描述:用于识别和可视化基因排名列表中的丰富GO术语的工具。它可以以两种模式之一运行: *搜索富集的GO术语,这些术语在排名的基因列表的顶部,或 *与基因的基因目标列表中的基因列表中的富集术语搜索。
靶向药物的开发使得癌症治疗可以实现精准医疗,并实现最佳的靶向治疗。准确识别癌症药物基因有助于加强对癌症靶向治疗的认识,促进癌症的精准治疗。然而,由于多组学数据的多样性和复杂性,发现的癌症药物基因非常少见。本研究提出了一种基于机器学习的癌症药物基因发现新方法DF-CAGE。DF-CAGE整合了~10000个TCGA谱中的体细胞突变、拷贝数变异、DNA甲基化和RNA-Seq数据,以识别癌症药物基因的概况。我们发现DF-CAGE从多组学数据的角度发现了目前已知的癌症药物基因的共性,并在OncoKB、Target和Drugbank数据集上取得了优异的表现。在~20,000个蛋白质编码基因中,DF-CAGE精确定位了465个潜在的癌症药物基因。我们发现候选癌症药物基因(CDG-基因)具有临床意义,可分为高可信、可靠和潜在基因集。最后,我们分析了组学数据对药物基因识别的贡献。我们发现DF-CAGE主要根据CNA数据、基因重排和人群中的突变率来报告药物基因。这些发现可能对未来新药的研究和开发有所启发。
简介:所有心脏瓣膜的正常发育都需要高度协调的信号通路和下游介体。虽然基因组变体可能导致先天性瓣膜疾病,但环境因素也可以发挥作用。生命瓣膜后期钙化是主动脉瓣狭窄的主要原因,这是一种进行性疾病,可能导致心力衰竭。当前对先天性瓣膜疾病和瓣膜钙化原因的研究正在使用多种高通量方法,包括转录组学,蛋白质组学和基因组学。来自生物知识库的高质量遗传数据对于促进这些高通量数据集的分析和解释至关重要。基因本体论(GO,http://geneontology.org/)是用于解释这些数据集的主要生物信息学资源,因为它提供了描述所有生物体基因产物的作用的结构化,可计算的知识。UCL功能基因注释小组的重点是人类基因产品的注释。确定了转录组,蛋白质组学和基因组数据中包含的GO注释没有提供有关心脏瓣膜开发的精确描述性信息,我们启动了一个集中的项目来解决此问题。
Acta Astronautica Acta。宇航员。太空研究的进步。空间res。农业水管理农业。水管理。分析科学肛门。SCI。 核医学年鉴。 nucl。 Med。 应用的环境微生物学应用程序。 环境。 微生物。 应用的微生物学和生物技术应用。 微生物。 生物技术。 应用的土壤生态学应用。 土壤Ecol。 一种大气化学和物理大气化学。 物理。 一个大气环境的气氛。 环境。 B生物科学,生物技术和生物化学Biosci。 生物技术。 生物化学。 B植物学码头botanica Marina B英国血液学杂志BR。 J. Hematol。 C癌症遗传学和细胞遗传学癌症遗传学。 细胞遗传学。 C癌症科学癌症科学。 c Celss Journal Celss J. C Chromsome Science Chrom。 SCI。 c土壤科学与植物分析社区中的通信。 土壤科学。 植物肛门。 c交流和综合生物学社区。 集成。 生物。 c计算流体动力学杂志计算。 流体dyn。 J. c电流遗传学。 基因。 c当前的药物生物技术Curr。 pharm。 生物技术。 D数据科学杂志数据科学。 j。 控制。SCI。核医学年鉴。nucl。Med。应用的环境微生物学应用程序。环境。微生物。应用的微生物学和生物技术应用。微生物。生物技术。应用的土壤生态学应用。土壤Ecol。 一种大气化学和物理大气化学。 物理。 一个大气环境的气氛。 环境。 B生物科学,生物技术和生物化学Biosci。 生物技术。 生物化学。 B植物学码头botanica Marina B英国血液学杂志BR。 J. Hematol。 C癌症遗传学和细胞遗传学癌症遗传学。 细胞遗传学。 C癌症科学癌症科学。 c Celss Journal Celss J. C Chromsome Science Chrom。 SCI。 c土壤科学与植物分析社区中的通信。 土壤科学。 植物肛门。 c交流和综合生物学社区。 集成。 生物。 c计算流体动力学杂志计算。 流体dyn。 J. c电流遗传学。 基因。 c当前的药物生物技术Curr。 pharm。 生物技术。 D数据科学杂志数据科学。 j。 控制。土壤Ecol。一种大气化学和物理大气化学。物理。一个大气环境的气氛。环境。B生物科学,生物技术和生物化学Biosci。 生物技术。 生物化学。 B植物学码头botanica Marina B英国血液学杂志BR。 J. Hematol。 C癌症遗传学和细胞遗传学癌症遗传学。 细胞遗传学。 C癌症科学癌症科学。 c Celss Journal Celss J. C Chromsome Science Chrom。 