只有在狩猎当天年满 10-17 岁的青少年才有资格参加。所有青少年必须购买青少年狩猎许可证,并在 www.wlf.la.gov/page/lottery-hunts 下载并打印火鸡标签。被选中参加 Fort Johnson/Fort Johnson North WMA 抽签狩猎的青少年将被分配一名向导。一名人员可以陪同青少年和向导,但不得狩猎。如需更多信息,请致电 LDWF 办公室 (337)491-2575。
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。
通过诱导有害外显子跳跃来恢复基因功能已被证明可有效治疗遗传疾病。然而,许多临床上成功的外显子跳跃疗法都是基于寡核苷酸的短暂疗法,需要频繁给药。基于 CRISPR-Cas9 的基因组编辑可导致外显子跳跃,是一种有前途的治疗方式,可以永久缓解遗传疾病。我们表明,机器学习可以选择破坏剪接受体并导致目标外显子跳跃的 Cas9 向导 RNA。我们通过实验测量了小鼠胚胎干细胞中 1,063 个向导 RNA 靶向的 791 个剪接序列的多样化基因组整合文库的外显子跳跃频率。我们发现,当使用阈值预测的外显子跳跃频率分别为 50% 和 70% 时,我们的方法 SkipGuide 能够以 0.72 和 0.91 的精度识别有效的向导 RNA。我们预计 SkipGuide 将有助于选择用于评估 CRISPR-Cas9 介导的外显子跳跃疗法的引导 RNA 候选物。
10.4.4 使用时间序列向导从 Microsoft Excel 或“.csv”文件导入数据............................................................................................................. 150
CRISPR 技术有两个基本生物学组成部分(图 1)。2 第一组组成部分是称为 CRISPR 相关蛋白 (Cas) 的蛋白质,其功能如同分子剪刀,可启动 DNA 的双链断裂。第二组组成部分是向导 RNA,由两部分组成:CRISPR RNA (crRNA) 和反式激活 CRISPR RNA (tracrRNA)。向导 RNA 会瞄准 DNA 上 Cas 进行断裂的确切位点。CRISPR 介导的编辑机制主要有三种类型,可产生基因操作。首先,CRISPR 可在 DNA 中造成单次切割,破坏原始 DNA 序列并导致基因失活。其次,可以使用两个向导 RNA 删除较大的 DNA 片段。在每个 DNA 位点进行切割后,细胞修复过程会将剩余 DNA 片段的不同末端连接起来。第三,可以将 DNA 模板添加到 CRISPR 机制中,使细胞能够纠正基因,甚至插入新基因。
gRNA(向导 RNA):Cas9 使用的 CRISPR RNA(crRNA)包含 20 个碱基的原间隔元件和与 tracrRNA 互补的额外核苷酸。反式激活 CRISPR RNA(tracrRNA)与 crRNA 的互补区域杂交。组合的 crRNA 和 tracrRNA 与 Cas9 内切酶相互作用,激活编辑复合物以在目标基因组内的特定位点产生双链断裂。这 2 种天然 RNA 分子可以合成生成,用于基因组编辑实验。IDT 科学家已经修改了这些 RNA 的长度和组成,以优化基因组编辑效率,尤其是在与 CRISPR 核酸酶预先复合并以 RNP 形式递送到细胞时。或者,可以使用单向导 RNA(sgRNA)代替 crRNA 和 tracrRNA 的组合。sgRNA 包含通过发夹状环序列连接的 crRNA 和 tracrRNA 序列。向导 RNA(gRNA)可以是 crRNA:tracrRNA 复合物,也可以只是 sgRNA。
摘要 CRISPR-Cas 系统已被广泛用作基因组编辑工具,其中两种常用的 Cas 核酸酶是 Spy Cas9 和 Lb Cas12a。虽然这两种核酸酶都使用 RNA 向导来寻找和切割靶 DNA 位点,但这两种酶在原间隔区相邻基序 (PAM) 要求、向导结构和切割机制方面有所不同。在过去的几年里,合理工程设计导致了 PAM 放宽变体 Sp RYCas9 和 imp Lb Cas12a 的诞生,以拓宽可靶向的 DNA 空间。通过使用它们的催化无活性变体 (dCas9/dCas12a),我们量化了蛋白质特异性特征如何影响靶标搜索过程。为了进行量化,我们将这些核酸酶与光激活荧光蛋白 PAmCherry2.1 融合,并在大肠杆菌细胞中进行单粒子追踪。通过跟踪分析,我们推导出了每种具有非靶向 RNA 向导的核酸酶的动力学参数,这强烈表明 Lb dCas12a 变体对 DNA 的询问比 Spy dCas9 更快。在存在靶向 RNA 向导的情况下,模拟和细胞成像均证实 Lb dCas12a 变体在找到特定靶位点方面更快、更高效。我们的工作展示了使用强大的框架工作放宽 Spy dCas9 和 Lb dCas12a 中的 PAM 要求的权衡,这可以应用于其他核酸酶以量化它们的 DNA 靶标搜索。