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MenFive 疫苗（脑膜炎球菌 (A, C, Y, W, X) ...
第 1 部分：摘要 MenFive [脑膜炎球菌 (A、C、Y、W、X) 多糖结合疫苗（冻干）]（脑膜炎奈瑟菌多糖群 A、C、Y、W 和 X 结合疫苗）是一种五价脑膜炎球菌多糖结合疫苗，由脑膜炎奈瑟菌荚膜多糖 A、C、Y、W 和 X 组成，每个多糖都与载体蛋白结合。脑膜炎奈瑟菌血清群 A 和 X 多糖分别与破伤风类毒素 (TT) 结合，而 C、Y 和 W 多糖与交叉反应物质 197 (CRM197) 结合。MenFive 疫苗由印度血清研究所 (Serum Institute of India Pvt) 生产。 Ltd, 212/2 Hadapsar, Pune 411028, Maharashtra, 印度 食品药品管理局的人用疫苗注册指南定义了疫苗的具体评估机制，对质量、安全性和有效性有着严格的标准。FDA 对 MenFive 疫苗的营销授权基于依赖路径，其中对提交的通用技术文件 (CTD) 档案的模块 1 至模块 5 进行了简要审查，以确定经 WHO 预审的 MenFive 疫苗的质量、安全性、有效性和同一性。此外，根据加纳药品安全监测指南，提交并评估了一份风险管理计划 (RMP)。申请人令人满意地概述了他们的药物警戒计划和安全问题或风险最小化措施，以确定如何识别产品风险的方法以及将采取哪些措施来监测和降低加纳的此类风险。本报告第 2 部分展示了所有已接受的 MenFive 介绍。第 3 部分、第 4 部分和第 5 部分分别介绍了已批准的患者信息手册 (PIL)、产品特性摘要 (SmPC) 和已批准的标签。第 6 部分介绍了有关 MenFive 疫苗质量、非临床和临床方面的科学讨论。第 7 部分介绍了 FDA 批准 MenFive 疫苗的详细步骤。MenFive 疫苗获得上市许可后，尚未采取任何行动或步骤。
基于狂犬病毒的 COVID-19 疫苗 CORAVAX™ 可诱导高水平的针对 SARS-CoV-2 的中和抗体。
引言严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 是一种人畜共患病原体，属于 Betacoronavirus 家族，于 2019 年 12 月在中国武汉出现。SARS-CoV-2 迅速席卷全球，引发冠状病毒病 (COVID-19) 大流行，感染超过 2240 万人，导致至少 789,455 人死亡（约翰霍普金斯大学，2020 年 8 月 20 日访问）1。在七种导致人类呼吸道疾病的冠状病毒中，有四种仅引起轻度感染（229E、NL63、OC43 和 HKU1），三种是高致病性（SARS-CoV、MERS 和 SARS-CoV-2）。SARS-CoV-2 最有可能起源于蝙蝠，并通过中间动物宿主传播给人类，就像其他高致病性人类冠状病毒 MERS 和 SARS-CoV 2 一样。 SARS-CoV-2 高传染性和致病性的分子决定因素仍是假设的，但刺突蛋白中获得弗林蛋白酶切割位点以及受体结合域发生突变使得刺突蛋白能够与人血管紧张素转换酶 (ACE2) 结合似乎是关键/重要因素 3 – 5 。这些以及其他可能存在的分子特征使得 SARS-CoV-2 成为三种致病冠状病毒中传播性最强的。与 SARS 不同，在有效疫苗问世之前，SARS-CoV-2 可能不会被消灭甚至无法控制。已发现 ACE2 受体介导 SARS-CoV-2 以及其他冠状病毒（包括 NL63 和 SARS-CoV）进入细胞，SARS-CoV-2 与后者有 76% 的氨基酸同一性 5 。表达 ACE2 的细胞易受 SARS-CoV-2 刺突 (S) 糖蛋白的影响，该糖蛋白从 SARS-CoV-2 病毒体膜表面伸出并充当配体 2 。在人类中，中和抗体和/或 T 细胞免疫反应是针对几种 SARS-CoV-2 蛋白产生的，但主要针对 S 蛋白，这表明 S 蛋白特异性免疫反应在保护中起着重要作用 6 。因此，目前大多数疫苗方法都使用 SARS-CoV S 蛋白或其部分作为疫苗免疫原 7 。
肉芽杆菌的比较基因组分析提供了对基因组多样性的见解
