保质期,木质素含量的减少,营养品质的增强,细菌和病毒耐药性,改变的花色等。(Le and Wang 2011; Tiwari等人2014)。尽管其他形式的反义技术(例如RNAi,siRNA和miRNA)已被广泛用于修饰和改善农作物的各种目的,但使用asrna的使用正在获得更多的接受度(Xu等人 2018; Tilahun等。 2021; Sinha等。 2023)。 因此,使用反义RNA技术改善了高经济和文化意义的农作物(表1),而在最近的十年中,更多的农作物是更多的关注和研究兴趣,这是针对反义RNA在作物改善中的应用。 此外,小型非编码RNA已被用作一种生物学工具,以在没有特定方式的特定方式中在体外和体内和调节基因中研究基因功能2018; Tilahun等。2021; Sinha等。2023)。因此,使用反义RNA技术改善了高经济和文化意义的农作物(表1),而在最近的十年中,更多的农作物是更多的关注和研究兴趣,这是针对反义RNA在作物改善中的应用。此外,小型非编码RNA已被用作一种生物学工具,以在没有特定方式的特定方式中在体外和体内和调节基因中研究基因功能
基因组资源联盟(简称“联盟”)由 7 个知识库项目共同努力而成:酵母菌基因组数据库、WormBase、FlyBase、小鼠基因组数据库、斑马鱼信息网络、大鼠基因组数据库和基因本体资源。联盟致力于提供多种益处:为这些项目服务的各个社区提供更好的服务;为所有生物医学研究人员、生物信息学家、临床医生和学生提供统一的数据视图;以及提供更可持续的基础设施。联盟已统一了跨生物体数据,以提供基因功能、基因表达和人类疾病相关性的有用比较视图。比较视图的基础是直系同源关系的共享调用和通用本体的使用。关键的数据类型是等位基因和变异、基于基因本体注释的基因功能、表型、与人类疾病的关联、基因表达、蛋白质-蛋白质和遗传相互作用以及参与途径。信息呈现在统一的基因页面上,便于轻松总结所涵盖的 7 种生物(芽殖酵母、线虫秀丽隐杆线虫、果蝇、家鼠、斑马鱼、褐家鼠和人类)中每种基因的信息。统一的知识可在 alliancegenome.org 门户网站上免费获取,以可下载文件和 API 的形式提供。我们希望其他现有和新兴知识库能够加入这一努力,提供每个知识库目前提供的有用数据和功能的统一。
摘要:CRISPR/CAS技术最近已成为植物中基因功能研究以及作物改善的基因功能研究的分子工具。小麦是具有良好注释基因组的全球重要主食作物,并且使用基因组编辑技术(例如CRISPR/CAS)有足够的范围来改善其在农业上重要的特征。作为本研究的一部分,我们针对了六叶小麦小麦的三种不同基因:春季品种卡登扎的tabak1-2以及冬季品种CEZANNE,GONCOURT和PREPERT的TA-EIF4E和TA-EIF4E和TA-EIF4E和TA-EIF(ISO)4E。携带CRISPR/CAS诱导的indels的主要转基因线成功地为所有靶向基因生成。虽然BAK1是植物免疫和发育的重要调节剂,但TA-EIF4E和TA-EIF(ISO)4E的作用是Potyviridae家族所需的植物病毒所需的易感性(S)因素,才能完成其生命周期。我们预计由此产生的纯合TABAK1-2突变线将有助于研究Bak1参与小麦的免疫反应,而Ta-Eif4e和Ta-eif(ISO)4E突变线有可能成为对小麦跨度摩西(Wsoic of wirs of wire of wirs of wirs)的潜力小麦。由于冬小麦品种通常不太适合遗传转化,因此在本研究中提出的冬小麦中转化和基因组编辑的成功实验方法将使研究社区感兴趣。
例如,要研究基因在疾病模型中的作用,您可以构建由基因的各种功能域或具有缺失域和靶向突变的变体组成的质粒文库。以这种方式,您可以破译该基因的生物学作用,基因的功能结构域以及与该基因功能相关的关键氨基酸残基。此外,您可以根据正在从事的不同项目以及用于制备质粒DNA的过程(研究与临床等级材料或简单的DNA Prep与哺乳动物细胞的无内毒素质粒准备)创建质粒文库。
CRISPR/CAS9系统不仅是基因编辑的革命性工具,而且还调节各种原核和真核生物的基因转录。在近年来,源自CRISPR/CAS9的CRISPR-DCAS9系统已用于基因成像,高通量筛选,基因调节,研究基本基因功能和表观遗传调节等许多领域。在这篇综述中,描述了CRISPR-DCAS9在激活或抑制基因转录,降低靶向效率以及梳理SGRNA与转录调节之间的内在关系,在生命科学中的应用以及进一步升级的固有关系的最新进展。