SCI。 c土壤科学与植物分析社区中的通信。 土壤科学。 植物肛门。 c交流和综合生物学社区。 集成。 生物。 c计算流体动力学杂志计算。 流体dyn。 J. c电流遗传学。 基因。 c当前的药物生物技术Curr。 pharm。 生物技术。 D数据科学杂志数据科学。 j。 控制。B生物科学,生物技术和生物化学Biosci。生物技术。生物化学。B植物学码头botanica Marina B英国血液学杂志BR。J. Hematol。C癌症遗传学和细胞遗传学癌症遗传学。 细胞遗传学。 C癌症科学癌症科学。 c Celss Journal Celss J. C Chromsome Science Chrom。 SCI。 c土壤科学与植物分析社区中的通信。 土壤科学。 植物肛门。 c交流和综合生物学社区。 集成。 生物。 c计算流体动力学杂志计算。 流体dyn。 J. c电流遗传学。 基因。 c当前的药物生物技术Curr。 pharm。 生物技术。 D数据科学杂志数据科学。 j。 控制。C癌症遗传学和细胞遗传学癌症遗传学。细胞遗传学。C癌症科学癌症科学。 c Celss Journal Celss J. C Chromsome Science Chrom。 SCI。 c土壤科学与植物分析社区中的通信。 土壤科学。 植物肛门。 c交流和综合生物学社区。 集成。 生物。 c计算流体动力学杂志计算。 流体dyn。 J. c电流遗传学。 基因。 c当前的药物生物技术Curr。 pharm。 生物技术。 D数据科学杂志数据科学。 j。 控制。C癌症科学癌症科学。c Celss Journal Celss J.C Chromsome Science Chrom。SCI。 c土壤科学与植物分析社区中的通信。 土壤科学。 植物肛门。 c交流和综合生物学社区。 集成。 生物。 c计算流体动力学杂志计算。 流体dyn。 J. c电流遗传学。 基因。 c当前的药物生物技术Curr。 pharm。 生物技术。 D数据科学杂志数据科学。 j。 控制。SCI。c土壤科学与植物分析社区中的通信。土壤科学。植物肛门。c交流和综合生物学社区。集成。生物。c计算流体动力学杂志计算。流体dyn。J.c电流遗传学。基因。c当前的药物生物技术Curr。pharm。生物技术。D数据科学杂志数据科学。j。控制。生物学环境中的环境控制。生物。e环境监测和评估环境。monit。评估。e环境污染环境。污染。e河口,沿海和货架科学埃斯图尔。海岸。货架科学欧洲核医学与分子成像欧洲杂志。J. nucl。Med。mol。成像E实验动物经验。anim。e实验血液学经验。剧烈。f自由基生物学和医学自由radic。生物。Med。f融合工程和设计融合工程。des。f融合科学与技术融合科学。技术。G地球化学杂志Geochem。J. G Geochimica et Cosmochimica acta Geochim。Cosmochim。Acta g重力和空间研究引力。空间res。H健康物理健康物理。H Hiroshima医学科学杂志Hiroshima J. Med。 i ICES海洋科学杂志J. Mar. SCI。 i体外细胞和发育生物学 - 动物体外细胞开发。 生物。 anim。 I印度科学技术杂志Ind。 J.Sci。 技术。 i国际大会系列int。 恭喜。 ser。 I国际生物科学杂志Int。 J. Biol。 SCI。 i国际癌症国际杂志。 J. J. Mol。 SCI。 J rad。H Hiroshima医学科学杂志Hiroshima J. Med。i ICES海洋科学杂志J. Mar.SCI。 i体外细胞和发育生物学 - 动物体外细胞开发。 生物。 anim。 I印度科学技术杂志Ind。 J.Sci。 技术。 i国际大会系列int。 恭喜。 ser。 I国际生物科学杂志Int。 J. Biol。 SCI。 i国际癌症国际杂志。 J. J. Mol。 SCI。 J rad。SCI。i体外细胞和发育生物学 - 动物体外细胞开发。生物。anim。I印度科学技术杂志Ind。 J.Sci。 技术。 i国际大会系列int。 恭喜。 ser。 I国际生物科学杂志Int。 J. Biol。 SCI。 i国际癌症国际杂志。 J. J. Mol。 SCI。 J rad。I印度科学技术杂志Ind。J.Sci。 技术。 i国际大会系列int。 恭喜。 ser。 I国际生物科学杂志Int。 J. Biol。 SCI。 i国际癌症国际杂志。 J. J. Mol。 SCI。 J rad。J.Sci。技术。i国际大会系列int。恭喜。ser。I国际生物科学杂志Int。 J. Biol。 SCI。 i国际癌症国际杂志。 J. J. Mol。 SCI。 J rad。I国际生物科学杂志Int。