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World File Search System土壤环境
练习和经验，ISSN 1895-1767，http：//www.scpe ...
摘要。为了科学而合理地监测城市居民区绿色空间的土壤环境，研究了居民区绿色空间的土壤监测点的布局和采样方法，包括选择代表性居民区的选择，确定监测点采样位置以及确定点数的确定。作者根据多源数据收集和大数据可视化，对城市居民区绿色空间的土壤监测点的布局和采样进行了研究。通过使用多源大数据可视化方法，选择了某个城市的代表性住宅区来监测其居民区绿色土壤中的重金属（镉，汞，砷，铅，铜，铜，铬，铬，锌和镍）。这项研究揭示了不同建筑年龄的居民区跨土壤中重金属浓度的变化。为了确保对居民区的土壤环境条件进行彻底监控，建议包括不同建筑年龄的社区作为监测地点。我们的发现表明，在这些区域内的采样位置的选择不会显着影响土壤样品中的重金属含量。因此，最好是优先考虑从居民区域进行采样，而不是仅专注于它们内部的大绿色空间，在同一居民区域内不同监控点的样品中存在差异，并且在每个居住区中应在每个居民区域中建立至少3-4个监测点，以代表该居民区域的土壤环境条件。多源大数据的应用对城市土壤监测点的分布具有积极作用和优势。
在海洋和陆地环境中，氨氧化古细菌的新颖秩序水平谱系
氨氧化古细菌（AOA）是地球上最普遍，最丰富的古细菌之一，在海洋，陆地和地热生态系统中广泛分布。与海洋和土壤系统相比，地下环境中AOA种群的基因组多样性，生物地理学和进化过程被大量研究。在这里，我们报告了一种新颖的AOA订单candidatus（CA.）硝基瘤，形成了嗜热ca的姐妹谱系。硝基层。宏基因组和16S rRNA基因读取映射表明，在各种地下水环境中，硝基瘤AOA大量存在及其在一系列地热，陆地和海洋栖息地的广泛分布。陆生氮气肌瘤AOA显示使用甲酸盐作为还原剂来源并使用硝酸盐作为替代电子受体的遗传能力。硝基瘤AOA似乎通过水平基因转移从其他中间人群中获得了关键的代谢基因和操纵子，包括编码尿素酶，亚硝酸盐还原酶和V-type ATPase的基因。获得的功能赋予的其他代谢多功能性可能已促进其辐射到各种地下，海洋和土壤环境中。我们还提供了证据表明，这四个AOA命令中的每一个都跨越了海洋和陆地栖息地，这表明主要AOA谱系比以前提出的更复杂的进化史。一起，这些发现建立了AOA的可靠系统基因组框架，并为该全球丰富的功能公会的生态学和适应提供了新的见解。
twhitman@wisc.edu-微生物学专业计划
课程动机和概述土壤是地球上微生物最多样化的栖息地之一。那里发现了哪些生物，它们如何生活？高通量测序使我们能够“看到”以前从未像现在这样“看到”土壤微生物，但是我们如何与数据一起工作？它的局限性是什么？这些问题对于理解土壤微生物在气候变化和营养循环的全球相关过程中所起的作用至关重要。土壤微生物还为我们提供了一个令人兴奋的平台，以研究基本生态原理。我们将通过讲座的结合，期刊文章讨论，小组项目以及使用高通量测序数据来研究本课程中的土壤微生物学和生物地球化学。官方课程描述微生物在土壤和地下水中养分和污染物的转变：强调酶促机制和代谢途径。用于分析微生物种群和包括分子技术的活动的方法。微生物活性用于污染土壤和地下水的生物修复。学习本课程后的学习成果，您应该能够：1。从微生物的角度描述土壤环境2。解释土壤微生物对全球重要问题的重要性，例如气候变化，营养循环和生物多样性3。描述用于研究土壤微生物并解释其局限性的关键方法4。讨论并批判性评估土壤微生物学中的科学论文5。6。设计并提出科学海报7。分析微生物群落数据以回答这个问题，这些社区中的生物是否不同？解释管理土壤微生物及其过程的可持续性挑战的社会，经济和/或环境方面8.分析管理土壤微生物及其过程的可持续性挑战的原因和解决方案
盐胁迫对水稻根际土壤细菌群落的影响