基于CRISPR的基因测定方法改变了精确基因编辑的景观,为研究人员提供了研究基因功能,开发靶向疗法并加速药物发现的强大工具。从医学到农业,CRISPR的应用是深远的,为科学和社会中一些最紧迫的挑战提供了解决方案。随着CRISPR技术的不断发展,随着基础和主要编辑等发展的进步,它彻底改变生物技术和医疗保健的潜力变得更加明显。但是,仔细考虑道德含义和技术挑战对于确保将来安全地和负责任地使用CRISPR至关重要。
基因组资源联盟(简称“联盟”)由 7 个知识库项目共同努力而成:酵母菌基因组数据库、WormBase、FlyBase、小鼠基因组数据库、斑马鱼信息网络、大鼠基因组数据库和基因本体资源。联盟致力于提供多种益处:为这些项目服务的各个社区提供更好的服务;为所有生物医学研究人员、生物信息学家、临床医生和学生提供统一的数据视图;以及提供更可持续的基础设施。联盟已统一了跨生物体数据,以提供基因功能、基因表达和人类疾病相关性的有用比较视图。比较视图的基础是直系同源关系的共享调用和通用本体的使用。关键的数据类型是等位基因和变异、基于基因本体注释的基因功能、表型、与人类疾病的关联、基因表达、蛋白质-蛋白质和遗传相互作用以及参与途径。信息呈现在统一的基因页面上,便于轻松总结所涵盖的 7 种生物(芽殖酵母、线虫秀丽隐杆线虫、果蝇、家鼠、斑马鱼、褐家鼠和人类)中每种基因的信息。统一的知识可在 alliancegenome.org 门户网站上免费获取,以可下载文件和 API 的形式提供。我们希望其他现有和新兴知识库能够加入这一努力,提供每个知识库目前提供的有用数据和功能的统一。
在模型植物系统中,b-酮酰基-[酰基载体蛋白]合酶 1 (KASI) 基因已被证明对蔗糖转化为油至关重要。先前的一项研究描述了与相互染色体易位相关的形态和种子组成表型,这种易位破坏了大豆中的一种 KASI 基因。这项研究的主要发现包括种子起皱表型、种子蔗糖增加、种子油减少和易位传播频率低。然而,仍不清楚这些表型中的哪一个(如果有的话)是由 KASI 基因功能丧失直接引起的,而不是染色体易位或其他相关因素。在本研究中,使用 CRISPR/Cas9 诱变来生成该基因的多个敲除等位基因,以及一个符合读框的等位基因。对这些大豆植物的形态、种子组成性状和遗传传递进行了评估。我们的结果表明,CRISPR/Cas9 突变体表现出与染色体易位突变体相同的表型,证实了观察到的表型是由基因功能丧失引起的。此外,与含有纯合敲除突变的植物相比,含有纯合框内突变的植物表现出相似的表型。这一结果表明,框内突变体中丢失的氨基酸对于基因的正常功能至关重要。为了产生新的种子组成表型,该基因的框内编辑可能需要靶向不太重要和/或进化保守的结构域。
一个多世纪以来,科学界一致认为,终末分化细胞的细胞核无法控制后代的发育。多莉的诞生推翻了这一理论,多莉是第一只使用成年体细胞作为核供体通过核移植产生的动物。随着这一范式转变,各种各样的动物都通过体细胞核移植被克隆出来。再加上现代基因组工程技术,体细胞核移植已成为生产转基因农场动物的首选方法。这为研究基因功能开辟了新的机会,并促成了各种人类状况和疾病的动物模型的建立,或改善了牲畜的健康。生殖 (2021) 162 F1–F10
摘要 病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术是快速鉴定植物基因功能的重要手段,建立稳定的芋头VIGS系统可为快速高效验证基因功能提供技术支持。以烟草脆裂病毒(TRV)为载体,构建以八氢番茄红素脱氢酶(CePDS)为指示基因的VIGS系统,并通过沉默CeTCP14基因以进一步验证该系统的稳健性。以赣榆一号芋头为材料,采用叶片注射法,以OD 600 = 0.6的CePDS构建VIGS系统,沉默植物率为12.23%,CePDS表达量与对照相比约为59.34%~77.18%,CePDS沉默植物的叶绿素含量降低了37.80%~56.11%。叶片注射OD 600 = 1.0可显著提高芋头的沉默植株率,达到27.77%,但叶片注射法和球茎真空处理的沉默植株率差异不显著。在赣榆2号中,用OD 600 = 1.0菌液和球茎真空处理对CeTCP14进行进一步沉默,沉默植株率为20%,CeTCP14表达量为对照的43.94%~63.34%,同时球茎中淀粉含量与对照相比显著降低,为70.88%~80.61%。综上所述,结果表明基于TRV的VIGS系统在芋头中是有效的,菌液浓度是影响VIGS系统的关键因素,CeTCP14能够影响芋头球茎中淀粉的积累。建立健全的芋头VIGS系统可为后续快速验证基因功能奠定良好的基础。