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World File Search System基因库
麦芽酵母琼脂
1. Wickerham, J. Tropical Med. Hyg., 42, 176 (1939) 2. Williams, (Ed.)，2005，《官方分析化学家协会官方分析方法》，第 19 版，AOAC，华盛顿特区 3. 微生物类型培养物保藏中心和基因库 (MTCC) 微生物技术研究所，昌迪加尔。 4. Isenberg, HD 《临床微生物学程序手册》第 2 版。 5. Jorgensen, JH、Pfaller, MA、Carroll, KC、Funke, G.、Landry, ML、Richter, SS 和 Warnock., DW (2015) 《临床微生物学手册》，第 11 版。 1. 6. 美国公共卫生协会，《乳制品检验标准方法》，1978 年，第 14 版，华盛顿特区 7. Salfinger Y. 和 Tortorello ML，第五版（编辑），2015 年，《食品微生物检验方法概要》，美国公共卫生协会，华盛顿特区 8. Wehr HM 和 Frank JH，2004 年，《乳制品微生物检验标准方法》，第 17 版，APHA Inc.，华盛顿特区
协调转录转换网络介导人类疟原虫的抗原变异
摘要 疟原虫通过系统地改变暴露在受感染红细胞表面的抗原来避免免疫清除。这是通过对大型多拷贝基因家族 var 的个体成员进行严格调控的转录控制来实现的，这是疟疾感染的毒性和慢性性质的关键。var 基因的表达是相互排斥的，并受表观遗传控制，然而，大量寄生虫如何协调 var 基因转换以避免抗原库过早暴露尚不清楚。在这里，我们为一个转录网络提供了证据，该网络由一个普遍保守的基因 var2csa 锚定，该基因协调转换过程。我们描述了一种结构化的转换偏差，它会随着时间的推移而发生变化，并可能在长期感染过程中塑造 var 表达的模式。我们的研究结果解释了疟疾感染的一个以前神秘的方面，并揭示了拥有相对较少的变异抗原编码基因库的寄生虫如何协调转换事件以限制抗原暴露，从而维持慢性感染。
以树木为例的“系统方法”植物育种
需要“树木多样性育种”来应对多重全球挑战和趋势 21 世纪的一个关键棘手问题（见词汇表）是如何在支持人类持续发展的同时避开多个地球边界（有些边界已经超越）[1]。树木发挥着至关重要的作用 [2]。除其他积极作用外，它们还可以减缓气候变化、恢复土壤、作为保护生物多样性的生态基质（它们本身也代表着巨大的生物多样性），并作为食物、燃料、纤维、木材等来源为人类提供恢复力和消费选择。支持这些角色的 60 000 多种树种 [3] 占据着许多不同的生产环境，从单一栽培的木材种植园和果园到高度多样化的多功能森林和复杂的农林复合体，并且被驯化到不同程度，从野生到完全依赖人类进行再生 [4]。它们还往往拥有大型基因库，天然林中遗传变异很大（例如 [ 5 ]），可以通过管理来增强其有益作用，尽管这些遗传资源常常受到森林砍伐和农业景观简单化的威胁 [ 6 ]。
维持工业重要的微生物
•工业微生物机构通常会保留一系列微生物的集合，这些生物具有生产该机构生产的商品的基因库。•这种生物库存被称为培养物，并确保定期在制造过程中使用的生物体供应。•培养物中的生物保持在低代谢状态，其中将细胞的复制保持在最小甚至完全限制。•工业上重要的微生物通常是突变体，并且保留其保持低新陈代谢的状况，限制了它们恢复到低屈服的祖先的趋势。•在某些情况下，生物体在几天相对较短的状态中保持了活跃状态，在这种状态下，它们立即准备在发酵中使用；这样的生物被称为工作库存。•例如，在许多啤酒厂中，生产酵母有时在被丢弃之前最多可重复八次或更多。•在接种之间的间隔中，某些工人将这些酵母视为工作库存。•必须记住，工作库存是污染和/或突变的机会，这是工业发酵固有的两个严重问题。
作物改良前沿技术
摘要 过去二十年，作物改良的若干前沿技术得到了快速发展和应用，这些技术为选择具有更好遗传特性的改良育种系带来了速度、精度和成本效益。需要提及的几项此类技术包括准确、高效地表征不同基因库种质、高通量测序和基因分型、快速世代推进、基于现代测序的性状定位和基因发现，随后识别出优良单倍型、基因组选择、基因编辑、正向育种和多组学方法，包括更好的生物信息学工具/软件。虽然各种性状（尤其是复杂性状）的表型分析方案仍有改进空间，但上述前沿技术为提高开发具有未来性状的新品种的精度和速度提供了巨大的机会，以确保不同作物的可持续性。利用一个共同平台大规模集成和使用这些技术，为作物的可持续发展提供完美支持。
通向高能密度电池的道路 - 创新
6 Fudan Development Institute，Fudan University，上海200433，中国 *通信：hdguo@radi.ac.cn收到：2023年11月7日；接受：2024年1月2日；在线发布：2024年1月30日； https://doi.org/10.59717/j.xinn-life.2024.100051©2024作者。 这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。 引用：Luo L.，Wang H.，Chen Z.等，（2024）。 世界遗产保护的生物多样性共同利益。 创新生活2（1）：100051。 保存世界遗产（WHSS）保护措施独特的栖息地，这是多种生态系统，这些生态系统对于众多物种的生存至关重要。 