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Vic9 分枝杆菌噬菌体：俄罗斯分离的第一个 B2 亚簇噬菌体
分枝杆菌噬菌体是专门感染分枝杆菌属细菌的病毒。目前已分离并鉴定了大量的分枝杆菌噬菌体，为了解其多样性和进化提供了宝贵的见解。这些噬菌体在治疗应用方面也具有巨大的潜力，特别是作为抗生素的替代品来对抗耐药性细菌菌株。在本研究中，我们报告了一种新的分枝杆菌噬菌体 Vic9 的分离和鉴定，该噬菌体使用结核分枝杆菌 mc (2)155 作为宿主菌株。Vic9 被归类为 B 簇的 B2 亚簇。形态学分析显示，Vic9 具有该亚簇的典型噬菌体结构，并形成特征性斑块。噬菌体在 30 分钟内吸附到宿主菌株细胞上，根据一步生长实验，其潜伏期持续约 90 分钟，随后是 150 分钟的生长期，平均产量约为每个受感染细胞 68 个噬菌体颗粒。在宿主范围实验中，Vic9 能有效裂解宿主菌株，并且还表现出裂解结核分枝杆菌 H37Rv 的能力，尽管接种效率较低（EOP ≈ 2 × 10 − 5），这是 B2 噬菌体的典型特征。在其他测试的分枝杆菌种中未观察到裂解。Vic9 的基因组包含 67,543 bp 的双链 DNA 并编码 89 个开放阅读框。尽管 Vic9 与其他 B2 亚簇噬菌体关系密切，但我们的分析揭示了 Vic9 的独特特征，即使在密切相关的噬菌体中也突显了其独特的特性。特别值得注意的是在负责 queuosine 生物合成的基因簇内发现了一个独特的 435 bp 序列，以及在 B1、B2 和 B3 亚簇成员之间的结构盒区（Vic_0033-Vic_0035）内发现了重组事件。这些遗传特征值得进一步研究，因为它们可能揭示噬菌体-细菌相互作用的新机制及其开发新型噬菌体治疗方法的潜力。
噬菌体DNA分离试剂盒
图 1. 有效去除宿主基因组 DNA，且不降低噬菌体 DNA 产量。使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从四种富集噬菌体培养物中分离总 DNA。在添加提供的裂解缓冲液之前进行 DNase I 预处理。简而言之，将 20 单位 DNase I 添加到 1 mL 富集噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育 20 分钟。DNAase I 处理后，遵循该程序。作为对照，使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从相同 4 种培养物的等分试样中分离 DNA，而不进行 DNase I 处理。对于 DNA 分析，将每 50 µL 洗脱液中的 10 µL 上样到 1X TAE 琼脂糖凝胶上。可以看出，噬菌体 DNA 被其外壳蛋白安全地保护起来，免受 DNase I 处理的影响，而宿主基因组 DNA 则被 DNase I 有效降解。因此，DNase I 预处理导致最终噬菌体洗脱中宿主 gDNA 污染较少，而不会影响总噬菌体 DNA 产量。M 号泳道为 Norgen 的 Highranger 1 kb DNA Ladder（货号 11900）。
cas9使用噬菌体抗...
