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World File Search System单胞菌
具有各种生物膜表型的四个假单胞菌临床菌株的基因组序列
囊性纤维化（CF）患者的肺肺部容易受到铜绿假单胞菌的感染（1）。cf肺通常由形成生物膜的非粘液铜绿假单胞菌菌株定植，并且在粘液菌株过量产生藻酸盐的出现后发生慢性感染（2）。他们的生物膜对抗生素和IMUNE介质具有高度抗性，并导致肺部下降（2，3）。铜绿假单胞菌菌株是从慢性感染的成年CF患者的痰液样本中分离出来的，并在法国南特的中心医院大学中心。由于这些痰样品仅用于分离细菌，但不用于人类细胞或人类DNA，因此法国法律（2016-1537，2016年11月16日）不要求由机构伦理委员会审查和批准该研究或参与者提供书面或言语知情的同意。细菌，并使用基质辅助激光解吸离子 - 流量质量光谱法（MALDI-TOF MS [VITEK; VITEK; BIOMERIERIEUX; BIOMERIERIEUX，MARCY-LECELANCE，france）鉴定为铜绿假单胞菌。使用了每个患者的单个分离株。主要基于它们的生物膜结构和粘液表型，分离株MUC-N1，MUC-N2，MUC-P4和MUC-P5被选择构成用于测试抗体FILM化合物的应变板（M. Simon，E.Pernet，E.Pernet，E.Pernet，E.Jouault，A.Jouault，E.Portier，E.M.Boukigb，S.Boukig，S。Pinaud，C。 POC-Duclairoir，M。G。J. Feuilloley，O。Lesouhaitier，J。Caillon，S。Chevalier，A。Bazire和A. Dufour，提交出版），促使我们对其基因组进行了测序。在37°C下在液体LB培养基中生长在LB琼脂板中挑选的单个菌落接种的液体LB培养基中生长，并使用基因组基因组DNA纯化试剂盒（Fisher Fisher Scientifip，France，France）使用基因组基因组DNA纯化的基因组DNA，并使用手机的推荐并评估了双重态度（There the）。量子液计（Thermo Fisher Scientifim，美国）和1％琼脂糖凝胶电泳。 使用Illumina Nextera XT DNA库准备套件制备了测序库，按照制造商的协议。 在Miseq仪器（LMSM基因组平台，Rouen Normandy University，Evreux，France，France，France）上进行了测序，并使用Miseq Reagent Kit Kit Kit v.3（2 250 BP）进行了双指数配对末端读数。 默认参数用于所有软件，除非另有说明。 使用Trimmomatic V.0.36（4）对读数进行修剪，并使用Multiqc 检查其质量在LB琼脂板中挑选的单个菌落接种的液体LB培养基中生长，并使用基因组基因组DNA纯化试剂盒（Fisher Fisher Scientifip，France，France）使用基因组基因组DNA纯化的基因组DNA，并使用手机的推荐并评估了双重态度（There the）。量子液计（Thermo Fisher Scientifim，美国）和1％琼脂糖凝胶电泳。使用Illumina Nextera XT DNA库准备套件制备了测序库，按照制造商的协议。在Miseq仪器（LMSM基因组平台，Rouen Normandy University，Evreux，France，France，France）上进行了测序，并使用Miseq Reagent Kit Kit Kit v.3（2 250 BP）进行了双指数配对末端读数。默认参数用于所有软件，除非另有说明。使用Trimmomatic V.0.36（4）对读数进行修剪，并使用Multiqc
使用人类干细胞产生的生殖细胞的人类胚胎...