J. Biol。 SCI。 i国际癌症国际杂志。 J. J. Mol。 SCI。 J rad。J. Biol。SCI。 i国际癌症国际杂志。 J. J. Mol。 SCI。 J rad。SCI。i国际癌症国际杂志。 J. J. Mol。 SCI。 J rad。i国际癌症国际杂志。J.J. Mol。 SCI。 J rad。J. Mol。SCI。 J rad。SCI。J rad。癌症I国际分子科学杂志Int。I国际放射生物学杂志Int。 生物。 J日本农业研究季刊JPN。 agric。 res。 Q. J J辐射研究杂志J. Radiat。 res。 J高级海洋科学技术学会杂志J. Adv。 3月 SCI。 技术。 Soc。 J航空航天杂志J. 航空航天J杂志农业和食品化学杂志J. Agric。 食物。 化学。 J农业气象学杂志J. Agric。 陨石。 J菌病学杂志J. Bacteriol。 J日本化学工程杂志J. Chem。 eng。 日本J临床和实验血症病理学杂志JCEH J JCEH J杂志生态技术研究J. Ecotechnol。 res。 J环境质量杂志J. Environ。 Qual。 J杂志《环境放射性杂志》。 放射性。 J Journal of实验植物学杂志J. Exp。 bot。 J遗传毒理学杂志J.Genetic Toxicol。 j综合现场科学杂志J. Integr。 现场科学。 J日本大气环境学会杂志J. JPN。 Soc。 Atmos。 环境。 J低剂量辐射杂志J. 低剂量辐射。 J核和放射化学杂志J. Nucl。 放射化学。 SCI。 J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。I国际放射生物学杂志Int。生物。J日本农业研究季刊JPN。agric。res。Q. J J辐射研究杂志J. Radiat。res。J高级海洋科学技术学会杂志J. Adv。3月SCI。 技术。 Soc。 J航空航天杂志J. 航空航天J杂志农业和食品化学杂志J. Agric。 食物。 化学。 J农业气象学杂志J. Agric。 陨石。 J菌病学杂志J. Bacteriol。 J日本化学工程杂志J. Chem。 eng。 日本J临床和实验血症病理学杂志JCEH J JCEH J杂志生态技术研究J. Ecotechnol。 res。 J环境质量杂志J. Environ。 Qual。 J杂志《环境放射性杂志》。 放射性。 J Journal of实验植物学杂志J. Exp。 bot。 J遗传毒理学杂志J.Genetic Toxicol。 j综合现场科学杂志J. Integr。 现场科学。 J日本大气环境学会杂志J. JPN。 Soc。 Atmos。 环境。 J低剂量辐射杂志J. 低剂量辐射。 J核和放射化学杂志J. Nucl。 放射化学。 SCI。 J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。SCI。技术。Soc。J航空航天杂志J.航空航天J杂志农业和食品化学杂志J. Agric。食物。化学。J农业气象学杂志J. Agric。 陨石。 J菌病学杂志J. Bacteriol。 J日本化学工程杂志J. Chem。 eng。 日本J临床和实验血症病理学杂志JCEH J JCEH J杂志生态技术研究J. Ecotechnol。 res。 J环境质量杂志J. Environ。 Qual。 J杂志《环境放射性杂志》。 放射性。 J Journal of实验植物学杂志J. Exp。 bot。 J遗传毒理学杂志J.Genetic Toxicol。 j综合现场科学杂志J. Integr。 现场科学。 J日本大气环境学会杂志J. JPN。 Soc。 Atmos。 环境。 J低剂量辐射杂志J. 低剂量辐射。 J核和放射化学杂志J. Nucl。 放射化学。 SCI。 J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。J农业气象学杂志J. Agric。陨石。J菌病学杂志J. Bacteriol。 J日本化学工程杂志J. Chem。 eng。 日本J临床和实验血症病理学杂志JCEH J JCEH J杂志生态技术研究J. Ecotechnol。 res。 J环境质量杂志J. Environ。 Qual。 J杂志《环境放射性杂志》。 放射性。 J Journal of实验植物学杂志J. Exp。 bot。 J遗传毒理学杂志J.Genetic Toxicol。 j综合现场科学杂志J. Integr。 现场科学。 J日本大气环境学会杂志J. JPN。 Soc。 Atmos。 环境。 J低剂量辐射杂志J. 低剂量辐射。 J核和放射化学杂志J. Nucl。 放射化学。 