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全基因组对大肠杆菌中替代性肽聚糖交联所需的基因的鉴定揭示了-lactams的意外影响多层网络中的遗传合作性暗示了亨廷顿氏病小鼠与症状同步的纹状体中的细胞存活和衰老
动机：亨廷顿氏病（HD）可以通过基因放松来发展。然而，基因放松管制对HD遗传合作的动力学的影响仍然很差。在这里，我们在HD敲入小鼠的大脑（等位基因HDH小鼠）的大脑中建立了一个多层网络模型。为了增强生物学精度和基因优先序列，我们整合了三个源网络的互补家族，所有这些都从HDH小鼠中的相同RNA-SEQ时间序列数据推断为加权 - 边缘网络，在该网络中，Edge-Edge-Edge-lates跨源网络跨源网络跨源网络和时点的路径长度变化。结果：加权边缘网络识别出富含受管化基因（临界阶段）的紧密遗传合作性的连续波，在皮质中曾经久经术，与纹状体呈现，并与纹状体相关，与细胞的存活有关（例如hipk4）与细胞增殖相互缠绕（例如scn4b）和细胞衰老（例如CDKN2A产品）响应。顶部纹状体加权边缘在HD发病机理的无脊椎动物模型中富含有缺陷行为的调节剂，从而验证了它们与体内神经元功能障碍的相关性。共同揭示了HDH小鼠大脑中遗传合作的高度动态的时间特征，其中2步逻辑突出了症状小鼠纹状体中细胞维持和延伸的重要性，提供了高度优先的靶标。联系人：Christian.neri@inserm.fr补充信息：补充数据可在Online BioInformatics获得。可用性和实现：加权边缘网络分析（WENA）数据和源代码，用于执行信号（SDS）的光谱分解（SDS）和Wena分析，均为使用Python编写，可在http://www.broca.inserm.inserm.inserm.fr/hd-wena/上获得。
有两个父亲的老鼠存活至成年，标志着科学里程碑
研究人员指出，他们的工作仍有几个局限性需要解决。首先，只有 11.8% 的可行胚胎能够发育到出生，而且由于发育缺陷，并非所有出生的幼崽都能活到成年。大多数活到成年的幼崽生长发育发生改变，寿命缩短。此外，活到成年的小鼠是不育的，尽管它们确实表现出更高的克隆效率。
使用基因组学破译候选门辐射的神秘特性和存活适应
摘要：微生物生态学是理解微生物在各种环境和健康相关过程中的组成，多样性和功能的关键领域。通过独立的方法发现候选门辐射（CPR）已引入了一种新的微生物划分，其特征在于以共生/寄生的生活方式，小细胞大小和小基因组为特征。尽管知之甚少，但CPR近年来由于它们在各种环境和临床样本中的广泛发现而引起了显着关注。与其他微生物相比，已经发现这些微生物表现出高度的遗传多样性。几项研究揭示了它们在全球生物地球化学周期中的潜在重要性及其对各种人类活动的影响。在这篇评论中，我们提供了CPR发现的系统概述。然后，我们专注于描述CPR的基因组特征如何帮助它们与不同生态壁ches中其他微生物进行互动并适应其他微生物。未来的工作应集中于发现CPR的代谢能力，并在可能的情况下隔离它们以更好地了解这些微生物。
特定的NQO2抑制剂S29434，仅略微改善了多巴胺神经元在MPTP感染小鼠中的存活
摘要：多年来，有证据表明胞质喹酮还原酶NQO2在帕金森氏症诱导的多巴胺神经元变性模型中可能的贡献作用，但大多数数据已在体外获得。因此，我们问了一个问题，NQO2是否参与MPTP的体内毒性，MPTP是一种经典用于帕金森氏病诱导神经变性的神经毒素。首先，我们表明NQO2在小鼠黑质中表达，nigra多巴胺能细胞体和人多巴胺能SH-SY5Y细胞也表达。一种高度特异性的NQO2抑制剂S29434能够减少具有星形胶质细胞U373细胞的SH-SY5Y细胞的共培养系统中MPTP诱导的细胞死亡，但在SHSY5Y单一培养物中无活性。我们发现S29434仅略微防止MPTP中毒在体内中的MPTP中的黑质酪氨酸羟化酶 +细胞损失。该化合物在第7天产生了多巴胺能细胞存活的略有增加，MPTP治疗后21个，尤其是1.5 mg和3 mg/kg剂量方案。未达到统计显着性的救援效应（除了在第7天进行了一个实验），并且在最新时间点随着4.5 mg/kg剂量的降低。尽管在小鼠MPTP模型中缺乏NQO2抑制剂的强大保护活性，但我们不能排除酶在帕金森氏变性中的可能作用，尤其是因为它在多巴胺能神经元中基本上表达。
