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World File Search System基因型
整合静态和动态数据，以改善使用增强基因型 - 表型表示的认知下降的预测
阿尔茨海默氏病（AD）是一种慢性神经退行性疾病，在患者的思维，记忆和行为中引起严重问题。早期诊断对于预言AD进展至关重要；为此，最近有人提出了许多算法来预测认知能力下降。然而，这些预测模型通常无法吸收异质遗传和神经影像标志物，并难以处理丢失的数据。在这项工作中，我们提出了一个新颖的目标函数和相关的优化算法，以鉴定与AD相关的认知下降。我们的AP-PRACH旨在通过参与者特定的增强结合通过回归任务对齐的多模式数据集成来结合动态神经影像学数据。我们的方法为了结合额外的侧面信息，利用了在最近的广告文献中普及的结构化正则化技术。武装着从多模式动态和静态模态中汲取的固定长度矢量反应，常规机器学习方法可用于预测与AD相关的临床结果。我们的实验结果表明，提出的增强模型改善了流行机器学习算法的认知评估评分的预测性能。我们的方法的结果被解释为验证现有的遗传和神经成像生物标志物，这些生物标志物已被证明可以预测认知能力下降。
腮腺炎病毒基因型 G 候选疫苗显示...
尽管儿童广泛接种腮腺炎疫苗，但疫情仍在持续，尤其是在成人中，据信这是由于免疫力下降和抗原漂移共同造成的。目前批准的麻疹、腮腺炎和风疹 (MMR) 疫苗中的腮腺炎疫苗是在 20 世纪 60 年代开发的，是一种减毒活 Jeryl Lynn 病毒，根据基因分类系统，该病毒属于 A 基因型腮腺炎病毒组。然而，自 20 世纪 80 年代以来，A 基因型菌株已停止传播。尽管 Jeryl Lynn 疫苗接种者的血清可以在体外中和所有其他基因型的腮腺炎病毒，但血清对抗异源基因型的效力大大降低。这导致人们呼吁开发新的、更有效的腮腺炎疫苗，以更好地代表病毒的循环菌株。为此，我们在目前的 Jeryl Lynn (JL) 疫苗骨架上创建了一种减毒腮腺炎候选疫苗，该疫苗表达了 G 基因型毒株（在全球传播超过十年）的一致病毒融合 (F) 和血凝素 (HN) 蛋白序列，并将该候选疫苗命名为 JL-G。方法：在恒河猴中评估了 JL-G 与 JL 的免疫原性
基因型到表型：CRISPR 基因编辑揭示了遗传补偿是变体和突变体表型分离的机制
摘要：正向遗传筛选已显示出有害突变的后果；然而，它们最适合于繁殖率高、繁殖量大的模式生物。此外，研究人员必须如实地识别表型变化，即使是细微的变化，才能充分发挥筛选的优势。反向遗传方法也探测基因型与表型的关系，只是遗传目标是预先定义的。直到最近，反向遗传方法还依赖于非基因组基因沉默或相对低效的同源性依赖基因靶向来产生功能丧失的产物。幸运的是，成簇的规律间隔的短回文重复序列 (CRISPR)/Cas 系统的灵活性和简单性彻底改变了反向遗传学，几乎可以随意对任何生物体中的任何基因进行精确诱变。成功整合插入/缺失 (INDEL) 和无义突变，从表面上看，会产生预期的功能丧失表型，但事实证明，这些整合几乎没有效果，即使其他基因沉默方法显示出强大的功能丧失后果。结果之间的分歧提出了有关我们对基因型到表型的理解的重要问题，并强调了中心法则中的补偿能力。本综述描述了最近似乎存在基因组补偿的研究，讨论了可能的补偿机制，并考虑了对强大的基因功能丧失研究很重要的因素。
镰状细胞性状和apol1基因型的影响对黑人美国人的可溶性UPAR与肾功能措施的关联
Solubleurokinaseplasminogenactivatorreceptor(suPAR) is the circulating form of urokinase plasminogen activator receptor,aglycosyl-phosphatidylinositol – anchoredmem- brane protein expressed in various cell types including kidneypodocytesandendothelialcells(1).suPARhasbeen associated with a decline in eGFR and the risk of incident在各种临床环境中的CKD或蛋白尿（1）。