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World File Search System基序
UWSP的化学研究机会
描述：冶金烯已经捕获了自1951年意外制备二循环（1下，M = Fe）以来的合成化学家和理论家的想象。多年来，基于复合物1的基序的多种冶金概念已经合成，最近人们对三甲基复合物（如2和尚未达到尚未实现的四边形decker decker complects）产生了兴趣。3。的确，如果我们将基于金属新近基序的“分子线”授课，将会发生什么？这种复合物将如何合成，它们的电子特性将是什么？我的小组将与西雅图大学的埃里克·沃森教授合作，试图回答这些确切的问题。沃森教授的本科生团队将综合新颖的三甲板综合体，并致力于制造七叶树综合体。我的研究小组将使用密度功能理论（DFT）来研究合成和想象的复合物的电子结构，以便更好地了解这一组有机金属物种的迷人化学。
基于核酸的靶向降解新进展...
基于核酸的TPD具有以下优势：首先，扩大了细胞内靶蛋白的范围。以核酸基序为弹头的PROTAC已成功用于降解缺乏活性配体结合位点的蛋白质，包括RNA结合蛋白（RBP）、转录因子（TF）和G-四链体（G4）结合蛋白。其次，可用于开发膜蛋白靶向降解的平台（例如双特异性适体嵌合体），核酸适体还可作为靶向递送工具，实现肿瘤特异性靶向降解。第三，核酸基序可作为靶向降解的底物用于治疗RNA疾病。一种新兴的RNA降解技术——核糖核酸酶靶向嵌合体（RIBOTAC）表明PROTAC的嵌合降解原理已扩展到RNA领域。本综述介绍了近年来新兴的基于核酸的TPD策略以及针对核酸（RNA）靶标的靶向降解新策略[3]。
科学期刊
具有可伸缩方法的聚合物中的微孔微孔度具有巨大的潜力，可以进行节能分子分离。在这里，我们报告了一种双相分子工程方法，可以通过界面聚合制备微孔聚合物纳米膜。通过整合两个微孔生成单元，例如水溶性Tröger的碱基（TBD）和一个扭曲的螺旋氟二氟烯基序（SBF）基序，最终的TBD-SBF聚酰胺显示出前所未有的高表面积。与传统化学制备的对照膜相比，具有中等分子量截止（〜640 g mol-1）的溶剂渗透率高达220倍（〜220 nm），该溶剂渗透率提高了220倍，而传统化学作品中的对照膜相比，目前均优于当前报道的聚合物膜。，我们还通过探索水相单体的同类异构体作用来操纵微孔力，突出了基于SBF的微孔聚酰胺对碳氢化合物分离的巨大潜力。
主机ZCCHC3通过双重机制阻止了HIV-1感染和生产
总结大多数哺乳动物细胞通过表达激活免疫系统的各种限制因子和传感器来防止病毒感染和增殖。已经鉴定出抑制人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）的几种宿主限制因子，但大多数人都被病毒蛋白拮抗。在这里，我们以CCHC型锌 - 纤维纤维蛋白3（ZCCHC3）为抑制HIV-1和其他逆转录病毒的产生的新型HIV-1限制性FACER，但似乎并未被病毒蛋白直接拮抗。它通过通过锌 - 纤维基序与GAG Nucleocapsid（GAGNC）结合起作用，该基序抑制了病毒基因组募集并导致基因组较高的病毒体产生。ZCCHC3还通过中间折叠结构域与病毒基因组上的长时间重复结合，将病毒基因组隔离为P体，从而导致病毒复制和产生减少。这种独特的双作用抗病毒机制构成了ZCCHC3的上调，这是一种新型的潜在治疗策略。
用酶上的DNA存储的逻辑密度缩放 - ...
DNA由于其高密度和耐力而成为长期数据存储的有前途的候选者。当今DNA存储中的主要挑战是合成的成本。在这项工作中，我们提出了复合图案，该框架工作使用预制基序的混合物作为构建块，以通过缩放逻辑密度来降低合成成本。为了撰写数据，我们会引入桥寡核苷酸组装，这是一种基于复合基序合成寡核体的酶结扎技术。对于序列数据，我们引入了直接的寡核苷酸测序，这是一种基于纳米孔的技术，用于序列寡核苷，而无需组装和扩增。为了解码数据，我们引入了Motif-Search，这是一个新颖的共识呼叫者，尽管合成和测序误差，但仍提供准确的重建。使用所提出的方法，我们提出了一个端到端实验，其中我们以84位/循环的逻辑密度存储文本“ Helloworld”（14-42×改进了对象。）
剖析p63和p53
摘要转录因子p53是最著名的肿瘤抑制剂，但其同胞p63是表皮发育的主要调节剂，也是鳞状细胞癌（SCC）中的关键致癌驱动器。尽管有多种基因表达研究，但报告的p63依赖性基因的重叠有限，因此很难破译p63基因调节网络。尤其是在研究中对p63响应元件的分析有很大不同。为了解决这种复杂的数据情况，我们提供了一个综合资源，该资源能够评估对任何感兴趣的人类基因的p63依赖性调节。我们结合广泛的CHIP-SEQ数据结合使用了一种新型的迭代基序搜索方法，以实现p53和p63结合位点，识别基序和潜在的共同因素之间的精确全球区别。我们将这些数据与增强子：基因关联整合在一起，以预测p63靶基因，并确定代表预后和治疗干预候选者的SCC中通常取消调节的基因。
RNA 时间戳可识别 RNA 测序中单个分子的年龄
目前的单细胞 RNA 测序 (RNA-seq) 方法仅提供有关基因表达动态的有限信息。我们在此介绍 RNA 时间戳，这是一种通过利用 RNA 编辑推断 RNA-seq 数据中单个 RNA 年龄的方法。为了引入时间戳，我们用一个报告基序标记 RNA，该基序由多个 MS2 结合位点组成，这些位点会募集与 MS2 衣壳蛋白融合的腺苷脱氨酶 ADAR2。ADAR2 与标记 RNA 结合会导致 A-to-I 编辑随时间累积，从而可以以小时级精度推断 RNA 的年龄。通过结合由同一启动子驱动的多个带时间戳的 RNA 的观察结果，我们可以确定启动子何时处于活跃状态。我们证明该系统可以推断多个过去转录事件的存在和时间。最后，我们应用该方法根据过去转录活动的时间来对单个细胞进行聚类。RNA 时间戳将允许将时间信息纳入 RNA-seq 工作流程。
改进的 LbCas12a 变体具有改变的 PAM 特异性......