Murakami K，Hamazaki N，Hamada N，Nagamatsu G，Okamoto I，Ohta H，Nosaka Y，Semba Y，Hayashi K.在体外雄性小鼠的功能性卵母细胞的产生。 div>自然。 div>2023年3月； 615（7954）：900-906。 doi：10.1038 / s41586-023-05834-x。 div>
微生物群对牙周组织炎症性疾病发生发展的影响
口腔器官和组织功能的一个重要特征是，其中发生的所有过程都是在各种微生物的不断存在下进行的，这些微生物会导致体内病理过程的发展或与之相关。在慢性全身性牙周炎的发病机制中，牙菌斑穿透牙龈沟底部，渗透到上皮下方进入结缔组织基质，引起其炎症。细菌会产生多种对周围组织有毒性作用的毒性物质。大多数细菌会产生链状脂肪酸，抑制白细胞和吞噬细胞的趋化作用。厌氧菌和螺旋体会分泌多种对大多数组织具有极大毒性的物质（丙酸和吲哚）。牙周组织中的炎症是由牙菌斑生物膜的微生物群引起的。随着牙周炎的发展，牙龈卟啉单胞菌、中间卟啉单胞菌和福赛丝菌的数量增加了100多倍。因此，给出的数据证明，在牙周组织炎症过程的发展和过程中，涉及复杂的菌群失调和组织-细胞相互作用，其动态平衡取决于其结果。
复发性梭状芽胞杆菌艰难梭菌感染和粪便菌群移植的结果：一种基于人群的评估
研究人群佐治亚州新兴感染计划（EIP）（由疾病控制与预防中心资助）在卫生区8县亚特兰大地区（2019年人口420万）中，在8县亚特兰大地区进行基于人群的CDI监视。佐治亚州EIP监视活动得到了埃默里大学机构审查委员会（IRB）的批准，并放弃了同意和HIPAA授权。数据收集得到了Emory University IRB，Atlanta VA研发办公室和Grady Memorial Hospital研究监督委员会的批准，并由佐治亚州公共卫生部IRB审查。这项研究评估了2016年1月1日至2019年12月31日之间的卫生区3的成年居民。此结束日期是由于2019年冠状病毒病（COVID-19）大流行期间对FMT的使用而选择的。
来自各种哺乳动物的多能干细胞的生殖细胞...
1，Hyashi K，Ohta H，Kurimoto K，Saitou M（2011111111 11通过多能干细胞在培养中对小鼠生殖细胞指定途径的重构。单元格，146，519 -2, Gafni O, Weinberger L, Mansour AA, Manor YS, Chom- sky E, Ben-Yosef D, Kalma Y, Viukov S, Maza I, Zviran A, Rais Y, Shipony Z, Mukamel Z, Krupalnik V, Zerbib M, Geula S, Caspi I, Schneir D, Shwartz T, Gilad S, Amann-Zalcenstein D，Benjamin S，Amit I，Tanay A，More-S-RWA R，Novershtern N，Hanna JH（2013年，新型人类基态幼稚的多能干细胞的脱颖而出。 自然，504，282 - 3，Irie N，Weinberger L，Tang WWC，Kobayashi T，Viukov S，Manor YS，Dietmann S，Hanna JH，Surani MA（2015 17是人类原始LOM LOM细胞脂肪的关键特征。 单元格，160，253 - 4, Sasaki k, yokayashi s, namurara t, okamoto i, yabot y, kurimoto k, ohta H, moritoki y, iwatani C, tsuciya h, nakura s, sekiguchi k, sakuma t, yamomomomomoto t, t, yamamoto s, yamamoto m, yamamoto m。 M（（2015年）在体外耐心诱导人类生殖细胞脂肪中的人类生殖细胞脂肪。 细胞干细胞，17，178 - 5，Kobayashi T，Zhang H，Tang WWC，Irie N，Withey S，Klipsch D，Syrirna，Dietmann S，Contreras，Webb R，Erlelegio R，Ellelegio R，Soup MA （2 自然，546，416 - 6，Tang WWC，Castillo-Venzor A，Gruhn WH，Kobayashi T，Penfold CA，Morgan MD，Sun D，Irie N，Surani MA （20222222222222222，Sequeential Enlancer State reamoulines Remoulines remoulines hu-man enferine hu-man enterline能力和指定。 