盐分是限制沿海滩涂土地利用的首要因素，根际微生物在增强作物抗逆性方面发挥着至关重要的作用，对环境变化高度敏感。水稻（Oryza sativa L.）是盐渍土改良的首选作物。本研究通过高通量测序技术，对不同盐胁迫处理下水稻根际土壤微生物群落进行了研究。研究发现，盐胁迫改变了水稻根际土壤细菌群落多样性、结构和功能。盐胁迫显著降低了水稻根际土壤细菌群落的丰富度和多样性。盐胁迫下，细菌群落中绿弯菌门、变形菌门和放线菌门丰度较高，厚壁菌门、酸杆菌门和粘球菌门相对丰度降低，拟杆菌门和蓝藻门相对丰度增加。水稻根际土壤细菌群落功能主要有化学异养、好氧_化学异养、光能营养等，其中化学异养和好氧_化学异养NS3（基土中添加3‰NaCl溶液）处理显著高于NS6（基土中添加6‰NaCl溶液）处理。本研究为开发水稻专用耐盐微生物菌剂提供了理论基础，为利用有益微生物改善滨海盐渍土土壤环境提供了可行的策略。
合成生物学工具箱用于氮固定土壤微生物
摘要：植物根附近的土壤环境称为根际，是各种微生物的家园，可以显着影响附近植物的生理学。根际中的微生物可以提供营养，分泌信号传导化合物并抑制病原体。如果可以在这些非模型微生物中实施方法，则可以用合成生物学来操纵这些过程，以增强用于食品，能源或环境修复的农作物的农业表现。驯化非模型生物的常见第一步是开发一组基因工程工具，称为合成生物学工具箱。工具箱包括转换协议，复制向量，基因组工程（例如CRISPR/CAS9），组成型和诱导启动子系统以及其他基因表达控制元素。这项工作验证了三种固定氮的土壤细菌中的合成生物学工具箱：Azotobacter vinelandii，Stutzerimonas stutzeri（Pseudomonas stutzeri）和一个新的klebsiella kelellable variicola。所有三种生物都可以适合转化和报告蛋白的表达，每个生物都可以使用几种功能性诱导系统。S。Stutzeri和K. variicola显示出更可靠的基于质粒的表达，从而成功地重新组合了无疤痕缺失和插入。使用这些工具，我们产生了具有诱导氮酶活性的突变体，并引入了异源基因，以产生具有相关生物学活性的植醇产物。关键字：重18zotrophs，CRISPR，CAS9，合成生物学工具箱，基因组编辑，氮酶■简介
SLM 505土壤微生物学和生物化学。 ...
SLM 505两学分课程是研究土壤微生物学和生物化学的全面课程，该课程旨在由高级本科生使用，他们希望对那些需要对土壤微生物学和生物化学领域进行全面了解的人进行概述。该课程有25个单位分为五个广泛的主题领域，从背景开始，并通过土壤生物群，生物体之间的相互作用，微生物转化，生物化学（酶促活性），并结论人类过程通过农药应用的影响。因此，这些主题将尝试提高为跨学科方法提供基础所需的理解，这些方法将继续在农业领域提供令人兴奋的新思想。，我们鼓励您奉献至少两个小时，研究25个单元中的每一个。您还建议您尝试自我评估练习，因为它们对于更好地理解单位很重要。您还建议您关注导师 - 标记作业（TMA）（单独文件中提供的详细信息）。将有教程课程。教程和时间的位置的详细信息将为您所知；这是您与课程协调员直接联系的绝佳机会。在研究过程中未知的领域将得到适当解释。您将在本课程中学到的本课程的总体目的是让您对土壤微生物学和生物化学领域有全面的了解。课程的目的将通过：对本课程的理解对于进一步理解农业和环境对生活的影响很重要。在课程中，您将了解微生物在土壤环境中的重要性，并将获得知识，以解决与地球其他生物系统功能有关的问题 - 生物化学（土壤微生物功能的主要支持或工具室）。课程的目的是使您对生活在土壤中的微生物及其具有农业和环境意义的活动有更好的了解。
利用沉积物中的细菌鉴别柴油
