1. 生物学程序和数据 细菌菌株和培养基 S3 生长抑制剂量反应试验 S3 细胞内 ATP 水平的量化 S4 脓肿分枝杆菌亚种倒置膜囊泡的制备 S4 ATP 合成试验以确定脓肿分枝杆菌 IMV 的 ATP 形成 S4 棋盘滴定试验 S5 细菌杀灭试验 S6 亚甲蓝试验 S6 生物膜测试 S7 巨噬细胞实验 S7 斑马鱼感染实验 S8 斑马鱼护理和道德声明 S9 显微镜和图像分析 S9 2. 计算程序和数据
摘要:F 1 F O -ATP合酶是结核分枝杆菌的生长和生存能力所必需的。bedaquiline在临床上验证了该目标。最近我们表明,酶旋转γ亚基的分枝杆菌特异性环在酶复合物内的ATP合成中起作用。在这里,我们报告了针对此γ亚基环针对的新型抗菌细菌的发现。生化和核磁共振研究表明,GAMF1通过与环的结合抑制ATP合酶活性。gamf1是杀菌性的,并且对多剂量和耐甲喹啉菌株具有活性。脚手架上的化学努力揭示了动态结构活动关系,并与纳摩尔势力传递了类似物。将GAMF1与Bedaquiline或新颖的日二氨基喹啉类似物结合起来显示出增强的,而无需在人类胚胎干细胞报告基因测定中诱导遗传毒性或表型变化。这些结果表明,GAMF1为发现新型抗结核F-ATP合酶抑制剂提供了有吸引力的铅。1个物理和数学科学学院,南洋技术大学,新加坡637371 Nanyang Link,新加坡共和国共和国;电子邮件:roderick@ntu.edu.sg
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可下可用(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2022 年 10 月 16 日发布。;https://doi.org/10.1101/2022.10.16.512417 doi:bioRxiv 预印本
大豆突变体 lox3 具有 Lox3 基因座中的突变等位基因,是利用 CRISPR/Cas9 系统通过定点诱变生成的。为了评估种子中 LOX3 活性降低的影响,检测了 lox3 在温度胁迫下的发芽能力。在所有温度条件下,lox3 种子都比野生型种子发芽更早。随着温度的升高,这种差异变得更加明显。随后,为了模拟种子的长期储存,通过将种子暴露在高温高湿条件下进行老化处理。虽然大多数野生型种子在老化处理后没有发芽,但大约 80% 的 lox3 种子发芽了。这表明 LOX3 活性的降低导致种子对长期储存的耐受性增强。为了阐明生理机制,对老化处理后的种子进行了测量,测量了通常用于评估脂质过氧化的丙二醛 (MDA) 含量。lox3 样品中的 MDA 含量低于野生型样品。这一结果表明 lox3 种子中的脂质过氧化降低了。为了评估基因表达水平,对 lox3 和野生型样本进行了转录组分析。转录组分析显示,野生型种子中应激反应基因的表达增加。这表明野生型种子比 lox3 种子受到的应激更严重。因此,我们证明种子中 LOX 活性的降低可能即使在高温胁迫或种子长期储存下也能保持发芽能力。日本大豆蛋白研究 23,35-40,2020。
炎症反应在肿瘤发生和癌变中都起着重要作用。在这项研究中,乳酸乳球菌亚乳球菌的继发代谢产物化合物。乳酸(LAC3),并通过分子对接和分子动力学(MD)分析筛选对COX-2受体的潜在抑制活性。抗炎剂Mofezolac和布洛芬用作阳性对照配体。结果表明5--((4-氨基-6-氨基-4-甲氧蛋白-4-基-1,3,5-三嗪-2-基)氨基)氨基] -2-甲基苯甲磺酸盐的甲基苯甲酸酯,该氢键在活性位点的Cox-2的Cox-2具有–9.0 kcal/mol/mol/mol/mol的亲和力的活性位点Tyr385。