XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System因子的
hipoxia调节人脐带衍生的间充质干细胞中生长因子的分泌
背景：间充质干细胞（MSC）具有巨大的潜力，因为疗法可以再生组织损伤并促进组织稳态。在低氧浓度中MSC的预处理已显示出影响这些细胞的治疗潜力。这项研究旨在比较在缺氧和正态氧中培养的MSC的营养因子的特征和分泌。方法：通过Explant方法从沃顿商人脐带（UC）组织的果冻中分离出MSC，并以流动性细胞仪为特征。在24小时的COCL 2诱导的低氧培养物之后，分别通过锥虫蓝排除试验和甲基噻唑基四唑（MTT）测定法分析了MSC的生存力和代谢活性。使用酶 - 连接的免疫吸附测定法（ELISA）方法，在条件培养基中评估了肝细胞生长因子（HGF）和血管内皮生长因子（VEGF）的分泌。结果：流式细胞仪分析表明，> 99％的MSC细胞群体为CD73和CD90阳性，CD105阳性为阳性。虽然MSC的细胞活力不受低氧培养条件的影响，但在低氧条件下，这些细胞的代谢活性率降低。与代谢活性降低相一致，低氧人类UC衍生的MSC产生的HGF低于常氧化物。与常氧MSC相比，在条件培养基中，缺氧预处理的MSC分泌更高的VEGF水平（P <0.05）。结论：缺氧降低了与HGF和VEGF分泌的调节有关的MSC的代谢活性。建议缺氧也可能影响MSC细胞的治疗能力。
MYC2 转录因子的部分脱敏会改变其与茉莉酸信号成分的相互作用并影响专门的代谢
a 山东农业大学植物保护学院烟草系，山东省农业微生物重点实验室，泰安 271018 b 美国肯塔基大学植物与土壤科学系，肯塔基烟草研究与发展中心，列克星敦，肯塔基州 40546，美国 c 广东省农业科学院作物研究所，广东省作物遗传改良重点实验室，广东省烟草育种与综合利用工程技术研究中心，广州 510640 d 云南省烟草农业科学院烟草育种与生物技术中心，云南昆明 650021 e 山西农业大学果树研究所，山西太谷 030815 f 中国科学院华南植物园，华南农业植物分子分析与遗传改良重点实验室，广东省应用植物学重点实验室，广州 510520 g 农业科学学院南洋理工大学生物科学系，新加坡 637551
测试伯氏疟原虫 ApiAP2 转录因子的单核苷酸多态性对小鼠实验性脑疟的影响
脑疟疾 (CM) 是最致命的严重疟原虫感染形式。目前，我们对疟原虫诱发 CM 的机制了解有限。由啮齿动物寄生虫伯氏疟原虫 ANKA (Pb ANKA) 感染引起的 CM 小鼠模型实验性 CM (ECM) 已被广泛用于研究 CM 的病理生理学。最近的基因组分析表明，Pb ANKA 和密切相关的伯氏疟原虫 NK65 (Pb NK65)（不会引起 ECM）的编码区仅在 21 个单核苷酸多态性 (SNP) 上有所不同。因此，含有 SNP 的基因可能有助于 ECM 的发病机制。虽然这些 SNP 中的大多数位于功能未知的基因中，但有一个 SNP 位于疟原虫 ApiAP2 转录因子家族成员的 DNA 结合位点，我们最近发现它作为毒力因子发挥作用，改变宿主对寄生虫的免疫反应。在这里，我们研究了这种 SNP 对 ECM 发育的影响。我们使用 CRISPR-Cas9 工程寄生虫的结果表明，尽管它具有免疫调节功能，但 SNP 既不是诱导 ECM 的必要条件也不是充分条件，因此无法解释寄生虫菌株在 ECM 表型方面的具体差异。
识别重复的SOX因子的功能分子基础，控制斑马鱼中的内胚层形成和左右模式
确定重复的SOX因子功能差异的分子基础，控制斑马鱼Simaran Johal 1，Randa Elsayed 2，Kristen A. Panfilio 1,3,4，Andrew C. Nelson 1* 1* 1.生命科学学院，吉布特山校园，沃里克大学，考文垂，Cv4 7al，英国2。Warwick医学院，Gibbet Hill校园，沃里克大学，考文垂，Cv4 7al，英国3。 霍恩海姆大学生物学研究所分子遗传学系。 30，70599德国斯图加特4。 动物学研究所：发育生物学，科隆大学，苏黎世大学，苏黎世大学47b，50674德国科隆 *通讯作者电子邮件：a.nelson.1@warwick.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac（acn）摘要内科胰腺。 这些器官的放置和图案依赖于左右的组织者 - 斑马鱼中称为库普弗囊泡（KV）。 转录因子Sox32和Sox17是斑马鱼Soxf亚科的成员。 