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World File Search System单加氧酶
具有阿斯曲霉风险的患者的先发性基因分型策略
摘要 引言 侵袭性曲霉病是血液病患者发病和死亡的最重要原因。目前，伏立康唑是侵袭性真菌病的一线治疗药物。伏立康唑的药代动力学个体间差异取决于遗传因素。伏立康唑总代谢的 70%–75% 参与 CYP450，主要是 CYP3A4 和 CYP2C19，其余 25%–30% 的代谢由单加氧酶黄素进行。CYP2C19 单核苷酸多态性可以解释伏立康唑代谢中 50%–55% 的变异性。材料和方法主要目的是比较预先伏立康唑基因分型与常规实践的效率。主要结果是第五天血清伏立康唑是否在治疗范围内。次要结果是与伏立康唑相关的治疗失败和首次给药后 90 天内不良事件的综合变量。总共将招募 146 名可能接受伏立康唑治疗的侵袭性曲霉病风险患者，并进行 CYP2C19 基因分型。如果患者最终接受伏立康唑治疗，他们将被随机分配（1:1 实验/对照）。在实验组中，患者将根据药物遗传学算法接受剂量，包括 CYP2C19 基因型和临床及人口统计信息。在对照组中，患者将根据临床实践指南接受剂量。此外，将进行西班牙国家医疗保健系统 (NHS) 的成本效益评估。将对每个组进行直接成本计算。结论这项试验将提供有关在西班牙 NHS 中实施预防性伏立康唑基因分型策略的可行性和成本效益的信息。伦理与传播 该方案的西班牙语版本已通过拉巴斯大学医院伦理委员会和西班牙药品和医疗器械管理局的评估和批准。 试验结果
全基因组鉴定细胞色素p450超家族基因，靶向BNCYP704B1的靶向编辑赋予了Rapeseed
摘要：细胞色素P450（CYP450）单加氧酶超家族，它参与了许多主要和次级代谢物的生物合成途径，在植物生长和发育中起着重要作用。然而，先前未被发现了有关甘蓝纳普斯（BN-CYP450）中CYP450的全身信息，其生物学意义远未理解。氏族86 CYP450的成员，例如CYP704B，对于在植物男性繁殖中形成花粉外壳至关重要，并且已使用CYP704B基因的靶向诱变来在许多农作物中创建新的雄性无菌系。在本研究中，在甘蓝纳普斯品种“中舒安11”（ZS11）中鉴定了总共687个BNCYP450基因，其与拟南芥中的CYP450成员近2.8倍。与拟南芥相比，甘蓝纳普斯是一家具有较大基因组的四倍体油厂，因此可以理性地估计。将BNCYP450基因分为47个亚家族，并将其聚集成9个氏族。系统发育关系分析表明，CYP86家族由四个亚家族和109个BNCYP450组成。CYP86基因的成员在不同组织中显示出特定的表达曲线，并响应ABA和非生物胁迫。CYP704内CYP86氏族，BNCYP704B1A和BNCYP704B1B的两个BNCYP450S在MS26（男性无菌26，也称为CYP704B1）中显示出高的模拟性。这两个BNCYP704B1基因在年轻的芽中特异性表达。然后，我们同时通过簇状的定期间隔短的Palindromic重复序列/CRISPR相关的细胞蛋白9（CRISPR/CAS9）基因组工程系统来淘汰这两个BNCYP704B1基因。编辑的植物在成熟的花药中表现出无花粉的无菌表型，这表明我们在甘蓝乳胶中成功地再现了基因男性不育（GMS，也称为核男性无菌性）线。这项研究提供了BNCYP450S的系统性视图，并提供了一种策略，以促进CRISPR/CAS9系统的商业实用性，以通过敲除Rapeseed的Rapeseed快速生成GMS，通过敲除GMS控制基因。
硝化细菌的多样性和分布在红树林沉积物的氮循环中起重要作用
土地和海洋之间红树林生态系统的独特定位使它们在氮循环中至关重要。硝化在氮循环中的作用对于提供红树林易于吸收的氮化合物很重要。然而，红树林地区的硝化过程和硝化细菌尚未全面理解。这项研究的主要目的是通过进行系统的综述，对红树林沉积物中的硝化细菌进行全面分析。系统评价和荟萃分析方法的首选报告项目被用作有助于系统地报告评论的指南，并具有流程图以显示选择相关研究的过程。数据收集是通过使用6个数据库和包括Scopus，PubMed，ResearchGate，Google Scholar和Springer在内的期刊搜索引擎进行的，以实现更全面的发现。