SCI。 J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。J菌病学杂志J. Bacteriol。J日本化学工程杂志J. Chem。 eng。 日本J临床和实验血症病理学杂志JCEH J JCEH J杂志生态技术研究J. Ecotechnol。 res。 J环境质量杂志J. Environ。 Qual。 J杂志《环境放射性杂志》。 放射性。 J Journal of实验植物学杂志J. Exp。 bot。 J遗传毒理学杂志J.Genetic Toxicol。 j综合现场科学杂志J. Integr。 现场科学。 J日本大气环境学会杂志J. JPN。 Soc。 Atmos。 环境。 J低剂量辐射杂志J. 低剂量辐射。 J核和放射化学杂志J. Nucl。 放射化学。 SCI。 J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。J日本化学工程杂志J. Chem。eng。日本J临床和实验血症病理学杂志JCEH J JCEH J杂志生态技术研究J. Ecotechnol。res。J环境质量杂志J. Environ。 Qual。 J杂志《环境放射性杂志》。 放射性。 J Journal of实验植物学杂志J. Exp。 bot。 J遗传毒理学杂志J.Genetic Toxicol。 j综合现场科学杂志J. Integr。 现场科学。 J日本大气环境学会杂志J. JPN。 Soc。 Atmos。 环境。 J低剂量辐射杂志J. 低剂量辐射。 J核和放射化学杂志J. Nucl。 放射化学。 SCI。 J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。J环境质量杂志J. Environ。Qual。J杂志《环境放射性杂志》。放射性。J Journal of实验植物学杂志J. Exp。bot。J遗传毒理学杂志J.Genetic Toxicol。 j综合现场科学杂志J. Integr。 现场科学。 J日本大气环境学会杂志J. JPN。 Soc。 Atmos。 环境。 J低剂量辐射杂志J. 低剂量辐射。 J核和放射化学杂志J. Nucl。 放射化学。 SCI。 J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。J遗传毒理学杂志J.Genetic Toxicol。j综合现场科学杂志J. Integr。现场科学。J日本大气环境学会杂志J. JPN。 Soc。 Atmos。 环境。 J低剂量辐射杂志J. 低剂量辐射。 J核和放射化学杂志J. Nucl。 放射化学。 SCI。 J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。J日本大气环境学会杂志J. JPN。Soc。Atmos。环境。J低剂量辐射杂志J.低剂量辐射。J核和放射化学杂志J. Nucl。 放射化学。 SCI。 J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。J核和放射化学杂志J. Nucl。放射化学。SCI。 J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。SCI。J核科学与技术杂志J. Nucl。 SCI。J核科学与技术杂志J. Nucl。SCI。SCI。技术。J Junder of Nutritional Science and Vitaminology J. Nutr。SCI。 维生素。 J海洋学杂志J. Oceanogr。 J Journal of Plankton Research J. Plankton Res。 J辐射研究杂志J. Radiat。 res。SCI。维生素。J海洋学杂志J. Oceanogr。 J Journal of Plankton Research J. Plankton Res。 J辐射研究杂志J. Radiat。 res。J海洋学杂志J. Oceanogr。J Journal of Plankton Research J. Plankton Res。J辐射研究杂志J. Radiat。 res。J辐射研究杂志J. Radiat。res。
教师(本科课程:UG)将根据以下政策组织和实施课程,以便学生可以实现文凭政策中指出的强制性目标。1。课程组织的政策(1)课程有效地结合了有关粮食,健康和环境基础的专业教育主题 - 人类生存的基础 - 范围内的教育学科,以培养广泛的知识和扎实的背景。((2)实用培训课程从国际角度培养学生,从国际角度扮演独立研究。((3)课程是根据与教学大纲中的讲座内容,严格的学习成果和成绩评估,自我评估以及课程改进的讲座内容评估相关的常规问卷进行评估的。2。(教育和教育学的政策1)我们促进了原始和创新的基础研究,以了解生物体,并提供实践和毕业培训以及项目开发的指导。(2)我们提供与
