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卵菌作为生物防治剂：揭示其在植物病害防治中的潜力和机制 Li Y 1* 、Ahmadi F 2* 、Wan S 1 和 Kariman K 2 1
植物病害爆发代表着全球粮食安全和环境可持续性的重大挑战，导致初级生产力下降、生物多样性减少，以及全球严重的粮食/饲料短缺。合成杀菌剂的滥用已经对人类健康和生态系统造成了重大危害。某些人类疾病，如阿尔茨海默氏症和自闭症，在过去几十年中急剧上升，这一趋势部分归因于现代农业和园艺中杀菌剂的使用/过度使用。鉴于这些令人担忧的迹象，现在应该重新考虑植物病害管理策略了。使用某些有益微生物（称为生物防治剂）有望成为对抗植物病原体的环保方法。卵菌通常被视为植物界的坏人，通过晚疫病、猝倒病和枯萎病等破坏性疾病造成混乱，这可能会造成灾难性的后果，例如爱尔兰马铃薯饥荒。然而，并非所有卵菌都是有害的！有些菌是伪装的好家伙，显示出帮助我们对抗植物疾病的潜力，可以作为有效的生物防治剂。了解生物防治卵菌保护作用的潜在机制对于实现理想结果和制定创新策略至关重要。卵菌的生物防治机制可分为五类：i）菌寄生，ii）分泌溶解酶，iii）与病原体竞争营养和空间，iv）诱导系统抗性（ISR），v）产生注射细胞（枪细胞）。本综述阐明了卵菌采用的生物防治机制，强调了它们的潜在实际意义以及对植物生长的积极影响。本文还讨论了影响生物防治卵菌功效的土壤和环境因素，以及旨在提高其生物防治效率或扩大目标病原体范围的各种策略。尽管对生物防治卵菌的了解取得了进展，但由于受环境条件、土壤类型、接种物活力、竞争微生物的影响，其田间表现不一致，因此其商业应用面临挑战。通过开发稳定的配方、基因改造、合成生物学、结合多种菌株以及与其他农艺实践相结合来提高生物防治卵菌的功效，可以帮助克服这些挑战并促进其在可持续农业中的应用。进行全面的风险评估以避免非目标效应，并简化监管审批流程也至关重要。了解生物防治卵菌如何抵抗植物病原体将提高我们对有益和有害微生物之间相互作用的基本认识，增强我们预测受其影响的植物疾病发展动态的能力
转化系统，基因沉默和基因编辑技术
卵骨是一组多样的孢子形成生物，包括数百种臭名昭著的病原体。其中几个在全球隔离名单上，严格受国家和国际法律的监管，以防止其传播（Rossmann等人。，2021）。宿主包括主要的栽培鱼类和植物物种，以及天然生态系统中的许多动物和植物物种（Cao等人，2012年； Fern Andez-Ben Eitez等。，2008年； Kamoun等。，2015年； van den Berg等。，2013年）。卵形构成了一种分类学不同的和大的真核微生物，它与真菌具有某些生理和形态学特征（例如，菌丝的形成和不同的目的孢子类型），但在系统源上是与Heterokont Algae（Baldauf等人（Baldauf等，2000; latijnhouers et and; <，2003）。卵菌和真菌可以通过只有卵菌具有的几种生化和细胞学特征来区分：a）纤维素是其菌丝壁的主要微纤维成分； b）含有磷酸化的B - （1,3） - 米麦葡萄糖的细胞质致密体/纤维打印液泡； c）在配子形成之前的减数分裂的二倍体thalli； d）线粒体带有肾小管crista；最终e）A -ε-二氨基二酰胺酸赖氨酸合成途径（Beakes等，2012年）。在其系统发育多样性中反映了卵形壮成长的大量环境条件和宿主。，2017年）。，2012年； de Bruijn等。，2012年； Fabro等。，2011年）。在过去的几十年中，宿主的卵形相互作用研究结合了基因组学和转录组学对卵菌如何感染其宿主有了充分的了解（Burra等人。意识到许多相互作用的分子的作用对于针对性的管理策略而言至关重要。已经确定，卵蛋白分泌了一系列效应子蛋白，可修饰宿主的免疫系统以促进感染（Bozkurt等人然而，尚未在感染过程中由不同的卵菌病原体产生的大量分子。用于对这些体内的功能分析，以基因修改卵菌的技术，例如RNAi（Saraiva等，2014； Whisson等人，2005年），稳定的转换（Judelson等人。，1993）或CRISPR/CAS（Fang and Tyler，2016年）至关重要。与真菌相比，卵形的分子技术的发展速度较慢，并且与真菌相比，目前仅限于相对较少的物种，并且效率低。由于卵菌中的异质性，需要针对每个物种以及在物种中优化每个菌株的转移方案。因此是
