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利用 CRISPR-Cas 系统检测传染性病原体的最新进展
摘要：传染病给人类带来巨大的经济损失，给个人乃至社会带来痛苦。现有的检测方法敏感性和特异性不足，周期长，且依赖于昂贵的设备。近年来，成簇的规律间隔短回文重复序列（CRISPR）-CRISPR相关蛋白（Cas）系统以其特异性高、敏感性高、速度快、可及性好等特点，被广泛应用于传染病病原体的检测。本文讨论了CRISPR-Cas系统的发现和发展，总结了相关的分析和解释方法，讨论了基于CRISPR的Cas蛋白检测传染病病原体的现有应用，总结了CRISPR-Cas系统在病原体检测中面临的挑战和前景。
CRISPR 在牙科中的应用 - 微生物和传染病
背景：成簇的规则间隔回文重复序列 (CRISPR) 是一种可编程蛋白质，可以改变基因组的内容、删除基因组内容以及打开和关闭基因组内容。这项尖端技术用途广泛，有可能改变口腔健康的未来。由于其有效性和精确性，CRISPR 相关蛋白 9 (Cas9) 基因组编辑技术可能成为治疗口腔癌的一种有前途的治疗工具。它可以快速改变细胞系、器官和动物的基因组成。因此，基因编辑已扩展到包括全基因组筛查功能丧失和增强。本研究总结了 CRISPR-Cas9 基因组编辑方法及其在牙科中的应用。
CRISPR/Cas基因组编辑系统及其在马铃薯中的应用
马铃薯是全球产量最大的非谷类粮食作物，产量高、营养价值高，是谷类作物的重要替代作物，在粮食安全中发挥着重要作用。CRISPR/Cas（成簇的规律间隔的短回文重复序列/CRISPR-associated）系统具有操作简便、效率高、成本低等优点，在马铃薯育种中显示出巨大的应用潜力。本文对CRISPR/Cas系统的作用机制、衍生类型以及CRISPR/Cas系统在改良马铃薯品质、抗性、克服马铃薯自交不亲和性等方面的应用进行了详细综述，同时对CRISPR/Cas系统在未来马铃薯产业发展中的应用进行了分析和展望。
用于靶向 DNA 修饰的 CRISPR/Cas9 系统的开发以及修饰效率和特异性的最新改进
靶向核酸酶聚集、规律间隔的短回文重复序列/CRISPR 相关蛋白 (CRISPR/Cas) 系统最近已成为一种重要的基因操作方法。由于它易于在各种生物体中通过 RNA 编程靶向 DNA/蛋白质结合，因此这种原核生物防御系统是一种多功能工具，在研究领域具有许多应用，并且在农业和临床改进方面具有很高的潜力。本综述将简要介绍导致其发现和适应的历史。我们还介绍了它的一些限制，以及为克服这些限制而进行的修改，特别关注最常见的 CRISPR/Cas9 介导的非同源末端连接修复。[BMB 报告 2020；53(7)：341-348]
AI 和 CRISPR：提高基因编辑的准确性。
CRISPR（成簇的规律间隔的短回文重复序列）为基因编辑提供了一种精确而强大的工具，彻底改变了基因工程。切割和修改特定 DNA 区域的能力在医学、农业和生物技术等领域具有巨大的潜力。然而，与任何技术一样，CRISPR 也存在挑战——尤其是在脱靶效应方面，即基因组的非预期部分被改变。为了应对这些挑战，人工智能 (AI) 发挥着越来越重要的作用，提高了基于 CRISPR 的基因编辑的准确性、效率和可预测性。本文探讨了 AI 和 CRISPR 如何协同工作以改善基因编辑结果，并讨论了这种动态组合的未来潜力 [1]。
CRISPR/Cas 系统：机制、应用和局限性
摘要：成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 相关内切酶 9 (CRISPR/Cas9) 基因编辑系统在许多细菌和古菌中发挥免疫抑制作用，具有高效、多样性和模块化等多种优势。它现在被广泛用于提高作物的质量和数量以满足全球粮食需求。尽管这些前景很诱人，但仍需要更深入的了解来提高其效率和安全性。因此，对这一特殊系统的概述非常重要。在这篇综述中，简要介绍了目前对不同类型的 CRISPR/Cas 系统的了解以及它们的机制、在作物育种中的应用和局限性，为未来的利用提供基本理解和指导。
生物弦：高效操纵生物弦
查找回文..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................11 GENETIC_CODE....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................14 获取序列....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................14 获取序列.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . ... . . . . . . . . . . . . 19 IUPAC_CODE_MAP . ... 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........................................................................................................................................................................................................................................122 XStringSetList-class ........................................................................................................................................................................................................................................................129..................................................................................................................................................................................119 XStringSet-io ........................................................................................................................................................................................................................122 XStringSetList-类 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支原体的基因编辑工具
支原体是一种成功的致病菌，可导致人类和各种动物宿主的衰弱性疾病。尽管支原体基因组极其精简，但它们已经进化出特殊的机制来从宿主细胞中获取必需的营养物质。用于操纵支原体基因组的遗传工具的匮乏阻碍了对致病菌种的毒力因子和营养物质获取机制的研究。本文总结了几种编辑支原体基因组的策略，包括同源重组、转座子、成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)/Cas 系统和合成生物学。此外，本文还讨论了不同工具的机制和特点，以期为高效操纵支原体基因组提供参考和未来方向。
CRISPR 技术——临床牙科的新视野
成簇的规则间隔回文重复序列被称为 CRISPR。它是一种可以编程来改变、消除或激活基因组的蛋白质。这项尖端技术提供了广泛的实施可能性，并将在未来几年彻底改变口腔保健。最广泛使用的基因组编辑技术包括归巢内切酶、转录激活因子样效应核酸酶、锌指核酸酶和 CRISPR-CRISPR 相关蛋白 9 (Cas9)。这些适应性强的基因组编辑工具可以以序列特异性的方式改变基因组。由于其高效和准确，基因组编辑方法 CRISPR-Cas9 已引起人们的关注，成为抗击癌症的有力武器。本综述介绍了这种方法及其用途，特别是在牙科领域的用途。
用于提高基因组编辑精度和安全性的小分子
摘要：基于成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 的基因组编辑技术彻底改变了生物学、生物技术和医学，并促进了新治疗方式的发展。然而，CRISPR 技术的安全使用仍然存在一些障碍，例如意外的脱靶 DNA 切割。小分子是解决这些问题的重要资源，因为它们具有简便的递送和快速的作用，可以实现对 CRISPR 系统的时间控制。在这里，我们全面概述了可以精确调节 CRISPR 相关 (Cas) 核酸酶和引导 RNA (gRNA) 的小分子。我们还讨论了新兴基因组编辑器（例如碱基编辑器）和抗 CRISPR 蛋白的小分子控制。这些分子可用于精确研究生物系统和开发更安全的治疗方式。