Cutibacterium Granulosum是一种在人皮肤上发现的共生细菌，以前称为粒细胞杆菌，很少引起感染，通常被认为是非致病性的。最近的研究表明，多药抗质粒PTZC1在颗粒梭状芽孢杆菌和痤疮痤疮之间的转移性，后者是手术部位感染中的机会性病原体。然而，关于颗粒的基因组缺乏明显的研究，并且该物种的遗传景观在很大程度上尚未大脑。我们通过分析总共30种元基因组组装基因组（MAGS）和从公共数据库中获取的分离基因组以及本研究中产生的基因组的基因组特征和进化结构。鉴定出用于颗粒梭状芽孢杆菌的6,077个基因的泛基因组。值得注意的是，“云基因”占泛基因组的62.38％。与动员相关的基因：预言，转座子[x]，防御机制[V]以及复制，重组和修复[L]在云基因组中富集。系统生物学分析显示了两个不同的单层，突出了颗粒的基因组多样性。通过平均核苷酸同一性（ANI）值的分布进一步证实了基因组多样性。颗粒梭菌的功能分布分析揭示了广泛的潜在抗生素耐药性基因（ARGS）和毒力因子，这表明其对各种环境挑战的潜在耐受性。CRISPR-CAS系统的亚型I-E在这些基因组中最丰富，这在痤疮梭菌基因组中也检测到了这一特征。亚型I-E在这些基因组中最丰富，这在痤疮梭菌基因组中也检测到了这一特征。鉴于皮肤微生物组中颗粒梭菌菌株的广泛分布，我们的发现为我们对遗传多样性的广泛理解做出了重大贡献，这可能为研究痤疮诸如痤疮等疾病的机制和治疗方法开辟了新的途径。
利用生成人工智能解锁从头抗体设计
生成式人工智能 (AI) 有可能大大提高抗体设计的速度、质量和可控性。传统的从头抗体发现需要耗费大量时间和资源来筛选大型免疫或合成库。这些方法对输出序列的控制也很少，这可能导致先导候选药物结合效果不佳且可开发性较差。几个研究小组已经引入了生成式抗体设计模型，并获得了有希望的计算机证据 [1–10]，但是，没有一种方法能够通过实验验证基于 AI 的生成式从头抗体设计。在这里，我们使用生成式深度学习模型以零样本方式从头设计针对三个不同靶标的抗体，其中所有设计都是单轮模型生成的结果，没有后续优化。具体来说，我们使用高通量湿实验室功能筛选了超过 100 万种设计用于结合人表皮生长因子受体 2 (HER2) 的抗体变体。我们的模型成功设计了抗体重链中的所有 CDR，并计算了通过结合校准的似然度。我们分别实现了重链 CDR3 (HCDR3) 和 HCDR123 设计的 10.6% 和 1.8% 的结合率，比从观察到的抗体空间 (OAS) 中随机抽样的 HCDR3 和 HCDR123 高四倍和十一倍 [11]。我们进一步使用表面等离子体共振 (SPR) 表征了 421 种 AI 设计的结合剂，发现其中三种比治疗性抗体曲妥珠单抗结合更紧密。这些结合剂高度多样化，与已知抗体的序列同一性低，并采用可变的结构构象。此外，这些结合剂在我们之前引入的自然性指标 [12] 上得分很高，表明它们可能具有理想的可开发性特征和低免疫原性。我们开源 1 HER2 结合剂并报告测得的结合亲和力。这些结果为利用生成式人工智能和高通量实验加速新治疗靶点的药物创造开辟了道路。
国际寄生虫学杂志 - Wheeler Lab
利什曼病是一种媒介传播疾病，由利什曼原虫属感染引起，利什曼原虫是专性细胞内原虫寄生虫。目前，人类疫苗尚不可用，主要治疗严重依赖全身用药，这些药物通常配方不理想且毒性很大，因此新药成为受疾病困扰的中低收入国家的高度优先事项，但由于利润率不高，大多数制药公司的议程中新药的优先级较低。需要新的方法来加速新药的发现或现有药物的重新定位。为了应对这一挑战，我们的研究旨在确定临床相关的利什曼原虫种之间共享的潜在蛋白质靶点。我们采用了减法蛋白质组学和比较基因组学方法，整合高通量多组学数据，根据不同的药物可药性指标对这些靶点进行分类。这项工作对 14 种致病性利什曼原虫种的 6502 个蛋白质靶点直系同源组进行了排名。在排名前 20 位的组中，已知具有吸引力药物靶标的代谢过程被重新发现，包括泛素化途径、氨酰基-tRNA 合成酶和嘌呤合成。此外，我们还发现了新的有希望的靶标，例如烟酸磷酸核糖转移酶和二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶。这些组表现出有吸引力的药物特性，包括与人类宿主蛋白质组的序列同一性小于 40%、预测的必要性、结构分类为高度药物化或药物化，以及在无鞭毛体形式中的表达水平高于第 50 个百分位。这项工作中提供的资源还代表了有关锥虫生物学的综合数据集合。
猫栉首蚤的分子鉴定...
