背景信息TAU(微管蛋白相关单元)是微管相关蛋白(也称为MAPT),主要在中枢神经系统的神经元中表达。其主要功能是调节微管动力学以维持轴突细胞骨架。Tau蛋白具有从单个基因通过替代RNA剪接产生的六种同工型。同工型在N末端的插入片数和C末端的重复次数(3重复3R; 4重复4R)。tau在衰老期间和年龄相关的神经退行性疾病(例如阿尔茨海默氏病(AD)和额叶痴呆症)中被过度磷酸化。Tau的高磷酸化导致神经元和神经胶质细胞中神经纤维缠结(NFT)的形成,这是AD的标志之一。
RNA丰度定量已成为常规和可行的,这要归功于高通量的“短阅读”技术,这些技术在基因水平上提供了准确的分子计数。对确定的全长的准确量化,转录本同工型仍然是一个固执的挑战,尽管在广泛的问题中具有明显的生物学意义。“长阅读”测序平台现在产生的数据类型,原则上可以驱动常规的确定形式量化。然而,当代长读数据型的一些细节以及同工型复杂性和遗传变异,当前的生物信息学挑战。我们在这里使用ONT数据显示,可以快速准确地量化长阅读数据,并且可以通过外部限制来改进。进行量化,我们开发了LR-Kallisto,它适应了长阅读技术的Kallisto散装和单细胞RNA-SEQ量化方法。
摘要Palladin(Palld)属于肌动蛋白含有免疫球蛋白的蛋白质蛋白的Palld/Myopalladin(mypn)/肌动蛋白家族。palld普遍于几种同工型中表达,其最长的200 kDa同工型(主要在肌肉中表达)表现出与MYPN的高结构同源性。mypn基因突变与人类心肌病有关,而palld在心脏中的作用仍然未知,部分原因是palld敲除小鼠的胚胎致死性。在酵母双杂交筛查中,鲤鱼/Ankrd1和Fhod1被确定为Palld N末端区域的新型相互作用伙伴。为了研究palld在心脏中的作用,我们产生了条件(CPKO)和诱导(CPKOI)心肌细胞 - 特异性PALLD敲除小鼠。虽然CPKO小鼠没有病理表型,但成年CPKOI小鼠的PALD消融引起了进行性心脏扩张和收缩功能障碍,与心肌细胞收缩率降低相关,椎间盘降低的椎间盘异常和纤维化,纤维化,纤维化,demon-palld对于正常心脏的心脏症必不可少。双CPKO和MYPN敲除(MKO)小鼠表现出与MKO小鼠相似的表型,这表明MYPN并不构成CPKO小鼠中PALLD的损失。在人体膨胀和缺血性心肌病患者的心肌组织中发现了MYPN和PALLD同工型的转录水平改变,而其蛋白质表达水平未经改变。
尽管三一个甲基氨酸(T3)对脂质代谢产生了几种有益的影响,但其使用受到毒性副作用的阻碍,例如心动过速,心律失常,心律失常,心力衰竭,骨骼和骨骼和肌肉cant骨和肌肉分解和情绪障碍。由于甲状腺激素受体的A同工型(TRS)是与T3相关有害效应的主要原因,因此已经做出了一些努力来开发B同工型的选择性激动剂,这些激动剂可以诱导一些有益的作用(即降低甘油三酸酯和胆固醇水平降低肥胖症并改善代谢综合征),同时克服大多数不良T3依赖性副作用。在此,我们描述了通过毒性分析所维持的药物发现过程,这使我们能够选择具有选择性的同工型TR B的新型激动剂,以及可接受的脱靶和吸收,分布代谢,排泄和毒性(ADME-TOX)。在合成的一系列化合物中,衍生物1和3从该分析中出现是“潜在的安全”,以参与临床前研究。在体外研究中证明,两种化合物都能够降低HEPG2中的脂质积累并促进脂肪分解,其作用与T3引起的脂肪相当,用作参考药物。此外,一项初步的体内研究证实了明显缺乏毒性,因此表明化合物1和3作为新的潜在TR B-选择性甲状腺纤维素。©2019 Elsevier Masson SAS。保留所有权利。