在美国，与白人相比，黑人的CKD风险较高可能是至少部分属于部分属性的，apol1和镰状细胞性状，这些特质分别发生在大约13％和8％的bllackpeople.hayek等。（2）最近表明，在非裔美国人对肾脏疾病和高血压研究的研究中，SUPAR水平修改了APOL1基因型与EGFR下降之间的关联，以及接受心脏结构化的黑人登记册。在基于社区的黑人成年人样本中，supar和肾功能的关系尚不清楚，尚未评估镰状细胞性状对suPAR的潜在效果修饰。，我们在3343个自我认同的黑人中测量了基线SUPAR水平，以及来自密西西比州杰克逊市和农村地区的3343个自我认同的黑人（杰克逊心脏研究），他们经过了平均遵循的平均8.0 6 0.84年。在基线（2000 - 2004年）和考试3（2009 - 2013）上评估了肾功能。在基线时，参与者的年龄范围从20至93岁（平均55）不等，男性为37％，目前吸烟者为13％，肥胖54％，肥胖57％，糖尿病患者为25％。30 mg/g。基线特征没有DifferBysickleCellor Apol1基因型。Suparlevels在742至10,595之间（中位数2097）PG/mL。基线时，平均EGFR为94 6 22 ml/min，每1.73 m 2，7％的EGFR为EGFR，每1.73 m 2的60 ml/min。在1605 Participantswithspoturinealbumin-creatinineratio（UACR）测量的子集中，基线平均值为49.5 6 277 mg/g，而13％的基线平均值为UACR。具有基线和3年级数据的个体，平均EGFR更改为2 0.004 6 1.96 ml/min每1.73 m 2
基因型无关的转化和基因组编辑，使用新型的外植体材料
农杆菌介导的菜籽（甘蓝纳普斯）通过下胚轴段转化是过去30年来常用的一种方法。虽然基于下胚基的方法是良好的，但它不容易适应精英种质，并且延长过程对于生产转化设置并不理想。我们开发了一种基于上皮基和较高的茎（损伤）段的农杆菌介导的转化方法，该方法有效，快速且可用于高通量转化和基因组编辑。该方法已在多种低芥酸菜籽基因型中成功实现。该方法似乎是与基因型无关的，具有不同的转化效率。节日段转换用于产生转基因事件以及CRISPR-CAS9介导的移码基因敲除。
引用：Monserrat Villatoro J，GarcíaGarcíaI，Bueno D等。随机多中心临床试验评估Voriconazole先发制人的基因型
摘要引入侵入性曲霉病是血液疾病患者发病率和死亡率的最重要原因。目前，伏立康唑是侵入性真菌疾病的一线治疗方法。伏立康唑的药代动力学间个体差异取决于遗传因素。CYP450涉及伏立康唑总代谢的70％–75％，主要是CYP3A4和CYP2C19，其中剩余的25％–30％由单氧酶黄素进行的代谢。CYP2C19单核苷酸多态性可以解释伏立康唑代谢变异性的50％–55％。材料和方法的主要目的是将先发制人的伏立康唑基因分型与常规实践进行比较。主要结果是在治疗范围内第五天的血清伏立康唑。次要结果是与伏立康唑有关的第90天内的治疗衰竭和不良事件的综合变量。总共有146例有可能会接受伏立康唑的侵入性曲霉病的患者将被招募，并且CYP2C19将是基因型的。如果患者最终会接受伏立康唑，则将被随机分配（1：1实验/对照）。在实验组中，患者将根据药物遗传学算法接受剂量，包括CYP2C19基因型以及临床和人口统计信息。在控制臂中，患者将根据临床实践指南接受剂量。此外，还将进行西班牙国家医疗保健系统（NHS）的观点成本效益评估。试验结果将执行每个手臂的直接计算。结论该试验将提供有关西班牙NHS中先发制人伏立康唑基因分型策略实施的可行性和成本效益的信息。道德和传播该协议的西班牙版本已由La Paz大学医院伦理委员会和西班牙药品和医疗设备进行了评估和批准。
评估基因型NTM-DR分析性能，用于鉴定和分子检测脓肿的分枝杆菌复合物