通过保护物种内的不同基因库来促进遗传多样性。 保护这些地点维护生态系统的平衡，有助于维持物种丰富性和弹性。 这些保护努力是活着的实验室，为进化过程和适应，丰富全球生物多样性以及增强人类与自然之间的和谐提供了见解。 从这个角度来看，我们通过生态系统，物种和基因的镜头探索了世界遗产（WH）保护的三倍生物多样性。 最后，我们概述了WH保护方面的未来挑战及其对生物多样性保护和可持续发展的影响。6 Fudan Development Institute，Fudan University，上海200433，中国 *通信：hdguo@radi.ac.cn收到：2023年11月7日；接受：2024年1月2日；在线发布：2024年1月30日； https://doi.org/10.59717/j.xinn-life.2024.100051©2024作者。这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。引用：Luo L.，Wang H.，Chen Z.等，（2024）。世界遗产保护的生物多样性共同利益。创新生活2（1）：100051。保存世界遗产（WHSS）保护措施独特的栖息地，这是多种生态系统，这些生态系统对于众多物种的生存至关重要。通过保护物种内的不同基因库来促进遗传多样性。保护这些地点维护生态系统的平衡，有助于维持物种丰富性和弹性。这些保护努力是活着的实验室，为进化过程和适应，丰富全球生物多样性以及增强人类与自然之间的和谐提供了见解。从这个角度来看，我们通过生态系统，物种和基因的镜头探索了世界遗产（WH）保护的三倍生物多样性。最后，我们概述了WH保护方面的未来挑战及其对生物多样性保护和可持续发展的影响。
HIV 依赖性因子的 CRISPR 筛选表明，CCNT1 在 T 细胞中不是必需的，但对于 HIV-1 从潜伏状态重新激活是必需的
摘要：我们试图探索 HIV-1 复制所需的宿主因子也在潜伏期逆转中发挥作用的假设。利用假定 HIV 依赖因子的 CRISPR 基因库，我们进行了筛选以确定潜伏期再激活所需的基因。我们确定了几个在 HIV-1 潜伏期再激活中起关键作用的 HIV-1 依赖因子，包括 ELL、UBE2M、TBL1XR1、HDAC3、AMBRA1 和 ALYREF。敲除 Cyclin T1 (CCNT1) 是 P-TEFb 复合物的一个组成部分，对转录延长很重要，是筛选中的最佳结果，对使用多种潜伏期逆转剂的 HIV 潜伏期逆转具有最大的影响。此外，CCNT1 敲除可防止 HIV 潜伏期原代 CD4+ T 细胞模型中的潜伏期再激活，而不会影响这些细胞的激活。 RNA 测序数据显示，CCNT1 调节 HIV-1 前病毒基因的程度比任何其他宿主基因都要大，并且在激活后对原代 T 细胞中的 RNA 转录没有显著影响。我们得出结论，CCNT1 功能在 T 细胞中不是必需的，但对于逆转 HIV 潜伏期来说绝对是必需的。
影响冠状病毒的药物的药物遗传学研究
摘要2019年冠状病毒病的新全球大流行（COVID-19）导致了一场医疗危机，其死亡率和发病率很高。目前，几种药物正在加速研究中，没有确定的疗效，并且被用于将Covid-19患者视为未批准的药物使用或临床试验。应考虑最佳使用这些药物，例如基因作用，药物相互作用和药物毒性。遗传多态性是构成药代动力学基础的人群基因库中的一种遗传多样性，这会导致药物功能和反应改变。由于检查单个药物基因组学标记的时间有限，因此似乎人口药物基因组学测试可能有助于预期COVID-19患者的药物治疗失败。我们基因分型并研究了位于150个健康单个样本的10个药基因源的33个单核苷酸多态性（SNP）的等位基因频率。在伊朗人口中确定了与COVID-19治疗相关的32种潜在药物基因组学变异。在患者的药物治疗中考虑它们可能会影响治疗优化并降低不良反应的严重程度。
牛的人工授精
一般信息：一头公牛通常在任何一个周期内与 60% 的母牛交配并受孕。因此，如果一头公牛与一群母牛交配三个 (3) 个周期（63 天），它应该至少能让 93% 的母牛怀孕。我们使用 AI 的原因：· 保持已死亡公牛的基因可用性。· 保持已受伤且无法再与母牛进行自然交配的公牛的基因可用性。· 为防止公牛损失及其随后的基因损失提供保险。· 允许使用一头公牛来管理大量母牛。· 提供岛上没有的牛品种。· 避免饲养公牛的成本和风险（母牛受伤、饲养员、饲料成本等）。· 提供可能不可用或购买成本过高的基因优良公牛。 · 允许因任何原因而无法与公牛交配的母牛繁殖。· 降低性病和外来疾病的传播风险。· 降低遗传性基因缺陷的传播风险。· 通过扩大岛上动物的基因库来防止近亲繁殖。· 减少与从海外引进公牛相关的成本、繁文缛节和运输问题（例如检疫、检测等）。
使用基于质谱的新生DNA
探测DNA复制动力学的主要方法是DNA纤维分析，该分析利用胸苷类似物掺入新生的DNA中，然后将DNA纤维的免疫荧光显微镜检查。除了耗时且容易出现实验者偏见外，它不适用于研究线粒体或细菌中的DNA复制动力学，也不适合进行高通量分析。在这里，我们介绍了质谱 - 基于新生DNA（MS波段）的分析，作为DNA纤维分析的快速，无偏，定量的替代方案。在这种方法中，使用三重四极尖串联质谱法对胸苷类似物的结合进行定量。MS波段准确地检测到人类细胞的细胞核和线粒体以及细菌的DNA复制改变。在大肠杆菌DNA损伤诱导基因库中捕获的MS-BAND捕获的复制改变的高通量能力。因此，MS波段可以作为DNA纤维技术的替代方案，并具有对不同模型系统中复制动力学的高通量分析的潜力。