抽象的超级增强剂是转录因子和染色质调节剂密集地占据的活性超增强剂的类别,可控制疾病相关基因的表达和细胞身份。最近的研究表明,各种因素和超级增强剂,尤其是在各种癌症中形成复杂结构。然而,我们目前对超级增强剂的了解,例如其基因组位置,与其他超级增强剂区域的因素,功能和区别的相互作用仍然有限。这项研究旨在采用深度学习技术来基于基因组和表观基因组特征来检测和区分超级增强剂和增强剂,并将结果的准确性与本研究中的其他机器学习方法进行比较,除了评估算法外,我们还培训了一组基因组和表观基因组和表观学算法 - DNA序列中的超级增强剂。我们以更高的精度和精度成功地预测了序列中超级增强剂的存在。
摘要:基因组结构,表观遗传学和增强子功能控制细胞的命运和身份。重新编程对诱导的多能干细胞(IPSC)将起始体细胞的转录率和染色质景观更改为逐步的多能细胞的转录景观。在正常胚胎发育过程中,调节网络的变化受到严格的调节,以确定细胞命运,并且同样需要在重编程过程中在细胞命运控制中发挥作用。关闭躯体程序并打开多能计划涉及表观遗传景观,增强子功能,染色质访问性和3D Chro-Matin拓扑的动态重组。在这种情况下,我们将在这里审查有关控制在体细胞重编程过程中控制和维护多能力的过程的当前知识。
摘要:由于发现青霉素,β -lactam抗生素通常用于治疗细菌感染。不幸的是,与此同时,病原体可以通过产生β-乳糖酶来发展对β-乳酰胺抗生素的抗性,例如青霉素,头孢菌素,单oc省和碳青霉烯。因此,将β -LACTAM抗生素与β-内酰胺酶抑制剂的组合是控制β-lactActam抗性细菌的一种有希望的方法。新型β-乳糖酶抑制剂(BLI)的发现对于有效治疗抗生素耐药细菌感染至关重要。因此,这篇综述讨论了旨在增强β-lactam抗生素活性的创新抑制剂的发展。具体而言,本综述描述了不同类别的β-乳糖酶的分类和特征以及β-乳酰胺和BLI的协同机制。此外,我们还引入了化合物的潜在来源,以用作新型BLIS。这为克服β-乳糖果酶产生细菌的当前挑战提供了见解,并与BLI结合设计有效的治疗选择。
2008 年,我开始研究参与代谢调节的信号分子的作用机制,并发现氨基葡聚糖(一种葡聚糖)促进活性受体复合物的形成。2011 年,由于日本东部大地震,我的研究活动被迫停止。我的导师告诉我 RIKEN 的灾难受害者支持计划。我很幸运地被录取进入了这个项目,并加入了一个专门从事葡聚糖有机合成的实验室,继续我的研究工作 10 个月。在此期间,我与专门从事合成有机化学的化学家进行了多次讨论,我认识到从化学角度了解生物功能的好处。这让我有机会探索我之前一直在研究的分子生物学和细胞生物学方法,并将生物化学视角融入我对葡聚糖内在参与机制的研究中。
抽象增强器协调驱动多细胞发展和谱系承诺的基因表达程序。因此,人们认为增强子的遗传变异通过改变细胞命运承诺会导致发育疾病。然而,尽管已经确定了许多含有变异的增强子,但缺乏内生测试这些增强剂对谱系承诺的影响的研究。我们执行一个单细胞CRISPRI筛选,以评估与先天性心脏缺陷(CHD)有关的25种增强子和推定心脏靶基因的内源性作用。我们确定了16个增强剂,其抑制导致人类心肌细胞(CMS)的分化不足。专注的CRISPRI验证屏幕表明,TBX5增强剂的抑制延迟了从中期到后期CM状态的转录开关。两个TBX5增强剂表观遗传扰动的内源性遗传缺失。共同确定了心脏发育的关键增强子,并表明这些增强剂的不正调可能导致人类患者的心脏缺陷。
摘要书籍程序摘要#1探索阴影增强剂建筑的功能意义Jillian Ness,Yu Wang,Christian Mei,Renata Serio,Renata Serio,Zeba Wunderlich Boston University,美国,美国许多发育基因都受到一套看似冗余的增强剂的调节,这些增强剂可以推动重叠的Spatiotemporpormoral模式。这些多增强器系统被称为阴影增强剂。阴影增强子可以缓冲遗传和环境应力以驱动正常的基因表达模式。使用果蝇胚作为模型,我们表明,前后图案基因的阴影增强子通过结合不同的输入转录因子的不同集来驱动一致的基因表达模式。