结果:我们发现了38个潜在的因果关系,将肠道微生物组中的遗传易感性与淋巴瘤的发育联系起来。一些更明显的结果如下:coprobacter属(OR = 0.619,95%CI 0.438 - 0.873,p = 0.006)表现出对霍奇金淋巴瘤(HL)的潜在保护作用。属属(OR = 0.473,95%CI 0.278 - 0.807,p = 0.006)是弥漫性大B细胞淋巴瘤的保护因素。reminococcaceae属(OR = 0.541,95%CI 0.341 - 0.857,p = 0.009)具有针对卵泡淋巴瘤的暗示性保护作用。lachnospireceaeucg001(OR = 0.354,95%CI 0.198 - 0.631,p = 0.0004)显示出针对T/NK细胞淋巴瘤的保护性。Q检验表明缺乏异质性,MR-EGGER检验没有显示出显着的水平多层。此外,保留的分析未能识别出对整体结果产生重大影响的任何SNP。
方法:为了推断 AS 与各种糖尿病相关特征(包括 1 型糖尿病 (T1DM)、T2DM、血糖水平、空腹血糖、糖化血红蛋白和空腹胰岛素)之间的因果关系,我们采用了孟德尔随机化 (MR) 分析。我们从 IEU OpenGWAS 数据库、GWAS 目录和 FinnGen 数据库中获取了暴露和结果变量的 GWAS 汇总数据。为了综合 MR 分析的结果,我们应用了使用固定或随机效应模型的荟萃分析技术。为了识别和排除与结果表现出水平多效性的工具变异 (IV),我们使用了 MR-PRESSO 方法。使用 MR-Egger 方法以及 Q 和 I^2 检验进行敏感性分析,以确保我们的研究结果的稳健性。
甲状腺功能障碍包括甲状腺功能减退和甲状腺功能亢进,是成年人普遍存在的健康问题和内分泌系统疾病,女性发病率更高 ( 1 )。该病的特点是血清促甲状腺激素 (TSH) 水平出现偏差,可表现为显性或亚临床形式,分别以 TSH 水平异常伴有或不伴有伴随症状以及游离甲状腺素 (FT4) 水平异常和正常为特征。值得注意的是,人们普遍认为血脂异常常见于甲状腺功能障碍患者,这表明甲状腺激素和脂质代谢之间存在内在联系 ( 2 – 4 )。甲状腺功能亢进的特征是低密度脂蛋白胆固醇 (LDL-C)、甘油三酯 (TG) 和总胆固醇 (TC) 水平较低,而高密度脂蛋白胆固醇水平较高 ( 2 , 5 )。另一方面,显性和亚临床甲状腺功能减退都与 TC 和 LDL-C 水平升高有关。同样,据观察,TSH 水平与 TC、LDL-C 和 TG 水平升高有关,而游离甲状腺素则可降低胆固醇水平(2、4、6)。研究证明甲状腺激素对心脏和心血管系统有显著影响(7)。长期以来,人们认识到甲状腺功能障碍的一些常见表现是甲状腺激素对心血管系统的生理影响的结果,包括静息心率、左心室收缩力、动脉粥样硬化、全身血管阻力和血容量。在心血管疾病管理中,通常建议开具他汀类降脂药物,目的是调节动脉粥样硬化(8、9)。鉴于甲状腺功能障碍与心血管疾病之间已确定的关系,在甲状腺相关心血管疾病患者中应用降脂扰动并不罕见。然而,降脂药物对甲状腺功能障碍患者的风险和益处仍不明确。一系列回顾性队列研究和临床试验表明,他汀类药物的使用与血脂异常患者的甲状腺功能恢复、甲状腺结节发生率减少、甲状腺体积缩小和甲状腺自身免疫力降低有关,但
139图2。两样本MR方法的四组分析的森林图。(a):EBI-A-A-GCST90038649上的EBI-A- 140 GCST90018925,(B):EBI-A-GCST90014023上的EBI-A-A-GCST90018814上的EBI-A-GCST90014023,(C):141 EBI-A-A-GCST90014023 ON EBI-A-a-a-a-a-a-gcst900181: EBI-A-A-GCST90018814上的EBI-A-GCST90014023。142尽管使用了不同的MR方法可能导致效应大小的不同,但较小的标准143误差和狭窄的置信区间表示这些估计值的统计有效性。144
上海上海上海北海大学医学院胰岛疾病中心一般手术系上海慢性非通信疾病和伤害的上海司,上海市政疾病控制与预防中心,上海,200336年,中国,中国f心血管医学系,流行病学研究和临床试验中心,临床试验中心和血管评估中心上海上海,上海医学基因组学关键实验室,临床试验中心,上海内分泌和代谢疾病研究所,内分泌学和代谢系,上海医院,上海乔顿医院,康北大学医学院,上海医学院新南威尔士大学,悉尼,新南威尔士州,澳大利亚j医学系,内分泌学,糖尿病和骨病科,伊坎尼山纽约州纽约,纽约州纽约州,美国K上海上海临床研究中心,上海,上海,中国中国,
