计算命中查找实验 (CACHE) 挑战系列的关键评估重点是使用计算方法识别蛋白质靶标的小分子抑制剂。每个挑战包含两个阶段,即命中查找和后续优化,每个阶段之后都会对计算预测进行实验验证。对于 CACHE 挑战 #1,亮氨酸富集重复激酶 2 (LRRK2) WD40 重复 (WDR) 域被选为计算机命中查找和优化的靶标。LRRK2 突变是家族性帕金森病最常见的遗传原因。LRRK2 WDR 域是一个研究不足的药物靶标,没有已知的分子抑制剂。在此,我们详细介绍了我们在 CACHE 挑战 #1 中获胜提交的第一阶段。我们开发了一个框架,用于对化学多样性小分子空间进行高通量基于结构的虚拟筛选。使用大规模深度对接 (DD) 协议,然后进行绝对结合自由能 (ABFE) 模拟,进行命中识别。使用基于自动分子动力学 (MD) 的热力学积分 (TI) 方法计算 ABFE。使用 DD 筛选了来自 Enamine REAL 的 41 亿个配体,然后通过 MD TI 为 793 个配体计算 ABFE。76 个配体被优先考虑进行实验验证,成功合成了 59 种化合物,并确定了 5 种化合物为命中物,命中率为 8.5%。我们的结果证明了组合 DD 和 ABFE 方法对于没有先前已知命中物的目标的命中识别的有效性。该方法广泛应用于超大化学库的有效筛选以及利用现代计算资源的严格蛋白质-配体结合亲和力估计。
摘要。随着计算、传感和车辆电子技术的进步,自动驾驶汽车正在成为现实。对于自动驾驶,雷达、激光雷达和视觉传感器等环境感知传感器作为车辆的眼睛发挥着核心作用;因此,它们的可靠性不容妥协。在本研究中,我们提出了一种通过中继攻击进行欺骗,它不仅可以在激光雷达输出中引起错觉,还可以使错觉看起来比欺骗设备的位置更近。在最近的一项研究中,前一种攻击被证明是有效的,但后一种攻击从未被证明过。此外,我们提出了一种针对激光雷达的新型饱和攻击,它可以完全使激光雷达无法感知某个方向。这两种方法的有效性都已通过 Velodyne 的 VLP-16 实验验证。
脑电图 (EEG) 和弥散光学断层扫描 (DOT) 是广泛用于神经成像的成像方法。虽然 EEG 的时间分辨率很高,但空间分辨率通常有限。另一方面,DOT 具有高空间分辨率,但时间分辨率本质上受到其测量的缓慢血液动力学的限制。在我们之前的工作中,我们使用计算机模拟表明,当使用 DOT 重建的结果作为 EEG 源重建的空间先验时,可以实现高时空分辨率。在这项工作中,我们通过以比 DOT 时间分辨率更快的速度交替闪烁两个视觉刺激来实验验证该算法。我们表明,使用 EEG 和 DOT 的联合重建可以清楚地在时间上解析这两个刺激,并且与单独使用 EEG 的重建相比,空间限制得到了显着改善。
在这项工作中,提出了一个渐进互动网络,以使代理的功能能够逐步专注于相关地图,以便更好地学习代理的功能表示,以捕获相关的地图约束。网络在以下三个阶段中逐渐通过图形卷积编码映射约束的复杂影响:在历史轨迹编码之后,在社交互动之后和多模式分化之后。此外,还提出了用于多模式训练的权重分配机制,以便每种模式都可以从单模地面真相获得学习机会。实验验证了渐进互动与现有一阶段相互作用的优越性,并证明了每个组件的有效性。在具有挑战性的基准中获得了令人鼓舞的结果。
人工智能、数字孪生、机器人和先进传感等数字和工程技术是降低成本、优化生物过程、缩短生物解决方案上市时间以及帮助减轻环境和社会风险的关键驱动因素。人工智能被视为其中最有前途的技术——84% 的企业高管表示,人工智能将在加速生物解决方案的采用方面发挥重要作用。此外,70% 的人表示,生成式人工智能将显著提高研发流程的效率,缩短生物解决方案开发的准备时间。机器人和数字孪生等技术也将发挥关键作用,实现更有效的扩大流程和复杂实验室工作流程的自动化,减少实验验证所需的时间和资源。
在电子传输问题和量子计算中起重要作用的开放量子系统的模型必须考虑到与周围环境的量子系统的反应。尽管在某些特殊情况下可以得出此类模型,但在大多数实际情况下,确切的模型是未知的,必须校准。本文提出了一种学习方法,可以从测量数据中推断马尔可夫开放量子系统中的参数。该方法中的一种重要成分是量子主方程的直接模拟技术,该技术旨在保存完全阳性的属性。在测量之间的时间间隔很大的情况下,该方法特别有用。该方法通过错误估计和数值实验验证。
本研究探讨了大学生书面交流的优势和局限性。实施了一项发展书面交流的策略,并通过实验验证了结果。本研究旨在评估改善基础教育专业学生书面交流的策略所取得的成果。上述策略的有效性得到了证实,因为学生在学习和智力发展方面取得了更高的学术成绩。采用了科学实验、科学测量、文件和内容分析方法。通过应用描述性和推理性统计方法分析数据,以证明允许验证所应用教学策略的假设。使用的理论方法是:比较法、假设演绎法、科学建模和功能结构系统。其中最显著的结果是加强了书面交流学习,提高了教学成果、动机水平和学习兴趣。
摘要 — 目前,已通过全基因组关联研究确定了遗传多态性与各种疾病之间的众多关联。大多数具有临床意义的多态性位于基因组的非编码区域。虽然现代生物信息学资源可以预测解释非编码多态性对基因表达影响的分子机制,但这些假设需要实验验证。本综述讨论了阐明疾病发病机制依赖于非编码序列内特定遗传变异的分子机制的方法。特别关注的是识别转录因子的方法,其结合效率取决于多态性变异。尽管生物信息学资源取得了显着进展,可以预测多态性对疾病发病机制的影响,但仍然需要实验方法来研究这一问题。
该原型机用于实验验证 SmartCHP 概念。实验工作的主要发现是,原型机的操作窗口比预期的要小。在当前系统中,由于燃料供应能力和燃烧所需的最低氧含量的限制,锅炉的容量只能在相对较小的范围内变化。重新设计燃料喷射方法以及向烟气锅炉中注入更多空气的选项可以增加这个操作窗口。不过,在项目期间考虑了一些替代的 CHP 解决方案,这些解决方案可以在复杂度较低的系统中以相似或更好的效率提供所需的灵活性。例如,发动机与热泵的组合可以(理论上)将系统的整体效率提高到 100% 以上,并且还有一个好处是,在高热量需求时(冬季),系统不会给电网带来负担。