摘要:糖原合酶激酶 3 (GSK-3) 是一种进化保守、普遍表达的多功能丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,参与调节多种生理过程。GSK-3 包含两种同工型(α 和 β),它们最初于 1980 年被发现,通过抑制糖原合酶的磷酸化参与葡萄糖代谢。与其他蛋白激酶不同,GSK-3 同工型在静息细胞中具有组成活性,其调节主要涉及通过上游调控网络的抑制。20 世纪 90 年代初,GSK-3 同工型被认为是癌细胞病理生物学中的关键参与者。活性 GSK-3 促进多种致癌蛋白的破坏,包括 β -catenin 和细胞周期进入和增殖代谢的主要调节器 (c-Myc)。因此,GSK-3 最初被认为是一种肿瘤抑制因子。一直以来,GSK-3 经常通过失调的上游信号通路在癌细胞中失活。然而,在过去的 10-15 年里,越来越多的研究强调,在某些癌症环境中,GSK-3 亚型会抑制肿瘤抑制通路,因此充当肿瘤促进剂。在本文中,我们将讨论 GSK-3 亚型在某些慢性血液系统恶性肿瘤(慢性粒细胞白血病、慢性淋巴细胞白血病、多发性骨髓瘤和 B 细胞非霍奇金淋巴瘤)中发挥的多种且往往神秘的作用,这些恶性肿瘤是最常见的血液癌细胞类型。我们还将总结针对 GSK-3 的可能新策略,以创新治疗这些疾病。
摘要:由于活性氧(ROS)的过量产生,血管内皮内的氧化应激被认为是2型糖尿病的心脏血管并发症的起始和进展至关重要的。ROS一词包括多种化学物种,包括超氧化阴离子(O 2• - ),羟基自由基(OH - )和过氧化氢(H 2 O 2)。虽然低浓度ROS的本构生成对于正常的细胞功能是必不可少的,但过量的O 2• - 可能导致不可逆的组织损伤。过量的ROS产生由黄嘌呤氧化酶,未偶联的一氧化氮合酶,线粒体电子传输链和烟酰胺腺苷二核苷酸磷酸(NADPH)氧化酶催化。在O 2• - - NADPH氧化酶的NOX2同工型中被认为对2型糖尿病中发现的氧化应激至关重要。 相比之下,转录调控的NOX4同工型产生H 2 O 2,可以发挥保护作用,并有助于正常的葡萄糖稳态。 本综述描述了NOX2和NOX4的关键作用,以及NOX1和NOX5在葡萄糖稳态,内皮功能和氧化应激中的关键作用,其关键重点侧重于它们在健康中的调节,并且在2型糖尿病中的调节失调。被认为对2型糖尿病中发现的氧化应激至关重要。相比之下,转录调控的NOX4同工型产生H 2 O 2,可以发挥保护作用,并有助于正常的葡萄糖稳态。本综述描述了NOX2和NOX4的关键作用,以及NOX1和NOX5在葡萄糖稳态,内皮功能和氧化应激中的关键作用,其关键重点侧重于它们在健康中的调节,并且在2型糖尿病中的调节失调。
1精神病学和生物行为科学系,加利福尼亚大学,加利福尼亚大学,加利福尼亚州洛杉矶分校,加利福尼亚州洛杉矶分校。 2 SEMEL神经科学与人类行为研究所,加利福尼亚大学,洛杉矶,美国加利福尼亚州洛杉矶。 3智力和发展障碍研究中心,SEMEL神经科学与人类行为研究所,加利福尼亚大学,洛杉矶分校,美国加利福尼亚州洛杉矶。 4人类遗传学系,大卫·格芬医学院,加利福尼亚大学,洛杉矶,加利福尼亚州洛杉矶,美国加利福尼亚州。 5宾夕法尼亚州宾夕法尼亚大学宾夕法尼亚州佩雷尔曼医学院精神病学系。 6宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州佩雷曼医学院遗传学系。 7位于宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州费城儿童医院的寿命脑研究所,美国宾夕法尼亚州。 8加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学统计系。 9生物信息学跨部门计划,加利福尼亚大学,洛杉矶,洛杉矶,加利福尼亚州,美国加利福尼亚州。 