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World File Search System地图集
拟南芥叶定量地图集：通过统一数据整合的细胞和亚细胞映射
需要进行定量分析和模型，以将植物的细胞组织与其新陈代谢联系起来。但是，定量数据通常散布在多个研究中，发现此类数据并将其转换为有用的信息是耗时的。因此，有必要集中可用数据并突出其余的知识差距。在这里，我们提出了一种逐步的方法，可以从各种信息源中手动提取定量数据，并统一数据格式。首先，对拟南芥叶的数据进行了整理，检查了一致性和正确性，并通过交叉检查来源进行策划。第二，通过应用计算规则将定量数据组合在一起。然后将它们集成到代表Arabidopsis参考叶的独特综合，参考，可重复使用的数据汇编中。该地图集包含在细胞和亚细胞水平的叶片中发现的15种细胞类型的指标。
地图集文档神经肿瘤学进步
抽象背景。胶质母细胞瘤（GBM）患者的预后令人沮丧，并且需要新的治疗选择。本研究旨在确定GBM中的新治疗靶标。方法。从基因表达综合和癌症基因组地图集中收集了患者衍生的GBM（n = 1279）和正常脑组织（n = 46）样品的mRNA表达数据。功能基因组mRNA分析用于捕获基因组改变对基因表达水平的下游影响。接下来，进行了GBM和正常脑组织之间的类综合。基于（1）已知的与抗塑性药物的相互作用，（2）人类当前的药物发育状态以及（3）与已知参与GBM有关的生物学途径的关联，将GBM中显着上调的基因显着上调。抗塑性剂对优先靶标的抗肿瘤剂在体外和体内验证。结果。与正常脑组织相比，我们发现了712个GBM中的712个基因，其中27个与抗肿瘤剂具有已知相互作用。在包括EGFR和VEGFA在内的27个基因中有17个已在疗效有限的GBM中进行了临床评估。对于其余10个基因，RRM2，MAPK9（JNK2，SAPK1A）和XIAP在GBM开发中起作用。我们证明了MAPK9抑制剂RGB-286638在多个GBM细胞培养模型中的生存力丧失。尽管在体内未观察到总体生存益处，但有迹象表明RGB-286638可能会延迟肿瘤的生长。结论。MAPK9抑制剂RGB-286638显示出有希望的体外结果。此外，体内靶向促进研究和与这种化合物的组合疗法需要进一步探索。
统一的DRG和TG参考地图集
资金：Burroughs Wellcome基金；丽塔·艾伦基金会；偏头痛研究基金会；爱德华兹（Edwards）疼痛研究中的博士生；巴里家庭哈佛干细胞研究所奖； Ninds U19NS130617; Ninds R01NS119476; Ninds U19NS130608; Ninds U19NS130607; NIDA DP1DA054343; NEI U01EY034709; Teva Pharmaceuticals；
胰腺癌的单细胞和空间分辨地图集揭示了与临床结果相关的免疫表型
摘要 - 胰腺导管腺癌（PDAC），占胰腺肿瘤的90％的占90％的特征，其预后不良，5年生存率仅为12％。大多数患者被诊断出患有转移性或局部晚期疾病，只有15％有资格进行治疗切除术。PDAC表现出对化学疗法，靶向疗法和免疫疗法的抗性，这主要是由于其高度异质性肿瘤微环境（TME）。在这项研究中，我们对公开可用的SCRNA，空间转录组学和批量RNA测序数据集进行了整合分析，以研究TME组成和肿瘤结构对PDAC进展，治疗反应，治疗反应和临床结果的影响。我们确定了具有不同细胞组成，功能特征和免疫调节性细胞 - 细胞相互作用的TME亚型。在空间上不同的细胞壁细分市场和基因模块揭示了原发性肿瘤和转移性病变的异质性。发现与患者生存相关的独特集群，为TME生物学及其临床意义提供了新的见解。这些发现强调了整合多摩管方法以揭示PDAC TME复杂性的重要性，并强调了其为治疗策略提供信息并改善患者结果的潜力。
