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许多可用于消费者的饮食产品,例如饮食补充剂,含有据称赋予人类健康益处的活微生物。有关于商业益生菌标签差异的报道,其中物种经常被错误分类或不存在,以及标签上未列出的微生物污染。这项研究的目的是更好地了解益生菌产品的质量,其标签的准确性以及使用整个基因组测序(WGS)宏基因组学鉴定潜在污染物和低水平成分的能力。在这项研究中,DNA从123种益生菌产物中纯化,并使用Illumina Miseq平台进行了元基因组测序。生成的序列用于鉴定具有基于新型内部K-MER数据库的独特物种特异性特异性特异性特异性特异性特异性标志的微生物成分。并行,使用培养依赖性方法,将产物的微生物含量生长用于单个集菌分离,然后使用WGS创建有益微生物的基因组序列数据库。此外,使用抗性基因识别剂和毒力发现者生物信息学工具来识别抗生素耐药性和毒力因子基因的存在。宏基因组方法中的一个挑战是在存在大量有意添加的物种(如乳杆菌和双叶杆菌)的情况下,以较少的数量(成分,污染物和病原体)来检测微生物。这些研究将使消费者可用的实时微生物补充剂的内容有更好的了解,并提供一种分析途径来检测低量的有害病原体。避免了这两种方法:使用特定的噬菌体和/或纯化的噬菌体赖氨酸来减少产品的本地微生物,以改善对低水平微生物成分的检测并使用靶标的物质测序。
CRISPR相关的TN7转座子(铸造)共同OPT CAS基因用于RNA引导的转座。在基因组数据库中极为罕见。最近的调查报道了类似TN7样的转座子,该座子选择了I型I-F,I-B和V-K CRISPR效应子。在这里,我们通过对元基因组数据库的生物信息学搜索扩展了报告的铸造系统的多样性。我们发现了所有已知铸件的体系结构,包括级联效应器的布置,目标归巢方式和最小V-K系统。我们还描述了选择了I型I-C和IV型CRISPR-CAS系统的铸造家族。我们对非TN7施放的搜索确定了包括核酸酶死亡CAS12的候选者。这些系统阐明了CRISPR系统如何与转型共同发展并扩展可编程基因编辑工具包。
作者的完整列表:Alessandri,Giulia;帕尔马大学,兽医医学系米兰,莱昂纳多克里斯蒂安·曼卡贝利;帕尔马大学,生命科学Mangifesta,Marta;帕尔马大学,生命科学Lugli,Gabriele Andrea;帕尔马大学,化学,生命科学与环境可持续性系Alice,Alice;帕尔马大学,Genprobio Srl Duranti,Sabrina Turroni,Francesca Ossiprandi,Maria;帕尔马大学,医学兽医科学系,杜威(Douwe);爱尔兰国立大学,Marco微生物学系;帕尔马大学生命科学
摘要M依赖依词学涉及遗传材料提取和直接从环境样本中进行测序,以获得微生物及其周围环境之间存在的见解和关系。在包括在坦桑尼亚阿鲁沙地区发现的苏打湖等极端环境中进行的研究很少。这项研究记录了确认湖泊末端的高pH值和盐度值。全长16S rRNA读取通过PACBIO测序的读数用于揭示细菌群落的首次宏基因组快照,从海岸线水域的10个随机点。结果表明,蛋白细菌和企业的优势分别为98.46%和70.46。α-杆菌(93.59%),拟杆菌(23.80%)和杆菌(23.19%)是最主要的类别。Oceanibaculaceae(52.43%),Rhizobiaceae(66.62%)和Izemoplasmataceae(12.50%)是最主要的家庭。主属分别为Oceanibaculum(52.44%),Allorhizobium(65.59%)和Izimaplasma(12.50%)。多样性指数显示出高水平的社区多样性,大量物种,稀有物种的存在以及在抽样点中细菌的平均分布。这项研究提供了有关纳特隆湖中各种分类单元的首次报告,但建议进行功能性元基因组分析,以进一步研究已鉴定物种的生态和生物技术意义。关键字:宏基因组学; PACBIO测序;细菌多样性;苏打湖;纳特隆湖简介
番茄果实成熟是由关键基因的脱甲基触发的,这会改变其转录水平,从而启动和传播一系列的生理事件。未知的是,当使用后票后实践成熟水果以扩展保质期时,这些过程如何改变,因为这些实践通常会降低水果的质量。为了解决这个问题,评估了处理后处理诱导的果实DNA甲基甲基和转录组的变化,以及它们如何与成熟速度相关,并评估了乙烯,脱甲酸和类胡萝卜素等成熟指标。这项研究通过动态分子变化全面连接生理事件的变化。成熟的果实在20℃,12.5℃或5℃冷却后达到“转动”(t),将其与新鲜的水果“ FHT”进行了比较。储存在12.5℃的水果具有最大的表观遗传标记和基因表达的改变,超过了后冷却后引起的变化。果实生理和年代年龄在12.5℃下取消耦合,因为成熟时间是最长的。成熟到12.5℃的果实成熟并不是最新的。没有呼吸道或乙烯爆发,而是脱落酸含量很高。在甲基化组和转录组中明显明显的后脱水和“ FHT”之间的明显差异。在“ FHT”果实中光合基因和叶绿素水平的较高表达表现为光明,因为它影响了果实成熟的分子变化。最后,对由DNA甲基化调节的基因的 - 组数据的相关分析。总体而言,这些数据改善了我们对番茄果实成熟方式如何通过后票后实践改变的解释,并且期望长期有助于提高水果质量。
我们首先要感谢并祝贺 Denise Wilson、审查指导小组的杰出成员和秘书处。这是一份出色的报告,也是对他们多年来致力于推进这一重要工作领域的致敬。我们很高兴看到,尽管企业在疫情期间面临巨大挑战,但最新的领导力数据显示,在 FTSE350 中,女性的代表性仍在不断提高。这表明,英国在改善企业领导力多样性方面采取的自愿、证据和企业主导的方法取得了成功,与其他一些司法管辖区的配额规定不同,这种方法适用于数量多得多的公司。
北肯辛顿及其周边地区的不平等,加上疫情、生活成本危机和格伦费尔大火灾难,加剧了年轻人结果的巨大差异。我们不收取任何费用,俱乐部的资金来自自愿捐款和赠款。我们的志愿者为来自不同背景的当地年轻人提供技能和培训,以改善他们的机会和福祉。通过将不同的当地社区聚集在一起,我们团结在一个共同的目标下:改善生活和创造社会资本。来自不同背景的球员、家长、支持者和助手共同努力,建立桥梁、友谊和人际关系。我们每周至少两次在户外与 400 多名年轻人一起工作,用足球帮助他们发挥潜力,无论他们的社会经济背景如何。