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宿主基因组学：传染病的教训
我们发现，在我们研究的四种传染病中，宿主基因组学研究活动十分活跃。我们的分析表明，在人群明确的情况下，研究活动通常最为活跃（例如，因感染 SARS-CoV-2 而住院的 ICU 患者）。在人群不易识别的情况下，相关研究活动往往较少。例如，HCV 或 HIV 感染的易感性很难研究，因为某些风险因素会使特定人群面临较高的暴露风险 [3, 10]。尽管存在遗传易感性，但许多人永远不会暴露于病毒。
CSFα-突触核蛋白种子扩增测定阳性与疾病的关联 UC Riverside 从不同溶剂加工的有机太阳能电池的效率同样高的效率揭示了形态控制的关键因素 2024年诺贝尔生理学或医学奖 通过IFNγ诱导的NRF2还原加剧的神经毒性小胶质细胞激活 科学期刊 无线可编程的，皮肤整合的热... 在多种核酸检测中荧光微球的最新进展 tau纤维诱导纳米级膜损伤，并在溶酶体处核定胞质tau 血清素能抗抑郁药停药的影响... 迷幻和“内部治疗师”：神话或机制？ 解开tau 肠道微生物组的重塑和代谢组谱可改善蛋白质起搏，并进行间歇性禁食与连续热量限制 粘液产生，宿主 - 微生物组相互作用，激素敏感性和先天免疫反应在人宫颈芯片中建模 劳伦斯·伯克利国家实验室 CIS基因调节的系统解码定义上下文... 干细胞分泌组治疗可改善全体代谢，降低肥胖并促进老年小鼠的骨骼肌功能 圣地亚哥UC
注意：对于SAA转换器，在转换时间点之前和之后提供了队列特征（即分别使用CSF 𝛼 -SYN SAA-的最后一个时间点，分别与CSF 𝛼 -SYN SAA +的第一个时间点）。n（％），用于连续变量的中位数（IQR）。在支持信息中，表S1提供了临床和生物标志物数据的数据计数和百分比。缩写：β，淀粉样蛋白β； ADAS-COG11，阿尔茨海默氏病评估量表认知子量表11-项目； Ancova，协方差分析；方差分析，方差分析； apoe，载脂蛋白E； CDR-SB，临床痴呆评级盒子的总和； CSF，脑脊液；铜，认知没有受损； MCI，轻度认知障碍； MMSE，小型国会考试； PACC，临床前阿尔茨海默氏症的认知复合材料； p-tau181，磷酸化的tau181; SAA，种子扩增测定法。皮尔森的卡方测试。b单向方差分析。c Fisher精确测试。d Ancova针对年龄，性别，教育，诊断和APOE进行了调整。e Ancova针对年龄，性别，教育，APOE，诊断和CSFAβ42状态进行了调整。f逻辑回归针对年龄，性别，教育，诊断和APOE进行了调整。g配对t检验：所有连续变量； McNemar测试：所有二进制变量；配对标志测试：诊断。
依赖饮食的宿主代谢产物形成肠道菌群以防止自身免疫性
饮食可以防止自身免疫性疾病；但是，饮食是否通过宿主和/或微生物组起作用尚不清楚。在这里，我们使用生酮饮食（KD）作为模型来剖析这些复杂的相互作用。A KD以依赖微生物群的方式挽救了多发性硬化症的实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型。用单个KD依赖的宿主代谢产物（β-羟基丁酸[βHB]）补充饮食，从而营救了EAE，而转基因小鼠无法在肠道中产生βHb，而在肠道中产生了更严重的疾病。βHb形肠道菌群的移植具有保护性。乳杆菌序列变体与T辅助辅助17细胞在体外的激活相关。最后，我们分离了一种保护EAE的Murinus菌株，该菌株是由乳酸乳杆菌代谢物富含βHb补充的吲哚乳酸酯乳酸盐的表皮。因此，饮食通过转移宿主代谢来改变肠道菌群的免疫调节潜力，强调采用更综合的方法来研究饮食 - 宿主 - 菌 - 微生物组相互作用。
设计用于产生5-羟色胺调节宿主肠道生理的细菌