尽管如此,尚不清楚为什么阴影增强子转录因子结合位点分布在多个增强器上,而不是在单个增强器中。可以想象,阴影增强子使用的机制可以编码为单个增强剂。我们已经生成了增强剂记者,其中消除了阴影增强剂之间的内源性DNA以做出“挤压”配置。令人惊讶的是,我们发现毛压和内源间隔增强子之间的RNA模式,水平和动力学几乎没有差异,这表明阴影功能不需要内源性间距。我们正在构建各个长度的合成污垢增强子,以测试squish增强子保留功能的较低尺寸限制。要理解引起阴影增强子的进化动力学,我们已经使用生物信息学来识别发育阴影增强子集的起源。星期四,我们发现重复事件和可转座元素似乎是果蝇中相对较小的(<10%)的发育阴影增强子出生来源,与我们在小鼠基因组中的发现相比(〜30%)。这些数据表明,合并的单个增强剂可以与不同的阴影增强子相比功能,而不会在压力下损害忠诚度。我们将探测创造和维持阴影增强子的进化动力学,以使其在动物发育中的普遍作用合理化。由NIH授予R01HD095246资助的工作。
资金信息抗癌联盟(标记为团队);国家研究机构(ANR)——白色项目; AMMICa US23/CNRS UMS3655;癌症研究协会(ARC);法兰西岛癌症中心;医学研究基金会(FRM);埃利尔; Equipex 癌表型筛查;欧洲罕见疾病联合计划(EJPRD);欧洲研究委员会高级研究员奖,资助/奖励编号:ICDCancer,101052444;欧盟地平线 2020 项目肿瘤生物组预评估,资助/奖励编号:101095604;欧盟地平线 2020 项目 Crimson,资助/奖励编号:101016923;国家癌症研究所(INCa);法国大学研究所; LabEx Immuno-Oncology,资助/奖励编号:ANR-18-IDEX-0001;马克基金会癌症研究 ASPIRE 奖; RHU 免疫生命; Seerave 基金会; SIRIC 癌症研究和个性化医疗 (CARPEM)
1. 英国伦敦癌症研究所癌症药物研发中心 7 2. 上海生物制品研究所,上海,中国 8 3. 广东工业大学生物医学与制药科学研究所,广州,中国 9 4. 中国农业科学院深圳农业基因组研究所,深圳,中国 10 5. 广州医科大学 GMU-GIBH 联合生命科学学院,广州,中国 11
摘要:皮肤是人体的外层,对于防御伤害和损害至关重要。暴露于外部刺激引起的衰老和皮肤受损的再生能力受到严重损害。目前,平均预期寿命的上升和现代人群的美学标准引发了人们对可以解决皮肤健康状况的基于干细胞的疗法的渴望。近年来,作为治疗剂的间充质干细胞(MSC)为管理皮肤再生和恢复活力提供了一种有希望的和有效的替代方法,这归因于可用于受损和老化的皮肤的愈合能力。但是,已经确定MSC的治疗作用可能主要是由旁分泌机制介导的,尤其是外泌体(EXOS)的释放。外泌体是具有脂质双层和膜结构的纳米级细胞外囊泡(EV),可以由不同类型的细胞自然释放。它们通过转移各种生物活性分子(包括脂质,蛋白质和核酸)(例如Messenger RNA(mRNA)(mRNA)和细胞之间的核酸(包括脂质)和核酸来影响受体细胞的生理和病理过程,从而在靶细胞中在细胞间通信和激活信号途径中起重要作用。中,miRNA是一种内源性调节的非编码RNA,通常被掺入外泌体中,作为调节蛋白质生物合成的重要信号分子。新兴证据表明,MSC的外泌体miRNA通过靶向多个基因并调节各种生物学过程,例如参与炎症反应,细胞迁移,增殖和凋亡,在皮肤再生和恢复中起关键作用。在这篇综述中,我们总结了有关MSC衍生的外泌体miRNA如何促进皮肤组织再生和复兴的研究和观察结果,并特别关注生物工程方法的应用来操纵外部货物的miRNA含量以提高其治疗潜力。本综述可以为诊断和治疗皮肤损伤和衰老提供新的线索,并协助研究人员探索创新的治疗策略,以治疗多种皮肤问题,目的是延迟皮肤老化,促进皮肤再生并保持健康的皮肤。
feixa llarga,08907,L'BositaTET de llobregat,巴塞罗那,西班牙运行标题:内含子增强剂铅组织特异性调节关键字:增强剂,内含子,基因调控,组织功能,组织功能,组织模式