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World File Search System叶绿体
意大利蜡菊 (Helichrysum italicum) 中的新叶绿体微卫星 (...
摘要：意大利蜡菊 (Roth) G. Don 是一种地中海药用植物，由于其独特的生物活性化合物，在化妆品、烹饪和制药领域具有巨大潜力。它最近被引入农业生态系统，增强了对自然种群遗传多样性的利用，尽管有限的分子标记使这一工作具有挑战性。在本研究中，针对叶绿体基因组中鉴定的所有 43 个 SSR（72.1% 单核苷酸、21% 二核苷酸和 6.9% 三核苷酸重复）设计了引物。使用十个精心挑选的 cpSSR 标记分析了来自 Cape Kamenjak（克罗地亚）和科西嘉岛（法国）的种群。从所有样本中扩增的初始 16 个 cpSSR 集合中，由于短长度多态性、大小同质性和无法通过等位基因长度检测到的核苷酸多态性，6 个 cpSSR 标记被删除。在检测到的 38 种单倍型中，有 32 种是其地理起源所独有的。在 Cape Kamenjak 种群中观察到的私有单倍型数量最多（检测到的 9 种中有 7 种）。根据聚类分析，Kamenjak 种群与 Capo Pertusato（南科西嘉岛）种群最为相似，尽管只有一个子单倍型是共享的。其他科西嘉种群彼此更相似。成功进行了 Helichrysum litoreum Guss. 和 Helichrysum arenarium (L.) Moench 的跨物种可移植性测试，并确定了私有等位基因。
叶绿体ATP合酶生物发生需要外围茎亚基ATPF和ATPG，以及通过OPR蛋白MDE1
叶绿体ATP合酶包含质体和核遗传来源的亚基。为了研究这种复合物的协调生物发生，我们通过筛选绿色藻类衣原体中的新型ATP合酶突变体，通过筛选高光灵敏度。我们在这里报告了影响两个外围茎亚基B和B 0的突变体的表征，该突变体由ATPF和ATPG基因编码，以及三个鉴定核因子MDE1的独立突变体，这些突变体稳定叶绿体编码的ATPE mRNA所需的核因子MDE1。全基因组测序显示在ATPG的3 0 UTR中插入了转座子插入，而质谱显示在此敲低ATPG突变体中，功能性ATP合酶的一小部分积累。相反，通过CRISPR-CAS9基因编辑获得的敲除ATPG突变体，完全防止ATP合酶功能和积累，这也是在ATPF框架转移突变体中观察到的。与主要类囊体蛋白酶的FTSH1-1突变体穿越ATP合酶突变体将ATPH鉴定为FTSH底物，并表明FTSH显着促进了ATP合酶亚基的一致积累。在MDE1突变体中，不存在ATPE转录物完全阻止ATP合酶的生物发生和光合作用。使用嵌合ATPE基因营救ATPE转录本的积累，我们证明了一种新型的八度肽重复（OPR）蛋白MDE1遗传靶向ATPE 5 0 UTR。从主要内部生物生物症（〜1.5 Gy）的角度来看，将MDE1募集到其ATPE靶标招募了一个核/叶绿体相互作用的典范，这些相互作用是在最近进化的，在叶绿体的祖先中，我的cs cs cs exestor higlophyceae的祖先，〜300。
RNA-Seq基因融合检测工具的荟萃分析 量表，新颖壁ches的高分辨率微生物分析 壳聚糖金纳米颗粒基于敏感的视觉检测组氨酸标记的重组蛋白 强化学习和工作记忆系统的双重过程障碍是生理焦虑中学习缺陷的基础 合成PPR蛋白的翻译激活阐明了拟南芥叶绿体中PSBA翻译的控制 在某些选定的白色念珠菌基因中对镜面重复序列的内部评估 生成人工智能执行基本的结构生物学建模 研究了模拟的两组分凝胶系统的组织再生 动物和机器人建模和模拟框架
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年2月2日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.09.09.03.556087 doi：Biorxiv Preprint
北极植物物种显示叶绿体DNA拷贝数
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使用 nrITS 和叶绿体 rbcL 基因序列对印度叶下珠进行 DNA 条形码编码和系统发育分析，以进行分子鉴定
