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在菌株下闭合DNA发夹期间寡核苷酸的位移和解离
1加州大学欧文分校生物医学工程系，CA 92617，美国2，2复杂生物体系中心，加利福尼亚大学，欧文分校，CA 92697，美国，3，CHAO合成生物学中心，Chao家族综合综合癌症中心发育和细胞生物学系，加利福尼亚州，美国4.26体质de l'ecole normale sup´erieure，ENS，Universit´e PSL，CNRS，Sorbonne Universit´e，Universit´e Paris cit´e，巴黎，法国，法国，5 Kusuma生物科学学院，印度技术学院，印度技术研究所，德里，德里，110016，印度110016，印度，6个小型Biosystems，facelent de deaada de de la d de la de de de de de de de de la sica de la sica， F´ısica，巴塞罗那大学，Carrer de Mart'i franqu`ies，1，08028西班牙巴塞罗那，7纳米西亚Institut de Nanotecnologia I nanotecnologia（IN2UB），巴塞罗那大学，佩尔纳尼亚州98028 pa Barcelona，98028 pa niia pa pan pa niia pa niia pa niia pa Institut de Biologie de l'´ Ecole Normale sup´erire（Ibens），CNRS，Insers，´Ecole Normale Sup´erieure，PSL研究生，F-75005，F-75005，法国，法国，10化学和生物化学系，加利福尼亚Los Angelles，Los Angelles，Los Angelles，Ca 90095法国1加州大学欧文分校生物医学工程系，CA 92617，美国2，2复杂生物体系中心，加利福尼亚大学，欧文分校，CA 92697，美国，3，CHAO合成生物学中心，Chao家族综合综合癌症中心发育和细胞生物学系，加利福尼亚州，美国4.26体质de l'ecole normale sup´erieure，ENS，Universit´e PSL，CNRS，Sorbonne Universit´e，Universit´e Paris cit´e，巴黎，法国，法国，5 Kusuma生物科学学院，印度技术学院，印度技术研究所，德里，德里，110016，印度110016，印度，6个小型Biosystems，facelent de deaada de de la d de la de de de de de de de de la sica de la sica， F´ısica，巴塞罗那大学，Carrer de Mart'i franqu`ies，1，08028西班牙巴塞罗那，7纳米西亚Institut de Nanotecnologia I nanotecnologia（IN2UB），巴塞罗那大学，佩尔纳尼亚州98028 pa Barcelona，98028 pa niia pa pan pa niia pa niia pa niia pa Institut de Biologie de l'´ Ecole Normale sup´erire（Ibens），CNRS，Insers，´Ecole Normale Sup´erieure，PSL研究生，F-75005，F-75005，法国，法国，10化学和生物化学系，加利福尼亚Los Angelles，Los Angelles，Los Angelles，Ca 90095法国
