XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System同工
国际电力和能源系统杂志
抽象的DNA甲基化改变是肿瘤发生过程中的早期事件，影响了结直肠癌（CRC）中细胞和周围环境之间串扰的基因。在这些基因中，Gria4，谷氨酸离子受体AMPA型亚基4，在启动子区域中显示高甲基化，并且是早期诊断生物标志物。众所周知，甲基化也会影响替代转录。这项研究的目的是评估23个CRC中的Gria4 Main同工型（规范性和短变体）的转录和蛋白质水平的表达，并匹配正常样品，我们以前验证了甲基化状态。我们进一步将miRNA/转录目标相互作用视为使用生物信息学工具的转录后调节。正如预期的那样，在肿瘤中已经观察到了这两种变体的下调。有趣的是，与在转录水平上观察到的相反，GlUR4蛋白短同工型的表达比正常组织或肿瘤组织中的规范性表达更高。这可以通过专门针对规范同工型的miRNA来解释。我们的研究是第一个显示出在结肠组织中两种同工型的表达的研究。需要注意，短同工型的明显表达表明在肠细胞生物学中具有功能作用。
神经种群在其时间接收窗口的大小上
长阅读的RNA测序可以在单个转录物同工型的分辨率下对RNA修饰，结构和蛋白质相互作用位点的映射。要了解这些RNA特征的功能，在转录组和基因组注释（例如开放式阅读框架和剪接连接）的背景下对它们进行分析至关重要。为了实现这一目标，我们开发了R2Dtool，这是一种生物信息学工具，将转录映射的信息与转录本和基因组注释集成在一起，从而允许同工型分辨分析和RNA在其基因组上下文中的RNA特征的图形表示。我们说明了R2Dtool使用同志数据集成和加速RNA特征分析的能力。R2DTOOL促进了替代转录本同工型的综合分析和解释。R2DTOOL促进了替代转录本同工型的综合分析和解释。
ADAR1 编辑组揭示了编辑特异性的驱动因素......
作用于 RNA ADAR1 的腺苷脱氨酶促进双链和结构化 RNA 中的 A 到 I 转换。ADAR1 有两种异构体，它们从不同的启动子转录：细胞质 ADAR1p150 是干扰素诱导的，而 ADAR1p110 是组成性表达的，主要位于细胞核中。ADAR1 突变会导致艾卡迪-戈蒂埃综合征 (AGS)，这是一种与异常 IFN 产生相关的严重自身炎症疾病。在小鼠中，ADAR1 或 p150 异构体的缺失会导致胚胎死亡，这是由干扰素刺激基因的过度表达引起的。这种表型通过删除细胞质 dsRNA 传感器 MDA5 得到挽救，表明 p150 同工型是不可或缺的，不能被 ADAR1p110 挽救。尽管如此，ADAR1p150 唯一针对的编辑位点仍然难以捉摸。在这里，通过将 ADAR1 同工型转染到无 ADAR 的小鼠细胞中，我们检测到了同工型特异性的编辑模式。使用突变的 ADAR 变体，我们测试了细胞内定位和 Z-DNA 结合域的存在如何影响编辑偏好。这些数据表明 ZBD 对 p150 编辑特异性的贡献很小，而同工型特异性编辑主要由 ADAR1 同工型的细胞内定位指导。我们的研究通过对异位表达标记 ADAR1 同工型的人类细胞的 RIP-seq 进行补充。两个数据集均表明 ADAR1p110 富集了内含子编辑和结合，而 ADAR1p150 优先结合和编辑 3'UTR。
OPA1处理在小鼠发育中是可赋予的，但在线粒体心肌病中具有保护性