多种气候变化压力源减少了砾石卵鱼物种的出现成功并改变了时间出现模式
气候变化对溪流沉积物，水文和温度动态的深远影响将加剧许多物种对栖息地条件的影响，尤其是那些依靠低蠕虫区域的早期生命阶段的栖息地条件，例如砾石散发型鱼类。Due to the complex and interactive nature of multiple stressor effects, we employed large-scale outdoor mesocosms to systemically test how the reproductive success of three gravel-spawning fish species brown trout ( Salmo trutta ), nase, ( Chrondrostoma nasus ) and Danube salmon ( Hucho hucho ) was affected by individual and combined effects of warming ( + 3 – 4 ◦ C), fine sediment (increase以<0.85毫米x 22％）和低流量（八倍排出）。细沉积物对所有三种物种的出现率和煎炸长度最大，在棕鳟中将出现率降低到零，Nase的9％，多瑙河鲑鱼中的出现速率降低了4％。通过细沉积物造成的出现死亡率明显地通过了，这表明由于缺氧引起的负面影响严重加剧了昆虫。变暖仅作为单个压力源具有较小的作用，但是低流量会降低春季产卵物种Nase和多瑙河鲑鱼的出现速率，分别达到8和50％。在包括细沉积物在内的联合处理中，即使在塞浦路斯物种Nase中，这三种物种的出现成功也反应良好，这在压力源之间在孵化成功方面几乎没有互动效应。变暖和细腻的沉积物也导致了炸薯条的早期出现，这意味着有可用的食品资源有异步的风险。这项研究极大地表明，气候变化对砾石卵鱼物种的再生成功产生有害影响，而与分类学或生态特征无关。
利用 CRISPR/Cas9 系统对植物和真菌基因组进行编辑，增强植物抗病能力
真菌和卵菌病原体的破坏性导致农作物产量大幅下降，这些病原体继续威胁着全球粮食安全。尽管人们已经使用化学和文化控制来保护农作物，但这些措施需要持续的成本和时间，而且植物病原体对杀菌剂的抗性报道也越来越多。保护农作物免受植物病原体侵害的最有效方法是培育抗病品种。然而，传统的育种方法既费力又费时。最近，CRISPR/Cas9 系统已被用于增强水稻、可可、小麦、番茄和葡萄等不同作物的抗病性。该系统允许通过 RNA 引导的 DNA 内切酶活性对各种生物进行精确的基因组编辑。除了作物的基因组编辑外，编辑真菌和卵菌病原体的基因组也可以为植物病害管理提供新的策略。本综述重点介绍了最近使用 CRISPR/Cas9 系统对植物抗真菌和卵菌病原体的研究。对于长期植物病害管理，利用 CRISPR/Cas9 针对多种植物抗病机制以及通过该系统探测真菌和卵菌基因组所获得的见解将成为有效的方法。
2020 年 2 月网络研讨会期间提出的问题的答复
清洁和消毒设备以去除球虫卵囊（卵）是一项挑战，因为卵囊很坚韧，并且能抵抗许多常见消毒剂。我们将为您提供清洁和消毒的一般准则，这将有助于减少设备上的卵囊数量，但可能无法消除它们。1. 开始之前，将设备移离您饲养鸟类的地方。2. 首先，使用大量水和一些洗洁精或其他常见清洁剂洗去污垢和大部分球虫卵囊（卵）。让设备彻底干燥后再进行消毒步骤。3. 然后，根据标签说明使用消毒剂。EPA 未将任何消毒剂标记为可有效对抗球虫或其他寄生虫，因此请选择可有效对抗沙门氏菌和禽流感病毒的消毒剂（标签上有此信息）。务必让产品保持所需的接触时间。 4. 最后，让设备在阳光下或其他炎热环境中晾干，例如封闭的棚子。 5. 作为额外的预防措施，利用“停机时间”进一步减少任何残留的细菌：将设备晾干后放在无虫害的房间中几天，然后再在饲养鸟类的地方使用该设备。
细胞骨架成分的先天突变引起DNA dna甲基化...
