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World File Search System噬菌体
噬菌体DNA分离试剂盒
图 1. 有效去除宿主基因组 DNA，同时不降低噬菌体 DNA 产量。使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从四种富集噬菌体培养物中分离总 DNA。在添加提供的裂解缓冲液之前进行 DNase I 预处理。简而言之，将 20 单位 DNase I 添加到 1 mL 富集噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育 20 分钟。DNAase I 处理后，按照程序进行。作为对照，使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从相同 4 种培养物的等分试样中分离 DNA，而无需进行 DNase I 处理。对于 DNA 分析，将每 50 µL 洗脱液中的 10 µL 上样到 1X TAE 琼脂糖凝胶上。可以看出，噬菌体 DNA 被其外壳蛋白安全地保护起来，免受 DNase I 处理的影响，而宿主基因组 DNA 则被 DNase I 有效降解。因此，DNase I 预处理导致最终噬菌体洗脱中宿主 gDNA 污染较少，而不会影响总噬菌体 DNA 产量。M 号泳道为 Norgen 的 Highranger 1 kb DNA Ladder（货号 11900）
噬菌体DNA分离试剂盒
图 1. 有效去除宿主基因组 DNA，同时不降低噬菌体 DNA 产量。使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从四种富集噬菌体培养物中分离总 DNA。在添加提供的裂解缓冲液之前进行 DNase I 预处理。简而言之，将 20 单位 DNase I 添加到 1 mL 富集噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育 20 分钟。DNAase I 处理后，按照程序进行。作为对照，使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从相同 4 种培养物的等分试样中分离 DNA，而无需进行 DNase I 处理。对于 DNA 分析，将每 50 µL 洗脱液中的 10 µL 上样到 1X TAE 琼脂糖凝胶上。可以看出，噬菌体 DNA 被其外壳蛋白安全地保护起来，免受 DNase I 处理的影响，而宿主基因组 DNA 则被 DNase I 有效降解。因此，DNase I 预处理导致最终噬菌体洗脱中宿主 gDNA 污染较少，而不会影响总噬菌体 DNA 产量。M 号泳道为 Norgen 的 Highranger 1 kb DNA Ladder（货号 11900）
偶然的噬菌体防御在由毒素 - 抗毒素系统介导的流行病弧形霍乱中，由噬菌体编码的抗毒素模仿
抽象细菌及其病毒捕食者（噬菌体）不断发展以相互颠覆。许多抑制噬菌体的细菌免疫系统是根据可以水平传播到多种细菌的流动遗传元素编码的。尽管细菌中免疫系统普遍存在，但这些免疫系统是否常常在自然界遇到的噬菌体作用。此外，有限的例子证明了这些噬菌体如何应对这种免疫系统。在这里，我们确定了具有编码细菌免疫系统DARTG的新型遗传元素的全球病原体弧菌霍乱的临床分离株，并揭示了免疫系统对共同循环裂解噬菌体ICP1的影响。我们表明，DARTG抑制ICP1基因组复制，从而防止ICP1斑块。我们通过识别反击DARTG并允许ICP1后代生产的ICP1编码蛋白来进一步表征DARTG介导的防御与ICP1之间的冲突。最后，我们将这种蛋白ADFB识别为一种功能性抗毒素，ABRO可能通过直接相互作用大门。在临床V.霍乱分离株中检测DARTG系统后，我们观察到ICP1分离株与功能性抗毒素的增加。这些数据强调了对霍乱弧菌及其裂解噬菌体的监视使用，以了解细菌与其自然界噬菌体之间的共同进化武器竞赛。
用反向移动欺骗噬菌体
