Q.2两个向导尝试使用所有四个元素,水,空气,火和地球创建一个咒语。 为此,他们决定将所有这些元素混合在所有可能的订单中。 他们还决定独立工作。 尝试了所有可能的元素组合后,他们得出结论,该法术不起作用。Q.2两个向导尝试使用所有四个元素,水,空气,火和地球创建一个咒语。为此,他们决定将所有这些元素混合在所有可能的订单中。他们还决定独立工作。尝试了所有可能的元素组合后,他们得出结论,该法术不起作用。
软件功能 ................................................................................................ 3 安装向导 ................................................................................................ 3 窗口和对话框管理 ...................................................................................... 4 网格线 ................................................................................................ 4 虚拟桌面 ................................................................................................ 6 配置文件 ................................................................................................ 7 应用程序特定配置 ...................................................................................... 7 热键 ...................................................................................................... 8 扩展任务栏 ............................................................................................. 8
摘要 基于 CRISPR/Cas9 的基因敲除 (KO) 能够精确扰动人类细胞中的靶基因功能,理想情况下可以通过分子组学读数以无偏的方式进行评估。通常,这需要漫长的分离 KO 亚克隆的过程。我们在此表明,无论使用哪种向导 RNA,KO 亚克隆在表型上都是异质的。我们提出了一种实验策略,该策略可避免亚克隆并实现细胞池中快速有效的基因沉默,该策略基于两个向导 RNA 的协同组合,这些向导 RNA 位于基因组接近处(40-300 bp)。我们的策略可实现更可预测的插入/缺失生成,具有较低的等位基因异质性,同时残留靶蛋白表达较低或不可检测,这由 MS3 质谱蛋白质组学确定。我们的方法适用于非分裂原代细胞,也可用于研究必需基因。它能够生成仅反映目标消融表型的高置信度组学数据。
第 3 课 — 工作包管理 45 3.1 InEight Plan 工作流 — 工作包管理 47 3.2 工作包管理概述 47 3.2.1 什么是高级工作包装 (AWP)? 47 3.2.2 工作包 48 3.2.2.1 施工工作包(CWP) 49 3.2.2.2 安装工作包(IWP) 50 3.3 创建工作包 51 3.3.1 创建施工工作包 (CWP) 51 创建施工工作包 (CWP) 51 3.3.2 编辑工作包 53 编辑工作包 54 3.3.3 复制工作计划 55 复制工作包 56 3.3.4 创建安装工作包 (IWP) 57 创建安装工作包 (IWP) 58 3.3.5 分组工作包 59 分组工作包 59 3.4 根据工作包制定每日计划(每日计划向导) 61 3.4.1 什么是每日计划? 61 3.4.2 每日计划向导 62 使用每日计划向导创建每日计划 64 3.5 安装工作包详细信息 70 3.5.1 工作包概览选项卡 70 安装工作包概览 70
本方案描述了如何将由纯化的 Cas9 核酸酶与化学修饰的合成单向导 RNA (sgRNA) 组成的核糖核蛋白 (RNP) 复合物递送至标准永生化细胞系(粘附或悬浮)。尽管针对 HEK293(人胚胎肾 293 细胞)进行了优化,但本方案可能适用于许多其他细胞系(例如 A549、U2OS、HeLa、CHO、MCF-7)。RNP 递送是使用 Lipofectamine™ CRISPRMAX™ 转染试剂完成的。化学修饰的 sgRNA 旨在抵抗核酸外切酶的降解并防止可能导致细胞死亡的先天性细胞内免疫级联。本方案可用于转染 EditCo 的多向导基因敲除试剂盒。
基本的 CRISPR-Cas9 系统由两种分子组成,它们将一种或多种修饰引入 DNA。第一种分子 Cas9 是一种酶,它充当一对“分子剪刀”,可以在特定位置切割 DNA 的两条链,以便添加新的 DNA 片段或去除现有的 DNA。Cas9 的改良版本已被开发出来,只能切割一条 DNA 链,而另一种已被开发出来,可以与 DNA 结合而无需任何切割。第二种分子是一段称为向导 RNA (gRNA) 的 RNA,由一小段预先设计的 RNA 序列(约 20 个碱基长)组成,位于较长的 RNA 支架内。支架与 DNA 结合,预先设计的序列将 Cas9 引导到正确的位置。向导 RNA 具有与目标 DNA 序列互补的 RNA 碱基。这意味着向导 RNA 将只与目标序列结合并将 Cas9 递送到目标序列。当 Cas9 切割 DNA 时,细胞会识别出 DNA 已受损并试图修复。因此,科学家利用细胞自身的 DNA 修复机制来改变基因组中的一个或多个基因。
利用 Cas9 的催化失活突变体(称为 dCas9)阻断细菌基因表达的能力正迅速成为一种标准方法,用于探测基因功能、进行高通量筛选和设计细胞以达到预期目的。然而,我们仍然缺乏对决定 dCas9 靶向活性的设计规则的良好理解。利用高通量筛选数据,我们建立了一个模型,根据靶序列预测 dCas9 阻断 RNA 聚合酶的能力,并在独立生成的数据集上验证其性能。我们进一步为大肠杆菌 MG1655 EcoWG1 设计了一个新型的全基因组向导 RNA 文库,使用我们的模型选择具有高活性的向导,同时避免可能有毒或具有脱靶效应的向导。在富集培养基中生长期间使用 EcoWG1 库进行的筛选比之前发布的筛选有所改进,表明仅使用少量精心设计的指南即可获得非常好的性能。能够设计有效的小型库将有助于使 CRISPRi 筛选更容易执行且更具成本效益。我们的模型和材料可通过 crispr.pasteur.fr 和 Addgene 向社区提供。
利用 Cas9 的催化失活突变体(称为 dCas9)阻断细菌基因表达的能力正迅速成为一种标准方法,用于探测基因功能、进行高通量筛选和设计细胞以达到预期目的。然而,我们仍然缺乏对决定 dCas9 靶向活性的设计规则的良好理解。利用高通量筛选数据,我们建立了一个模型,根据靶序列预测 dCas9 阻断 RNA 聚合酶的能力,并在独立生成的数据集上验证其性能。我们进一步为大肠杆菌 MG1655 EcoWG1 设计了一个新型的全基因组向导 RNA 文库,使用我们的模型选择具有高活性的向导,同时避免可能有毒或具有脱靶效应的向导。在富集培养基中生长期间使用 EcoWG1 库进行的筛选比之前发布的筛选有所改进,表明仅使用少量精心设计的指南即可获得非常好的性能。能够设计有效的小型库将有助于使 CRISPRi 筛选更容易执行且更具成本效益。我们的模型和材料可通过 crispr.pasteur.fr 和 Addgene 向社区提供。
3 例如,使用这种较旧的基因工程形式,很难将所需的变化定位在宿主生物体 DNA 的准确位置。基因组编辑技术为这个问题提供了解决方案,其中最有希望的是成簇的规律间隔的短回文重复序列/CRISPR 相关蛋白 9 (CRISPR-Cas9) 系统,该系统由向导 RNA 组成,旨在查找并结合 DNA 中的特定序列,Cas9 酶在结合后可用作剪刀来切割特定序列。通过调整随附的向导 RNA,CRISPR-Cas9 复合物可用于在任何位置切割 DNA。然后 DNA 由细胞自身修复,从而可以修改 DNA 序列。Crispr-Cas9 使改变遗传物质变得更快、更容易、更具体、更通用和更易于获取。