文章历史：24-704 收到日期：2024 年 11 月 10 日 修订日期：2024 年 12 月 20 日 接受日期：2024 年 12 月 24 日 在线优先：2025 年 1 月 7 日 摘要 本研究旨在从分子水平上鉴别栉首蚤种类并从寄生在越南狗和猫身上的跳蚤中检测犬复孔绦虫。研究样本包括从狗和猫身上采集的 20 个混合跳蚤样本。方法上，从跳蚤中提取的 DNA 用于 PCR 扩增跳蚤 18S rDNA 基因的 1200bp 区域和犬复孔绦虫 28S rDNA 基因的 653bp 片段。随后，选择两个跳蚤阳性 PCR 产物和两个犬复孔绦虫阳性 PCR 产物（分别来自狗和猫）进行系统发育树分析。结果表明，在第一次 PCR 中所有 20 个样本均为阳性，显示 1200bp 的条带，与跳蚤 18S rDNA 基因的估计大小相对应。此外，在第二次 PCR 中，20 个样本中有 4 个显示约 653bp 的条带，与 D. caninum 28S rDNA 基因的预期大小一致。系统发育分析进一步表明分离的跳蚤为猫栉首蚤。本研究中两种 D. caninum 分离株之间的百分比同一性为 94.1%，表明这两种分离株属于两种不同的基因型（猫栉首蚤和犬栉首蚤基因型）。本研究是越南首次报告从狗和猫跳蚤中检测出 D. caninum 绦虫。此外，本研究还提醒狗和猫的主人，从他们的伴侣动物身上消灭跳蚤以防止感染复孔绦虫非常重要。关键词: Ctenocephalides sp., Dipylidium caninum, 狗, 猫, 越南
接触依赖性生长抑制 (CDI) 系统部署了一大批多态离子载体毒素，用于细菌间竞争
接触依赖性生长抑制 (CDI) 是一种由 CdiA 效应蛋白介导的广泛存在的细菌间竞争形式。CdiA 存在于抑制剂细胞表面，并在接触时将其有毒的 C 末端区域 (CdiA-CT) 传递到邻近的细菌中。抑制剂细胞还会产生 CdiI 免疫蛋白，这些蛋白可中和 CdiA-CT 毒素以防止自我抑制。在这里，我们描述了一组不同的 CDI 离子载体毒素，它们会消散目标细菌中的跨膜电位。这些 CdiA-CT 毒素由基于 AlphaFold2 建模的两个不同域组成。C 末端离子载体域都预测会形成能够跨越细胞膜的五螺旋束。N 末端“进入”域的结构各不相同，似乎劫持了不同的整合膜蛋白，以促进毒素组装到脂质双层中。大肠杆菌分离株部署的 CDI 离子载体根据其进入域结构分为六大类。比较序列分析鉴定出第 1 组和第 3 组（AcrB）、第 2 组（SecY）和第 4 组（YciB）的离子载体毒素受体蛋白。利用正向遗传学方法，我们鉴定出第 5 组和第 6 组离子载体的新受体。第 5 组利用由 puuP 和 plaP 编码的同源腐胺输入蛋白，第 6 组毒素识别由旁系同源 dtpA 和 dtpB 基因编码的二肽/三肽转运蛋白。最后，我们发现离子载体结构域表现出显著的组内序列变异，特别是在预测与 CdiI 相互作用的位置。因此，相应的免疫蛋白也具有高度多态性，通常与同一组的成员仅共享约 30% 的序列同一性。竞争实验证实，免疫蛋白对其同源离子载体具有特异性，无法抵御来自同一组的其他毒素。这种蛋白质相互作用网络的特异性为大肠杆菌分离株之间的自体/非自体识别提供了一种机制。
长的体细胞DNA重复扩张驱动亨廷顿疾病的神经退行性
亨廷顿疾病（HD）是一种致命的遗传疾病，其中大多数纹状体投射神经元（SPN）退化。有关HD发病机理的中心生物学问题是亨廷顿蛋白（HTT）基因中引起疾病的DNA重复膨胀（CAG N）如何导致数十年的明显潜伏期后神经变性。遗传的HTT等位基因具有更长的CAG重复急性疾病发作；这种重复的长度也随时间变化，产生了体细胞镶嵌性，调节DNA重复稳定性的基因可能会影响高清年龄。了解细胞的CAG重复长度与其生物学状态之间的关系，我们开发了一种单细胞方法，用于测量CAG重复长度以及全基因组RNA的表达。我们发现，HTT CAG重复在HD-vulnerable SPN中从40-45个CAG扩展到100-500+ CAG，而在其他纹状体细胞类型中则不扩展，而这些长的DNA重复扩展在不同时间通过单个SPN获得。令人惊讶的是，从40个CAGS的体细胞膨胀对基因表达没有明显的影响 - 但是具有150-500+ CAGS的神经元具有深刻的基因表达变化。