DNA的生物学作用与水溶液中的结构和稳定性密切相关。DNA的完全脱水或用较低极性的溶剂取代水会导致DNA结构发生很大变化[1]。溶液的离子强度的变化产生了显着的结构可塑性[2],并且柜台性质的变化甚至可以逆转双链DNA稳定性的规范规则[3]。 某些渗透液,例如尿素,甲酰胺,氯化硫苷,二甲基硫氧化物或吡啶是化学变性剂[4]。 我们最近使用了微秒长的分子动力学(MD)模拟来证明PYR的非常强的变性特性与其通过在开放的,溶剂暴露的核碱基上堆叠捕获显微镜展开事件的能力有关[5]。 在这里,我们在另一种强大的变性剂的存在下探索了PYR的变性特性:pH。 在这项工作中,我们评估了这两种变性剂的效果是加性,合作或抗合作性的。 我们首先探索了具有不同GC含量的三种DNA双链体在中性pH值下的分泌特性(表1)。 图1(a,b)和补充表S1 所示的结果溶液的离子强度的变化产生了显着的结构可塑性[2],并且柜台性质的变化甚至可以逆转双链DNA稳定性的规范规则[3]。某些渗透液,例如尿素,甲酰胺,氯化硫苷,二甲基硫氧化物或吡啶是化学变性剂[4]。我们最近使用了微秒长的分子动力学(MD)模拟来证明PYR的非常强的变性特性与其通过在开放的,溶剂暴露的核碱基上堆叠捕获显微镜展开事件的能力有关[5]。在这里,我们在另一种强大的变性剂的存在下探索了PYR的变性特性:pH。在这项工作中,我们评估了这两种变性剂的效果是加性,合作或抗合作性的。我们首先探索了具有不同GC含量的三种DNA双链体在中性pH值下的分泌特性(表1)。图1(a,b)和补充表S1
碎屑,然后保存并存储以进行后续填写。用于DNA工作的标本应直接存储在95%或100%乙醇中,以确保乙醇不包含诸如Ke Tones,醛,醛,甲醇或煤油之类的变性剂,这些乙醇对DNA有害。仔细阅读乙醇瓶上的标签将表明使用了哪些变性剂。通常,COM可获得的95%乙醇是首选的,因为它可能不包含任何变性剂。异丙醇可以降低为贬值剂。样品应在乙醇中存储在冰冻的或类似的合适的小瓶中,并应在常规冰箱(在–20°C下)中冷藏,或者在可能的情况下或常规冰箱(约4至8°C)中保存在使用。作为一个警告,福尔马林对DNA的工作非常有害,而用于DNA分析的蠕虫绝不能与福尔马林接触。有关收集方法的详细信息,请参见Gardner和Jiménez-Ruiz(2009)。
乙醇:分离的DNA中乙醇的存在可能导致DNA浓度高于其实际值和纯度值的偏差。污染超过7.5%乙醇Ca n阻止了ONT文库的准备。异丙醇:类似于乙醇污染,异丙醇污染直接影响连接化学的运行性能。edta ::它在纳米体中引起浓度和纯度测量的扰动,显示浓度更高。具有超过5 mM EDTA的污染可以防止库的制备。NACL:超过100毫米的污染可以防止库库的准备。氯化鸟苷:作为一种变性剂,它会影响纳米体测量值,尤其是260/230的比例。氯化氯化物污染超过100毫米,可以防止图书馆制备。鸟苷异硫氰酸盐:作为变性剂,它会破坏用纳米体进行的浓度和纯度测量。鸟苷异硫氰酸盐污染超过50 mm,可以防止库的制备。苯酚:分离的DNA中苯酚的存在可能导致DNA浓度高于纯度测量值的实际值和偏差。具有超过1%现象的污染物可以防止ONT文库制备。
2020 2021 % 变化与运营成本 百万美元 百万美元 2020 原料(玉米) 16,405 美元 30,823 美元 87.9% 酶、酵母和化学品 1,053 美元 1,191 美元 13.2% 变性剂 213 美元 549 美元 157.4% 天然气、电力、水 2,050 美元 3,164 美元 54.3% 直接人工 569 美元 640 美元 12.4% 维护和维修 452 美元 508 美元 12.4% 运输 130 美元 147 美元 12.4% GS&A 539 美元 606 美元 12.4% 总运营成本 21,411 美元 37,628 美元 75.7% 美元/加仑 1.57 美元 2.54 美元