Sox32和Sox17来自Teleost血统中祖先Sox17的重复。 SOX32在早期胚胎中诱导SOX17的表达，是内胚层和KV祖细胞规范所必需的。 斑马鱼Sox17与KV形态发生有关。 在哺乳动物中，Sox17对于内胚层形成至关重要，可以诱导内胚层祖细胞身份。 因此，表型证据表明斑马鱼Sox32和Sox17与哺乳动物Sox17之间的功能相似性。Warwick医学院，Gibbet Hill校园，沃里克大学，考文垂，Cv4 7al，英国3。霍恩海姆大学生物学研究所分子遗传学系。30，70599德国斯图加特4。动物学研究所：发育生物学，科隆大学，苏黎世大学，苏黎世大学47b，50674德国科隆 *通讯作者电子邮件：a.nelson.1@warwick.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac（acn）摘要内科胰腺。这些器官的放置和图案依赖于左右的组织者 - 斑马鱼中称为库普弗囊泡（KV）。转录因子Sox32和Sox17是斑马鱼Soxf亚科的成员。Sox32和Sox17来自Teleost血统中祖先Sox17的重复。SOX32在早期胚胎中诱导SOX17的表达，是内胚层和KV祖细胞规范所必需的。斑马鱼Sox17与KV形态发生有关。在哺乳动物中，Sox17对于内胚层形成至关重要，可以诱导内胚层祖细胞身份。表型证据表明斑马鱼Sox32和Sox17与哺乳动物Sox17之间的功能相似性。我们试图探索斑马鱼早期胚胎中这些蛋白质之间的功能差异和潜在的相似性。我们的结果表明，与Sox32不同，人类Sox17不能在斑马鱼中诱导内胚层规范。此外，使用混合蛋白功能分析，我们表明SOX32内胚层基因调节网络的特异性与其HMG域与旁产皮sox17的进化差异有关。此外，Sox32和Sox17的C末端区域的变化是其在介导差异基因调节程序中的不同目标特异性和差异的基础。最后，我们确定C末端结构域中的特定保守肽对于SOX17在建立正确的器官不对称性中的作用至关重要。总体而言，我们的结果为脊椎动物内胚层发育，左右模式以及SOXF转录因子功能的演变提供了新的见解。
利用抗菌肽和孢子形成因子的靶向基因编辑对短小芽孢杆菌菌株进行表征
摘要：许多芽孢杆菌属物种因能够产生可防止疾病生长的抗菌肽而对植物有益。在本研究中，我们研究了芽孢杆菌3-19菌株及其衍生物在靶向基因组编辑后的拮抗活性。利用CRISPR-Cas9系统特异性地失活了芽孢杆菌3-19基因组中的两个具有抗菌作用的肽基因——芽孢杆菌素 (bac) 和细菌素 (bact)，以及编码孢子形成西格玛因子的sig F基因。由于芽孢杆菌3-19基因组中靶基因的失活，对蜡状芽孢杆菌和布伦纳泛菌的抗菌活性降低，其中对芽孢杆菌素的影响明显。当 bac 、 bact 和 sig F 基因失活时，培养物的生长动态发生变化，并且变异菌株的蛋白水解活性较低。通过失活 sig F 基因获得了 B. pumilus 3-19 的无孢子突变体。已经证明，bacilysin 在 B. pumilus 3-19 对土壤微生物的拮抗作用的形成中起着独特的作用。
DNA 序列和染色质区分人类疟原虫恶性疟原虫中序列特异性转录因子的结合
1 南加州大学生物化学与分子生物学系，美国加利福尼亚州洛杉矶 90089 2 南加州大学哈克研究所真核基因调控中心，美国加利福尼亚州洛杉矶 90089 3 南加州大学哈克研究所疟疾研究中心，美国加利福尼亚州洛杉矶 90089 4 南加州大学基因组与计算生物学中心，美国加利福尼亚州洛杉矶 90089 5 南加州大学生物统计学与生物信息学系，美国加利福尼亚州洛杉矶 90089 6 南加州大学计算生物学与生物信息学项目，美国加利福尼亚州洛杉矶 90089 7 南加州大学定量与计算生物学系，美国加利福尼亚州洛杉矶 90089 8 南加州大学化学系，美国加利福尼亚州洛杉矶 90089 9 物理与南加州大学天文学系，美国加利福尼亚州洛杉矶 90089 10 Thomas Lord 南加州大学计算机科学系，美国加利福尼亚州洛杉矶 90089 11 计算机科学系，美国北卡罗来纳州达勒姆 27708 12 杜克大学分子遗传学与微生物学系，美国北卡罗来纳州达勒姆 27708 13 宾夕法尼亚州立大学化学系，美国宾夕法尼亚州大学公园 16802
NMR光谱窗口对SARS-COV-2感染对循环细胞因子的血浆脂蛋白和代谢产物的系统性影响