本研究的主要目的是从 Qua 河沉积物中分离和量化柴油利用细菌，并确定它们对不同浓度柴油的耐受水平。使用标准微生物技术收集和处理样品。然后使用气相转移法进行筛选测试，并在室温（28±2 0 C）下孵育。样品（3）记录的柴油利用细菌数量最高，为 9.7 x 10 3 CFU/g，而样品一（1）记录的最低细菌数量为 6.0 x 10 3 CFU/g。假单胞菌属、藤黄微球菌和芽孢杆菌属是已鉴定的柴油利用细菌分离物。在矿物盐肉汤中对这些分离株对 1%、3%、5% 和 7% 柴油的耐受性进行了测试，通过光密度（OD 600nm）证明，藤黄微球菌对 1%（0.279）、3%（0.253）和 5%（0.154）柴油的生长（OD 600nm）低于假单胞菌属（0.685）、3%（0.483）和 5%（0.466）以及芽孢杆菌属（0.509）、3%（0.452）和 5%（0.390），但在 7%（0.1）时的生长（OD 600nm）略高于假单胞菌属（0.095）和藤黄微球菌（0.093）。在 5% 显著性水平下的方差分析证明，柴油浓度对这些分离株的生长（OD 600nm）存在显著差异。这些结果突出了 Qua 河作为石油生物修复细菌的潜在来源。关键词：柴油利用细菌、沉积物、碳氢化合物降解、细菌鉴定、生物修复介绍沉积物是水生生态系统的主要组成部分，由永久水体叠加而成，无论是海洋、峡湾、湖泊还是水库，通常含有外来和本土有机物，能够刺激水生残留物产生有利反应（Jian 等，2022 年）。与水体的液体部分相比，沉积物区域以生物活动和微生物多样性为主。沉积物与土壤有一些共同的特性，但由于各种原因而与土壤环境不同，其中许多原因有利于栖息在沉积物中的微生物种群。柴油是最复杂的混合物之一，由饱和烃和芳香烃组成。通讯作者电子邮件：ubahchioma3@gmail.com
对矿物质肥料对土壤的长期影响的综述...
土壤微生物组和肥料之间的复杂关系对于农业的可持续未来至关重要。本综述深入研究了土壤微生物与不同肥料方案之间的多方面相互作用，从而阐明了它们的直接和长期影响。土壤，具有丰富的细菌，真菌，古细菌，原生动物和病毒的多样性，在农业生产力中起着关键作用。这些微生物群落与土壤健康，生育能力和韧性相关。肥料虽然对提高农作物产量至关重要，但对这些微生物群落的影响各不相同。立即采用后的动力学揭示了微生物多样性和丰度的变化，对土壤过程的潜在级联影响。现实世界中农业环境中的纵向研究强调了面对干扰时这些社区的韧性和适应性。高级技术工具，从宏基因组学到IoT设备，提供前所未有的见解和实时监控功能。生物学与技术的融合具有未来的希望，即基于实时微生物反馈，对农业实践进行了微调，从而确保了增强的产量和持续的土壤健康。当我们站在全球粮食需求激增和环境可持续性的十字路口时，了解和利用土壤微生物的潜力变得至关重要。这篇评论强调了对坚固的长期研究努力的需求，以绘制真正可持续农业的道路。1。这个过程是土壤生育能力的支柱。关键字：微生物组；肥料；可持续性；农业;宏基因组学。引言土壤通常被称为地球的皮肤，而不仅仅是用根部固定植物的培养基。这是一个复杂而充满活力的生态系统，具有多种生命形式，其中最重要的是土壤微生物。这些微观实体是土壤基质的无名英雄，在确保土壤健康以及扩展全球粮食安全方面发挥了关键作用。本综述旨在阐明这些微生物的重要性，并了解矿物质肥料在现代农业中的作用和含义。土壤微生物包括各种细菌，真菌，原生动物和藻类。尽管大小微小，但它们对土壤环境和整个生态系统的影响是巨大的。它们是营养循环，分解有机物，固定大气氮，改善土壤结构并通过共生关系增强植物健康的主要药物[1]。土壤微生物的主要贡献之一是它们在养分周期中的作用。通过有机材料的分解，微生物将必需的营养物质释放到土壤中，从而可用于植物摄取。某些被称为重18zotrophs的细菌可以固定
土壤和种子都会影响大麻sativa幼苗的微生物组中的细菌多样性
