手稿:所有共同作者玛丽亚·格拉西亚·朗卡罗洛(Maria Grazia Roncarolo)手稿写作:沃尔克·威伯金(Volker Wiebking),马修·波特斯(Matthew Porteus)评论Wiebking,Matthew Porteus,Alice Bentaira监督:爱丽丝·伯恩塔(Alice Bentausis):爱丽丝·贝纳塔(Alice Bnateis):爱丽丝·伯恩塔(Alice Berainda),马修·托尔特(Matthew) Nathalie Mostrel Off-target analysis: Ciaran M. Lee and Gang Bao Data Matthew Porteus In vitro studies: Volker Wiebking, Premanjali Lahiri In vivo studies: Volker Conception and design: Volker Wiebking, Rasmus Bak, Alice Bertaina and Contributions:
(a)Q. Alba基因组组装的HAPA和HAPB之间的结构同步。两个反转超过1 Mb:3染色体上的1.1 Mb反转和染色体上的1.9 Mb反转。35S阵列的位置用红色正方形表示,5S阵列用红色圆圈表示。(b)中期染色体用两对35(绿色)和一对5s(红色)rDNA信号扩散。小型35S信号由白色箭头指示。
伙伴关系、合作和倡导 Belun 的优势来自于伙伴关系和对合作的承诺。 Belun 与以下机构合作: - 东帝汶政府,作为由 MFAT TL、总理办公室领导的 SDGs 工作组的观察员;国家冲突预防和应对网络成员(由内政部领导),总理办公室领导的国家安全工作组成员。 - 民间社会组织,是人权捍卫者网络成员、土地网络成员、司法公正工作组、性别工作组以及信息获取和反腐败工作组 - 区域 / 国际团体,包括亚太预防暴行伙伴关系、东盟民间社会 / 东盟人民论坛和民间社会国家建设与和平建设平台 - 政府实体,包括总统办公室(民间社会部)、总理办公室(民间社会部);内政部(国家社区冲突预防局)、社会团结和包容部(和平建设与社会凝聚力部);国家警察、国防军、外交部、国家行政办公室、公共工程部(水和卫生办公室);司法部(土地和财产办公室、公设辩护人办公室);商业和工业部(国家合作社理事会);教育部。
鳄梨 (Persea americana) 是木兰科植物的一种,木兰科植物是被子植物的早期分支谱系,其果实营养丰富,在全球具有很高的价值。在这里,我们报告了商业鳄梨品种 Hass 的染色体水平基因组组装,该品种占世界鳄梨消费量的 80%。使用由遗传图谱支持的先前发布的基因组版本进一步组装由 Pacific Biosciences HiFi 读数产生的 DNA 重叠群。总组装体为 913 Mb,重叠群 N50 为 84 Mb。分配给 12 条染色体的重叠群代表 874 Mb,覆盖了 98.8% 的胚性植物基准单拷贝基因。蛋白质编码序列注释确定了 48 915 个鳄梨基因,其中 39 207 个可归因于功能。基因组含有 62.6% 的重复元素。研究了基因组中感兴趣的特定生物合成途径。分析表明,鳄梨中庚糖生物合成的主要途径可能是通过景天庚酮糖 1,7 双磷酸,而不是通过其他途径。内切葡聚糖酶基因数量众多,与鳄梨使用纤维素酶催熟果实一致。尽管经历了多次基因组复制事件,但鳄梨基因组似乎在同源染色体之间有有限数量的易位。与相关物种的蛋白质组聚类允许识别鳄梨和樟科其他成员特有的基因,以及在单子叶植物和真双子叶植物分化前或分化时分化的物种特有的基因。该基因组提供了一种工具,以支持未来开发产量和果实质量更高的优质鳄梨品种。
稀有变异难以检测是传统全基因组关联研究 (GWAS) 面临的问题之一。这一问题与单倍型等由多个等位基因组成的复杂基因组成密切相关。为解决这一问题,已提出了多种单核苷酸多态性 (SNP) 集方法。但这些方法很少与单倍型相关讨论。在本研究中,我们开发了一种新的 SNP 集方法“RAINBOW”,并将该方法应用于基于单倍型的 GWAS,将单倍型块视为 SNP 集。结合单倍型块估计和 SNP 集 GWAS,可在无需先前单倍型信息的情况下进行基于单倍型的 GWAS。我们准备了 100 组稻 (Oryza sativa subsp.) 的模拟表型数据和真实标记基因型数据集。 indica,并对数据集进行 GWAS。我们比较了我们的方法、传统的单 SNP GWAS、传统的基于单倍型的 GWAS 以及传统的 SNP 集 GWAS 的功效。结果显示我们的方法在三个方面优于这些方法:(1)控制假阳性;(2)如果数据集中对因果变异进行了基因分型,则可以不依赖连锁不平衡来检测因果变异;(3)它显示出比其他方法更高的功效,即它能够检测到其他方法未能检测到的因果变异,主要是当因果变异位置非常接近且其作用方向相反时。通过在本研究中使用 SNP 集方法,我们期望不仅可以检测出罕见变异,还可以检测出具有复杂机制的基因,例如具有多个因果变异的基因。 RAINBOW 是作为名为“RAINBOWR”的 R 包实现的,可从 CRAN(https://cran.r-project.org/web/packages/RAINBOWR/index.html)和 GitHub(https://github.com/KosukeHamazaki/RAINBOWR)获取。
可靠的供应链也是维持全球可再生能源成本价值主张的关键。随着各国推出大规模的能源转型产业政策包,全球可再生能源知识、创新和技术交流的障碍可能会增加——所有这些对于实现经济高效和公平的转型都至关重要,特别是对于新兴市场和发展中经济体而言。必须谨慎平衡本地价值创造和区域供应链投资的需求与可再生能源行业核心商品和服务的公平透明贸易惯例。企业应该能够在公平的竞争环境中参与市场。这些因素对于避免加剧供应链瓶颈和降低可再生能源的成本竞争力,同时最大限度地提高社会经济效益至关重要。
肝细胞癌 (HCC) 是一种原发性肝脏肿瘤,是日本第五大癌症死亡原因。大多数 HCC 见于肝硬化或慢性肝损伤患者,例如病毒感染[乙型肝炎病毒 (HBV)、丙型肝炎病毒 (HCV)]、酒精性损伤、非酒精性脂肪性肝病 (NAFLD) 以及包括原发性胆汁性胆管炎和自身免疫性肝炎在内的自身免疫性疾病。WHO 估计 53% 的 HCC 发生在 HBV 感染患者中,另有 25% 发生在 HCV 感染患者中。相反,在日本,大约 65% 的 HCC 病例是由 HCV 感染引起的,15% 由 HBV 感染引起(1)。日本最近的多机构全国性调查报告称,因饮酒或非酒精性脂肪性肝炎 (NASH) 引起的非病毒性肝硬化的比例有所增加(2)。为了根据肝脏的局部情况预防慢性损伤,可以采取控制病毒感染的措施,以及改变生活方式,包括减少饮酒、健康饮食和体育锻炼,作为二级预防。尽管 HCV 的直接抗病毒 (DAA) 疗法和 HBV 的核苷酸类似物已被广泛使用,但 HCC 仍然是少数几种