摘要：胃肠道中的细菌在肠道运动，稳态和功能障碍中起着至关重要的作用。揭开微生物影响宿主的机制，由于肠道中细菌产生或代谢的大量代谢产物而构成了许多挑战。在这里，我们描述了肠道共生细菌的工程，1917年的大肠杆菌Nissle，以生物合成为人类代谢产物血清素的生物合成，以检查微生物产生的生物胺对宿主生理学的影响。在对小鼠的口服给药后，我们的工程细菌到达大肠，在那里产生5-羟色胺。用血清素产生细菌治疗的小鼠在转录和生理水平上表现出肠道的生物学变化。这项工作建立了一个新型的框架，该框架采用工程细菌来调节腔5-羟色胺水平，并提出了改良的微生物疗法的潜在临床应用，以解决人类肠道疾病。关键字：E。Coli Nissle 1917，5-HT，5-羟色胺，微生物组工程，工程益生菌，肠道■简介
开放式博士位置（M/F/D） - 研究寄生虫诱导的宿主细胞使用器官技术
OID技术研究宿主 - 寄生虫相互作用以剖析疾病机制。 所提供的PHD项目专门旨在剖析肠道上皮细胞分化的改变，重点是杯状细胞增生，并在感染肠道寄生虫贾第鞭毛虫duodenalis时，是全球公共卫生问题的肠道亲通道。 该项目由德国研究基金会（DFG）资助，并提供3年OID技术研究宿主 - 寄生虫相互作用以剖析疾病机制。所提供的PHD项目专门旨在剖析肠道上皮细胞分化的改变，重点是杯状细胞增生，并在感染肠道寄生虫贾第鞭毛虫duodenalis时，是全球公共卫生问题的肠道亲通道。该项目由德国研究基金会（DFG）资助，并提供3年
病原体 - 宿主相互作用数据库（PHI-base）
Phi-Base 5网站上的软件开发工作由Molecular Connections Pvt Ltd（印度班加罗尔）提供。Phi-canto策划工具是与剑桥大学的Pombase团队合作开发的，金·卢瑟福（Kim Rutherford）提供软件开发和Val Wood提供了有关新策展过程的咨询和培训。由Incatools开发的本体论开发试剂盒的协助，由Upheno Project与Nico Matentzoglu协商（Sentancicly Ltd，曾经是EMBL-EBI）协商，由Upheno Project开发的统一表型本体学的开发。基因本体论的编辑者，尤其是Pascale Gaudet（瑞士 - 普罗特，瑞士生物信息学研究所），开发了新的本体论术语，以协助Phi-Base中病原体 - 霍斯特过程的策划。自2011年以来，Phi-base数据已在每个Ensembl释放中托管。Phi-Canto和Phipo的开发是由英国生物技术与生物科学研究委员会（BBSRC）（BB/S020020/1）资助的。PHI-BASE的持续发展目前由Rothamsted Research的两个学院战略计划提供资金：增长健康（BB/X010953/1; BBS/E/E/RH/230003A）并提供可持续的小麦（BBS/E/E/RH/230001B）。
皮肤自主抗体生产调节宿主 -
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UC Riverside 从不同溶剂加工的有机太阳能电池的效率同样高的效率揭示了形态控制的关键因素 2024年诺贝尔生理学或医学奖 通过IFNγ诱导的NRF2还原加剧的神经毒性小胶质细胞激活 科学期刊 无线可编程的，皮肤整合的热... 在多种核酸检测中荧光微球的最新进展 tau纤维诱导纳米级膜损伤，并在溶酶体处核定胞质tau 血清素能抗抑郁药停药的影响... 迷幻和“内部治疗师”：神话或机制？ 解开tau 肠道微生物组的重塑和代谢组谱可改善蛋白质起搏，并进行间歇性禁食与连续热量限制 粘液产生，宿主 - 微生物组相互作用，激素敏感性和先天免疫反应在人宫颈芯片中建模 劳伦斯·伯克利国家实验室 CIS基因调节的系统解码定义上下文... 干细胞分泌组治疗可改善全体代谢，降低肥胖并促进老年小鼠的骨骼肌功能 圣地亚哥UC
