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World File Search System基因改造
背景：杨树的首次开花：利用新基因组技术进行的微小基因组变化可以改变物种特异性特征
摘要 美国科学家成功利用新基因工程（新基因组技术，NGT）将杨树的幼树期从 7 至 10 年大大缩短至仅几个月，从而实现提前开花。结果表明，只需进行少量基因改造，无需添加新基因，即可改变杨树的根本物种特异性特征。与一年生耕地植物类似，理论上，这使得可以在短时间内杂交和选择 NGT 杨树，从而大大加快其释放和销售。然而，如果杨树被释放或逃逸到环境中，这种特性可能会导致不受控制的蔓延，对受保护的杨树物种的保护产生巨大的后续影响。例如，在环境中蔓延的 NGT 杨树可能会取代濒危物种红色名录上的黑杨树。此外，复杂的生态系统可能会受到影响或破坏，因为杨树与大量物种相互作用，尤其是昆虫，包括受保护的蝴蝶和甲虫物种。
CAR-T和同种异体干细胞移植在淋巴肿瘤治疗中都有用吗？
摘要：异基因干细胞移植 (allo-SCT) 是治疗血液系统恶性肿瘤的首个免疫疗法：它一直被认为是一种疾病的治疗方法，但从未被认为是一种延长患者生命的方法。异基因干细胞移植的成功既源于它能够用强化放化疗治疗患者，也源于供体免疫介导的强大移植物抗白血病效应。尽管近年来取得了长足的进步，但疾病复发、移植物抗宿主病、感染并发症和治疗方案相关毒性等重大障碍仍然存在。此外，随着基因改造自体 T 淋巴细胞疗法 (CAR-T) 的商业化引入，血液系统恶性肿瘤（尤其是急性淋巴细胞白血病和某些形式的淋巴瘤）的治疗发生了革命性的变化。我们的回顾讨论了异基因干细胞移植适应症的现行标准和不断变化的范式以及 CAR-T 细胞治疗对淋巴肿瘤的作用。
酵母合成基因组学中 DNA 突变对核小体位置影响的全基因组预测
如今，基因改造基因组经常用于许多基础和应用研究领域。在许多研究中，编码或非编码区域被故意修改，以改变蛋白质序列或基因表达水平。修改基因组中的一个或多个核苷酸也会导致基因表观遗传调控的意外变化。因此，在设计具有许多突变的合成基因组时，能够预测这些突变对染色质的影响将非常有用。我们在此开发了一种深度学习方法，可以量化每个可能的单个突变对整个酿酒酵母基因组上核小体位置的影响。这种类型的注释轨道可用于设计改良的酿酒酵母基因组。我们进一步强调了该轨道如何为驱动核小体在体内位置的序列依赖机制提供新的见解。关键词——深度学习、基因组学、酿酒酵母、突变、合成生物学、核小体、DNA 基序
影响未来个体：为何以及何时生殖细胞基因组编辑需要对后代承担更大的道德义务
34 我假设胚胎在通过 GGE 进行基因改造之前和之后具有相同的数值身份，因此无论是否进行 GGE，出生的人在数值上是相同的，尽管在质量上有所不同。许多人可能同意，胚胎 DNA 的微小变化（例如单基因疾病的情况）不会将胚胎 A 变成新的胚胎 B。因此，不会出现数值上不同的人。但是，我知道这种说法并非没有争议，因为 GGE 应用于胚胎是否会导致不同的人诞生仍是一个悬而未决的问题，还应考虑许多其他因素：例如，基因变化的程度、变化在个体生命中的表现、这种变化的影响何时发生在个体的生命中等。关于这一点，请参阅：Zohar，N. (1991)。基因治疗的前景——一个人能从改变中受益吗？生物伦理学，5 (4)，275-288；Elliot，R. (1993)。身份与基因治疗的伦理学。《生物伦理学》，7（1），27-40。
基因技术立法 - 开放期刊系统