是COX-2抑制剂的另一个候选者,被指定为3-吲哚丙酸,在COX-2的重要残基Ser530上结合氢,亲和能量为–6.9 kcal/mol。确认结合特异性,还针对COX-1进行了分子对接分析。使用MD模拟确认结合稳定性和灵活性。此外,根据Lipinski的规则和煮熟的蛋型建模预测了潜在配体的毒性和溶解度。5- [((4-氨基-6-甲酚-4-基-1,3,5-三嗪-2-基)氨基] -2-甲基苯甲磺酸盐磺酸盐表明,通过胃肠道无源吸收的倾向倾向,而三3- indolopropropropropropionic Acid a intolointestinal tract均表现出较高的血液中脑溶液的概率。总而言之,这项研究通过分子对接分析确定了潜在化合物,该分析可以作为COX-2抑制剂开发。
西红柿在各个阶段的生长阶段都容易受到寒冷温度的损害。因此,重要的是要确定可以增强番茄耐受能力的遗传资源和基因。在这项研究中,使用了223个番茄加入的人群来识别植物对冷应激的敏感性或耐受性。对这些加入的转录组分析表明,蔗糖合酶基因家族的成员SUS3是由冷应激诱导的。我们通过过表达(OE)和RNA干扰(RNAI)进一步研究了SUS3在冷应激中的作用。与野生型相比,SUS3 -OE线累积的MDA和电解质泄漏较少,脯氨酸和可溶性糖,维持SOD和CAT的较高活性,降低了超氧化物自由基,在寒冷下造成的膜损伤较少。因此,我们的发现表明SUS3在对冷应激的反应中起着至关重要的作用。本研究表明SUS3可以成为基因工程和改进项目的直接目标,旨在增强番茄作物的冷耐受性。
二芳二酸(L -IDOA)残基硫酸乙酰乙酰胺(HS)和硫酸真皮(DS)中的残基。在MPS I中,低水平的溶酶体IDUA活性会导致HS和DS积聚在细胞中,从而导致包括大脑在内的多个组织和器官的进行性疾病。更严重的MP形式我通常会在生命的前十年内导致智力低下和过早死亡。有两种可用的MPS I:I)使用重组人IDUA静脉注射的酶替代疗法,[2]和II)造血干细胞移植以从健康移植细胞中产生IDUA,但是,两者都有实质性的限制。例如,替代酶不能越过血脑屏障(BBB),因此对神经系统症状没有影响,而造血干细胞移植具有很大的发病率和死亡风险。此外,两种治疗方法都非常昂贵。因此,需要越过BBB并缓解MPS I的神经系统症状的小分子药物的发展是可取的。小分子抑制剂目前正在探索作为溶酶体储存疾病的治疗方法。例如,与累积底物生物合成有关的酶的抑制作用已用于底物还原疗法。最近,研究了有机固核药物Ebselen(2-苯基1,2-苯甲甲硅烷二唑-3(2 h)-One),作为MPS I的潜在底物还原治疗。[3] Ebselen通过抑制L -IDOA生物合成降低了MPS I细胞中的糖胺聚糖积聚。但是,它无法减少MPS I鼠标模型中的糖胺聚糖积累。治疗溶酶体储存疾病的另一种常见小分子方法是药理学伴侣治疗(PCT)。在PCT中,伴侣分子通常是活性位点定向抑制剂,可以结合和稳定突变酶以防止其降解并改善运输到溶酶体。[4]一次在溶酶体的低pH环境中,伴侣分离导致
1. 定义问题(identify and define problem) 2. 找寻资料(research the need or problem) 3. 发展解决方案(develop possible solutions) 4. 选择最佳方案(select the best possible solution) 5. 制作原型(construct a prototype) 6. 测试与评估(test and evaluate the solution) 7. 沟通方案(communicate the solution) 8. 再设计(redesign) 9. 完成(completion)