10田纳西大学健康科学中心,田纳西州田纳西州田纳西州,美国11个遗传学,基因组学和信息学系11蛋白质组学和代谢组学中心,田纳西州孟菲斯的圣裘德儿童研究医院。 12,美国纽约州锡拉丘兹的SUNY UPSTATE医科大学精神病学系。 13中部南大学生命科学学院医学遗传学医学遗传学和湖南关键实验室;长沙,匈奴,410008,中国1精神病学和生物行为科学系,加利福尼亚大学,加利福尼亚大学,加利福尼亚州洛杉矶分校,加利福尼亚州洛杉矶分校。2 SEMEL神经科学与人类行为研究所,加利福尼亚大学,洛杉矶,美国加利福尼亚州洛杉矶。3智力和发展障碍研究中心,SEMEL神经科学与人类行为研究所,加利福尼亚大学,洛杉矶分校,美国加利福尼亚州洛杉矶。4人类遗传学系,大卫·格芬医学院,加利福尼亚大学,洛杉矶,加利福尼亚州洛杉矶,美国加利福尼亚州。5宾夕法尼亚州宾夕法尼亚大学宾夕法尼亚州佩雷尔曼医学院精神病学系。6宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州佩雷曼医学院遗传学系。 7位于宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州费城儿童医院的寿命脑研究所,美国宾夕法尼亚州。 8加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学统计系。 9生物信息学跨部门计划,加利福尼亚大学,洛杉矶,洛杉矶,加利福尼亚州,美国加利福尼亚州。 10田纳西大学健康科学中心,田纳西州田纳西州田纳西州,美国11个遗传学,基因组学和信息学系11蛋白质组学和代谢组学中心,田纳西州孟菲斯的圣裘德儿童研究医院。 12,美国纽约州锡拉丘兹的SUNY UPSTATE医科大学精神病学系。 13中部南大学生命科学学院医学遗传学医学遗传学和湖南关键实验室;长沙,匈奴,410008,中国6宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州佩雷曼医学院遗传学系。7位于宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州费城儿童医院的寿命脑研究所,美国宾夕法尼亚州。8加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学统计系。 9生物信息学跨部门计划,加利福尼亚大学,洛杉矶,洛杉矶,加利福尼亚州,美国加利福尼亚州。 10田纳西大学健康科学中心,田纳西州田纳西州田纳西州,美国11个遗传学,基因组学和信息学系11蛋白质组学和代谢组学中心,田纳西州孟菲斯的圣裘德儿童研究医院。 12,美国纽约州锡拉丘兹的SUNY UPSTATE医科大学精神病学系。 13中部南大学生命科学学院医学遗传学医学遗传学和湖南关键实验室;长沙,匈奴,410008,中国8加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学统计系。9生物信息学跨部门计划,加利福尼亚大学,洛杉矶,洛杉矶,加利福尼亚州,美国加利福尼亚州。10田纳西大学健康科学中心,田纳西州田纳西州田纳西州,美国11个遗传学,基因组学和信息学系11蛋白质组学和代谢组学中心,田纳西州孟菲斯的圣裘德儿童研究医院。12,美国纽约州锡拉丘兹的SUNY UPSTATE医科大学精神病学系。 13中部南大学生命科学学院医学遗传学医学遗传学和湖南关键实验室;长沙,匈奴,410008,中国12,美国纽约州锡拉丘兹的SUNY UPSTATE医科大学精神病学系。13中部南大学生命科学学院医学遗传学医学遗传学和湖南关键实验室;长沙,匈奴,410008,中国