1996 年《危险物质和新生生物法》的目的是“通过预防或管理危险物质和新生生物的不利影响，保护环境以及人民和社区的健康和安全”（第 4 条）。2024 年，《危险物质和新生生物法》将成为新西兰管理基因改造（如基因编辑）的主要立法（Everett-Hincks 和 Henaghan，2019 年；Kershen，2015 年）。根据该法案，转基因或编辑生物 (GMO) 被视为“新生生物”，即使是在新西兰开发（第 2A 条）。未经国家环境监管机构环境保护局 (EPA) 事先批准，不得在新西兰开发、进口、实地测试或释放任何转基因生物（第 34、38A、40、109 条）。基因技术在 20 世纪 90 年代开始引起公众的关注（Smith，2006 年），并于 2000 年成立了皇家基因改造委员会。二十多年后，人们对基因技术和态度已与 2003 年《危险物质和新生物法》中转基因生物条款最后一次重大更新时相比发生了很大变化（Brankin，2021 年；Clark 等人，2024 年；Penman 和 Scott，2019 年）。特别是过去十年中更精确的基因编辑的发展，重新引起了人们对基因技术帮助解决新西兰健康、环境和初级产业挑战的潜力的兴趣和讨论（Pantoja，2021 年；Penman 和 Scott，2019 年；科学媒体中心，2024 年）。在环境背景下应用的基因技术包括美国环保署不认为是基因改造的技术，例如 eDNA（Bunce 和 Freeth，2022 年）和基因沉默（Palmer 等人，2022 年）。然而，基因技术领域的控制问题和毛利人缺乏自决权的问题仍未得到解决（Clark 等人，2024 年；Cram，2005 年；Palmer、Mercier 和 King-Hunt，2020 年）。自 1990 年代以来，毛利人就参与了基因技术的辩论（Smith，2006 年；Tipa，2016 年），并一直对基因技术缺乏控制表示担忧。
了解控制小核糖核酸病毒的机制......
感染 项目时长 5 年 0 个月 项目目的 (a) 基础研究 (b) 转化或应用研究，具有以下目的之一： (i) 避免、预防、诊断或治疗人类、动物或植物的疾病、不健康或异常或其影响 关键词 小核糖核酸病毒、保守表位、保护性免疫反应、抗病毒药物、抗病动物 动物类型 生命阶段 小鼠 成年 回顾性评估 国务卿已确定不需要对该许可证进行回顾性评估。 目标和好处 描述项目目标，例如它正在解决的科学未知数或临床或科学需求。 这个项目的目的是什么？ 小核糖核酸病毒家族中的病毒包括动物和人类的重要病原体。该项目的总体目标是使用小鼠感染模型来了解这些病毒的复制并开发新方法来控制它们引起的疾病。该项目可能带来的潜在利益，例如科学可能如何进步，或者人类、动物或环境可能如何受益——这些可能是项目期间的短期利益，也可能是项目完成后的长期利益。为什么开展这项工作很重要？与本申请相关的动物小核糖核酸病毒是口蹄疫病毒 (FMDV)，它是牲畜最严重的疾病之一，由于生产力下降和对未认证为无病地区的贸易禁运而导致巨大的经济损失。这种疾病在许多低收入国家流行，损害了经济和社会发展，并导致农村社区的贫困和营养不良。偶尔爆发的口蹄疫也会对通常不存在这种疾病的高收入地区产生重大影响，2001 年英国的爆发导致损失约 100 亿英镑。疫苗可用于控制口蹄疫，但目前的疫苗有明显的缺点，例如免疫持续时间短和对各种循环菌株的保护性较差。为了克服这些缺点，需要了解如何诱导更广泛的保护性和更持久的免疫反应。预防牲畜口蹄疫的另一种策略是对动物进行基因改造，使它们不再容易感染病毒。近年来，这种基因改造 (GM) 的概念通过一种称为基因编辑的过程得到了显著改进，现在可以通过对动物进行非常细微的改变来引入有利的特性
基因编辑的伦理挑战