摘要：为了研究SARS-COV-2感染的全身代谢效应，我们分析了人类血浆中的1 H NMR光谱数据，并与多个血浆细胞因子和趋化因子和趋化因子和趋化因子（并行测量）共同建模。因此，在从SARS-COV-2 RRT-PCR阳性患者（n = 15，具有多个样本时间点）和年龄相匹配的健康对照（N = 34的CORMED-CCR）中，在SARS-COV-2 RRT-PCR阳性患者（n = 15，n = 15，n = 15）中记录的血浆中收集了600 MHz 1 h溶剂抑制的单脉冲，自旋回波和2D J分解光谱。测试了SARS-COV-2阴性的Uenza样临床症状（n = 35）。我们将单脉冲NMR光谱数据与体外诊断研究（IVDR）的信息进行了比较，以了解从原始1D NMR数据中提取的定量脂蛋白促蛋白（112个参数）。所有NMR方法都对使用单个NMR方法的对照组和SARS-COV-2阴性患者对SARS-COV-2阳性患者进行了高度显着歧视，从而给出了有关疾病诱导的现场版本的不同诊断信息。选定患者的纵向轨迹分析表明，在恢复阶段没有可检测的病毒的个体中，代谢恢复是不完整的。我们观察到四个血浆细胞因子簇，它们表达了与多种脂蛋白和代谢产物的复杂统计关系。IL-18，IL-6和IFN-γ与IP-10一起，RANTES与LDL1-4亚构件表现出很强的正相关性，并且与多个HDL亚段的负相关性。包括以下内容：群集1，包括MIP-1β，SDF-1α，IL-22和IL-1α，与多个增加的LDL和VLDL亚隔离相关；群集2，包括IL-10和IL-17A，仅与脂蛋白蛋白相关。群集3，包括IL-8和MCP-1，与多种脂蛋白成反比。总体而言，这些数据表明了与SARS COV-2感染的多级细胞免疫反应与血浆脂蛋白相互作用的多级免疫反应，从而使疾病的强烈和特征性免疫代谢表型相互作用。我们观察到，呼吸道恢复阶段和无测试病毒的一些患者在代谢上仍然是高度异常的，这表明这些技术在评估全身恢复中的新作用。关键字：血浆，Covid-19，Sars-Cov-2，NMR光谱，单脉冲，自旋回波，IVDR，代谢表型，生物标志物，诊断模型，脂蛋白■简介
在参考心脏应力测试的患者中，糖尿病与其他预后预测因子的比较：来自精炼镜头注册表的当代分析
方法和结果：从19,658例患者接受了SPECT-MPI，我们确定了3,122名没有已知冠状动脉疾病（CAD）（DM+/CAD-）的糖尿病患者（DM+/CAD-）和3,564个无糖尿病患者，具有已知CAD（DM-/CAD+）。倾向得分匹配用于控制DM+/CAD-和DM-/CAD+组之间特性的差异。在匹配的DM+/CAD-和DM-/CAD+组中有可比的MACE（HR：1.15，95％CI：0.97–1.37）。通过Chi-Square分析，压力类型（运动或药物），总灌注不足（TPD）和左心室功能是MACE的最有效预测指标，其次是CAD和糖尿病状态。对压力，TPD和糖尿病模式的综合考虑提供了协同分层，在药理学压力的糖尿病患者中增加了8.87倍（HR：8.87，95％CI：7.27–10.82）的增加，糖尿病患者的MACE和TPD> 10％> 10％的患者（相对于无疾病的患者，均无疾病的患者）。
血小板脱粒的定量超分辨率成像揭示了von Willebrand因子和von Willebrand因子的差异释放从alpha-Granules
f i g u r e 1 vwf和VWFPP静止血小板的定位。（a，b）静止的血小板被染色为α-微管蛋白（洋红色），vWF（红色，小鼠单克隆抗VWF，clb-rag20）和（a）vwfpp（green）或（b）纤维化（a）。（c）为α-微管蛋白（洋红色），vWF（红色，兔多克隆抗VWF，dako）和sparc（绿色）染色的静止血小板。成像是通过SIM进行的，显示了代表性的高分辨率单平面，宏伟的图像。黄色正方形内包含单个颗粒的区域在右侧（黄色正方形）上放大。比例尺表示1μm。 （d，e）VWF与α颗粒蛋白VWFPP，SPARC和纤维化的共定位分析。（d）Pearson的共定位系数（PCC）和（E）对单个血小板图像（VWF-VWFPP n = 239，VWF-SPARC N = 199，VWF-FIBLIN N = 73）的成对曼德斯的共定位系数（MCC），与VWF相比，VARC与VWF相比，vwf-fibrin n = 199，vwf-sparc n = 199，vwf-fibrin n = 73）bars表示为95％顺式的平均值，平均PCC和MCC值在图的顶部。SIM，结构化照明显微镜； Sparc，分泌的蛋白质酸性和富含半胱氨酸； vwf，von Willebrand因素； VWFPP，VWF丙肽。