线粒体融合和裂变伴随着压力和代谢需求改变的适应性反应。内膜融合和CRISTAE形态发生取决于视觉萎缩1（OPA1），它以不同的同工型表达，并从膜结合的裂解，长到可溶的短形式。在这里，我们通过生成仅表达一种可裂解的OPA1同工型或不可裂解的变体来分析OPA1同工型和OPA1处理的物理学作用。我们的结果表明，单个可裂解或不可裂解的OPA1同工型的表达可保留胚胎发育和成年小鼠的健康。OPA1处理在代谢和热应力下是可分配的，但可以延长寿命，并预防缺乏OXPHOS缺陷COX10 - / - 小鼠中的线粒体心脏肌病。从机械上讲，OPA1处理的损失会破坏线粒体生物发生和线粒体之间的平衡，从而抑制了Cox10 - / - 心脏中心脏肥大的生长。我们的结果突出了OPA1加工，线粒体动力学和心脏肥大的代谢的关键调节作用。
我们非常热情地宣布，新的医学系统生物学研究所（NIMSB）的新调查阶段的开始。
15:00 Hagen Tilgner Weill Cornell Medicine，美国中枢神经系统的RNA同工型在发育和疾病中或时间和空间中的单细胞同工型。 15:30 Mireya PlassPórtulasbellvitge生物医学研究所，单细胞级别的转录后调节：神经发生和神经退行性疾病的影响。 16:00 ANA POMBO MDC代表在Nimsb bod 的闭幕词15:00 Hagen Tilgner Weill Cornell Medicine，美国中枢神经系统的RNA同工型在发育和疾病中或时间和空间中的单细胞同工型。15:30 Mireya PlassPórtulasbellvitge生物医学研究所，单细胞级别的转录后调节：神经发生和神经退行性疾病的影响。 16:00 ANA POMBO MDC代表在Nimsb bod 的闭幕词15:30 Mireya PlassPórtulasbellvitge生物医学研究所，单细胞级别的转录后调节：神经发生和神经退行性疾病的影响。16:00 ANA POMBO MDC代表在Nimsb bod 的闭幕词16:00 ANA POMBO MDC代表在Nimsb bod
肌营养不良蛋白DP71剪接变体的表达在啮齿动物脑发育期间受到时间调节
摘要肌营养不良蛋白DP71是大脑中Duchenne肌肉营养不良（DMD）基因的主要产物，其在DMD患者和小鼠模型中的丧失会导致认知障碍。dp71表示为一系列蛋白质，该蛋白质是由外显子71至74和78的替代剪接产生的，该蛋白在主DP71D和DP71F组中分类为包含特定C端端的dp71d和DP71F组。但是，尚不清楚每个同工型在大脑发育的不同细胞类型，大脑区域和/或阶段中是否具有特定的作用。在本研究中，我们表征了胎儿（E10.5，E15.5）和产后（P1，P7，P14，P14，P21和P60）小鼠和大鼠脑发育期间DP71同工型的表达。我们通过RT-PCR和在全脑和不同大脑结构中的样品中的RT-PCR和克隆测定方法很好地量化了几个DP71转录本的表达。检测到以下DP71转录本：DP71D，DP71D ∆71，DP71D ∆74，DP71D ∆71,74，DP71D ∆71d ∆71-74，DP71F，DP71F，DP71F，DP71F，DP71F ∆71，DP71F ∆1F ∆1F ∆1FΔ74，dpp0071,71,71,71,71,71,007,71,00f ∆71,了Δ71-74。我们发现DP71F同工型是在E10.5（> 80％）中表达的主要转录物，而其表达则逐渐降低并被DP71D组的同工型从E15.5到产后和成年年龄所代替。第三代纳米孔测序证实了这一主要发现。此外，我们发现特定DP71同工型的表达水平随产后阶段和大脑结构的函数而变化。我们的结果表明，DP71同工型在胚胎和产后脑发育过程中具有不同的和互补的作用，很可能参与了不同细胞类型的各种成熟过程。
克服对慢性淋巴细胞性白血病靶向疗法的耐药性