KMT5B神经发育中的单倍症的机制。 Sheppard，S.E。；科比，L。 Wickramasekara，R.N。； Vaccaro，C。；罗伯逊 分子医学时代的肉瘤治疗 Zhiqiang人脑sha的白质连接组的遗传结构； Schijven，d。; S.E. Fisher； Francks，C。2023，文章 /字母T < / div> 眼睛追踪技术支持视觉筛选... 在外太空的军备竞赛？ 预言与广泛的CRISPR – CAS ... 使用来自婴儿宇宙的中性氢的21 cm信号与低频空间干涉仪凝视到黑暗（年龄） 睾丸癌幸存者的心血管疾病 脾脏在训练有素的免疫力模型中的作用有限：对中性粒细胞增生的影响。 Uijen，R.F。; Bulut，O。;琼·乔奇（M.I.） de; doming 社会游戏行为以特定于区域的方式Bijlsma，Ate塑造前额叶抑制的发展； Vanderschuren，L。； Wierenga，Corette J. 地图集文档 神经肿瘤学进步
KMT5B的机制和人类神经发育的机制。 Sheppard，S.E。 ; Brying，L。; Wickramascaker，R.N。 ;疫苗接种，c。罗伯茨，b。简，J。; Hulen，J。；沃森（C.J.） ; Faunds，V。; duffourd，y。 Lee，P。;西蒙，M.C。 ; Cruz，X。 N。Patilla；弗洛雷斯·梅德（Flores-Mend）； Akizu，n。;微笑，J。；来自R. Silva的Pellemino；仪式。;月，米；玫瑰，a。; Barcelo-Serts，i。 Choa，Z.X。 ; Lim，C.Y。 ;杜布格，c。日记，H。； Demurger，f。; Mulhern，M。；阿克曼，c。 Lippa，n。;安德鲁斯（M。）； Baldridge，D。君士坦丁，J。；毛发，A。Van； Snoeck-streef，i。 Chow，P。; Hing，A。; J.M. Graham Jr ; au，m。; Faivre，L。; Shen，W。;毛。 J。Palubos； Viscope，d。; Gahl，W。； tifft，c。; Mamamara，E。； Hauser，n。; Miller，R。； Maffeo，J。； Afenjar，A。; Doummar，d。; Keren，b。 Arn，P。; Macklin-Mania，S。；消息，i。 Callewaert，b。对，a。; Zweier，c。; Brewer，C。； Saggar，A。; Smeland，M.F。 ;库马尔，阿吉斯； Elmslie，F。; Deshpand，c。很好，m。 Cogne，b。 Ierland，Y。Van；威尔克（M。）； Slegtenst，M。Van；海岸Chhen，J.Y。 ;干燥，d。码头，d。 Wormanmann，S.B。 ; Kamstean，E.J。 ; Coch，J。； Haynes，d。;污染，L。； Tither，H。; Ranguin，K。； Pitch-Man，A.S。；韦伯，葬礼的佩雷斯，a。 Sanchez del Pozo，J。； J.M. Rosals ; Jose，P。;标准，K。；劳赫（Rauch） Mei，D。；玛丽，f。; Guerrini，r。 Lesin，J。； Tran Mau-Them，f。;菲利普，c。 Dauriat，b。雷蒙德（L. Raymond）； Moutton，S。； Quiet-Gonzal，A.M。；火灾，T.Y。 ;朋友，c。格罗托（Grotto）肾脏，f。; Drive，T.G。 ;伊斯兰教。 Sidlik，J.A。 ;亨德森（L.B.）KMT5B的机制和人类神经发育的机制。Sheppard，S.E。 ; Brying，L。; Wickramascaker，R.N。 ;疫苗接种，c。罗伯茨，b。简，J。; Hulen，J。；沃森（C.J.） ; Faunds，V。; duffourd，y。 Lee，P。;西蒙，M.C。 ; Cruz，X。 N。Patilla；弗洛雷斯·梅德（Flores-Mend）； Akizu，n。;微笑，J。；来自R. Silva的Pellemino；仪式。;月，米；玫瑰，a。; Barcelo-Serts，i。 Choa，Z.X。 ; Lim，C.Y。 ;杜布格，c。日记，H。； Demurger，f。; Mulhern，M。；阿克曼，c。 Lippa，n。;安德鲁斯（M。）； Baldridge，D。君士坦丁，J。；毛发，A。Van； Snoeck-streef，i。 Chow，P。; Hing，A。; J.M. Graham Jr ; au，m。; Faivre，L。; Shen，W。;毛。 J。Palubos； Viscope，d。