叶下珠属植物因其生态和治疗意义而闻名。准确识别这些物种对于保护和研究目的至关重要。由于植物的表型可塑性以及在检测植物产品中的替代品或掺假物方面存在挑战，传统的分类学鉴定往往不够完善。因此，通过 DNA 条形码进行分子鉴定已成为草药产品质量控制和国际草药贸易的新标准。本研究使用 DNA 条形码工具来识别印度叶下珠属物种，重点关注 nr 内部转录间隔区 2 (ITS2) 和叶绿体 rbcL 基因。系统发育分析显示高度的遗传相似性和很强的系统发育关系。这些发现证实了与全球同类的遗传亲缘关系，突出了进化模式。ITS2 区域的结构使用最小自由能计算来验证物种鉴定。这项研究展示了如何将 rbcL 基因分析与基于 ITS2 的 DNA 条形码相结合来准确识别印度叶下珠属物种，这种方法增强了这些宝贵植物资源的可持续利用，确保了产品质量，最大限度地减少了掺假，并支持生物多样性保护。
Müller等。 - Aurora -A通过CDK12 1 阻止TRC JAX动物行为系统（JABS） 混合猪中等位基因特异性调节变化的多摩尼克表征1 质膜修复需要Septin细胞骨架 RNA-Seq基因融合检测工具的荟萃分析 量表，新颖壁ches的高分辨率微生物分析 壳聚糖金纳米颗粒基于敏感的视觉检测组氨酸标记的重组蛋白 强化学习和工作记忆系统的双重过程障碍是生理焦虑中学习缺陷的基础 合成PPR蛋白的翻译激活阐明了拟南芥叶绿体中PSBA翻译的控制 在某些选定的白色念珠菌基因中对镜面重复序列的内部评估 生成人工智能执行基本的结构生物学建模 研究了模拟的两组分凝胶系统的组织再生 动物和机器人建模和模拟框架
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该版本的版权持有人于2025年1月19日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.15.633177 doi：biorxiv preprint
濒危特有婆罗洲水果菠萝蜜 (Artocarpus tamaran Becc) 叶绿体基因组完整特征分析
塔玛拉菠萝蜜（Artocarpus tamaran Becc.）是桑科菠萝蜜属的一种，该属包含 74 种植物（POWO, 2024 ）。该树种树高可达 45 米，树干直径可达 1 米，板根可高达 3 米（Kochummen, 2000 ）。该物种是婆罗洲的特有物种，分布在沙捞越、沙巴、加里曼丹和文莱达鲁萨兰国，具体分布在低地至丘陵混合龙脑香科森林、河边、砂岩、粘土和冲积基质上（POWO, 2024；Jarrett, 1959 ）。它也曾在海拔 20 米至 1800 米的原始或古老的次生林和砍伐林中发现（Jarrett, 1959 ）。根据国际自然保护联盟 (IUCN) 的红色名录分类，Artocarpus tamaran 被列为易危 A2c（根据国际自然保护联盟的红色名录分类）（ IUCN, 2024 ）。该物种因栖息地丧失而濒临灭绝，栖息地已被改造成人工林、砍伐、烧毁和气候影响，例如在沙巴、砂拉越和加里曼丹（ IUCN, 2024 ； POWO, 2024 ）。该物种的树皮可用于生产纤维材料，用于生产布料和帽子（ Kulip, 2003 ； Fern2014 ）、新鲜水果和煮熟或烘烤后的可食用种子（ Lim, 2012 ）。该树干在当地术语中被称为“ terap ”，在建筑方面具有潜在的应用价值（ Kochummen，2000 年）。该树种的木材价格为 22.90 美元/立方米
成功建立了基于病毒复制元素的衣原体叶绿体中的外源基因表达系统
此预印本版的版权持有人于2024年11月27日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.11.26.625556 doi：biorxiv Preprint
通过CRISPR/CAS9和多个RAAVS 成功建立了基于病毒复制元素的衣原体叶绿体中的外源基因表达系统 散装转录组分析，inmoose，python中的综合多摩管开源环境 标题：在神经退行性疾病的小鼠模型中自动评估区域脑萎缩的工具 揭示了来自单个人类皮肤部位的共生菌群的多样性 探索1 ... 中的遗传转化和基因组编辑 诱惑：纵向微生物组研究的时间信息降低 白血病蛋白PHF6和PHIP形成一种染色质复合物，抑制髓样白血病 靶向trem2-tyrobp跨膜结合的药物筛查 Klebphacol：Klebsiella的社区驱动资源... 干细胞因子抑制purkinje细胞的调节 牛的牛外胚层细胞 丰富的测量结果揭示了人类肠道微生物组中的裂解与裂解性之间的平衡 稳定的登革热病毒2包膜亚基疫苗重定向中和抗体1
我们感谢Ben Humphreys，Gaya Amarasinghe，Daisy Leung和Ting Wang的评论和建议，Robert Fulton，Catrina Fronick，Paul Cliften提供了技术帮助。这项工作得到了Siteman Cancer Center的共享资源投资计划的部分支持。