有机太阳能电池（OSC）的功率转化效率超过20％，这是形态优化起着重要作用的进步。普遍认为，加工溶剂（或溶剂混合物）可以帮助优化形态，从而影响OSC效率。在这里，我们开发了对一系列加工溶剂的强大耐受性的OSC，所有设备的高功率转换效率均约为19％。通过研究溶液状态，膜的形成动力学以及经过实验和计算的处理膜的特征，我们确定控制形态的关键因素，即受体材料的侧链与溶剂链的侧链以及供体和受体材料之间的相互作用之间的相互作用。我们的工作为形态控制的长期问题和有效指南提供了新的理解，以将OSC材料设计用于实用应用，在这种应用中，大规模加工需要绿色溶剂。
人类凝集素阵列用于表征宿主 - 病原体相互作用
已经开发了人类凝集素阵列，以探测具有致病性和共生微生物的先天免疫受体的侵蚀。Following the successful intro- duction of a lectin array containing all of the cow C-type carbohydrate-recognition domains (CRDs), a human array described here contains the C-type CRDs as well as CRDs from other classes of sugar-binding receptors, including galectins, siglecs, R-type CRDs, fi colins, intelectins, and chitinase-like lectins.阵列是用单位生物素标签修饰的CRD构建的，以确保CRD中的糖结合位点显示在定义方向的链霉亲和素涂层的表面上，并可以访问Mi-Crobes的表面。一种用于表达和显示来自聚糖结合受体所有不同结构类别的CRD的常见方法，可以在凝集素家族之间进行比较。除了先前记录的含量标记细菌结合的方案外，还开发了通过用DNA结合染料染色来检测与阵列结合的未标记细菌的方法。筛查也已被病毒糖蛋白以及细菌和真菌多糖未侵蚀。阵列为与受体相互作用的糖配体提供了一个公正的筛选，并且许多人表现出了较早研究所没有预期的结合。例如，某些甲状腺蛋白与缺乏乳糖或N-乙酰乳糖胺的细菌甘氨酸结合。结果证明了人类凝集素阵列的实用性，以提供与先天免疫系统中多种类似聚糖蛋白相互作用的独特概述，并提供了不同类型的微生物。
非生物因子塑造增强宿主发育的蚊子微生物
后生动物通过多个生命阶段依靠与微生物的互动。例如，蚊子的发育轨迹可能会根据水生幼虫阶段可用的微生物而变化。然而，当地环境在塑造这种宿主微叶动力学和对宿主有机体的后果中所扮演的作用仍然不足。在这里，我们研究了非生物因子，局部可用的细菌的影响，以及它们对蚊子艾德斯白化菌的发育和相关微生物群的相互作用。Our findings reveal that leaf detritus infused into the larval habitat water, sourced from native Hawaiian tree ‘ ¯ ohi‘a lehua Metrosideros polymorpha , invasive strawberry guava Psidium cattleianum , or a pure water control, displayed a more substantial influence than either temperature variations or simulated microbial dispersal regimes on bacterial community composition in adult mosquitoes.然而，特定的细菌在跨碎屑输注中表现出不同的模式，这些蚊子与幼体栖息地中的丰度不符。具体来说，我们观察到了菊花杆菌的相对丰度较高。从草莓番石榴输注中的蚊子中的菌株比纯水控制，而对于假单胞菌sp。观察到相反的趋势。应变。在一项后续实验中，我们操纵了这两种细菌菌株的存在，并通过包括菊科SP来增强幼体发育成功。草莓番石榴输注和假单胞菌sp。在纯水控制中应变。共同表明，幼虫环境的非生物因素和微生物之间的相互作用可以帮助塑造蚊子人群的成功。