。cc-by-nc 4.0国际许可证可永久提供。是作者/资助者,他已授予Medrxiv的许可证,以显示预印本(未通过同行评审证明)的预印版本的版权所有者,该版本持有人于2025年2月13日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.12.12.25322150 doi:medrxiv Preprint
4 5 1 遵义医科大学附属口腔医院口腔颌面外科,贵州省遵义市。7 2 遵义医科大学口腔医学院、口腔医院,贵州省遵义市。8 3 遵义医药高等专科学校信息技术网络管理中心,贵州省遵义市。10 11 # 这些作者对本文贡献相同。12 ‡ 这些作者对本文贡献相同。13 * 通讯作者:宋庆高 (814641639@qq.com)14 15 摘要16 目前,慢性牙周炎 (CP) 的治疗仍面临挑战。本研究旨在利用孟德尔随机化(MR)方法在可用药物基因组中鉴定出治疗慢性牙周炎的新药物靶点。在本研究中,基于 4479 个药物基因靶点列表,在血液表达数量性状位点(eQTL)中选择了重叠基因,然后对其进行双样本 MR(TSMR),并使用来自 CP 的全基因组关联研究(GWAS)数据验证了融合转录组关联研究(TWAS),以确认与 CP 遗传相关的药物基因,并使用基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR)分析和共定位测试多重效应。最后,对确定的药物靶点进行表型组关联研究(PheWAS)。我们应用SMR、TSMR、Fusion TWAS和一系列共定位方式来评估可用药靶点与CP之间的遗传关联。综上所述,金属蛋白酶25(MMP25)被认为是最有前途的药物靶点,此外,我们对TNFRSF18、CDC25B、STK10和ACVR2B也抱有一定信心。最后,PheWAS-MR结果显示,应用MMP25抑制剂的可能副作用包括外耳炎以及一些代谢紊乱等。综上所述,我们利用TSMR、Fusion TWAS、SMR和共定位等一系列方法确定了五个潜在的CP药物靶点,其中MMP25通过了所有测试。这一发现为未来CP药物开发提供了学术基础,并在一定程度上缩短了药物开发时间和经济成本。关键词:慢性牙周炎,全基因组孟德尔随机化,靶基因。
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摘要背景分枝杆菌包括各种毒力的普遍存在种。然而,环境和个体特定因素,特别是宿主遗传因素,在接触分枝杆菌的结果中起着至关重要的作用。单基因分枝杆菌易感性的第一个分子证据来自对分枝杆菌病 (MSMD) 孟德尔易感性的研究,这是一种罕见的 IFN-γ 免疫先天缺陷,即使对低毒力分枝杆菌感染也具有选择性易感性,患者大多为儿童,常规检查中没有可识别的免疫缺陷。本文全面、最新地描述了所有已知的 MSMD 单基因缺陷最重要的分子、细胞和临床特征。结果 在过去的 20 年中,已发现 MSMD 患者中有 19 个基因发生突变(IFNGR1、IFNGR2、IFNG、IL12RB1、IL12RB2、IL23R、IL12B、ISG15、USP18、ZNFX1、TBX21、STAT1、TYK2、IRF8、CYBB、JAK1、RORC、NEMO 和 SPPL2A),这些基因位点的等位基因异质性已导致 35 种不同的遗传缺陷的定义。尽管存在临床和遗传异质性,但几乎所有 MSMD 的遗传病因都会改变干扰素 γ (IFN- γ ) 介导的免疫力,方法是削弱或消除 IFN- γ 的产生或对该细胞因子的反应,或两者兼而有之。已证明人类 IFN- γ 水平是决定分枝杆菌感染结果的数量性状。结论 这些单基因缺陷的研究有助于了解人类分枝杆菌感染的分子机制,并有助于开发新的诊断和治疗方法以改善护理和预后。这些发现还弥合了简单的孟德尔遗传与复杂的人类遗传学之间的差距。关键词 分枝杆菌病、单基因、先天性免疫缺陷、孟德尔易感性、IFN-γ
我们利用孟德尔随机化(MR)来评估白细胞端粒长度(LTL)和肌醇侧面硬化症(ALS)之间的因果关系以及基因组范围研究的汇总统计数据(n = 〜38,000 n = 〜38,000 for ltl and 〜31,000 for ltl and 〜81,000,欧洲人群中的ltl;我们进一步评估了脂质在从LTL到ALS的途径中的介导作用。在欧洲人群中,ALS上LTL的每标准偏差降低为1.10(95%CI 0.93-1.31,p = 0.274),在亚洲人群中为0.75(95%CI 0.53–1.07,p = 0.116)。在欧洲人口中的LTL和额颞痴呆之间也发现了这种无效的关联。但是,我们发现LTL对ALS的间接影响可能是由低密度脂蛋白(LDL)或总胆固醇(TC)介导的欧洲人群。这些结果对广泛的灵敏度分析是可靠的。总的来说,我们的MR研究不支持LTL与ALS风险之间的直接因果关系,而是为LDL或TC对LTL和ALS在欧洲人群中的影响提供了暗示性的证据。