调控和功能性遗传元件(例如启动子、增强子、限制性酶切位点、转基因和选择标记)的示意图。信息包括但不限于病毒衣壳的组成、包膜结构、分子量、颗粒大小、糖基化位点、基因组的性质(单链、双链、DNA 或 RNA、每个颗粒的基因组拷贝数)、病毒载体的趋向性(例如病毒载体对特定宿主组织的特异性)。• 对于质粒载体,提供调控和功能性遗传元件(例如启动子、增强子、限制性酶切位点、转基因和选择标记)的示意图。信息包括但不限于插入的外来基因的物理特性、生化、生长特性、遗传标记和位置(例如在质粒上、游离型或染色体上)。• 对于基因编辑技术的使用,提供
抽象的哺乳动物基因组是通过远距离染色质相互作用来组织和调节的。由CCCTC结合因子(CTCF)形成的结构回路,并粘附于基因组中,而增强子在跨广阔的基因组距离上与启动子相互作用以调节基因表达。尽管基因组学和固定细胞成像方法有助于阐明染色质相互作用的许多方面,但时间信息通常会丢失。在这里,我们讨论3D超分辨率活细胞成像(SRLCI)如何解决有关染色质相互作用的染色体形成和溶解的开放问题。我们讨论了SRLCI实验设计,实施策略以及数据解释,并突出相关的陷阱。我们得出的结论是,尽管在技术要求的情况下,SRLCI AP-PARACHES可能会成为动态探测3D基因组结构和功能并研究增强子 - 启动子相互作用和染色质循环的关键工具。
寻找痴呆症治疗的治疗,以及其他科学和社会变化,促使人们针对退化性脑疾病,轻度认知障碍以及涉及认知障碍的精神疾病的患者开发了症状治疗和疾病改良药物。对认知方面的方面(例如学习和记忆)的增强对于患有正常年龄相关的人和健康人的人来说似乎是可能的,尽管到目前为止,这些认知增强子的影响是适度的。接下来的二十年可能会更深入地了解学习,记忆和遗忘的机制,以及对分子,细胞和脑电路变化之间的关系以及认知变化的理解。,制药行业的研究工作已经有望提供更多的疾病修饰剂和推定的认知增强子,尽管将实验室发现转化为有效的人类使用干预措施时存在局限性。
chiba千叶大学医学院分子肿瘤学系,260-8670,日本b,b耳鼻喉科和颈部外科,卡纳泽大学医学科学研究生院,卡纳泽大学,卡纳泽瓦,伊希卡瓦,伊希卡瓦,伊西卡瓦,日本920-8640,日本c奇巴,chiba c chibib and chiba,chiba chiba,chiba chiba,260-2600000000于期。 Nanyang Technological University生物科学,新加坡Nanyang Drive 60号,637551,新加坡E E. Otorhinolaryngology/Head and Neck手术,Hamamatsu大学医学研究生院,Shizuoka Hamamatsu大学医学院研究生院 Chiba, 260-8670, Japan g Cancer Science Institute of Singapore, National University of Singapore, 14 Medical Drive, Singapore, 117599, Singapore h Department of Haematology-Oncology, National University Cancer Institute, Singapore, 5 Lower Kent Ridge Road, Singapore, 119074, Singapore i Department of Pharmacology, Yong Loo Lin School of Medicine, National University of Singapore, Blk MD3, 16 Medical Drive, Singapore, 117600, Singapore j Cancer and Stem Cell Biology Program, Duke-NUS Medical School, Singapore, 169857, Singapore k Cancer Science Institute of Singapore, Centre for Translational Medicine, National University of Singapore, Singapore, 117599, Singapore l Institute of Molecular and Cell Biology, Agency for Science, Technology and Research (A*STAR), 61 Biopolis Drive, Proteos,新加坡,138673,新加坡