内生菌是生活在植物组织中的微生物。由于他们与宿主的亲密关联，他们可以对植物生理产生强大的影响（Hardoim等，2008； Johnston-Monje和Raizada，2011; Hardoim等，Hardoim等，2012； Hardoim等，2015; Truyens等，2015）。内生菌可以通过提供养分，增加营养摄取，调节和分泌植物素的养分来促进植物生长，并防御植物的病原体（Hu等，2003； Johnston-Monje和Raizada，2011; Mousa et al。，2016; Shehata等，2017，2017年）。植物似乎选择了特定的内生菌，尤其是在幼苗出现期间，这些内生植物可能由种子跨几代人培养，以保护幼苗免受环境压力的影响（Truyens等，2015; Pitzschke，2016; 2016; Shahzad et al。例如，少年玉米植物中内生菌种的显着部分是种子来源的，并从其含种子的父母继承（Johnston-Monje等，2014； Johnston-Monje等，2016）。与植物相关的微生物群可以源自环境和父母，尽管每个人的相对贡献并不总是很清楚（Aleklett和Hart，2013年）。一些微生物内生菌似乎在被子植物，与土壤环境无关，甚至在无菌底物上生长时都广泛保守。这表明至少某些植物相关的微生物是种子衍生的（Johnston-Monje等，2014，Johnston-Monje等，2021）。此外，发现杆菌的特异性细菌被发现是所有研究的所有大麻基因型的内生细菌。此外，有些植物似乎具有“核心”微生物群，这些植物对物种的大多数人来说都是共有的（Sánchez-lóPez等，2018）（Johnston-Monje等，2014; Truyens等，2015; Walitang et al。，2018）。最近第一次证明了大麻中种子传播微生物遗传的这种现象（Dumigan和Deyholos，2022年）。这项研究表明，在加拿大西部的多个位置生长的大麻和药物大麻品种载体生物活性和抗真菌性内生细菌，再到下一代幼苗。然而，这项先前的研究仅限于可培养的微生物，并且是在轴原条件下进行的，因此未测试土壤对内生微生物组的影响。用于加拿大医疗和娱乐市场的药物大麻植物通常在Soilless培养基中生长。这为种植者提供了对可以从土壤转移的病原体的更多控制。然而，它还限制了可能是土壤的潜在有益的微生物，并可能无意中改变了大麻植物的微生物组。一个重要的问题来自这个很大程度上未研究的主题：土壤和种子衍生因素对大麻幼苗内生菌社区组成的相对影响是什么？在当前的研究中，我们假设土壤将对大麻幼苗endosphere的微生物组产生显着影响，而大麻幼苗的胚芽细菌的组成部分将来自种子 - 生物元素细菌，与土壤条件无关。我们使用基于16S的扩增子宏基因组学测试了这一假设，以比较两种土壤类型的作用，无论是否有或没有灭菌，对三种不同的大麻基因型中的endosphere微生物组组成。
在固化或预防渔业疾病作为环境生物分子的疾病中的生态技术
Debabrata Das, Prakriti Das, Aranya Das and Santa Ana Das DOI: https://doi.org/10.22271/fish.2022.v10.i4b.2697 Abstract At this digital era author finds that digitally in aquatic and terrestrial environments Total Dissolved Solids, TDS and Cation Exchange Capacity, CEC both have significant roles in in渔业和人类具有阴性与生长和繁殖力相关。目前的交流指出，这是脂肪酸和尊敬卫生生物分子合成的最小单位，可能与CEC和TDS负相关。异戊二烯在各种渔业和人类中都具有巨大的抗病毒作用，因此，环境可以根据环境在合成脂肪酸中发挥重要作用。鱼类脂肪酸和磷脂的需求很高，因此鱼本身和其他动物的免疫力。经常发现脂肪酸生物分子可以视为渔业和每种人类的抗病毒生物分子。浮游生群中的脂肪酸合成的基本单位称为异戊二烯合成，这种纳米颗粒在热带渔业的水生环境的上表面上更加普遍，因此，所有顶级喂食器种类，因此，所有顶级喂食器都在鳄鱼，catla catla，catla catla，tilapia spp，tilapia spp，puntius spp spp spp spp spp spp s p。