在国王企鹅国王孵化的最后一部分中,男性可以在胃中保存几个星期的胃中无解的食物。这确保了新近孵化的小鸡的生存,如果延迟了海上觅食女性的情况。根据应激诱导的细菌的特征,我们证明了在保留的胃含量中发生强抗菌活性。我们分离并充分表征了一种新型38个沉积物抗菌肽(AMP)的两种同工型,Spheniscin,属于-Defensin subfensin subfensin。spheniscin浓度会大大增加。使用两种Spheniscin同工型之一的合成范围,我们确定该肽具有广泛的活性谱,影响致病细菌和真菌的生长。中心,我们的数据表明,Spheniscins和其他尚未确定的抗菌物质可能在长期保存企鹅国王胃中储存的食物中起作用。
缩写:AKT,蛋白激酶B; Cldn18.2,Claudin-18同工型2; ctDNA,循环肿瘤DNA; DKK-1,Dickkopf-1; DMMR,缺乏不匹配的维修; EBV,爱泼斯坦 - 巴尔病毒; EHR,电子健康记录; FGF,成纤维细胞生长因子; FGFR,FGF受体; FGFR2,FGF受体2; FGFR2B,FGFR2同工型IIIB; g/geJ,胃/胃管交界处; HER2,人表皮生长因子受体2; IHC,免疫组织化学; ITIM,免疫受体酪氨酸抑制基序; MAPK,有丝分裂原激活的蛋白激酶; MSI,微卫星不稳定性; MTOR,雷帕霉素的哺乳动物靶标; NTRK,神经营养酪氨酸受体激酶; PD-1,程序性细胞死亡蛋白1; PD-L1,程序性细胞死亡配体1; PI3K,磷酸肌醇3-激酶;拉斯,老鼠肉瘤; Tigit,T细胞免疫球蛋白和ITIM结构域; TMB,肿瘤突变负担;美国,美国; VEGFR-2,血管内皮生长因子受体2。
DNA拓扑异构酶IIα(TOP2α /170)是增殖细胞必不可少的酶。为了说话繁殖恶性肿瘤,这使Top2α /170成为依托泊苷和其他临床活性抗癌药物的重要靶标。这些药物的功效通常受到与TOP2α /170表达水平的改变有关的情况的限制。我们的实验室最近显示出TOP2α /170的水平降低,并且由于内含子的聚腺苷酸化(IPA;内含子19)在获得的可获得的依托托糖苷抗性K562 k562 k562 clonal细胞系中,C末端截短的90 kDa同工型TOP2α /90降低了TOP2α /90。我们先前报道说,这种同工型用TOP2α /170异构二聚体是对依托泊苷的耐药性的决定因素。通过基因编辑恢复的TOP2α /170水平,在耐药K /VP.5细胞中优化耐药的K /VP.5细胞中的剪接位点,TOP2α /90表达降低,并降低了耐药性。通过CRISPR /CAS9对父母K562细胞中的外显子19 /内含子进行沉默,并通过同源指导修复(HDR)进行沉默,从而迫使内含子19保留,从而诱导抵抗力,从而诱导抵抗力,从而破坏正常的RNA处理(即进一步评估90 nir and 2 and 2 and 2 and 2)同工型作为抗性决定因素。通过定量聚合酶链反应(QPCR)鉴定基因编辑的克隆,并通过Sanger测序验证。RNA-SEQ和QPCR研究表明,内含子19保留导致TOP2α编辑的mRNA转录物的降解导致TOP2α /170的表达降低。TOP2α / 170 mRNA /蛋白质表达水平在TOP2α基因编辑的克隆中衰减,这会导致对依托泊苷的耐药性,如依托泊苷诱导的DNA损伤(γH2AX,彗星测定)和生长抑制所评估。在基因编辑的K562细胞中TOP2α /90的强制表达进一步降低了依托泊苷诱导的DNA损伤,以支持该截短的同工型的主要负面作用。共同支持TOP2α /170和Top2α /90作为对TOP2α-靶向剂的灵敏度 /耐药性的重要作用。