; Gahl，W。； tifft，c。; Mamamara，E。； Hauser，n。; Miller，R。； Maffeo，J。； Afenjar，A。; Doummar，d。; Keren，b。 Arn，P。; Macklin-Mania，S。；消息，i。 Callewaert，b。对，a。; Zweier，c。; Brewer，C。； Saggar，A。; Smeland，M.F。 ;库马尔，阿吉斯； Elmslie，F。; Deshpand，c。很好，m。 Cogne，b。 Ierland，Y。Van；威尔克（M。）； Slegtenst，M。Van；海岸Chhen，J.Y。 ;干燥，d。码头，d。 Wormanmann，S.B。 ; Kamstean，E.J。 ; Coch，J。； Haynes，d。;污染，L。； Tither，H。; Ranguin，K。； Pitch-Man，A.S。；韦伯，葬礼的佩雷斯，a。 Sanchez del Pozo，J。； J.M. Rosals ; Jose，P。;标准，K。；劳赫（Rauch） Mei，D。；玛丽，f。; Guerrini，r。 Lesin，J。； Tran Mau-Them，f。;菲利普，c。 Dauriat，b。雷蒙德（L. Raymond）； Moutton，S。； Quiet-Gonzal，A.M。；火灾，T.Y。 ;朋友，c。格罗托（Grotto）肾脏，f。; Drive，T.G。 ;伊斯兰教。 Sidlik，J.A。 ;亨德森（L.B.）Sheppard，S.E。; Brying，L。; Wickramascaker，R.N。;疫苗接种，c。罗伯茨，b。简，J。; Hulen，J。；沃森（C.J.）; Faunds，V。; duffourd，y。 Lee，P。;西蒙，M.C。; Cruz，X。 N。Patilla；弗洛雷斯·梅德（Flores-Mend）； Akizu，n。;微笑，J。；来自R. Silva的Pellemino；仪式。;月，米；玫瑰，a。; Barcelo-Serts，i。 Choa，Z.X。; Lim，C.Y。;杜布格，c。日记，H。； Demurger，f。; Mulhern，M。；阿克曼，c。 Lippa，n。;安德鲁斯（M。）； Baldridge，D。君士坦丁，J。；毛发，A。Van； Snoeck-streef，i。 Chow，P。; Hing，A。; J.M. Graham Jr; au，m。; Faivre，L。; Shen，W。;毛。 J。Palubos； Viscope，d。; Gahl，W。； tifft，c。; Mamamara，E。； Hauser，n。; Miller，R。； Maffeo，J。； Afenjar，A。; Doummar，d。; Keren，b。 Arn，P。; Macklin-Mania，S。；消息，i。 Callewaert，b。对，a。; Zweier，c。; Brewer，C。； Saggar，A。; Smeland，M.F。;库马尔，阿吉斯； Elmslie，F。; Deshpand，c。很好，m。 Cogne，b。 Ierland，Y。Van；威尔克（M。）； Slegtenst，M。Van；海岸Chhen，J.Y。;干燥，d。码头，d。 Wormanmann，S.B。; Kamstean，E.J。; Coch，J。； Haynes，d。;污染，L。； Tither，H。; Ranguin，K。； Pitch-Man，A.S。；韦伯，葬礼的佩雷斯，a。 Sanchez del Pozo，J。； J.M. Rosals; Jose，P。;标准，K。；劳赫（Rauch） Mei，D。；玛丽，f。; Guerrini，r。 Lesin，J。； Tran Mau-Them，f。;菲利普，c。 Dauriat，b。雷蒙德（L. Raymond）； Moutton，S。； Quiet-Gonzal，A.M。；火灾，T.Y。;朋友，c。格罗托（Grotto）肾脏，f。; Drive，T.G。;伊斯兰教。 Sidlik，J.A。;亨德森（L.B.）; Hennessy，L。； Raper，A。;父母，我。 Caiser，F.J。;有时，一个。布克，Ø.L。; Juusola，J。；人，r。 Schnur，R.E。; Vitobello，A。;银行； Bhoj，E.J。; Stepman，H.A.F。2023，文章 /编辑（Adventure Science，9，10，（2023），pp。EADE1463，第1463条）