与X射线摄像机相关的多光谱监测数据在发夹的激光焊接期间
在当今的高性能电动发动机中，发夹技术用于提高效率。而不是由绕线线制成的定子，将较厚的铜销组装和焊接。由于表面污染，夹紧，定位或以前的切割过程，典型的焊缝失败，例如飞溅物，毛孔或连接不足。对于生产设施，它不足以识别有缺陷的焊缝；还需要进行分类以确定故障的原因并尽快纠正它们。在本研究的帮助下，在原位X射线摄影中评估了多光谱监测系统的能力。数据显示与蒸气毛细管的稳定性，焊接位置和飞溅形成的相关性。
使用新型熔体发夹探针设计
数字PCR（DPCR）是需要对目标分子绝对定量或检测罕见事件的研究和诊断应用的强大工具，但是可以在测定中进行区分的核酸靶标数量限制了其实用性。对于大多数DPCR系统，每个目标都会在光通道中检测到一个目标，并且目标总数受到平台上光通道的数量的限制。高阶多路复用有可能显着增加DPCR的实用性，尤其是在样本有限的情况下。多路复用的其他潜在收益包括较低的成本，更多的探针生成的其他信息以及较高的吞吐量。为了满足这种未满足的需求，我们开发了一种新颖的基于熔体的发夹探针设计，以提供多重多重数字PCR的强大选择。在16孔微流体数字PCR平台中，使用三个基于熔体的发夹探针的原型多重数字PCR（MDPCR）测定方法准确区分并量化了每个孔的12个核酸靶标。对于具有10,000个人类基因组当量的样品，空白极限的探针特异性范围为0.00％ - 0.13％，检测分析限制的范围为0.00％ - 0.20％。实验室间的可重复性非常好（r 2 = 0.997）。重要的是，这种新型基于熔体的发夹探针设计具有超出该原型测定的12个目标/孔的多路复用的潜力。具有出色性能特征的易于使用的MDPCR技术有可能彻底改变数字PCR在研究和诊断环境中的使用。
非常稳定的基于发夹的生物传感器，用于快速检测DNA连接酶
摘要：DNA连接酶是所有生物体中与DNA复制和修复过程有关的必不可少的酶。这些酶通过催化在双链DNA中并置了5'磷酸盐和3'羟基末端之间的磷酸二酯键来密封DNA。除了它们在维持基因组完整性方面的关键作用外，DNA连接酶最近已被确定为几种类型的癌症的诊断生物标志物，并被认为是治疗各种疾病的潜在药物靶标。尽管DNA连接在基础研究和医学应用中是显着的，但开发有效检测和精确量化这些关键酶的策略仍然具有挑战性。在这里，我们报告了高度敏感和特定生物传感器的设计和制造，其中利用稳定的DNA发夹来刺激荧光信号的产生。在广泛的实验条件下，验证了该探测器是稳定的，并且在检测DNA连接酶时表现出有希望的性能。我们预计，基于发夹的生物传感器将显着发展针对某些疾病的新靶向策略和诊断工具。
集成杂交链式反应或催化发夹组装的 DNA 基生物传感器研发新进展
作为等温、无酶信号放大策略，杂交链式反应 (HCR) 和催化发夹组装 (CHA) 具有放大效率高、生物相容性好、反应温和、操作简便等优点。因此，它们已广泛应用于基于 DNA 的生物传感器，用于检测小分子、核酸和蛋白质。在这篇综述中，我们总结了采用典型和先进的 HCR 和 CHA 策略的基于 DNA 的传感器的最新进展，包括分支 HCR 或 CHA、局部 HCR 或 CHA 和级联反应。此外，还讨论了在生物传感应用中实现 HCR 和 CHA 的瓶颈，例如高背景信号、比酶辅助技术更低的放大效率、动力学慢、稳定性差以及细胞应用中 DNA 探针的内化。
基于 TSV 的发夹带通滤波器，适用于 6G 移动...
