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World File Search System基因组学
宏基因组学-Toolkit
对具有数千个数据集的复杂环境的元基因组分析，例如序列读取存档中可用的数据集，需要巨大的计算资源才能在可接受的时间范围内完成计算工作。这样的大规模分析要求有效地使用基础基础结构。此外，任何分析都应完全可复制，并且必须公开使用工作流程，以允许其他研究人员了解计算结果背后的推理。在这里，我们介绍了可扩展的数据不可吻合的工作流程的宏基因组学-Toolkit，该工作流程分别自动化了从Illumina或Oxford Nanopore技术设备获得的简短和长元基因组读取。宏基因组学-ToolKit不仅提供元基因组工作流程中预期的标准功能，例如质量控制，组装，套件和注释，还提供独特的特征，例如基于各种工具的质粒识别，恢复无组成的微生物社区成员的恢复以及通过互联网模型的相互依赖模型的恢复，并发现了一个元素，并依赖于基本模型，并进行互联网组合。此外，元基因组学 - 库尔基特包括一个机器学习优化的组装步骤，该步骤量身定制元素组装程序要求的峰值RAM值以符合实际要求，从而最大程度地减少对专用高音硬件的依赖性。虽然可以在用户工作站上执行Metagenomics-Toolkit，但它还为有效的基于云的集群执行提供了多种优化。Metagenomics-Toolkit是开源的，可在https://github.com/metagenomics/metagenomics-tk上获得。我们将宏基因组学 - toolkit与五个常用的宏基因组工作流进行了比较，并通过在757 Metagenome数据集中从污水处理样本中执行元基因组学 - 静电库来证明其能力，以研究可能的污水核心微生物组。
基因组学：对教育的影响
2024年1月，基于《基因组学之外的健康报告》（Beyond Health Report），教育部（DFE）与政府科学办公室（GO-Science）共同资助，通过期货采购框架委托IPSOS UK委托英国，以了解基因组学在教育中使用的潜在未来风险和机会。政府科学办公室的《超越健康报告》（政府科学办公室，2022年）强调了两个潜在的问题要探讨。首先，与教育相关领域的基因组测试中不受管制的商业市场的潜在扩展。其次，在出生时基因组筛查的潜在使用以在获得其他数据之前确定其他教育需求；例如，确定患有与特殊教育需求和残疾相关状况的较高风险的儿童（发送）。
基因组学和生物信息学（次要）
生物学科学旨在了解其各种形式的生活的运作。生物学系是世界一流实验室的所在地，教职员工致力于推动知识的前沿并教育下一代科学家和生物医学专业人员。研究和教学涵盖了现代生物学的范围，从微生物到多细胞动物和植物，从分子和细胞过程到遗传学，发育，行为和进化。
精确医学和基因组学
4 Department of Economics, Chukwuemeka Odumegwu Ojukwu University, Igbariam, Anambra State, Nigeria ___________________________________________________________________________ Corresponding Author: Francisca Chibugo Udegbe Corresponding Author Email: udegbefrancisca14@gmail.com Article Received: 15-01-24 Accepted :20-03-24发布：18-04-24许可详细信息：作者保留了本文的权利。该文章是根据创意共享属性的条款分发的，NON商业4.0许可证（http://www.creativecommons.org/licences/by-nc/4.0/），该公司允许非商业用途，复制和分布工作，而无需进一步的工作归因于原始工作，以归因于原始作品，以归因于本期刊的开放式访问页面。___________________________________________________________________________
谷物质量的基因组学
