真菌内生菌可增强养分吸收并诱导宿主植物产生抗性,从而促进植物生长发育。在本研究中,我们报告了与草类 Saccharum spontaneum L. 相关的根部真菌内生菌 (RFE) 的出现和多样性,这些菌生长在菲律宾北部邦板牙省萨科比亚河沿岸的火山泥流地区。火山泥流是水和火山碎屑的混合物。本研究通过形态培养表征和 ITS 基因的分子分析鉴定了分离的 68 种 RFE,并将它们归类为九个属,即曲霉菌、枝孢菌、附球菌、镰刀菌、青霉菌、紫霉、踝节菌、木霉和丝核菌。稀疏曲线分析显示采样工作量为 75%,其中宿主植物 1 和 3 的物种最为多样化。我们的研究强调了在受火山活动影响的地区茁壮成长的三种宿主植物的内生真菌的巨大多样性。
词汇表(注1)放线菌Odontolyticus(A.odontolyticus):一种口腔中的一种居民细菌,据说与牙周疾病有关。据报道,2019年,它存在于结肠癌早期的肠道中。 (注2)细胞外囊泡:细胞释放的脂质覆盖的颗粒,直径约为100 nm。这些囊泡包含多种生理活性物质,被认为在与其他细胞交流中起着作用。细菌产生独特的细胞外囊泡,称为膜囊泡(MVS),它们是相似的结构,但是它们的生产机制和生理活性通常是未知的。 (注3)活性氧:一组高反应性分子作为使用氧气制造能量的副产品。如果产生过量,氧化应激会导致DNA损伤。 (注4)Toll样受体2(TLR2):这是在人类细胞中表达的Toll样受体之一,并充当病原体(例如微生物)的传感器,到目前为止已经确定了10种类型的受体。 TLR2主要识别细菌细胞壁的成分,并将其传输到产生免疫反应的下游信号。 (注5)核细菌核(F.nucleatum):一种口腔中的一种居民细菌,是引起牙周疾病的细菌之一。近年来,有许多与结肠癌关联的报道。 (注6)永生的人类结肠上皮细胞:出于研究目的,通过导致正常的,非癌症的人类结肠上皮细胞永生的细胞失去了限制细胞分裂的能力。 (注7)NF-κB信号:调节炎症反应的重要信号之一,调节响应特定刺激的炎症细胞因子的表达。它参与慢性炎症,并参与肿瘤形成和进展。 (注8)敲除:一种抑制特定基因表达的技术。 (注9)从人IPS细胞中得出的迷你肠:由人IPS细胞创建的2017年肠道的3D器官模型。这项研究中使用的肠道的特征是肠上皮的外部取向。 (注10)发育不良:形态与正常形态不同的疾病,这被认为是癌前病变的早期阶段。
纸上的真菌色素:链格孢属菌种的拉曼和量子化学研究。Victor V. Volkov 和 Carole C. Perry* 诺丁汉特伦特大学科学技术学院跨学科生物医学研究中心,克利夫顿巷,诺丁汉 NG11 8NS,英国。摘要为了加深对影响图书馆、博物馆和档案馆的文化遗产的真菌分子生物化学的了解,我们研究了拉曼光谱在识别纸上真菌有色发色团组成的诊断能力。在本研究中,我们探索了共振拉曼在区分高湿度下在纸上生长的真菌丝中的发色团的诊断能力,重点是表征链格孢属菌种的发色团。为了促进分子分析,我们对在紫外-可见光谱范围内具有光吸收的代表性代谢物进行了量子化学计算。通过理论与实验的比较,我们发现,在成熟的菌丝丝中存在 fonsecin、erythroglaucin 和 aurasperone 类型的发色团,而 β-胡萝卜素在纸面上的酵母沉积物中占主导地位。成熟丝的共振拉曼光谱表明,比 β-胡萝卜素更长的胡萝卜素对光谱特征的贡献更大。利用微观分辨率,我们在丝从酵母沉积物开始的空间区域中区分了丰富的拉曼特征集,这些特征集被归因于木质素、flavoglaucin、核黄素、cycloleucomelon(e) 和 asperyellone 分子成分。在这些区域中,丝的微结构刺激了成熟三维支架的发育,拉曼共振的多样性证实了发育结构具有丰富的生物化学性质。这里介绍的特征真菌发色团和代谢物的光学和光谱响应计算库对于理解真菌对各种纸制品(包括书籍、版画、素描、水彩画、雕刻甚至雕塑)的影响以及设计基于真菌菌丝垫的下一代材料至关重要。 关键词 拉曼、显微镜、真菌、纸、光学、密度泛函理论 引言 真菌界早期 [1] 的专业化归因于原真菌细胞在概念上依赖可渗透壁的生物学来提供快速分子运输和外部消化食物。后者在我们的生活中对真菌起着至关重要的作用:在工业和文化中。