[4] Kisilevsky R. 从关节炎到阿尔茨海默病:关于淀粉样变性发病机制的最新概念。Can J Physiol Pharmacol,1987,65:1805-15 [5] György B、Lööv C、Zaborowski MP 等人。CRISPR/Cas9 介导的瑞典 APP 等位基因破坏作为早发性阿尔茨海默病的治疗方法。Mol Ther Nucleic Acids,2018,11:429-40 [6] Zetterberg H、Mattsson N. 了解散发性阿尔茨海默病的病因。Expert Rev Neurother,2014,14:621-30 [7] Jack CR Jr、Knopman DS、Jagust WJ 等人。阿尔茨海默病病理级联动态生物标志物的假设模型。Lancet Neurol,2010,9:119-28 [8] Ittner LM、Ke YD、Delerue F 等。tau 的树突状功能介导阿尔茨海默病小鼠模型中的淀粉样蛋白 β 毒性。Cell,2010,142:387-97 [9] Muralidar S、Ambi SV、Sekaran S 等。tau 蛋白在阿尔茨海默病中的作用:主要的病理因素。Int J Biol Macromol,2020,163:1599-617 [10] Wang X、Wang W、Li L 等。阿尔茨海默病中的氧化应激和线粒体功能障碍。 Biochim Biophys Acta, 2014, 1842: 1240-7 [11] Grothe M, Heinsen H, Teipel SJ. 成年年龄范围内以及阿尔茨海默病早期阶段胆碱能基底前脑萎缩。Biol Psychiatry, 2012, 71: 805-13 [12] He Y, Ruganzu JB, Jin H, et al. LRP1 敲低通过调节 TLR4/NF- κB/MAPKs 信号通路加重 Aβ 1-42 刺激的小胶质细胞和星形胶质细胞神经炎症反应。Exp Cell Res, 2020, 394: 112166 [13] Huang HC, Hong L, Chang P, et al.壳寡糖减弱Cu 2+诱导的细胞氧化损伤和细胞凋亡,涉及Nrf2激活。Neurotox Res,2015,27:411-20 [14] Tomljenovic L. 铝和阿尔茨海默病:经过一个世纪的争论,是否存在合理的联系?J Alzheimers Dis,2011,23:567-98 [15] Shen H,Guan Q,Zhang X,等。阿尔茨海默病神经炎症的新机制:肠道菌群介导的NLRP3炎症小体的激活。Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry,2020,100:109884 [16] Ferreira-Vieira TH,Guimaraes IM,Silva FR,等。阿尔茨海默病:针对胆碱能系统。Curr Neuropharmacol,2016,14:101-15 [17] Scannevin RH。针对神经退行性蛋白质错误折叠障碍的治疗策略。Curr Opin Chem Biol,2018,44:66-74 [18] Giau VV,Lee H,Shim KH 等人。CRISPR-Cas9 的基因组编辑应用促进阿尔茨海默病的体外研究。Clin Interv Aging,2018,13:221-33 [19] Gupta D,Bhattacharjee O,Mandal D 等人。CRISPR-Cas9 系统:基因编辑的新曙光。生命科学, 2019, 232: 116636 [20] Makarova KS, Wolf YI, Alkhnbashi OS, et al.更新了
这项工作得到了内蒙古自治区的自然科学基金会项目(编号2019MS08024)抽象非小细胞肺癌(NSCLC是最常见的组织学肺癌类型,在诊断时约有66%的患者中与远处转移有关。大脑是转移的常见部位,在初始诊断时,大约13%的患者在颅内受累。这严重影响了生活质量,并导致预后不良。驱动基因阳性NSCLC脑转移患者的靶向治疗可实现更好的颅内控制率;但是,使用驱动基因阴性NSCLC脑转移的患者的治疗选择有限。近年来,随着免疫疗法的扩展,免疫检查点抑制剂(ICI)已被广泛用于临床实践。ICI与放射疗法结合的治疗方式在治疗驱动基因阴性NSCLC脑转移的患者方面有望。本文回顾了敏感驱动器基因阴性NSCLC脑转移患者的放射治疗与免疫疗法的临床研究进度,目的是为可用的临床治疗方案提供参考。