Cas12a（以前称为 Cpf1）核酸酶在基因组工程中的广泛使用受到它们需要相当长的 TTTV 原型间隔区相邻基序 (PAM) 序列的限制。在这里，我们旨在放宽这些 PAM 限制，并通过将其相应的 RR 和 RVR 变体的突变与改变的 PAM 特异性相结合，生成了在哺乳动物和植物细胞中活跃的四种 Cas12a 直系同源物的新型 PAM 突变变体。选择表现出最高活性的 LbCas12a-RVRR，使用基于质粒的测定法深入表征其在哺乳动物细胞中的 PAM 偏好。LbCas12a-RVRR 的共识 PAM 序列类似于 TNTN 基序，但也包括 TACV、TTCV CTCV 和 CCCV。经发现，改良的 LbCas12a (impLbCas12a) 中的 D156R 突变以 PAM 依赖的方式进一步提高了该变体的活性。由于 impLbCas12a 和最近报道的 enAsCas12a 变体的 PAM 偏好重叠但仍有差异，它们相互补充，为基因组编辑和转录组调节应用提供了更高的效率。
人类卫星 3 DNA 编码兆碱基规模的转录因子结合平台
真核生物基因组中经常散布着大量串联重复序列，称为卫星 DNA，这些序列是组成性异染色质的基础，常位于着丝粒区域周围。虽然某些卫星 DNA 类型在着丝粒生物学中具有明确的作用，但其他丰富的卫星 DNA 的功能尚不明确。例如，人类卫星 3 (HSat3) 约占人类基因组的 2%，形成高达数十兆碱基的巨大阵列，但这些阵列在着丝粒功能中没有已知的作用，直到最近才几乎完全被排除在基因组组装之外。因此，这些巨大的基因组区域仍然相对研究不足，而 HSat3 的潜在功能作用在很大程度上仍然未知。为了解决这个问题，我们对新的 HSat3 结合因子进行了系统筛选。我们的工作表明，HSat3 阵列含有高密度的转录因子 (TF) 基序，这些基序与与多个高度保守的信号通路相关的因子结合。出乎意料的是，HSat3 中最富集的 TF 属于 Hippo 通路转录效应子家族 TEAD。我们发现 TEAD 以细胞状态特异性的方式将辅激活因子 YAP 募集到 HSat3 区域。利用 RNA 聚合酶-I 报告基因检测、HSat3 的靶向抑制、YAP 的诱导降解和超分辨率显微镜，我们表明 HSat3 阵列可以将 YAP/TEAD 定位在核仁内，YAP 在那里调节 RNA 聚合酶-I 活性。除了揭示 Hippo 通路与核糖体 DNA 调控之间的直接关系外，这项研究还表明卫星 DNA 可以编码多个转录因子结合基序，为这些巨大的基因组元素定义了新的作用。
物联网的实用跨层射频基于射频的身份验证方案
摘要常染色体显性症（AD）高IGE综合征（HIE）的抽象患者患有一系列表现形式，包括复发细菌和真菌感染，严重的特应性和骨骼异常。这种情况通常是由单相关的显性阴性（DN）STAT3变体引起的。在2020年，我们描述了来自八名具有DN IL6st变体的八种幼虫的患者，导致了一种新形式的AD HIE。这些变体编码了截短的GP130受体，具有完整的细胞外和跨膜结构域，但缺乏细胞内回收基序和四个STAT3结合残基，导致无法循环和激活STAT3。我们在这里报告了三个无关的HIS-AD家庭中IL6ST的两个新的DN变体。这些变体的生化和临床影响与先前报道的变体的生化和临床影响不同。p。（Ser731Val f s*8）变体，在来自两个家族的7例患者中鉴定出来，缺乏回收基序和所有STAT3结合残基，但其在细胞表面的水平仅略有升高，并且它的基础是轻度生物学表型，具有可变的临床表达性。p。（arg768*）在单个患者中鉴定出的变体缺乏回收基序和三个最远端的STAT3结合残基。这种变体在细胞表面积聚，并构成严重的生物学和临床表型。p。（Ser731Val f s*8）变体表明，在细胞表面上以接近正常水平表达的DN GP130可以是异质临床表现的基础，范围从轻度到重度。p。（arg768*）变体表明，截短的GP130蛋白保留了一种STAT3结合残基可以是严重HIE的基础。