nat Cell Biol，24，448 -2, Gafni O, Weinberger L, Mansour AA, Manor YS, Chom- sky E, Ben-Yosef D, Kalma Y, Viukov S, Maza I, Zviran A, Rais Y, Shipony Z, Mukamel Z, Krupalnik V, Zerbib M, Geula S, Caspi I, Schneir D, Shwartz T, Gilad S, Amann-Zalcenstein D，Benjamin S，Amit I，Tanay A，More-S-RWA R，Novershtern N，Hanna JH（2013年，新型人类基态幼稚的多能干细胞的脱颖而出。自然，504，282 -3，Irie N，Weinberger L，Tang WWC，Kobayashi T，Viukov S，Manor YS，Dietmann S，Hanna JH，Surani MA（2015 17是人类原始LOM LOM细胞脂肪的关键特征。 单元格，160，253 - 4, Sasaki k, yokayashi s, namurara t, okamoto i, yabot y, kurimoto k, ohta H, moritoki y, iwatani C, tsuciya h, nakura s, sekiguchi k, sakuma t, yamomomomomoto t, t, yamamoto s, yamamoto m, yamamoto m。 M（（2015年）在体外耐心诱导人类生殖细胞脂肪中的人类生殖细胞脂肪。 细胞干细胞，17，178 - 5，Kobayashi T，Zhang H，Tang WWC，Irie N，Withey S，Klipsch D，Syrirna，Dietmann S，Contreras，Webb R，Erlelegio R，Ellelegio R，Soup MA （2 自然，546，416 - 6，Tang WWC，Castillo-Venzor A，Gruhn WH，Kobayashi T，Penfold CA，Morgan MD，Sun D，Irie N，Surani MA （20222222222222222，Sequeential Enlancer State reamoulines Remoulines remoulines hu-man enferine hu-man enterline能力和指定。 nat Cell Biol，24，448 -3，Irie N，Weinberger L，Tang WWC，Kobayashi T，Viukov S，Manor YS，Dietmann S，Hanna JH，Surani MA（2015 17是人类原始LOM LOM细胞脂肪的关键特征。单元格，160，253 -4, Sasaki k, yokayashi s, namurara t, okamoto i, yabot y, kurimoto k, ohta H, moritoki y, iwatani C, tsuciya h, nakura s, sekiguchi k, sakuma t, yamomomomomoto t, t, yamamoto s, yamamoto m, yamamoto m。 M（（2015年）在体外耐心诱导人类生殖细胞脂肪中的人类生殖细胞脂肪。 细胞干细胞，17，178 - 5，Kobayashi T，Zhang H，Tang WWC，Irie N，Withey S，Klipsch D，Syrirna，Dietmann S，Contreras，Webb R，Erlelegio R，Ellelegio R，Soup MA （2 自然，546，416 - 6，Tang WWC，Castillo-Venzor A，Gruhn WH，Kobayashi T，Penfold CA，Morgan MD，Sun D，Irie N，Surani MA （20222222222222222，Sequeential Enlancer State reamoulines Remoulines remoulines hu-man enferine hu-man enterline能力和指定。 nat Cell Biol，24，448 -4, Sasaki k, yokayashi s, namurara t, okamoto i, yabot y, kurimoto k, ohta H, moritoki y, iwatani C, tsuciya h, nakura s, sekiguchi k, sakuma t, yamomomomomoto t, t, yamamoto s, yamamoto m, yamamoto m。 M（（2015年）在体外耐心诱导人类生殖细胞脂肪中的人类生殖细胞脂肪。