逆转录酶（RTS），使用RNA模板合成DNA的酶，广泛分布在生命的所有领域中。这些酶在多种过程中具有作用，包括在逆转和移动遗传元素以及端粒生物学的生命周期中。在细菌中，RT对抗爆抗防御特别重要，并且被多种遗传系统使用，其作用是保护细菌免受噬菌体的影响。例如，一些CRISPR-CAS系统使用逆转录对RNA噬菌体（3）的核酸（“间隔者”）的新免疫盒（“垫片”）。rts也用于称为回试的反出发遗传系统中，该遗传系统由三个编码RT，NCRNA和“效应子”毒素的基因组成。通过反向转化的过程，反式反应产生嵌合核酸链，其中DNA和RNA共价链接。该嵌合DNA-RNA分子的作用尚不清楚，但已显示为
英国的牲畜初创企业 - 对创新的评论...在英国开发和交付基于噬菌体的技术Tees Valley本地行动计划
Tees Valley在帮助我们创造自己想要的未来的情况下，在其工业遗产和创新优势的基础上起着非常重要的作用，以将所需的技术商业化。与创新领导的利益相关者和本地人才合作，我们试图通过投资有影响力的想法来提高这些技术的好处，从而推动可持续增长并提高生产率。
2D层次的双氢氧化物和过渡金属二核苷用于应用可再生氢的电化学生产基因工程噬菌体作为新型纳米材料：抗菌剂以外的应用USP44过表达通过表观遗传重编程驱动神经母细胞瘤中的MYC样基因表达程序
神经母细胞瘤是一种胚胎癌，在幼儿死亡造成了成比例的疾病。测序数据在该癌症中很少有反复突变的基因，尽管表观遗传途径与病原体相关。我们使用了基于表达的计算屏幕，该屏幕揭示了去泛素化酶对患者生存的影响，以识别潜在的新靶标。，我们将His-Tone H2B去泛素化酶USP44视为神经母细胞瘤患者生存最大影响的酶。高水平的USP44与转移性疾病，不利组织学，晚期患者年龄和MYCN扩增显着相关。表达高水平USP44的肿瘤患者的子集的生存率明显较差，包括缺乏MYCN扩增的肿瘤。我们从经验上表明，USP44调节神经母细胞瘤细胞的增殖，
探索原核生物，噬菌体和移动遗传元素的反防御系统的多样性
。cc-by-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年8月21日。 https://doi.org/10.1101/2024.08.21.608784 doi：biorxiv preprint
探索原核生物、噬菌体和移动遗传元件的抗防御系统的多样性
。CC-BY-ND 4.0 国际许可证（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 8 月 21 日发布。；https://doi.org/10.1101/2024.08.21.608784 doi：bioRxiv 预印本
噬菌体分析：带有肽信号的内胆素和...
一些内olysin在N末端部分包含符号年度释放（SAR）域（SAR）域，首先由Xu等人描述。（2004），允许膜锚定。内ol丝蛋白含有肽切割刀信号（PS）的信号，该信号通过宿主的SEC机械（Frias; Frias; frias; helocrocristine; Ramirez，2013; Escobedo et al。，2019年）控制了内叶蛋白在periplasm中释放的信号。一些研究指出，这些结构域内的疏水程度以及信号肽（PS）的疏水程度有一定的保留。最近的研究表明，其中一些内olysin能够渗透到革兰氏阴性细菌的外膜（Lim等，2014）。因此，肽信号和SAR代表了在克细菌中外源作用的抗菌蛋白的有前途的来源
ECM-VB1噬菌体的隔离和表征...
通过椎间盘扩散法确定了大肠杆菌分离株对不同抗生素的敏感性，如表1所示。数据表明，大肠杆菌分离株中有7.7％（5/65）对前苯甲苯具有抗性，分离株中有9.2％（6/65）对硝基氟耐药有抗性，分离株的21.5％（14/65）是对氯苯二甲酸的耐药性，47.7.7％（31/65）的抗性抗性（31/65）。 53.8％（35/65）的分离株对哌拉西林 - tazobactam有抵抗力，分离株的67.6％（44/65）对三甲氧苄啶甲基甲氧唑抗性，分离株的70.7％（46/65）是脱离了81.5％（53/65 ep）的分离株（46/65）。分离株的95.4％（62/65）是头孢唑啉和头孢曲松抗性，97％（63/65）的分离株对环丙沙星具有抗性，最后，头孢二胺，阿莫替辛和阿莫克西林 - 克拉氨酸盐和阿莫克西林 - 克氨酸酯均未对100％（65/65/65/65/65）的有效有效。所有65个分离株均为MDR。