摘要:癌症基因组学的最新进展置于聚光灯DNA甲基化之下,这是一种调节基因组功能的遗传修饰,其修饰在肿瘤发生和肿瘤抑制中具有重要作用。由于下一代测序中的最后进步产生的高维和大量基因组数据,有效地利用DNA甲基化数据在诊断应用中,例如在健康VS患病样本中,有效地利用DNA甲基化数据。此外,最先进的技术不足以快速产生可靠的结果或有效地管理大量数据。因此,我们建议通过分析其DNA甲基化数据来分析肿瘤与非肿瘤样本的HD分类器,这是一种基于内存认知的高维(HD)监督机学习算法。该方法从人的大脑能够通过采用过度向量而没有单个数值值来记忆和区分简单概念的灵感。完全按照大脑的工作,这允许编码复杂的模式,这使整个架构都可以通过嘈杂的数据来解决故障和错误。我们设计和开发一种算法和一个能够使用HD方法执行监督分类的软件工具。我们对不同类型癌症的三个DNA甲基化数据集进行了实验,以证明我们的算法的有效性,即乳腺浸润性癌(BRCA),肾脏肾脏乳头状细胞癌(KIRP)和甲状腺癌(THCA)。,我们在准确性和计算时间方面获得了出色的结果,其计算资源量较低。此外,我们通过将其(i)与BigBiocl进行比较,该方法基于一个基于随机森林的软件,用于对分布式计算环境中的大型OMICS数据集进行分类,(ii)支持向量机(SVM)和(iii)与决策树的最新分类方法。最后,我们在GitHub上自由发布数据集和软件。
摘要。辣椒半导体由于其高功率转化效率而被广泛用作薄膜太阳能电池,尤其是柔性太阳能电池的吸收剂。它们也具有有趣的机械性能,使它们具有有希望的材料,可弹性,光线和薄的太阳能电池。在这项工作中,我们报告了Cuins 2,Cuinse 2和Cuin(S,SE)2吸收器太阳能材料的晶格常数和大量模量的第一原则计算。使用PBE-GGGA近似值和Ultrasoft伪电位在密度功能理论框架中使用量子意式浓缩软件软件包中实现的平面波进行所有计算。计算出的晶格常数与可用的实验研究很好地相关。使用Birch-Murnaghan的状态方程的三阶来描述能量体积和压力量关系,以计算吸收器太阳能材料的大量模量,这与特定条件下材料的硬度相关。除了Cuin(S,SE)2外,对Cuins 2和Cuinse 2获得的批量模量值与可用的理论结果非常吻合,这些结果已首次计算并报告。
摘要:我们展示了一种简便的方法,用于批量生产氧化石墨烯(GO)散装修饰的屏幕打印电极(GO-SPE),这些电极(GO-SPE)是经济的,高度可重现的,并提供了分析有用的输出。通过制造具有不同百分比质量掺入(2.5、5、7.5和10%)的GO-SPE,观察到对所选的电分析探针的电催化作用,与裸露的/石墨SPE相比,随着更大的GO掺杂而增加。最佳质量比为10%,达到90%的碳墨水显示出朝向多巴胺(DA)和尿酸(UA)(ua)的电分析信号。×10的幅度比在裸露/未修改的石墨SPE上可实现的大小要大。此外,10%的GO-SPE表现出竞争性低的检测极限(3σ)对DA的DA。81 nm,它优于Ca的裸露/未修饰的石墨SP。780 nm。改进的分析响应归因于居住在GO纳米片的边缘和缺陷位点的大量氧化物种,可用于对内晶的电化学分析物表现出电催化反应。我们报道的方法简单,可扩展性且具有成本效益,可用于制造GO-SPE,该方法表现出竞争激烈的LOD,并且在商业和药用应用中具有重大兴趣。
由于调整成本,通过使用CRISPR-CAS3 mRNA-LNP和基因组编辑诱导的突变蛋白分析的基因组编辑分析将进行高度的安全评估。我们还将为CRISPR-CAS3 mRNA-LNP的大规模生产开发和临床研究做准备。
原发性膜性肾病 ( primary membranous nephro- pathy , PMN ) 是全球成人肾病综合征常见的病因 , 也是中国原发性肾小球疾病中发病率第二 、 增长 最快的疾病 [ 1 ] 。大多数 PMN 患者有典型的临床表 现 , 包括大量蛋白尿 、 低蛋白血症 、 水肿和高脂血 症等。近 30% 的 PMN 患者能够获得自发缓解 , 但 中危和高危患者 , 即大量蛋白尿 、 肾功能不稳定的 患者 , 缓解的可能性较低 [ 2 ] 。 既往研究表明 , 线粒体功能障碍在急性肾损伤 ( acute kidney injury , AKI ) 和慢性肾脏病 ( chronic kidney diseases , CKD ) 的发病机制和肾脏修复中发 挥关键作用 [ 3 - 4 ] 。线粒体功能与线粒体 DNA ( mito- chondrial DNA , mtDNA ) 的完整性密切相关 , 当线 粒体受损时 , mtDNA 会从线粒体基质释放到细胞 质或细胞外 , 进而激活氧化应激反应 , 并作为炎症 介质激活自然免疫炎症反应 [ 5 ] 。目前多项研究表 明 , 尿 mtDNA 是各种肾脏疾病中线粒体损伤的替 代标志物 [ 6 ] 。我们之前的研究表明 , mtDNA 在尿液 和肾脏组织中容易被检测到 , 其拷贝数与糖尿病肾 脏疾病的肾功能下降和肾脏病理结构改变有关 [ 7 ] 。 另一项研究指出 , 尿液中 mtDNA 与肾功能下降速 度有关 , 并能预测非糖尿病肾脏疾病患者血肌酐翻 倍或需要进行透析治疗的风险 [ 8 ] 。然而 , 尿 mtD- NA 在 PMN 患者中的改变及其对预后的预测作用 仍不明确。本研究旨在探讨尿 mtDNA 与 PMN 患