摘要:淀粉样β肽(Aβ)在阿尔茨海默病(AD)的发病机制中起着关键作用,并对神经元产生毒性作用。目前可用于AD患者的治疗方案,例如乙酰胆碱酯酶抑制剂,只能缓解症状。膳食植物化学物质目前被用作辅助疗法,以加快其治疗效果。本研究旨在研究姜黄素和胡椒碱作为抗淀粉样变性剂的潜在生物活性化合物。应用分子对接进行计算机筛选过程,以预测姜黄素和胡椒碱配体与Aβ42肽结合时最可能的构象。分子对接筛选表明,姜黄素和胡椒碱可以以不同的结合亲和力与Aβ42肽结合。姜黄素对Aβ42肽具有结合亲和力,结合能为-5.6 kcal/mol,而胡椒碱的结合能为-5.4 kcal/mol。考虑到结合亲和力、与氨基酸的分子间相互作用、氢键和疏水性,姜黄素成为治疗 AD 的潜在先导化合物。关键词:姜黄素;胡椒碱;抗淀粉样蛋白生成;分子对接;计算机模拟摘要:阿米洛肽-β (Aβ) 肽与阿尔茨海默病 (EA) 的产生和神经元的作用有关。 EA 的实际情况,AChE 的抑制因素,síntomas 的单独作用。您可以探索如何通过饮食补充最有效的营养。我们致力于研究姜黄素和胡椒粉作为抗阿米洛药物的潜力。该分子利用姜黄素和胡椒粉与肽 Aβ42 的相互作用进行模拟。根据不同的喜好,我们可以计算出 Aβ42 肽的结果。姜黄素的能量为 -5,6 kcal/mol,而胡椒粉的能量为 -5,4 kcal/mol。结合氨基酸、分子间相互作用、除汗剂和除汗剂的结合,姜黄素手术与 EA 治疗相结合。帕拉布拉斯:姜黄;胡椒属;抗amiloideogénico; Acoplamiento 分子;计算机模拟
– – = 不适用。– = 数据不可用。1 包括炼油厂和油库或运往油库和管道的国内和海关清关外国原油库存。2 包括根据外国或商业储存协议持有的非美国库存。3 不包括位于“东北取暖油储备”、“东北地区精炼石油产品储备”和“纽约州战略燃料储备计划”中的库存。有关详细信息,请参阅附录 C。4 2020 年 4 月 10 日之前,这包括终端持有的丙烯库存。5 包括 NGPL 和 LRG(丙烷/丙烯除外)、煤油、沥青和道路用油的每周数据;以及基于月度数据的次要产品估计库存。6 国内原油产量包括租赁凝析油,使用美国本土 48 个州的短期预测和阿拉斯加最新的可用产量估计值进行估算。对于美国和美国本土 48 个州,每周原油产量估计值四舍五入到最接近的 1,000 桶/天 (b/d)。此更改是从四舍五入到最接近的 100,000 b/d。有关更多详细信息,请参阅附录 B 中的“通过模型获得的数据”。7 根据 EIA-806 报告,阿拉斯加每周 NGL 总产量。8 最新“石油供应月报”中天然汽油(不包括凝析油)和未加工油转移到原油供应量,加上每周凝析油产量减去每周凝析油库存变化量,然后将总数乘以 -1。9 以前称为未计入原油,这是一个平衡项目。从 2023 年 11 月 15 日的出版物开始,原油调整包括转移到原油供应量(第 4 行)。有关进一步解释,请参阅词汇表。 10 2010 年 6 月 4 日之前称为天然气液产量,包括对燃料乙醇和车用汽油混合成分的调整。11 包括变性剂(例如戊烷加)和其他可再生能源(例如生物柴油)。2020 年 4 月 10 日之前,包括其他含氧化合物(例如 ETBE 和 MTBE)。12 包括成品石油、半成品油、汽油混合成分、燃料乙醇、NGPL 和 LRG。13 包括基于月度数据的次要产品库存变化估计值。14 包括对氢气和其他碳氢化合物产量的月度调整。15 从产品供应中减去并转入原油供应的 NGL 和半成品油总桶数(第 4 行)。 16 总产品供应量 = 炼油厂的原油输入量(第 17 行)+ 其他供应产量(第 18 行)+ 净产品进口量(第 24 行)- 库存变化量(第 27 行)+ 调整量(第 28 行)+ 原油供应转移量(第 29 行)。17 参见表 2,脚注 3。18 丙烷产品供应量的计算不包括阿拉斯加生产的、已转移到原油中的丙烷(第 5 行)。19 其他石油产品供应量 = 总产品供应量(第 30 行)减去成品汽油(第 31 行)、煤油型喷气燃料(第 32 行)、馏分燃料油(第 33 行)、残渣燃料油(第 34 行)和丙烷/丙烯(第 35 行)的供应量。注:部分数据为估算值(请参阅来源以进行澄清)。由于独立四舍五入,数据可能未加总。差异和百分比变化使用未四舍五入的数字计算。数据来源:参见第 29 页。