RECQ5 的转录衰减和RNA聚合酶II的缩合机制 通过欧洲黑松的造林管理增强生态系统服务提供 brochosomes作为叶霍普珀的反染色伪装涂层 myh11稀有变体增强主动脉生长，并诱导心脏肥大和心力衰竭，并以压力超负荷 Genomeocean：在大规模宏基因组组件上训练的有效基因组基础模型 干细胞特异性NF-κB是干细胞存活和肠道损伤时上皮再生所必需的 1 Nora病毒在分裂的肠道干细胞中增殖... 2025.01.31.635872.full.pdf 一个集成多端的计算分析，以更好地了解85个小动物的结构和功能 铬摩托运动指纹启用单个疾病生物标志物分子的多素数字计数 AAV血清型php.eb与中的AAV9相比，具有上升的神经元转导效率 Neuromark DFNC模式 rtct：啮齿动物三角完成任务，以促进路径整合的翻译研究 全球大脑活动和功能连通性的剂量依赖性变化1 1识别... 的JNK调节的磷蛋白体标记 CDKN2ALOW癌细胞胜过... 的巨噬细胞 2025.02.05.636601.full.pdf gutheridge3
。cc-by-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该预印本版本的版权持有人，该版本发布于2025年2月5日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.05.636647 doi：Biorxiv Preprint
持续诱导自噬可提高蝾螈细胞在长期饥饿状态下的存活率
蝾螈表现出极强的抗饥饿能力，这让它们能够在自然栖息地中忍受长时间的无食物状态。虽然自噬（一种涉及进化上保守的蛋白质的过程）有助于在食物匮乏的情况下生存，但它如何导致蝾螈细胞极端的抗饥饿能力仍未被探索。我们的研究使用了蝾螈物种 Pleurodeles waltl，结果表明蝾螈初级成纤维细胞在长期细胞饥饿期间保持恒定的自噬激活。与正常哺乳动物成纤维细胞不同（在急性饥饿期间自噬体形成会增加，但在长时间后会回到基线水平），蝾螈细胞在自噬开始 4 天后仍保持较高的自噬体数量，超过在营养丰富条件下观察到的水平。与营养丰富和饥饿状态下的哺乳动物细胞相比，独特的 P. waltl mTOR 直系同源物均表现出降低的溶酶体定位。然而，蝾螈细胞在饥饿条件下表现出 mTOR 底物的去磷酸化，类似于哺乳动物细胞。这些观察结果表明，蝾螈可能已经进化出一种独特的系统来平衡看似相互冲突的因素：高再生能力和饥饿期间自噬介导的生存。
干细胞特异性NF-κB是干细胞存活和肠道损伤时上皮再生所必需的
。CC-BY 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审的认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年2月4日发布的此版本中显示在版权所有的此版本中。 https://doi.org/10.1101/2025.01.30.635658 doi：biorxiv preprint
DNA甲基化对新辅助化疗的响应变化与乳腺癌存活有关