细胞干细胞，17，178 -5，Kobayashi T，Zhang H，Tang WWC，Irie N，Withey S，Klipsch D，Syrirna，Dietmann S，Contreras，Webb R，Erlelegio R，Ellelegio R，Soup MA （2自然，546，416 -6，Tang WWC，Castillo-Venzor A，Gruhn WH，Kobayashi T，Penfold CA，Morgan MD，Sun D，Irie N，Surani MA （20222222222222222，Sequeential Enlancer State reamoulines Remoulines remoulines hu-man enferine hu-man enterline能力和指定。nat Cell Biol，24，448 -7，Yamashiro C，Sasaki K，Yabuta Y，Kojima Y，成熟T，Okamoto I，Yokayashi S，Murase Y，Shirara Y，Shirane K，Sasaki K，Sasaki H，Sasaki H，Yamamoto T，Yamamoto T，Saitou M（ 201818年）Pluripot pluripot pluripot pluripot celped pluripot pluripot cel celed pluripot pluripot celed pluripot celed细胞的pluripot卷成pluripot。科学，362，356 -8，Hwang YS，Suzuki S，Seita Y，ITTO J，Sa Sato Y，Dog Y，Sato K，Sato K，Hermann BP，Sasaki K （2020020020重建了繁荣症状的spefiification in Verrom，该spefiification in Verrom a Verrom受到了诱发的PACECACE PAMAPOPOTENT SPOS SPOS细胞。nat commun，11，Kobayashi T，Kobayashi H，Goto T，Takashima T，Oakawa M，Ikeda H，Terada R，Yoshida F，Sanbo M，Ukida H，Kurrimoto K，Hirabayashi M （2020 U 2020 U型生殖器开发Kobayashi T，Kobayashi H，Goto T，Takashima T，Oakawa M，Ikeda H，Terada R，Yoshida F，Sanbo M，Ukida H，Kurrimoto K，Hirabayashi M （2020 U 2020 U型生殖器开发
参考：DSHB3010技术数据表产品：Cetrimide琼脂（假单胞菌选择性琼脂）
*根据需要进行调整和 /或补充，以满足性能标准方向，将45.3 g粉末悬浮在1升蒸馏水中，并加入10毫升甘油。将其烧开并分配到合适的容器中。在121°C的高压釜中灭菌15分钟。描述锡酰胺琼脂是基于铜绿假单胞菌菌株对季铵化合物（QAC）的耐药性。用肉基三乙基氨基氨溴化物A以1G/L的浓度为1g，但非常贫穷和缓慢。0,2-0,3 g/L的抑制剂浓度似乎不会影响化脓性物种的生存能力。，但它确实抑制了伴随的细菌，包括革兰氏阳性和革兰氏阴性生物。可能在抑制浓度较低的抑制浓度下形成的其他假单胞菌也受到抑制。在30-35°C下孵育18-72小时，PS存在着重要的优势。铜绿可对任何其他抗性微生物都显着，建议在42°C下进行第一个隔离，在48小时时延长孵育，因为在这些情况下，抑制其他微生物几乎是总的。技术根据当前的国家或国际标准，已建立和测试的协议或根据每个实验室建立和接受的程序进行。质量控制
抗生素对东非社区中铜绿假单胞菌基因组表达的影响：系统评价
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2024年12月26日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2024.12.25.630341 doi：Biorxiv Preprint
新型假单胞菌产物在体外刺激气道上皮细胞中的白介素-8
由于在囊性纤维化患者的痰中发现了高浓度的IL-8，因此我们假设铜绿假单胞菌（PA）诱导呼吸道上层细胞和单核细胞中IL-8的产生。因此，我们与人类转化的支气管上皮细胞（16-HBE）或单核细胞一起孵育了PA培养物的植物。已与PA超代孵育6小时的16-HBE细胞的培养物具有趋化活性，该抗体受到对人IL-8的抗体的抑制。PA上清液诱导原代支气管上皮细胞，16-HBE细胞和单核细胞产生IL-8。与PA上清液孵育后，16-HBE细胞显示IL-8基因表达水平显着升高。负责IL-8生产的PA产品抵抗冻结，沸腾和蛋白水解。该产品不可提取脂质，并且存在于1 kD滤液中。我们得出的结论是，PA的小分子质量产物刺激了16-HBE细胞和单核细胞的IL-8产生，并且在Expo-DA后16-HBE产生的趋化活性主要归因于IL-8。（J.Clin。投资。1994。93：26-32。）关键词：上皮 - 细胞因子表达 - 囊性纤维化 *内毒素 *趋化性