几十年来，基因组工程一直是推动人们理解基因组的关键因素，而最近，基因组工程取得了重大进展，并推动了基因编辑的发展。当前的颠覆性创新包括两个方面：实施越来越快的基因组测序技术，以及开发越来越有效的工具来编辑现有的 DNA 序列，也就是重写基因组。这些前所未有的生物技术工具有望揭示基因的作用、个体间差异的意义（尤其是对健康状况的影响），以及更广泛地说，为人类基因组修复和驯化更适合人类需要的动植物提供新的可能性。然而，将这些技术应用于包括人类在内的生物体，引起了人们对将基因改造传递给后代的担忧，并促使人们进行伦理反思。伦理问题还涉及我们目前对所用技术的不完善控制，以及对个人、生态和进化系统不确定的短期和长期影响。在植物界，品种间杂交、选择方法、体外繁殖技术、诱变、转基因以及最近的基因编辑使某些植物能够适应人类的需求，同时也引发了社会、伦理和知识产权问题。在动物界，人们正在开发多种应用，将有害基因引入有害物种以根除它们，或者将抗性基因引入受到细菌、真菌或病毒感染威胁的物种种群。然而，这些应用对生态系统的长期影响尚不清楚。在动物育种中，长期以来，为了商业盈利的目的，人们一直采用实验程序来扩大牲畜基因改造的传统方法，但却忽视了动物福利问题。更成问题的是基因驱动，它能够迅速将基因改造引入整个种群。在公共卫生背景下，使用基因驱动来控制媒介传播疾病，例如消灭疟疾媒介蚊子等物种，可能会带来无法控制的、甚至可怕的后果。在人类中，对体细胞基因组进行临床试验似乎在各个领域都很有前景。然而，编辑人类基因组的新可能性不是在体细胞中，而是在配子或胚胎中，这意味着身体的所有细胞，包括生殖细胞，都会受到影响，这带来了一个重大的伦理问题，因为基因修改会传给后代。这种方法在法国被禁止，除了基础研究领域之外，因为它违反了法国批准的《奥维耶多公约》和《法国民法典》第 16-4 条。
基因治疗途径——全球挑战、机遇和……
引言 1989 年，第一位在获准的临床试验中接受基因改造细胞治疗的患者接受了治疗。1 如今，三十多年过去了，我们看到基因疗法的希望已经成为现实，可以帮助那些身患绝症的患者摆脱生命危险。欧盟和其他七个国家已拥有一种或多种获批的基因治疗产品。预计这一数量将激增，到 2030 年预计将有超过 60 种新获批产品。2 人们对这些新疗法的热情是理所当然的，但全球范围内的获取存在许多挑战。在这里，我们将当前的基因疗法开发工作与资源匮乏地区的主要卫生重点进行比较。然后，我们将基因治疗需求与基因治疗临床试验和许可产品的获取进行对比。我们讨论了最近由美国基因和细胞治疗学会 (ASGCT) 主办的巴西、南非和印度研讨会上的见解，以得出结论并抓住机会，促进更好地获取新型基因疗法。
基因编辑肉：解读消费者的态度和潜在购买行为
新型基因编辑 (GE) 技术为提高牲畜生产力和应对全球畜牧业生产可持续性和粮食安全挑战提供了良好的机会。然而，这些技术与食品生产中以前的基因改造技术一样，很可能引起社会争议和反对将其用于肉类行业。在这里，我们探讨了公众对基因编辑肉类产品的态度和消费倾向及其对畜牧业的潜在附加好处。我们的结果表明，社会认知目前是一个整体，其中基因编辑技术的使用充当了肉产品质量的外在线索，并用于同时对所有质量方面做出一系列推断。虽然持反对 GE 态度的消费者通常对价格折扣或附加好处不敏感，但附加好处增加了大多数温和和支持 GE 消费者的消费倾向，其中与动物福利相关的好处比与环境或人类健康问题相关的好处影响更大。
社论：产油微生物的生理学、应用和生物工程
当前研究主题提供了一个有效的交流平台，收集原创研究文章和评论论文，探讨脂质积累机制、生物技术应用以及与产油真菌（包括非常规酵母）相关的代谢工程努力。微生物已被用于生产高能量密度的碳氢化合物，作为“直接”燃料、可再生化学品和增值化合物。除了大肠杆菌和酿酒酵母等常用的模型生物外，在过去的几年中，天然积累高含量脂质的产油酵母已被直接使用或通过基因改造用于生产各种生物产品，尽管早期对微生物油的商业化生产的试验可以追溯到第一次世界大战。本研究主题集中于产油酵母的生物工程进展，包括解脂耶氏酵母和红冬孢酵母（Rhodosporidium (Rhodotorula ) toruloides），用于生产生物燃料和生物产品，特别强调建立合成生物学工具和新颖的工程策略。