摘要 全球 5.9% 的死亡与过量饮酒有关。然而,这一数字在男性中尤其严重,7.6% 的死亡可归因于饮酒。先前的研究发现,在不同男性群体中,甘丙肽 (GAL) 基因的基因型与焦虑和酒精滥用之间存在显著的相互作用,但无法确定其中的机制。为了解决这些问题,本研究分析了英国生物银行的人类队列,并发现高度保守的人类 GAL5.1 增强子的等位基因变异 (GG 或 CA 基因型)、酒精摄入量 (AUDIT 问卷分数) 和男性焦虑之间存在显著的相互作用 (n = 115,865; p = 0.0007)。至关重要的是,使用 CRISPR 基因组编辑破坏小鼠的 GAL5.1 显著降低了杏仁核和下丘脑中的 GAL 表达,同时相应减少了 KO 小鼠的乙醇摄入量。有趣的是,我们还发现雄性 GAL5.1KO 动物的焦虑样行为减少的证据与我们在英国生物库研究中看到的人类相似。通过生物信息学分析和共转染研究,我们进一步确定了 EGR1 转录因子,该因子与杏仁核和下丘脑中的 GAL 共同表达,对蛋白激酶 C (PKC) 支持的 GG 基因型 GAL5.1 活性很重要,但在 CA 基因型中则不那么重要。我们独特的研究采用了人类关联分析、小鼠 CRISPR 基因组编辑、动物行为分析和细胞培养研究的新组合,以确定一种高度保守的调节机制,该机制将焦虑和酒精摄入联系起来,这可能导致男性对焦虑和酒精滥用的敏感性增加。
最近的研究表明,与健康对照1、2的B细胞相比,与慢性淋巴细胞性白血病患者(CLL)衍生的克隆B细胞已改变了组蛋白修饰景观。我们还表明,BCR信号通路会影响CLL B细胞3、4的染色质景观,这意味着CLL中的致癌信号传导和表观遗传机械之间的相互作用。然而,CLL中的大多数染色质研究集中于与癌基因表达相关的活性增强子。对CLL中丢失的增强剂的了解非常有限:1)丢失增强剂的功能是什么; 2)这些丢失的增强剂如何在CLL中保持; 3)在CLL的前体状态,单克隆B细胞淋巴细胞增多(MBL)的前体状态下可以检测到这些丢失的增强子; 4)如果这种异常的染色质签名受CLL治疗影响。
解密基因如何解释细胞核内转录因子(TF)浓度的信息仍然是基因调节中的一个基本问题。最近的进步揭示了TF分子的异质分布,对精确解码浓度信号提出了挑战。使用荧光果蝇胚胎中荧光标记的TF双子体的高分辨率单细胞成像,我们表明双子体簇中的双聚体积累保留了母体双聚体梯度的空间信息。这些集群通过强度,大小和频率提供精确的空间提示。我们进一步发现,双子靶基因以增强子结合亲和力依赖性方式与这些簇共定位。我们的建模表明,聚类为全球核浓度提供了更快的传感机制,而不是通过简单增强子检测到的自由扩散的TF分子。
增强子易位,由于3q26重排,在急性髓样白血病(AML)的侵略性亚型中驱动了脱皮的MECOM表达。使用内源性生长素诱导的脱基龙直接耗尽MECOM,立即上调髓样分化因子CEBPA的表达。MECOM耗竭也伴随着干细胞的严重丧失和分化的增加。mecom通过与 +42KB CEBPA增强子结合而产生抑制作用,这是中性粒细胞发育必不可少的基因。这部分取决于MECOM及其共抑制器CTBP2之间的相互作用。我们证明CEBPA过表达可以绕过MECOM介导的分化块。此外,通过增强劫持的AML MECOM过表达的AML患者显着降低了CEBPA。我们的研究直接连接了两个主要参与者Meeloid Transformation Mecom和Cebpa,它提供了对MECOM通过灭活Cebpa将干细胞状态保持在AML独特亚型的机制的洞察力。
大脑救星承诺包括建立血脑屏障并防止神经毒素破坏健康脑细胞所需的营养和矿物质。此外,认知增强子促进了脑细胞再生,从而恢复了多年的脑损伤。此外,它包含刺激神经递质创建的物质,从而增强了神经元与各种肌肉之间的联系。
最近的治疗进展显著改善了多发性骨髓瘤 (MM) 患者的预后。成功的标准疗法的基础是 Ikaros 降解剂、糖皮质激素和蛋白酶体抑制剂的组合,它们通过直接或间接靶向增强子结合转录因子和控制 MM 依赖性基因表达的辅激活因子来干扰骨髓瘤特异性超增强子的完整性。T 细胞接合剂和嵌合抗原受体 T 细胞将患者自身的 T 细胞重定向到确定的肿瘤抗原上以杀死 MM 细胞。即使在终末期患者中,它们也能诱导完全缓解。不幸的是,对常规疗法和免疫疗法的反应都不持久,肿瘤异质性、抗原丢失和 T 细胞适应性不足导致治疗耐药性和复发。目前正在开发针对骨髓瘤特异性弱点的新方法,以及设计多模态免疫学方法(包括 T 细胞及其他方法),这些方法可同时识别多个表位以防止抗原逃逸和肿瘤复发。