au：preeconfirnheadinglevelsarreepressedCornectedCorcely：噬菌体编码抗蛋白蛋白（ACR）蛋白质，使CRISPR-CAS细菌免疫系统失活，允许成功入侵，复制，复制和预测整合。ACR蛋白使用多种机制抑制CRISPR-CAS系统。acriia1由许多噬菌体和质粒编码，专门与Cas9 HNH结构域结合，是第一个发现抑制spycas9的ACR。在这里，我们报告了ACRIIA1诱导的spycas9和saucas9在人类细胞培养中的降解的观察，这是人类细胞中ACR诱导的CRISPR-CAS核酸酶降解的首次检查。acriia1诱导的spycas9降解被Acriia1中的突变所消除，这些突变破坏了两种蛋白质之间的直接物理相互作用。Acriia1靶向CAS9蛋白降解可以调节人类疗法中的Cas9核酸酶活性。ACRIIA1的小尺寸和特异性可用于CRISPR-CAS蛋白水解靶向嵌合体（Protac），提供了一种用于开发安全且精确的基因编辑应用的工具。
噬菌体DNA分离试剂盒
图 1. 有效去除宿主基因组 DNA，同时不降低噬菌体 DNA 产量。使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从四种富集噬菌体培养物中分离总 DNA。在添加提供的裂解缓冲液之前进行 DNase I 预处理。简而言之，将 20 单位 DNase I 添加到 1 mL 富集噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育 20 分钟。DNAase I 处理后，按照程序进行。作为对照，使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从相同 4 种培养物的等分试样中分离 DNA，而无需进行 DNase I 处理。对于 DNA 分析，将每 50 µL 洗脱液中的 10 µL 上样到 1X TAE 琼脂糖凝胶上。可以看出，噬菌体 DNA 被其外壳蛋白安全地保护起来，免受 DNase I 处理的影响，而宿主基因组 DNA 则被 DNase I 有效降解。因此，DNase I 预处理导致最终噬菌体洗脱中宿主 gDNA 污染较少，而不会影响总噬菌体 DNA 产量。M 号泳道为 Norgen 的 Highranger 1 kb DNA Ladder（货号 11900）
噬菌体DNA隔离试剂盒
图1。有效的宿主基因组DNA去除，而无需降低噬菌体DNA产量。 使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从四个富集的噬菌体培养物中分离总DNA。 在添加提供的裂解之前，进行了DNase I预处理。 布里液，将20单位的DNase I添加到1 ml富集的噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育20分钟。 DNAase I处理后，遵循该过程。 作为对照，使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从相同4个培养物的等分试样中分离DNA，而无需进行DNase I处理。 进行DNA分析，将10 µL的每50 µL洗脱加载到1x TAE琼脂糖凝胶上。 可以看出，噬菌体DNA被其外套蛋白安全地保护了DNase I治疗，而宿主基因组DNA则被DNase I有效降解。 因此，DNase I预处理导致最终噬菌体洗脱中的宿主GDNA污染较少，而不会影响总噬菌体DNA产量。 车道M是Norgen的Highranger 1 Kb DNA梯子（Cat。 11900）。有效的宿主基因组DNA去除，而无需降低噬菌体DNA产量。使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从四个富集的噬菌体培养物中分离总DNA。在添加提供的裂解之前，进行了DNase I预处理。布里液，将20单位的DNase I添加到1 ml富集的噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育20分钟。DNAase I处理后，遵循该过程。作为对照，使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从相同4个培养物的等分试样中分离DNA，而无需进行DNase I处理。进行DNA分析，将10 µL的每50 µL洗脱加载到1x TAE琼脂糖凝胶上。可以看出，噬菌体DNA被其外套蛋白安全地保护了DNase I治疗，而宿主基因组DNA则被DNase I有效降解。因此，DNase I预处理导致最终噬菌体洗脱中的宿主GDNA污染较少，而不会影响总噬菌体DNA产量。车道M是Norgen的Highranger 1 Kb DNA梯子（Cat。11900）。
ECM-VB1噬菌体的隔离和表征...