摘要 针对第六代（6G）移动通信应用，提出了三种新型五阶超紧凑发夹带通滤波器。发夹单元的臂采用三维集成技术（TSV）实现，部分发夹单元由四个臂组成。本文介绍了这三种滤波器的设计方法，并通过基于有限元法的工业级仿真器HFSS验证了滤波特性。结果表明:所设计的三个滤波器的中心频率分别为0.405 THz、0.3915 THz、0.3955 THz,带宽分别为0.1 THz、0.077 THz、0.063 THz,插入损耗为2.0 dB,回波损耗分别为12.4 dB、13.4 dB、14 dB。所设计的三个滤波器的尺寸均为0.284×0.0325 mm2(1.29×0.148λg2)。关键词:第六代(6G)移动通信、太赫兹(THz)频段、发夹带通滤波器、硅通孔(TSV)分类:电子器件、电路和模块(硅、化合物半导体、有机和新材料)
发夹和剪刀 - 为大众提供非基因编辑的同种异体 CAR-T 细胞疗法 David Gilham Celyad Oncology 首席科学官
概述 两种嵌合抗原受体 (CAR) T 细胞疗法获批用于治疗 B 细胞恶性肿瘤，凸显了细胞免疫疗法在提供令人印象深刻的持久临床反应方面的潜力 1 。这些产品本质上是自体的，涉及从患者身上收集用于制造 CAR T 细胞的免疫细胞。一旦生产出来，这些 CAR T 细胞就会作为临床产品重新注入患者体内。然而，自体疗法面临着重大挑战，包括产品生产时间（目前需要数周），在此期间患者的病情可能会恶化，以及起始材料的质量高度不稳定，这可能导致制造失败。同种异体 CAR T 细胞疗法是一种现成的方法，可以在需要时进行管理，是理想的解决方案。这种方法从健康供体中生成细胞，形成一个 CAR T 细胞库，可根据需要使用。同种异体 CAR T 的关键挑战是克服与同种异体 CAR T 细胞识别健康患者组织相关的毒性。这是由 T 细胞受体 (TCR) 介导的。破坏 TCR 是所有当前同种异体 CAR-T 策略的基础 2 。发夹和剪刀目前，用于生成同种异体 CAR-T 的基因编辑技术处于临床开发的早期阶段。不同的基因编辑方法都是基于切割编码 TCR 的基因之一内的基因组，从而永久性地降低整个 TCR 复合物的表达。虽然是一种优雅的方法，但由于潜在的产品安全问题，这种剪刀策略一直难以进入临床测试阶段——主要是确保在基因编辑过程中没有“脱靶”基因组切割 3 。或者，在 mRNA 水平上靶向基因表达不涉及切割基因组，并避免危及基因组完整性。为了实现这种 mRNA“编辑”，Celyad Oncology 采用了短发夹 RNA (shRNA)，这是一种几十年来用于敲低基因表达的方法 4 。该方法涉及使用具有与目标基因互补序列的 shRNA。换句话说，靶向 shRNA 可以通过干扰 mRNA 而不是切割基因组 5 来特异性降低所需蛋白质（如 TCR 复合物）的水平。其中的核心是一体化载体方法。只需一步，将单一试剂（载体）引入健康供体 T 细胞，即可同时产生 T 细胞中的所有元素，这些元素可以将 T 细胞重定向到肿瘤（CAR）、消除 TCR（shRNA）并提供一个手柄，使修饰的细胞可以在制造过程中富集（标记物）。同种异体 CAR T 细胞平台中的 shRNA CD3z 亚基为 TCR 提供主要信号功率，从而激活和参与 T 细胞杀伤能力。通过选择最佳 shRNA 和工艺开发，靶向 CD3z 可使原代 T 细胞上的 TCR 持续高水平敲低，达到与基因编辑 CD3z 基因时相同的水平（图 1A）。从功能上讲，这与这些细胞无法对有丝分裂刺激（又称 TCR 驱动的 T 细胞活化；图 1B）作出反应以及当这些细胞被注入黄金标准体内测试模型时相应没有毒性有关（图 2A、B）。有趣的是，shRNA 靶向 T 细胞的持久性比 CRISPR-Cas9 基因的持久性要长得多
使用息肉素反向Hoogsteen发夹技术对点突变的基因校正