idelalisib和Duvelisib分别是PI3K同工型P110 D和P110 D / G的抑制剂。对PI3K D抑制剂的抗性可能是靶向P110同工型或替代同工型的上调。p110 A相对于p110 d的高表达已被证明可以识别耐elalisib的MCL，并且在复发时该比率显着增加。31 PIK3CA的扩增，响应P110 A抑制作用的P110 A的基因已在乳腺癌细胞系中显示。32此外，据报道，PIK3CA的激活突变是乳腺癌患者对P110 A抑制剂BYL719具有抗性的。33个分析显示PTEN的其他副本丢失。PTEN敲低诱导对BYL719的抗性，而p110 B的联合抑制
克服对慢性淋巴细胞性白血病靶向疗法的耐药性
idelalisib和Duvelisib分别是PI3K同工型P110 D和P110 D / G的抑制剂。对PI3K D抑制剂的抗性可能是靶向P110同工型或替代同工型的上调。p110 A相对于p110 d的高表达已被证明可以识别耐elalisib的MCL，并且在复发时该比率显着增加。31 PIK3CA的扩增，响应P110 A抑制作用的P110 A的基因已在乳腺癌细胞系中显示。32此外，据报道，PIK3CA的激活突变是乳腺癌患者对P110 A抑制剂BYL719具有抗性的。33个分析显示PTEN的其他副本丢失。PTEN敲低诱导对BYL719的抗性，而p110 B的联合抑制
微调FAM161A基因增强疗法以恢复视网膜功能
已有15年了，基因疗法一直被视为遗传性视网膜疾病的希望的灯塔。许多临床前研究都集中在具有最大基因表达能力的载体周围，但是尽管基因转移有效，但在各种纤毛病中仍观察到了最小的生理改善。色素型视网膜炎28（RP28）是FAM161A中Bi-Callelic null突变的结果，Fam161a是连接纤毛（CC）结构的必不可少的蛋白质。在缺席的情况下，纤毛杂乱无章，导致外部片段崩溃和视力障碍。在人类视网膜中，FAM161A有两个同工型：带外显子4的长度，而没有它的短。为了恢复FAM161A中的CC，在纤毛混乱开始后不久，我们将AAV载体与启动子活性，剂量和人类同工型进行了比较。虽然所有矢量都改善了细胞存活，但仅使用弱FCBR1-F0.4启动子启用了两种同工型的组合，启用了CC中的精确FAM161A升级和增强的视网膜功能。我们对RP28的FAM161A基因置换的调查强调了精确治疗基因调节，适当的载体给药和两种同工型的递送的重要性。此精度对于涉及FAM161A等结构蛋白的安全基因疗法至关重要。
时间和剂量依赖性的播种趋势在细胞中的外源性tau R2和R3聚集体
tauopathies是一组神经退行性疾病，分为三种类型，分为3R，4R或3RÞ4R（混合）tauopathies，基于构成异常含量的TAU同工型。据认为所有六个TAU同工型具有功能特征。然而，与不同的呼吸病相关的神经病理病理学的差异提供了一种可能性，疾病的进展和tau的积累可能会因同工型组成而有所不同。微管结合结构域中的重复2（r2）定义了同工型的类型，这可能会影响与特定TAU同工型相关的TAU病理学。因此，我们的研究旨在确定使用HEK293T生物传感器细胞的R2和重复3（R3）聚集体的差异差异。我们表明，由R2诱导的播种通常高于R3聚集体，较低浓度的R2聚集体能够诱导播种。接下来，我们发现R2和R3聚集物均剂量依赖性地增加了Triton-溶于剂的Ser262天然Tau的磷酸化，尽管在较高浓度（12.5 nm或100 nm）的R2和R3聚集体的细胞中，该细胞在较高的R2聚集物中播种，但在72小时的浓度下，R2和R3聚集体可见。然而，在用R2诱导的细胞中可见Triton-不溶pser262 tau的积累比R3聚集体中可见。我们的发现表明R2区域可能有助于早期和增强tau聚集的诱导，并定义4R tauopathies疾病进展和神经病理学的差异。©2023 Elsevier Inc.保留所有权利。