通过椎间盘扩散法确定了大肠杆菌分离株对不同抗生素的敏感性，如表1所示。数据表明，大肠杆菌分离株中有7.7％（5/65）对前苯甲苯具有抗性，分离株中有9.2％（6/65）对硝基氟耐药有抗性，分离株的21.5％（14/65）是对氯苯二甲酸的耐药性，47.7.7％（31/65）的抗性抗性（31/65）。 53.8％（35/65）的分离株对哌拉西林 - tazobactam有抵抗力，分离株的67.6％（44/65）对三甲氧苄啶甲基甲氧唑抗性，分离株的70.7％（46/65）是脱离了81.5％（53/65 ep）的分离株（46/65）。分离株的95.4％（62/65）是头孢唑啉和头孢曲松抗性，97％（63/65）的分离株对环丙沙星具有抗性，最后，头孢二胺，阿莫替辛和阿莫克西林 - 克拉氨酸盐和阿莫克西林 - 克氨酸酯均未对100％（65/65/65/65/65）的有效有效。所有65个分离株均为MDR。
用反向移动欺骗噬菌体
逆转录酶（RTS），使用RNA模板合成DNA的酶，广泛分布在生命的所有领域中。这些酶在多种过程中具有作用，包括在逆转和移动遗传元素以及端粒生物学的生命周期中。在细菌中，RT对抗爆抗防御特别重要，并且被多种遗传系统使用，其作用是保护细菌免受噬菌体的影响。例如，一些CRISPR-CAS系统使用逆转录对RNA噬菌体（3）的核酸（“间隔者”）的新免疫盒（“垫片”）。rts也用于称为回试的反出发遗传系统中，该遗传系统由三个编码RT，NCRNA和“效应子”毒素的基因组成。通过反向转化的过程，反式反应产生嵌合核酸链，其中DNA和RNA共价链接。该嵌合DNA-RNA分子的作用尚不清楚，但已显示为
使用镜像噬菌体显示
阿尔茨海默氏病和其他陶氏病与由tau蛋白以及有毒的tau低聚物组成的神经纤维缠结有关。因此，病理tau聚集的抑制剂是针对未来靶向aupathies的未来疗法的潜在有用的候选者。已知tau中的两个六肽，desiged phf6*（275-vqiink-280）和PHF6（306-vqivyk-311），已知可以促进tau聚集。最近，PHF6*段被描述为TAU聚集的更有效的驱动因素。因此，我们使用大型肽文库使用镜像噬菌体显示器来识别由D-替象体氨基酸组成的原纤维结合肽。已经证明了蛋白酶稳定且免疫原性的体内肽对体内应用的适合性。已鉴定的d-替代肽MMD3及其恢复形式，desig-
噬菌体基因组工程的方法
一个多世纪以前，发现了细菌生物技术病毒中的噬菌体，称为噬菌体或噬菌体[1]。从那时起，对噬菌体及其与细菌的相互作用的研究对我们对生物学的理解产生了巨大影响。例如，噬菌体的研究提供了以下证据：DNA是遗传物质[2]，建立了遗传密码的三重态[3]，并为基因调节提供了许多范式，包括在转录中具有功能相关的创伤的组织，其转录被控制为单位[4]。以噬菌体为中心的研究也是分子生物学的基础。例如，发现细菌编码限制酶，以防止特异性DNA序列的切割来免受噬菌体感染[5]。通过将限制性酶的这种特性与噬菌体T4 DNA连接酶将DNA分子结合在一起的能力，可以为DNA组装创建分子切割和糊状方法。这项技术代表了重组DNA黄金时代的开始，通过允许基因克隆进行功能研究[6]。此外，噬菌体DNA聚合酶对于测序技术的开发至关重要[7，8]，最近，对抗的定期散布的短与短质体的重复酶相关蛋白（CRISPR- CAS）系统可以实现基因组编辑的革命[9]。许多其他令人兴奋的发现可能正在等待研究噬菌体的研究 - 细菌相互作用和噬菌体基因组。但是，噬菌体基因组上的大多数蛋白质编码基因仍然具有未知功能，并且与数据库中的其他序列缺乏同源性，因此要求实验方法来揭示基因功能。
美国的噬菌体疗法前进
噬菌体疗法是一种潜在的抗生素耐药性感染疗法，但在美国不像世界其他地区那样普遍使用。噬菌体疗法是前苏联和俄罗斯治疗细菌感染的历史实践。由于噬菌体自然存在于环境中，因此只有经过基因工程的合成噬菌体才能获得制药公司的专利，这使得在美国很难融入临床护理。但是，抗生素耐药性和生物技术的最新进展的日益增长的成本正在促使美国政府机构与工业合作，以支持开发合成噬菌体以打击抗生素耐药性。尽管很少有噬菌体疗法临床试验在过去的第二阶段进行了进展，但进一步发展的潜力令人难以置信。本综述通过评估噬菌体耐药性的风险与其潜在的益处，作为针对细菌耐药机制并提高抗生素易感性的有效产品，评估了美国噬菌体疗法的前景。