1 Laboratory of Bacte´riology, Center Hospitalier Universitaire de Montpellier, Montpellier, France, 2 Mivegec, IRD, CNRS, Universite´ de Montpellier, Montpellier, France, 3 Bordeaux Population Health Center U1219, Universite´ de Bordeaux, Bordeaux, France, 4 CYSTIC FIBROSIS Center, University Hospital of Montpellier,细菌学院卫生部，南特斯大学，南特斯大学，法国南特大学，6 Unirouen，Gram EA2656，Rouen University Hospital，Normandy Universite´，Rouen，Rouen，France，7 USC EA 3671 Mycoplasmes和Chlamydiae的人类感染。 Bordeaux，Borteaux，Bortaux，法国，8 Chu de Toulouse，Bacte´riology-hygiè，Institut fe´dératif de Biologie，图卢兹，图卢兹，法国9个细菌疗法 - 医院卫生系，布雷斯特大学，布雷斯特大学，布雷斯特大学，布雷斯特，布雷斯特，10个实验室，苏尔，sn ofero sn sn oilo sn sn ofer sn Dioulasso，布基纳法索（Brkina Faso），东南亚的11 LMI耐药性“ Drisa”，IRD Montpellier，Montpellier，法国，1 Laboratory of Bacte´riology, Center Hospitalier Universitaire de Montpellier, Montpellier, France, 2 Mivegec, IRD, CNRS, Universite´ de Montpellier, Montpellier, France, 3 Bordeaux Population Health Center U1219, Universite´ de Bordeaux, Bordeaux, France, 4 CYSTIC FIBROSIS Center, University Hospital of Montpellier,细菌学院卫生部，南特斯大学，南特斯大学，法国南特大学，6 Unirouen，Gram EA2656，Rouen University Hospital，Normandy Universite´，Rouen，Rouen，France，7 USC EA 3671 Mycoplasmes和Chlamydiae的人类感染。Bordeaux，Borteaux，Bortaux，法国，8 Chu de Toulouse，Bacte´riology-hygiè，Institut fe´dératif de Biologie，图卢兹，图卢兹，法国9个细菌疗法 - 医院卫生系，布雷斯特大学，布雷斯特大学，布雷斯特大学，布雷斯特，布雷斯特，10个实验室，苏尔，sn ofero sn sn oilo sn sn ofer sn Dioulasso，布基纳法索（Brkina Faso），东南亚的11 LMI耐药性“ Drisa”，IRD Montpellier，Montpellier，法国，Bordeaux，Borteaux，Bortaux，法国，8 Chu de Toulouse，Bacte´riology-hygiè，Institut fe´dératif de Biologie，图卢兹，图卢兹，法国9个细菌疗法 - 医院卫生系，布雷斯特大学，布雷斯特大学，布雷斯特大学，布雷斯特，布雷斯特，10个实验室，苏尔，sn ofero sn sn oilo sn sn ofer sn Dioulasso，布基纳法索（Brkina Faso），东南亚的11 LMI耐药性“ Drisa”，IRD Montpellier，Montpellier，法国，