热带气候。 尽管我们可能知道，脂肪生物分子可能是环境异戊二烯，异丙素等，而是在鱼类中作为磷脂的合成，或者以半自然渔业中物种的饲料补充物积累。 生态技术关系可能会说细菌自然可以控制或预防病原体。浮游生群中的脂肪酸合成的基本单位称为异戊二烯合成，这种纳米颗粒在热带渔业的水生环境的上表面上更加普遍，因此，所有顶级喂食器种类，因此，所有顶级喂食器都在鳄鱼，catla catla，catla catla，tilapia spp，tilapia spp，puntius spp spp spp spp spp spp s p。热带气候。 尽管我们可能知道，脂肪生物分子可能是环境异戊二烯，异丙素等，而是在鱼类中作为磷脂的合成，或者以半自然渔业中物种的饲料补充物积累。 生态技术关系可能会说细菌自然可以控制或预防病原体。浮游生群中的脂肪酸合成的基本单位称为异戊二烯合成，这种纳米颗粒在热带渔业的水生环境的上表面上更加普遍，因此，所有顶级喂食器种类，因此，所有顶级喂食器都在鳄鱼，catla catla，catla catla，tilapia spp，tilapia spp，puntius spp spp spp spp spp spp s p。热带气候。 尽管我们可能知道，脂肪生物分子可能是环境异戊二烯，异丙素等，而是在鱼类中作为磷脂的合成，或者以半自然渔业中物种的饲料补充物积累。 生态技术关系可能会说细菌自然可以控制或预防病原体。浮游生群中的脂肪酸合成的基本单位称为异戊二烯合成，这种纳米颗粒在热带渔业的水生环境的上表面上更加普遍，因此，所有顶级喂食器种类，因此，所有顶级喂食器都在鳄鱼，catla catla，catla catla，tilapia spp，tilapia spp，puntius spp spp spp spp spp spp s p。热带气候。尽管我们可能知道，脂肪生物分子可能是环境异戊二烯，异丙素等，而是在鱼类中作为磷脂的合成，或者以半自然渔业中物种的饲料补充物积累。生态技术关系可能会说细菌自然可以控制或预防病原体。在第二和第三个实例中，从鱼类中提取生物分子的脂肪酸可能会在科学上可能在不绝对的鱼类捕捉而进行科学上，并且每个非食性食客群落可能会变得更加愉快地从渔业中获得脂肪酸，从而成为包括抗病毒作用在内的有价值的药物。生态技术揭示了与环境氮源成比例的细菌，病原体或病毒的自然盛行，并且在分子生物学和阿育吠陀研究的研究中发现了与简单的异戊二烯呈负相称。当环境可用的硝酸盐变得更多，脂肪或异戊二烯或碳酸化合物时，病原体会更加普遍。当情况逆转时，可能会逆转致病控制或预防。细菌，当可用的硝酸盐变得较少，脂肪或异戊二烯时，病原体可能会受到限制，或者在环境中占用更多时碳氢化合物化合物。我们可能知道病原体可以是土壤，空气，也可以是渔业水传播的水传播病原体，并描述了大肠菌菌的病原体。这种陈述的现象更多地在环境中具有可用氮的病原体在每个环境中也可能是正确的。也是异戊二烯和简单的碳氢化合物，在所有相同指定的环境中都可以占上风。关键字：环境生物分子，CEC，鳄鱼鱼，Catla Catla，catla catla，罗非鱼SPP，Puntius spp简介大多数病原体都是空气生成的，因为空气可能包含最大的氮衍生物，例如NO2，NO3，NO3等，以及对环境的感应元素，使其对环境有足够的水分viz的环境。相对湿度超过60％。空气中的这种可用氮会增加，并且可能形成第3号，而2个氮气在亚土壤厌氧条件下有助于病原体。大气可用的氮可能与土壤和水环境中可用的氮化合物有关系，并且病原体可能占上风。作者微生物或致病性控制或预防可以使用异戊二烯，最简单的碳氢化合物可能在异戊二烯或碳氢化合物或脂肪泡沫衍生物中可能在空气或水中30 ppm左右或可能在土壤环境中发现30 ppm的脂肪泡沫衍生物时可能存在零病原体。在异戊二烯旁边，阿育吠陀完全可以破坏所有邪恶的蛋白质，病毒体，微生物仅仅是外蛋白，与多细胞不同，可以很容易地通过植物酸（pH <6.5）或植物生物碱（pH> 8.0）和植物中的植物变性。