单基因疾病通常是特定基因单点突变的结果，导致非功能蛋白的产生。不同的血液疾病，例如β-丘脑贫血，镰状细胞病，遗传性球细胞增多症，fanconi贫血和血友病A和B，通常是由点突变引起的。基因编辑工具，包括Talens，ZFN或CRISPR/CAS平台，以纠正负责不同疾病的突变。然而，不依赖核酸酶活性的替代分子工具，例如形成三核苷酸及其衍生物（例如肽核酸），也证明了它们在DNA中纠正突变的能力。在这里，我们回顾了修复 - 螺肽反向Hoogsteen发夹（PPRHS）技术，该发夹可以代表该领域内的替代基因编辑工具。修复-PPRHS是由由五甲状腺素桥连接的两个息肉素镜重复序列形成的单链DNA分子，然后在分子的一端进行扩展序列，该序列是与DNA序列同源的，但要修复了DNA序列，但含有修复的DNA序列。PPRH的两个息肉臂由嘌呤之间的分子内反间隔键结合，从而形成了发夹结构。该发夹芯与watson-crick键以序列特异性方式与dsDNA中靶突变相对近乎近距离突变结合，从而产生了刺激重组的三重结构。这项技术已成功地用于修复其内源性基因座中DHFR和APRT基因突变体在哺乳动物细胞中的集合，并且可以适合校正负责血液疾病的突变。
基于 CRISPR–Cas9 修饰的催化发夹组装的灵敏且特异的 microRNA 检测和原位成像方法
微小RNA（miRNA）是一类小型非编码RNA，在调控基因表达和相关病理过程中发挥着至关重要的作用。1,2作为一种重要的生物标志物，miRNA在细胞内的分布和表达与许多疾病，尤其是癌症有着密切的关系。因此，miRNA的体外检测和原位成像都有利于疾病诊断。3最近，外泌体是一种直径约30 – 150纳米的小型载体，含有几种不同的生物分子，包括蛋白质、脂质以及mRNA和非编码RNA。外泌体也被认为是细胞 - 细胞通讯介质中的重要部分，因为它们可以将其内容物（尤其是miRNA）释放到邻近细胞和远端细胞。4 – 6因此，外泌体miRNA被视为疾病诊断和病理研究的有前途的生物标志物。据报道，许多 miRNA 检测方法，如实时定量聚合酶链式反应 (qRT-PCR)、北方印迹、微阵列，可在溶液或细胞裂解物中实现灵敏的 miRNA 检测。7,8 尽管如此，这些方法也因步骤耗时、程序复杂和成本昂贵而受到批评，阻碍了它们的广泛应用。7,9,10
b'CIRDARCONATION肿瘤细胞（CTC）是用于转移性癌症检测和监测进展的有希望的生物标志物。但是，由于CTC的低频率和异质性，对CTC的检测仍然具有挑战性。本文中，我们报告了一种生物启动的方法，该方法是基于信号扩增的级联反应，使用可编程DNA杂交链反应（HCR）电路。我们应用了这种方法，使用抗HER2抗体（曲妥珠单抗）与引发剂DNA耦合，从而检测HER2 +癌细胞，从而引发了HCR级联反应，该抗体会导致细胞表面的荧光信号。在4 \ XC2 \ XB0 C下，这种HCR检测方案导致在HER2细胞和外周血白细胞的背景下，在HER2 +细胞的膜上对DNA发夹的高效，特异性和敏感的信号扩增，几乎没有荧光。结果表明，该系统提供了一种新的策略，可以进一步开发出一个体外诊断平台，以敏感，有效地检测CTC。
b'CIRDARCONATION肿瘤细胞（CTC）是用于转移性癌症检测和监测进展的有希望的生物标志物。但是，由于其低频和异质性，CTC的检测仍然具有挑战性。在此，我们根据使用可编程DNA杂交链反应（HCR）电路的信号扩增级联反应报告了一种生物启发的方法来检测单个癌细胞。我们使用这种方法使用抗HER2抗体（Trastuzumab）与引发剂DNA耦合，从而检测HER2 +癌细胞，从而引发了HCR级联反应，该HCR级联反应在细胞表面导致荧光信号。在4 \ XC2 \ XB0 C时，这种HCR检测方案在HER2细胞和外周血清细胞的背景下，在HER2 +细胞的膜上特别在HER2 +细胞的膜上进行了高效，特异性和敏感的信号扩增，这几乎是非荧光的。结果表明，该系统提供了一种新的策略，可以进一步开发出用于敏感有效检测CTC的体外诊断平台。