摘要:单分子测量值提供了对分子过程的详细机械见解,例如在基因组调节中,DNA访问受核小体和染色质机械控制。然而,作用于定义的染色质底物上的核因子的实时单分子观察对于定量和可重复性执行具有挑战性。在这里,我们提出XSCAN(染色质关联的多路复用单分子检测),一种通过同时对核小体库的成像并行化单分子实验的方法,其中每种核小体类型在其核体DNA中携带一个可识别的DNA序列。并行实验。我们使用这种方法来揭示Cas9核酸酶在入侵染色质DNA作为PAM位置的函数时如何克服核小体屏障。
哺乳动物的抽象视网膜变性导致永久视力丧失,因为无法自然再生。一些非哺乳动物脊椎动物通过Muller Glia(MG)显示出强大的再生。,我们最近通过刺激性转录因子ASCL1的转基因表达来刺激成年小鼠MG以再生功能神经元的重生。这些结果表明MG可以作为神经元替代的内源性来源,但该过程的功效是有限的。为了在哺乳动物中改善这一点,我们设计了一个小分子筛选,一种使用SCI-plex,一种将多达数千个单核RNA-seq条件多路复用到单个实验中的方法。我们使用这项技术筛选了92种化合物的库,鉴定并验证了两种在体内促进神经发生的库。我们的结果表明,高通量单细胞分子分析可以基本上改善可以刺激神经再生的分子和途径的发现过程,并进一步证明了这种方法在视网膜疾病患者中恢复视力的潜力。
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