替换可能导致与某些域或农艺性状相关的功能,因此开发具有宽松 PAM 识别的 Cas9 变体对于基因功能分析和植物育种至关重要。最近,识别 NGN PAM 的 SpCas9-NG 变体已在植物中成功测试,主要是在单子叶植物中。在这项研究中,我们研究了 SpCas9-NG 在模式苔藓 Physcomitrella patens 和两种茄科作物(番茄和马铃薯)中对经典 CRISPR 基因敲除和胞嘧啶碱基编辑的效率。我们发现 SpCas9-NG 允许靶向非典型 NGT 和 NGA PAM,大大扩展了基因组编辑的范围。我们在研究中开发的 CRISPR 工具箱为模式植物和作物开辟了新的基因功能分析和植物育种前景。
腺嘌呤碱基编辑提供了一种基于镰状细胞疾病(SCD)的可行基因疗法,将镰状血红蛋白(HBS,βε6V)转化为G-Makassar血红蛋白(HBG,βE6A),一种天然发生的,非致病变体。但是,单独使用HB的HBG功能在很大程度上没有表征。我们提出了一种用于表征纯化的HBG-MAKASSAR以及HBGG和HBGS红细胞功能的小鼠模型。纯化的HBG-makassar表现为功能性血红蛋白,包括在缺氧下无聚合。HBG-MAKASSAR的氧和脱氧状态的结构表征显示出血红蛋白折叠的拓扑结构与βε6α突变没有变化。 红细胞功能分析,缺氧下的疾病倾向,血液计数和线粒体保留措施将HBGS RBC作为HBAS和HBSS之间的严重程度中间,器官功能与HBA相当。 HBGG类似于大多数指标的HBAA。 总结我们的结果表明,直接校正HBS对HBG-Makassar可以为SCD提供变革性疗法。HBG-MAKASSAR的氧和脱氧状态的结构表征显示出血红蛋白折叠的拓扑结构与βε6α突变没有变化。红细胞功能分析,缺氧下的疾病倾向,血液计数和线粒体保留措施将HBGS RBC作为HBAS和HBSS之间的严重程度中间,器官功能与HBA相当。HBGG类似于大多数指标的HBAA。总结我们的结果表明,直接校正HBS对HBG-Makassar可以为SCD提供变革性疗法。
鉴于糖尿病的全球患病率,迫切需要精确的预测工具。通常,传统的诊断方法无法识别临床数据中的复杂模式,从而导致干预措施延迟。机器学习(ML)和深度学习(DL)可以分析大型数据集,具有巨大的变革潜力。本综述着重于两项研究这些技术的最新研究,重点是它们对预测精度,功能分析和实际实施的贡献。这是在论文中提出的,为糖尿病预测开发两阶段比较框架的总体目的。