链接预测AI将预测依据的可解释性与融入用户知识的能力相结合,提供了一种发现隐藏在海量数据中的未知价值的手段。为实现个人和企业能够最大限度发挥潜力的社会做出贡献。
a 图卢兹传染病和炎症性疾病研究所 (Infinity)、法国图卢兹图卢兹第三大学 INSERM U1291、CNRS U5051 b 巴黎城市大学、INSERM UMR1163、Imagine 研究所、法国巴黎 c 内克尔儿童疾病医院 - 巴黎公立医院 (AP-HP) 原发性免疫缺陷研究中心、法国巴黎 d 蒙彼利埃圣埃洛伊医院内科和多器官疾病科、法国蒙彼利埃 CHU e 儿童自身免疫性疾病免疫遗传学实验室、INSERM UMR 1163 研究所、F-75015 巴黎、法国 f INSERM-UMR 1163、Imagine 研究所、法国巴黎 g 内科和肿瘤免疫学 (MedI2O) 研究所法国蒙彼利埃大学医院再生医学与生物治疗中心 (IRMB) h 法国蒙彼利埃大学再生医学与生物治疗中心、法国蒙彼利埃国家健康与医学研究院、法国蒙彼利埃大学医院再生医学与生物治疗中心 i 法国巴黎内克尔儿童医院 (AP-HP) 儿科免疫血液学和风湿病科 j 法国巴黎内克尔大学儿童医院 (AP-HP) 国家原发性免疫缺陷参考中心 (CEREDIH) k 法国巴黎想象研究所 INSERM-UMR 1163 生物信息学核心设施 l 法国巴黎国家科学研究中心、3633 号综合服务单位、法国巴黎城大学 INSERM
1气象与气候研究所(IMK-TRO),Karlsruhe理工学院(KIT),Karlsruhe,德国2 Potsdam大学,Karl-Liebknecht-Str。24-25,14476德国波茨坦3德累斯顿技术大学,水文与气象学院,皮恩纳·斯特劳斯(PiennerStraße),23,01737德国塔兰特(Tharandt)4 4莱比锡大学气象学研究所德国6汉堡大学,气象学院,格林德伯格5,20144汉堡,德国7德国气象局,法兰克福斯特拉松135,63067 Offenbach AM MAIN 8部分,GFZ德国德国研究中心,德国地球科学研究中心,Telegrafenberg,Telegrafenberg,Telegrafenberg,144773 Potsdam,Dermane 45 blimechenem blimechenem, 20146 Hamburg, Germany 10 Center for Disaster Management and Risk Reduction Technology (Cedim), Karlsruhe Institute of Technology (KIT), Karlsruhe, Germany 11 Institute of Physics and Meteorology, University of Hohenheim, Garbenstrasse 30, 70599 Stuttgart, Germany Weather Service, Regionales Klimabüro Potsdam, Güterfelder DAMM 87-91 14532 Stahnsdorf,德国13 Bodenk Scientifififififififififififififififififififififififififififififififi,Alexandra 9391,新西兰
植物再生是植物繁殖的一个重要方面,也是转基因植物生产的关键步骤。然而,不同基因型和物种的再生能力差异很大,其分子基础在很大程度上是未知的。全基因组关联研究 (GWAS) 等关联作图方法早已证明能够帮助揭示植物性状变异的遗传基础;然而,这些方法的性能取决于表型分析的准确性和规模。为了对模型树杨树的植物愈伤组织和芽再生进行大规模 GWAS,我们开发了一个涉及语义分割的表型组学工作流程,以量化再生植物组织随时间的改变。我们发现得到的统计数据高度非正态分布,因此采用了变换或排列以避免违反 GWAS 中使用的线性模型的假设。我们报告了超过200个统计学上支持的数量性状基因位点(QTL),其中基因包含或接近顶级QTL,包括细胞粘附、应激信号和激素信号通路的调控因子,以及其他多种功能。我们的研究结果鼓励植物再生过程中激素信号转导模型除了通常考虑的生长素和细胞分裂素途径外,还应考虑应激相关信号(例如涉及茉莉酸和水杨酸)的关键作用。我们鉴定的假定调控基因和生物学过程为理解植物再生的生物学复杂性提供了新的见解,并可能成为改善顽固基因型和物种再生和转化的新方法。