摘要：基因组学的快速进步正在提供谷物中质量（营养和功能）遗传基础的工具。这有望通过减少对新品种的广泛最终产品测试的需求，从而允许增加遗传增益率。许多质量特征是相对较新的人类选择的结果，因此很可能仅由几个主要基因控制。这使得鉴定这些基因用于育种选择是育种者的有吸引力的目标。发现基因的示例，这些基因是关键谷物质量属性的主要因素，包括大米的香气和烹饪温度（通过重新测序确定）以及小麦的面包体积和铣削产量（通过转录组分析确定）。将基因组工具扩展到包括野生亲戚在内的更广泛基因库的分析，将使未来可能有助于改善或新颖的谷物质量的等位基因鉴定，并且可能对确保在变化的气候下保留质量至关重要。可能会产生全新的谷物物种。关键词：基因组学，测序，小麦，大米，玉米，大麦，高粱，最终使用质量。
秋葵：育种和基因组学
抽象的秋葵是一种重要的蔬菜作物，在世界的热带和亚热带地区以及温带地区的温暖地区种植。其商业种植专门分布在亚洲和非洲的各个发展中国家。通常，通常培养的秋葵被报告给四倍体物种，并具有非常大而复杂的基因组，它利用现代的OMICS技术阻碍了其快速的遗传改善。繁殖方法适用于自授粉作物，经常用于秋葵的遗传改善，例如植物引入，纯线选择，杂交，然后选择，突变育种和异性疾病育种。血统的选择和杂种育种，这导致了印度许多品种和杂种的发展。在现代的秋葵繁殖中，对YVMV，oelcv，吮吸害虫和鲍鱼的多种耐受性，易于收获，深绿色水果颜色和理想的植物类型是主要目标特征。在过去的几十年中，不同的公共部门机构已开发并发布了33种改进的品种/混合动力车，以使全国农业社区受益。这些品种/混合动力车中很少有人对印度的秋葵产量产生了值得注意的影响。本文回顾了秋葵育种的当前状态，包括遗传资源，细胞遗传学关系，育种目标，品种发展，抗性育种，生物技术干预及其未来的改善策略。关键词：秋葵，遗传学，育种，遗传资源，生物技术。
遗传学，基因组学和进化
纤毛属均成为微生物真核遗传学中的第一个模型系统之一，这在很大程度上有助于早期理解与基因组重排，隐秘形成，细胞质遗传性和内生物植物的多种多样的现象，以及在interns of interns of Small and small and cons of shime and cons of sym and cons of sym and of n os of small and of necne and small and of necne and small。最近在科学和人口基因组学领域取得了实质性进展。Parmecium物种将一些最低的已知突变率与一些已知有效人群以及可能非常高的重组率相结合，从而使人口遗传环境促进了异常有效的选择能力。因此，基因组非常精简，具有很小的基因间区域与少量的微小内含子相结合。大部分黑质研究的主题，古代的aurelia物种复合物，是两个
胡萝卜：育种和基因组学
摘要 胡萝卜 ( Daucus carota ) 是一种重要的冷季根类蔬菜，在全球广泛种植和消费。其块根富含胡萝卜素、花青素、膳食纤维和维生素，还具有独特的风味和健康益处。传统和现代分子育种技术都为提高全球温带、亚热带和热带地区胡萝卜的产量和品质做出了贡献。在本文中，我们简要总结了现有的遗传资源、胡萝卜产量、品质和主要生物和非生物胁迫育种的进展、基因组资源和分子育种。我们还讨论了热带胡萝卜育种在改良重要性状（主要是 β-胡萝卜素、钝根形和无疤痕光滑根）方面面临的挑战和未来前景。 关键词 : 胡萝卜、胡萝卜、根、热带、育种、杂交、基因组学。
非洲健康基因组学
优先领域公共卫生摘要非洲健康基因组学的核心旨在利用基因组学的潜力革新非洲的医疗保健。基因组学可以更好地理解稀有疾病，癌症和感染，这可以导致更有效的治疗方法。结合生化，生物物理和结构分析，基因组学是精确医学和个性化治疗方法的有力工具。，尽管具有巨大的价值，但由于基础设施，资源和科学能力不足，在非洲仍在使用基因组学。该核心将建立基于基因组学的稀有疾病，癌症和感染的诊断能力，并结合研究蛋白质结构功能功能关系并支持最佳药物治疗和疫苗开发。它将为非洲研究界提供一个独特而开放的平台，以利用与蛋白质结构功能研究相结合的全部基因组学潜力，这是彻底改变传染病和罕见的非传染性疾病的基本工具。共同领导（学术，大学）
amplicon宏基因组学
Amplicon宏基因组学是基于微生物RRNA基因的NGS测序。由于ngs读取长度受到限制，因此只能放大和测序rRNA基因的一部分。对于原核生物，该分析靶向16S rRNA基因的高变量区域（V1-9），而对于真菌，内部转录的间隔区域（ITS）用于分类分析（见图1）。理想的底漆系统应该足够通用，以涵盖广泛的分类群体，而随之而来的扩增子必须提供足够的分类信息来进行可靠的分类学分类。根据我们的经验和16S/ITS分析管道的验证，我们建议表1中显示的引物系统。我们的服务不仅限于显示的标记基因和底漆系统，还限于其他系统发育标记基因（例如，细胞色素C氧化酶I）和底漆系统可以使用。试点研究对于为您的特定研究问题找到最佳的底漆系统非常有帮助。