uhrf1在受精后主要迁移到卵和胚胎中的细胞质，其中少量的UHRF1在某些区域（例如ICR）中维持甲基化修饰的细胞核中剩余少量。另一方面，除了受精后立即卵和胚胎外，所有UHRF1均易位到细胞核中，并在与细胞分裂相关的DNA复制过程中复制甲基化修饰。由于使用卵的实验受到局限性，因此研究小组使用人类培养的细胞发现NLRP5和OOEEP与构成SCMC的核心蛋白之间的结合。研究小组还产生了一条细胞系，可以通过药物诱导的诱导UHRF1（称为Cuhrf1：图1），该细胞系已被修饰以将其定位为细胞质，就像卵子一样，并检查了Cuhrf1在NLRP5和OOEP存在下CuHRF1变化的蛋白质稳定性。我们发现，在OOEEP存在下，CuHRF1的稳定性不会改变，但是在NLRP5存在下，Cuhrf1的稳定性增加了两倍以上（图2）。我们还发现，NLRP5缺陷小鼠的卵中的细胞质和细胞核中UHRF1蛋白的量均降低。该结果表明，在易位进入细胞核后，稳定的UHRF1的一部分可能稳定存在。
使用牛津纳米孔扩增子测序的温室灌溉水中真菌和卵菌病原体的早期评估
水传播植物的致病真菌和卵菌是温室生产系统中的主要威胁。对这些病原体的早期检测和量化将使我们能够及时治疗所需的经济和生物阈值，从而改善有效的疾病管理。在这里，我们使用了牛津纳米孢子的扩增子来分析从用于生长番茄，黄瓜和Aeschynanthus sp的温室收集的灌溉水中的微生物群落。真菌和卵形群落的特征是使用放大整体内部转录垫片（ITS）区域的引物。为了评估小兵测序的灵敏度，我们将串行稀释的模拟DNA刺激到图书馆制备之前从温室水样品中分离的DNA中。真菌和卵骨读数的相对丰盛在温室灌溉水中和来自番茄番茄的设置中的水样中与众不同。在相应的连续稀释样品中衍生出的源自真菌和卵形模拟群落的序列读数是成比例的，因此确认了最小值扩增子测序对环境监测的适用性。通过使用尖峰标准来测试使用小兵测试定量的可靠性，我们发现样品中尖峰ins的检测受到了真菌或卵形DNA的背景量的高度影响。我们观察到，与较长的尖峰（> 790bp）相比，我们大多数稀释液的长度较短（538bp）的尖峰在我们的大部分稀释液中产生。此外，相对于稀释序列，序列读数不均匀，并且在具有最高DNA浓度的背景样品中最不可检索，这表明性能的动态范围狭窄。我们建议对小兵测序进行连续的基准测试，以改善未来快速植物性诊断和监测的定量元编码工作。
表征两个卫星DNA家族在卵形植物病原体植物质体的基因组中
卫星DNA是一类重复序列，在大多数真核生物中的串联重复单元中都组织起来。长期以来被视为selfh dNA，现在提出了卫星序列有助于基因组完整性。尽管由于基因组数据的匮乏和组装高度保守的卫星阵列而尚未在卵菌中研究卫星DNA，但尚未在卵菌中研究卫星DNA。却获得有关卵菌病原体基因组的结构和演变的知识，对于理解适应其环境的机制以及提出有效的疾病控制策略至关重要。phytophthora寄生虫基因组的从头组装是一种重要的卵植物病原体，导致鉴定了几个串联重复的序列的家族，大小，拷贝数和序列保守序列变化。其中，两个大量的家庭，指定为PPSAT1和PPSAT2，显示了卫星DNA的典型特征，并被统称为PPSAT。这两个卫星家族的长度，序列，组织，基因组环境和进化动力学不同。PPSAT1，但不是PPSAT2，呈现了Oomycetes中的同源物。这一观察结果以及PPSAT家族的转录本的表征表明，这些卫星DNA家族可能在这一重要的病原体中起着保守的作用。
与宫颈parthenium root渗出液相关的细菌会影响冈比亚按蚊的嗅觉产卵反应
结果：将三个分离株鉴定为属于两个家族的革兰氏阴性细菌：肠杆菌科（肠杆菌sp。和肠杆菌）和alcaligenaceae（Alcaligens aquatilis）。an。gambiae在A. Aquatilis培养物中产卵的卵比在肠杆菌属的卵中多3倍。依次。在莫里的培养物中产卵的卵比A. aquatilis多4倍。总体而言，在属于化学类别的苯甲酸盐，吡啶，醛，甲醛，甲基苯，酒精，烷烃和吲哚的分离株的顶空中鉴定了16个VOC。随机森林分析确定了10种化合物，最大程度地吸引了细菌分离株对产卵的气味。特别是，肠杆菌SP的气味比其他两个物种发出的十二烷和吲哚的发射量更高。近距离分析表明，分离物在妊娠蚊子上的不同吸引力与它们的挥发性释放相关。