这些表达的变化涉及数百个基因，并在进一步的CAG重复扩张旁边升级，侵蚀了阳性，然后神经元同一性的负面特征，并在衰老/凋亡基因的表达中达到顶峰。跨高清阶段的纹状体神经元丧失率反映了神经元进入该生物学变形状态的速率。我们得出的结论是，在HD过程中的任何时候，大多数神经元具有无害的（但不稳定的）亨廷顿基因，而HD发病机理几乎是神经元生命的DNA过程。我们的结果表明，纹状体神经元中的HTT CAG重复进行数十年的生物学安静膨胀，因此，由于它们异步越过高阈值，因此SPN会使SPN迅速和异步变性。
摘要。 Wijayanti C，Suryadarma P，Mubarik NR。 2024年。从Simadu菠萝RO
摘要。Wijayanti C，Suryadarma P，Mubarik NR。2024。从Simadu菠萝根分离的辅助细菌的整个基因组测序。生物多样性25：4860-4869。铁载体是由细菌合成的有机化合物，可充当铁螯合配体，促进铁进入细胞的溶解和转运。生产细菌在各个研究和应用领域都具有重大好处。最近的一项研究调查了来自印度尼西亚西爪哇省Subang区的Simadu菠萝根的产生铁载细菌M7分离物。这项研究旨在分析M7分离株通过基因组挖掘的完整基因组序列的铁载体生物合成基因簇（BGC）。对菌株型锰氧基lldra6的比较基因组分析表明，M7分离株具有相似的鸟嘌呤 - 酪氨酸（GC）含量，其序列长度较长，总序列总计为4,447,159 bp。使用平均核苷酸同一性（ANI）计算的基因组比较表明，M7分离株的基因组相似性为98.82％，与菌株P. manganoxydans lldra6相似。此外，M7分离株的基因组包含铁采集和代谢的系统，涉及调节铁的机制。M7分离株中的特定区域通过非核糖体肽合成酶合成酶的铁载体（NIS）途径编码负责二级载体生物合成蛋白的IUCA/IUCC家族。这种遗传特征可能会引起并发的蛋白质表达，并有可能增强体力指数的积累。关于铁载体BGC，该分离物显示出与stuartii的最高相似性，遗传冗余含量差异。此外，与Stuartii的P. Stuartii不同，M7分离株的病原体预测结果表明它对人类不是致病性的，该预测是致病性的。新的铁载体产生细菌M7分离物具有核心生物合成基因的复制，代表了支持铁载体生物合成的遗传冗余。
在Asin的温泉中隔离嗜热细菌，...
抽象的背景和目标：嗜热细菌的研究较少，但由于它们产生工业酶的能力，它们是重要的微生物。材料和方法：在这项研究中，从Asin，Tuba，Benguet的温泉中分离了嗜热细菌。一种可以忍受高温的细菌的特征是形态学，生物化学和其16S rRNA基因的测序。筛选分离株的蛋白酶和淀粉酶活性。研究了分离株的系统发育隶属关系。结果：具有耐受高温能力的细菌被确定为杆菌。通过其16S rRNA基因的形态，生物化学和测序。对序列的爆炸搜索分析显示了与芽孢杆菌SP的最大同一性（99％和100％相似性）。对分离株的系统发育分析揭示了与嗜热芽孢杆菌物种密切相关的。结论：该研究证实了分离的芽孢杆菌sp。是真正的嗜热剂，可能是可为食品工业利用的热稳定淀粉酶的来源。在世界范围内引言，可以找到微生物。如果动植物具有数百万种，则是微生物。这些是我们肉眼看不到的生物。因此，需要显微镜才能查看它们。他们可以在不同的环境中生存。有些人可以在蒸汽通风口，沸腾的泥锅和其他的极端情况下壮成长。微生物还喜欢水，土壤，空气和其他生物内部（锡安国家公园）。细菌是可以在不同条件不同的环境中繁衍生息的微生物之一。考虑的一个条件是环境的温度。因此，细菌可以表现出耐受的温度范围。来自在寒冷温度下生长的精神噬菌体，在中等温度下生长的微生物和在高温下生长的嗜热物（Pandey，A。et al。2014; Trimulyono，G。等。2018）。这项研究的重点是嗜热。它们是极端环境中丰富的细菌。它们可以在高温下生存。它们可以在地球的不同加热地理区域中找到，例如温泉，水热通风孔等（NZQA）。它们的最佳生长温度为50-55°C，但可以在40–60°C的范围内生长（Gleeson等人。2013）。进行了几项对嗜热的研究。此外，正如Reichle在他的研究中所说的那样，在研究之前