如果说系统地使用真菌作为生产剂的理念自直观的古代发酵以来一直发展缓慢,直到 19 世纪末设计出第一种草酸生产的药物化学方案 [2],那么,人们直到最近几十年才开始意识到真菌作为我们日常生活中的积极参与者,无论是作为病原体,还是作为共生体,或者作为一种冷漠竞争的生命力,只有在了解这些生物组成了自己的王国之后,我们才能理解它们之间的区别 [3]。真菌对人类文化有着巨大的影响,这里我们讨论的是保存在纸质文物中的遗产。纸是一种由纤维素纤维制成的片状材料。在过去的两千年里,纸张是日常使用中信息存储和传输的主要“载体”,取代了蜡和粘土板、桦树皮和皮革羊皮纸。作为一种由多糖链构成的吸湿性有机材料,纸可能是许多微生物的营养来源。真菌是导致纸张降解的主要菌群 [4 ]。它们是图书馆、档案馆和博物馆中书面和印刷遗产的主要威胁 [5 ]。各种曲霉菌、镰刀菌、木霉菌、漆霉和青霉菌都能在纸上有效生长,并引起纸张基质的化学改变。
CRISPR/Cas 已成为多种生物体中遗传操作的最先进的技术,能够以前所未有的效率进行有针对性的遗传改变。本文中,我们报告了在重要的坏死性植物病原体灰霉病中首次建立强大的 CRISPR/Cas 编辑,该方法基于将优化的 Cas9-sgRNA 核糖核蛋白复合物 (RNP) 引入原生质体。通过开发一种将 RNP 递送与含端粒的瞬时稳定载体共转化相结合的新策略,进一步提高了编辑产量,从而允许临时选择和方便地筛选无标记编辑事件。我们证明,与现有的基于 CRISPR/Cas 的丝状真菌方法(包括模型植物病原体稻瘟病菌)相比,这种方法提供了更高的编辑率。编辑菌株的基因组测序显示很少有额外的突变,也没有 RNP 介导的脱靶证据。端粒载体介导编辑的高性能通过随机诱变 sdhB 基因的 272 个密码子得到证实,该基因是琥珀酸脱氢酶抑制剂 (SDHI) 杀菌剂抗性的主要决定因素,方法是将 272 个密码子批量替换为编码所有 20 种氨基酸的密码子。在没有选择的情况下,所有交换的频率都相似,但 SDHI 选择允许识别新的氨基酸替换,这些替换赋予了对不同 SDHI 杀菌剂的不同抗性水平。基于 RNP 的共转化效率提高且易于操作,有望加速 B . cinerea 和其他真菌的分子研究。
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ICAN Ocean Pout链球菌Americus Fishery colaps collaps collaps collaps a s laps the造成的sporidian pleistophora acrozrozoarcides(Fischthal 1944年,Sandholzer等,1945,Sheehy等。 1974)。 彩虹窒息的Osmerus Mordax渔业的崩溃部分归因于Glugea Hertwigi的感染(Haley 1954)。 余生感染会降低生长,厌食症(Matthews&Matthews 1980,Figueras等人。 1992),《游泳能力障碍》(Sprengel&Lüchtenberg,1991年),降低了生殖成功(Summerfelt 1964,Wiklund等人 1996)和肌肉组织的液化(Nigrelli 1946,Grabda 1978,Egidius&Soleim 1986,Pulsford&Matthews 1991)。 glugea属,核孢菌,洛马和pleistophora的成员对农场饲养的鱼也有重大影响(Chilmonczyk等人。 1991,肖和1945,Sheehy等。1974)。彩虹窒息的Osmerus Mordax渔业的崩溃部分归因于Glugea Hertwigi的感染(Haley 1954)。余生感染会降低生长,厌食症(Matthews&Matthews 1980,Figueras等人。1992),《游泳能力障碍》(Sprengel&Lüchtenberg,1991年),降低了生殖成功(Summerfelt 1964,Wiklund等人1996)和肌肉组织的液化(Nigrelli 1946,Grabda 1978,Egidius&Soleim 1986,Pulsford&Matthews 1991)。glugea属,核孢菌,洛马和pleistophora的成员对农场饲养的鱼也有重大影响(Chilmonczyk等人。1991,肖和
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