针对 HPV16/18 基因型的双价治疗性疫苗，由人类纤连蛋白额外结构域 A 与 HPV16/18 E7 病毒抗原之间的融合蛋白组成
摘要背景 将人乳头瘤病毒 (HPV) 衍生的抗原体内靶向树突状细胞可能构成针对宫颈癌的有效免疫治疗策略。在之前的研究中，我们已经证明鼠纤连蛋白 (mEDA) 的额外结构域 A 可用于将抗原靶向表达 Toll 样受体 4 (TLR4) 的树突状细胞并诱导强烈的抗原特异性免疫反应。在本研究中，我们生产了一种由人类 EDA (hEDA) 与 HPV16 和 HPV18 的 E7 蛋白融合而成的双价治疗性疫苗候选物 (hEDA-HPVE7-16/18)，并评估了其作为宫颈癌治疗性疫苗的潜力。材料和方法 制备了包含与 hEDA 融合的 HPV16 和 HPV18 病毒亚型的 HPV E7 蛋白的重组融合蛋白，并在体外测试了它们结合 TLR4 和诱导人单核细胞和树突状细胞产生肿瘤坏死因子-α 或白细胞介素 (IL)-12 的能力。在患有皮下或生殖器原位 HPV16 TC-1 肿瘤的小鼠中评估了疫苗与顺铂或 TLR3 激动剂分子聚肌苷酸-聚胞苷酸 (Poly IC) 或 Poly ICLC 联合使用的免疫原性和潜在治疗活性。结果 hEDA-HPVE7-16/18 原型疫苗与人 TLR4 结合并刺激人单核细胞衍生的树突状细胞的 TLR4 依赖性信号通路和 IL-12 产生。接种 hEDA-HPVE7-16/18 可诱导强烈的 HPVE7 特异性细胞毒性 T 淋巴细胞 (CTL) 反应，并消除 TC-1 肿瘤模型中已建立的肿瘤。通过将融合蛋白与顺铂或 TLR-3 配体 Poly IC 以及尤其是与稳定化类似物 Poly ICLC 结合，抗肿瘤效果显著提高。此外，hEDA-HPVE7-16/18+Poly ICLC 可诱导 100% 携带原位生殖器 HPV 肿瘤的小鼠完全肿瘤消退。结论我们的结果表明，这种治疗性疫苗制剂可能是一种有效的治疗方法，可治疗对当前疗法无反应的宫颈肿瘤。
四例谷胱甘肽合成酶缺乏症患者的基因型和临床表型
背景和目的：谷胱甘肽合成酶缺乏症 (GSSD) 是一种常染色体隐性遗传病，文献中描述了约 80 名患者。目前，人们对 GSSD 的基因型-表型相关性知之甚少，尽管可以通过突变分析在一定程度上预测其严重程度。在这里，我们描述了四名患有 GSSD 的患者，并评估了他们的基因型和表型。此外，我们还提供了最新的文献综述。方法：我们回顾性地审查了巴勒斯坦耶路撒冷 Al-Makassed 医院过去十年中所有患有 GSSD 患者的病历。我们回顾了医疗管理的文献和最新的治疗研究，并讨论了表型-基因型相关性。结果：我们描述了四名确诊为 GSSD 的患者。临床表现的严重程度各不相同，但患者通常表现为溶血性贫血和乳酸性酸中毒。尿液有机酸分析显示大量乳酸和焦谷氨酸排泄。所有患者均接受了 N-乙酰半胱氨酸、维生素 E、维生素 C 和碳酸氢钠治疗。除一名患者在两个月大时死亡外，所有患者在治疗后均有显著改善。结论：GSSD 的表现与许多其他疾病相似，有时会导致诊断延迟。早期开始治疗可以改善临床结果和整体发展。如果高度怀疑患有 GSSD，则重要的是考虑进行 mRNA 测序，以防止在存在剪接位点突变时延误诊断。
研究趋同进化以将基因型与行为表型联系起来
神经科学在利用不寻常的动物进行研究方面有着悠久而丰富的历史。在过去的几十年里，用于神经科学研究的物种一直存在技术驱动的瓶颈。然而，即将到来的适用于多种动物的技术浪潮有望使研究人员能够解决使用传统实验室动物无法解决的具有挑战性的科学问题。在这里，我们讨论了如何利用生理或行为表型的趋同进化来增强研究基因型与表型相互作用的映射。我们介绍了两个使用电鱼和毒蛙的案例研究，并讨论了比较工作如何教会我们了解生物组织各个层面的进化约束和灵活性。我们还就建立神经科学研究中新模型系统的潜力和陷阱提供了建议。最后，我们以讨论魅力动物在神经科学研究中的使用及其在公众宣传中的效用结束。总的来说，我们认为趋同进化框架可以帮助确定神经科学的可推广原则。