变性剂

变性剂可以稳定DNA吗？吡啶逆转酸性pH **

DNA的生物学作用与水溶液中的结构和稳定性密切相关。DNA的完全脱水或用较低极性的溶剂取代水会导致DNA结构发生很大变化[1]。溶液的离子强度的变化产生了显着的结构可塑性[2]，并且柜台性质的变化甚至可以逆转双链DNA稳定性的规范规则[3]。 某些渗透液，例如尿素，甲酰胺，氯化硫苷，二甲基硫氧化物或吡啶是化学变性剂[4]。 我们最近使用了微秒长的分子动力学（MD）模拟来证明PYR的非常强的变性特性与其通过在开放的，溶剂暴露的核碱基上堆叠捕获显微镜展开事件的能力有关[5]。 在这里，我们在另一种强大的变性剂的存在下探索了PYR的变性特性：pH。 在这项工作中，我们评估了这两种变性剂的效果是加性，合作或抗合作性的。 我们首先探索了具有不同GC含量的三种DNA双链体在中性pH值下的分泌特性（表1）。 图1（a，b）和补充表S1 所示的结果溶液的离子强度的变化产生了显着的结构可塑性[2]，并且柜台性质的变化甚至可以逆转双链DNA稳定性的规范规则[3]。某些渗透液，例如尿素，甲酰胺，氯化硫苷，二甲基硫氧化物或吡啶是化学变性剂[4]。我们最近使用了微秒长的分子动力学（MD）模拟来证明PYR的非常强的变性特性与其通过在开放的，溶剂暴露的核碱基上堆叠捕获显微镜展开事件的能力有关[5]。在这里，我们在另一种强大的变性剂的存在下探索了PYR的变性特性：pH。在这项工作中，我们评估了这两种变性剂的效果是加性，合作或抗合作性的。我们首先探索了具有不同GC含量的三种DNA双链体在中性pH值下的分泌特性（表1）。图1（a，b）和补充表S1