建立机械生物学的地图集：五种主要人类细胞类型中2418个激酶抑制剂的高通量收缩屏幕揭示了相关细胞类型之间的选择性发散响应
。cc-by-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2025年1月14日。 https://doi.org/10.1101/2025.01.11.632556 doi：Biorxiv Preprint
BGC地图集：探索细菌基因组中编码的全球化学多样性的网络资源
1天然产品的转化基因组挖掘，培养基和感染医学研究所Tübingen（IMIT）（IMIT），研究学研究所生物医学信息学研究所（IBMI），Tübingen，Auf der Morgenstelle 28，72076Tübingen2 28，72076Tübingendenoker -Nord nord sworkity flative forkitizan of Denok nove nord swiment fin Plads，220，2800 Kongens Lyngby，丹麦3计算生物学，国家农业食品生物技术研究所（NABI），S.A.S.德国6生物信息学中心Saar和Saarland大学，Saarland信息学校园，E2 1，66123Saarbrücken，德国7分子生命科学系和瑞士生物信息学研究所和苏黎世大学，苏黎世大学，苏黎世大学，Winterthurerstrasse，190年Drovendaalsesteeg 1 Radix West，6708pb Wageningen，荷兰9德国感染研究中心（DZIF），合作伙伴Tübingen，Auf der Morgenstelle 28，72076Tübingen，德国，德国
人类细胞地图集：承诺，最近的发展，...
人类基因组项目产生了参考基因组序列，该序列在体内的37万亿个细胞中几乎相同。然而，体内有广泛的细胞类型，这是由于这些细胞表型中活化基因的差异引起的。基因组学的最新革命，例如单细胞RNA测序（SCRNA-SEQ）技术的发展，例如引入原位条形码，已使数十万个平行细胞的细胞分辨率评估基因表达。2此外，空间转录组学方法的进步现在允许映射基因表达，同时保留有关细胞在组织样品中细胞分布的空间信息。2加上分析这些数据所需的现代计算生物学方法，这些发展使创建人体所有细胞类型的参考地图集成为可能，这将标志着150年前的努力对这些细胞类型进行分类。这些进步导致了人类细胞地图集的概念，因为他们意识到庞然大物既可行又在经济上可行。
地图集文档
据报道，在大型强子对撞机上使用𝑝𝑝碰撞数据的𝑊碰撞数据的电孔和光子与√𝑠= 13 tev的中心的观测。数据是通过ATLAS实验从2015年到2018年记录的，对应于140 fb -1的综合发光度。此过程通过矢量玻色子散射机制对四分尺仪玻色子耦合敏感，并对标准模型的电动型扇区进行了严格的测试。。多元技术用于区分electroweak的过程与不可还原背景过程。与6.3个标准偏差相比，Electroweak 𝑊𝛾𝑗𝑗过程的显着性远高于六个标准偏差。信托和差异横截面是在接近检测器接受度的基准相空间中测量的，这与Madgraph5+Pythia8和Sherpa的领先顺序标准模型预测合理一致。结果用于在有效的现场理论的背景下限制新的物理效应。
健康地图集：在整个美国可视化基于地点的数据
• Interactive map of over 120 variables • Census tract, ZIP code, congressional districts, county, CBSA, PUMA, and state level maps • 2010 Census and 2020 Census geographies • Comparing two variables • Visualizing data distributions • Custom area selection • Data export • Detailed data descriptions