图1。CH 4 -N 2覆盖物的实验设置可在低压(18 MPa)和低144温度(256 K±4 K)条件下进行合成。杂质在连接到145冷却系统的高压高压灭菌器中合成。由控制气体混合控制台,热质量流量146控制器,手动球阀,螺线管阀和气动压缩机组成的多气体混合系统允许在N 2 -CH 4中制备14777777777均匀的反应气体混合物,范围为4 mol%CH 4至95 mol%CH 4。通过分析可覆盖分离的气相来确定148个组合物,这要归功于Rolsi Micro-Smpampler/Impotor的149个直接气体注射到与热150电导率检测器(GC-TCD)相连的气相色谱仪的直接气体注入。151 152
摘要背景。越来越多的研究表明,使用从成像数据中提取的放射组学特征可以预测各种恶性肿瘤的组织学或遗传信息。本研究旨在通过内部和外部验证来研究基于 MRI 的放射组学在预测脑转移瘤原发性肿瘤中的作用,并使用过采样技术来解决类别不平衡问题。方法。这项经 IRB 批准的回顾性多中心研究包括肺癌、黑色素瘤、乳腺癌、结直肠癌和其他原发性实体的组合异质组(5 类分类)的脑转移瘤。2003 年至 2021 年期间从 231 名患者(545 个转移瘤)获取了本地数据。分别对来自公开的斯坦福 BrainMetShare 和加州大学旧金山分校脑转移瘤立体定向放射外科数据集的 82 名患者(280 个转移瘤)和 258 名患者(809 个转移瘤)进行了外部验证。预处理包括脑提取、偏差校正、配准、强度归一化和半手动二元肿瘤分割。从每个序列(8 次分解)的 T1w(± 对比度)、液体衰减反转恢复 (FLAIR) 和小波变换中提取了 2528 个放射组学特征。使用原始数据和过采样数据的选定特征训练随机森林分类器(5 倍交叉验证),并使用准确度、精确度、召回率、F1 分数和受试者工作特征曲线下面积 (AUC) 在内部/外部保留测试集上进行评估。结果。过采样并没有改善内部和外部测试集上整体不令人满意的性能。不正确的数据分区(训练/验证/测试分割之前的过采样)会导致对模型性能的严重高估。结论。应严格评估放射组学模型从成像中预测组织学或基因组数据的能力;外部验证至关重要。
表观遗传学的变化,例如组蛋白脱乙酰化和DNA甲基化来调节基因表达。实际上,表观遗传变化容易发生变化,并且是出色的候选者,以解释某些因素如何增加肿瘤发生和癌症诱导的风险。然而,通过对关键调节剂(例如肿瘤抑制基因(TSG))的转录沉默,DNA甲基化在癌症中起着重要作用。基本上,肿瘤发生是由两个不同基因组的变化指导的:抑制细胞生长和促进该过程的细胞基因的TSG。同时,染色质修饰(例如DNA甲基化)会影响局部染色质结构,而没有任何DNA序列变化。肿瘤发生的主要步骤是通过位于启动子区域的CpG岛的过度甲基化来失活基因。在哺乳动物中,DNA甲基化发生在胞嘧啶的C5位置,主要是在CpG二核苷酸内(Grønbaek等,2007)。特定的酶,例如DNA甲基转移酶(DNMT)在DNA甲基化中起主要作用,并导致TSG的表达降低,导致癌症