这项研究采用了广泛认可且常用的技术，通过首先识别人口，干预，比较和结果来以重点方式定义评论的范围。这项研究确定了358项研究，筛查后审查中包括了31项研究。基于筛查结果，关于红树林沉积物中硝化细菌的研究在地理上仅限于印度尼西亚，越南，泰国，中国，墨西哥，美国，印度和沙特阿拉伯等多个国家。氨氧化细菌通常是主要的群体，但是各种硝化细菌基团在不同的红树林环境中分布多样。这项研究表明，在红树林沉积物中硝化细菌之间存在高度的多样性，五个不同的组鉴定出来：氨氧化细菌，亚硝酸盐氧化细菌，厌氧菌细菌和comammammox细菌，最近鉴定出的组。在进行氮化合物的变化时，从硝化过程的不同步骤中使用功能基因的硝化作用，例如硝酸氨基酶，单加氧酶亚基A，亚硝酸盐氧化剂氧化液亚基A，硝酸盐亚基亚基，硝酸盐还原链链酶，一氧化氧酶，氮的再生氮，氢氮合酶，肼氧化还原酶和羟胺氧化还原酶基因。这项研究还表明了红树林沉积物中的植被类型和硝化细菌的分布。这些沉积物的深度通常从0到60厘米不等，大多数样品以0到20厘米的深度采集。采样位置的植被类型由Kandelia Candel，Avicennia Marina，Kandelia Obovata和Rhizophora Mangle的种类主导。关于硝化细菌在红树林沉积物中的限制为深入研究提供了机会。这项全面的综述提供了对硝化细菌的多样性和传播的深入概述，强调了它们在氮循环中的作用，并强调了发现红树林沉积物中新硝化细菌的潜力。
小鼠，大鼠和豚鼠在FMOS表达和TMAO的组织浓度上有所不同，TMAO是肠道细菌的心血管和代谢疾病的生物标志物
三甲胺（TMA）是肠道菌群代谢产物。大量的研究表明，TMA肝脏氧化的产物三甲胺氧化物（TMAO）是炎血管中的生物标志物[1-3]，代谢[4-6]和肾脏疾病[7]。TMA是由饮食胆碱和肉碱的肠道菌群生产的[8-13]人类TMA和TMAO的另一个直接来源是海鲜[14，15]。TMA穿过肠血屏障，在肝脏中，通过含黄素单加氧酶（FMOS）迅速将其氧化为TMAO。已经进行了广泛的研究，以阐明FMOS生化特性，底物特异性和功能作用。其中，FMO5脱颖而出，因为它没有对三甲胺的活性[16-23]。在人类中，肝脏中的FMO3在TMA的氧化中起关键作用[24]。然而，在人类和动物中，在肾脏，肺，心脏和小肠等各种器官中都可以找到其他同工型[25-28]。人肝内FMO3活性的缺乏会导致一种通常称为“钓鱼气味综合征”或三甲基nuria的疾病，其特征在于诸如钓鱼体气味之类的症状[29 - 32]。先前已经报道了小鼠和大鼠之间FMO3活性的变化。大鼠在肝脏中表现出FMO1和FMO3的表达[27]。在该物种中，FMO3对于将TMA氧化为TMAO，类似于人类。相反，FMO3基因表达在雄性小鼠的肝脏中被抑制，导致其血液和尿液中TMA水平升高[28，33]。在雄性和雌性小鼠中，FMO1都被假定将大约10％的TMA氧化[34]。研究表明，TMAO可能会对各种生理过程产生有害的影响，并在心血管，肾脏和元性疾病的进展中发挥直接作用[2，5，35 - 38]。但是，来自其他研究的数据矛盾挑战了关于TMAO的负面影响的主张[39-41]，其中一些证据表明具有积极作用[42 - 44]。这些差异可能是由于测试的TMA/TMAO剂量的变化或不同物种中TMA/TMAO的生理水平或代谢差异[35 - 39，42 - 50]，这些因素可能导致TMA/TMAO暴露的差异，潜在地影响了对健康的影响。最后，有些人认为TMA但没有TMAO对生物体产生负面影响[47，51 - 55]。因此，将TMA氧化为TMAO的FMO3的表达和活性在介入的实验环境中在外源性TMA和/或TMAO的生物学作用中起着至关重要的作用。适当选择动物模型对于确保发现对人类的转换性至关重要，因为与物种相关的因素显着影响数据解释[56 - 58]。尚未建立良好的建立良好的尚未建立良好的公认，尤其是在大鼠，小鼠和豚鼠中，tmao组织浓度及其前体的种间差异尚未得到良好成就。 这项研究旨在确定TMAO的组织浓度及其前体在这些使用实验物种中。尚未建立良好的公认，尤其是在大鼠，小鼠和豚鼠中，tmao组织浓度及其前体的种间差异尚未得到良好成就。这项研究旨在确定TMAO的组织浓度及其前体在这些使用实验物种中。此外，还检查了不同组织中含黄素单古族遗传（FMO）的表达，以了解这些动物中TMA/TMAO代谢的见解。