摘要背景：局部晚期乳腺癌是对新辅助化学疗法（NACT）和生存的反应。目前无法准确预测谁将从特定类型的NACT中受益。DNA甲基化是一种表观遗传机制，已知在调节基因表达中起重要作用，并且可以作为治疗反应和生存的生物标志物。我们调查了DNA甲基化作为乳腺癌NACT后长期生存（> 5年）的预后标记的潜在作用。方法：使用Illumina Human-Methylation 450 Beadchip研究了来自83例局部晚期乳腺癌女性的83名局部晚期乳腺癌女性的DNA甲基化谱（n = 55）和治疗后（n = 75）活检。患者接受了硬纤维素和/或紫杉醇的新辅助治疗。线性混合模型分别基于对NACT（部分反应或稳定疾病）和5年生存的临床反应，将DNA甲基化与治疗反应和生存相关。进行了基于统计学意义的甲基化位点来确定风险评分，并使用Kaplan-Meier曲线分析使用十年的生存后续数据来估算生存率。我们发现队列中发展的风险评分在独立验证队列中得到了验证，该验证队列由来自85名局部晚期乳腺癌女性的配对前治疗和治疗后活检组成。验证队列中包括的患者用阿霉素或5-FU和丝裂霉素NACT治疗。验证队列中包括的患者用阿霉素或5-FU和丝裂霉素NACT治疗。结果：在5年幸存者的NACT中，DNA甲基化模式在非生存者中没有发生变化，而在非生存者中未观察到显着变化或与治疗反应有关。DNA甲基化的变化包括CPG岛上甲基化的总体丧失以及非CPG岛中甲基化的增益，这些变化影响了与转录因子活性，细胞粘附和免疫功能相关的基因。基于四个甲基化位点开发了风险评分，这些甲基化位点成功地预测了我们的队列中的长期生存（p = 0.0034）和不可用验证的同类群体（p = 0.049）。
Charlson综合征指数预测胰腺癌患者的存活率接受免疫疗法 生物医学，专利路径和前景分析中的反应式纳米材料 单细胞测序显示细胞异质性和与肝细胞癌微血管浸润相关的异质性途径 公共部门参与可持续粮食系统的非国家治理 - 生物多样性的观点 社论：多发性硬化症中的神经可塑性 克服肺癌和结直肠癌的抗药性 综合注意力卷积网络用于运动图像EEG分类 编辑：chatgpt和其他生成AI工具 世界气候研究计划灯塔活动
胰腺癌（PC）是一种高度恶性的消化系统肿瘤，预后极差，通常在晚期阶段被诊断出来并迅速发展（1，2）。目前，PC的治疗仍然主要依赖化学疗法，中位总生存率少于1年（3 - 5）。尽管对PC的免疫疗法进行了连续探索，但与仅化学疗法相比，它并没有改善总体预后（6）。PC患者通常伴有其他慢性疾病，并且合并症的数量较高，表明治疗效率较低，整体生存期较短。Charlson合并症指数（CCI）是一个广泛使用的指标，可以通过计算慢性病的评分和体重来评估患者的整体健康状况。它已经在各种肿瘤类型中进行了广泛的研究，包括前列腺癌（7、8），结直肠癌（9），胰腺癌（10）等，但没有关于CCI指数在PC免疫疗法中的预测作用的报道。因此，我们对现实世界数据进行了分析，以评估PC患者中CCI评分的预后意见。
Charlson综合征指数预测胰腺癌患者的存活率接受免疫疗法
近年来，由于其在精确的药物输送和受控释放方面具有独特的优势，响应式纳米材料在生物医学应用中具有巨大的潜力。对于癌症，慢性炎症和遗传疾病等复杂疾病，传统治疗方法通常受到不足的靶向和显着副作用的限制。通过感知内部或外部刺激的响应式纳米技术，显着提高了治疗的精度和效率。这项研究系统地总结了通过全球专利和文献数据的响应纳米材料的技术轨迹和新兴研究方向，采用了主要路径分析，衍生途径分析和关键字同时出现分析。结果揭示了这一领域的演变，从对早期单刺激反应性的纳米递送系统的优化到治疗学整合的兴起，然后在多刺激性响应性的协同疗法中进步，并最终在生物含量材料设计中创新。每个发育阶段越来越集中于适应复杂的生物学环境，实现卓越的靶向性能并增强治疗性效率。关键字共发生分析突出了关键的研究热点，包括仿生设计，多模式协同疗法和新兴响应机制。将来，响应式纳米材料有望在个性化医学，多功能载体设计和复杂的疾病管理中发挥关键作用，从而为精密医学提供新颖的见解和技术支持。