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对设计的苯咪唑衍生物的分子对接分析为EGFR
摘要非小细胞肺（NSCL）和结直肠癌经常与表皮生长因子受体（EGFR）的致癌激活相关，这是受体酪氨酸激酶（RTK）家族的成员。当前的酪氨酸激酶抑制剂（TKI）容易受到耐药性突变的影响，并诱导了对正常EGFR S的细胞毒性作用。带嘌呤的苯咪唑的同余性质具有模仿基于嘌呤的ATP的结合模式并防止其与EGFR活性位点的接触的巨大潜力。在这里，我们报告了50种设计的苯咪唑衍生物以及Gefitinib和ATP的分子对接，以分析和比较EGFR WT和T790M活性位点的结合模式。配体的设计基于我们先前的研究，我们建议评估与双键接头的酮和氨基 - 苯并咪唑，以及在各个位置附有电子捐赠和电子撤回的苯基基团。对接模拟表明，酮苯并咪唑在两个EGFR配合物中占据了前十名最高结合亲和力。与其他具有-8.1（7C）和-7.8（11C）KCAL/MOL在EGFR WT中的结合能相比，具有更稳定的复合物的磺酰基取代基的存在，eGFR WT中的结合能，-8.3（7d）和-8.4（7d）和-8.4（1c）kcal/mol for t790m t790m for T790m。对苯咪唑的取代影响不仅有助于氢键和疏水相互作用，而且还对经常被转化的范德华力的力，这些力是负责苯并咪唑与EGFR结合口袋的形状互补性的负责。
AM与锻造Ti6Al4V板材激光对接焊接头特性研究
摘要 钛合金Ti6Al4V具有强度高、耐腐蚀性能好等优点，被广泛应用于医疗、汽车、航空航天等行业。另一方面，增材制造（AM）技术可以给予产品设计的自由度。为了推广AMed产品，需要将AMed与锻造产品连接起来，了解接头特性非常重要。本研究在氩气保护下用光纤激光器对Ti6Al4V板进行对接焊，并实验研究了激光焊接锻造/锻造、AMed/AMed、AMed/锻造Ti6Al4V板的接头特性。AMed板的抗拉强度高于锻造板，但AMed板的伸长率较小，这是因为AM工艺中AMed板在激光辐照过程中由于快速冷却而产生α'马氏体。然后，AMed/AMed板的激光焊接接头具有较高的抗拉强度，但伸长率小于锻造/锻造板。强化/锻造钢板的焊接接头表现出良好的焊接状态，因为较小的热输入导致锻造钢板和强化钢板之间形成较小且硬度较高的焊道。
利用分子对接和分子动力学研究释放已批准药物对原肌球蛋白受体激酶 A 变构抑制的潜力
1 苏丹杰济拉大学药学院药物化学系，2 苏丹杰济拉大学药学院药剂学系，3 苏丹喀土穆大学药学院药物化学系，4 沙特阿拉伯阿尔哈吉 Prince Sattam Bin Abdulaziz 大学药学院生药学系，5 苏丹喀土穆大学药学院生药学系，6 埃及曼苏拉曼苏拉大学药学院生药学系，7 沙特阿拉伯麦加乌姆古拉大学药学院临床药学系，8 沙特阿拉伯麦地那 Al-Munawwarah 泰巴大学药学院药理学与毒理学系阿拉伯、9 沙特阿拉伯麦地那泰巴大学药学院药剂学和制药技术系、10 沙特阿拉伯吉达巴特吉医学院化学系预科课程、11 埃及艾斯尤特大学药学院生药学系、12 沙特阿拉伯吉达阿卜杜勒阿齐兹国王大学药学院天然产物和替代医学系
CD对接MPK4的基本作用在植物免疫，生长和发育中
MAPK是通用的真核信号传导因子，其功能被认为取决于其激活剂，底物和iNactivators对公共对接基序（CD）的识别。我们通过执行相互作用的基础并确定结合配体结合的MPK4晶体结构来研究拟南芥MPK4的CD结构域的作用。我们揭示了MPK4的CD域对于其上游MAPKKS MKK1，MKK2和MKK6对于相互作用和激活至关重要。cys181被证明是对活性氧的体外响应的磺酰基的。为了测试C181在体内的功能，我们生成了野生型（WT）MPK4-C181，Nonsulfenylabable MPK4-C181S，并在MPK4淘汰赛中模仿MPK4-C181D线的潜在硫乙基。我们分析了MPK4-C181S具有WT活性并补充MPK4表型的生长，发育和压力反应中的表型。相比之下，MPK4-C181D不能被上游MAPKK激活，并且不能补充MPK4的现场类型。我们的发现表明，CD基序是必不可少的，并且是由上游MAPKK激活MPK4功能所必需的。此外，生长，发育或免疫功能需要上游激活MPK4蛋白激酶。
calaxin稳定脊椎动物中的外臂动力蛋白的对接到纤毛双子微管
抽象的外臂动力蛋白（OAD）是纤毛跳动的主要力发生器。尽管OAD损失是人类原发性睫状运动障碍的最常见原因，但OAD的对接机制在纤毛双线微管上（DMT）仍然难以捉摸脊椎动物。在这里，我们使用斑马鱼精子和冷冻电子层析摄影术分析了脊椎动物OAD-DC（停靠复合物）的五个组成部分中的Calaxin/efcab1和ARMC4的功能。ARMC4的突变导致OAD完全丢失，而卡拉辛的突变仅导致OAD的部分损失。 详细的结构分析表明，卡拉辛 - / - OAD通过Calaxin以外的其他DC组件将DMT束缚在DMT上，并且重组卡拉辛可以自主挽救缺陷的DC结构和OAD的不稳定性。 我们的数据证明了Calaxin和ARMC4在OAD-DMT相互作用中的离散作用，这表明OAD对接在脊椎动物中DMT上的稳定过程。ARMC4的突变导致OAD完全丢失，而卡拉辛的突变仅导致OAD的部分损失。详细的结构分析表明，卡拉辛 - / - OAD通过Calaxin以外的其他DC组件将DMT束缚在DMT上，并且重组卡拉辛可以自主挽救缺陷的DC结构和OAD的不稳定性。我们的数据证明了Calaxin和ARMC4在OAD-DMT相互作用中的离散作用，这表明OAD对接在脊椎动物中DMT上的稳定过程。
性别对接受监视技术的影响
政府面临的经典困境和公民都是隐私与安全之间的权衡。这一概念是在《宪法》的《第四修正案》中找到的，这意味着公民有权受到“政府不合理的搜查和癫痫发作”的保护（Findlaw 2019）。技术革命及其对隐私的影响使这项权利的本质变得复杂。不同类型的数据需要不同的方法来实现隐私与安全权衡。Wright等人的2003年面板。al询问应接触到通过跟踪用户在线或现实世界移动的技术收集的“传感器数据”，并将其描述为“真实和增长的隐私威胁”（Wrightet。al 2003）。监视技术属于这一类别。某些人口统计学对隐私的价值比其他人更重要。在隐私增强技术的背景下（可以保护应用程序用户身份的系统），有色人种和女性的人似乎比在在线论坛和个人数据收集的背景下对白人更重视隐私（Joshghani，Eksstrand，eksstrand et。al 2018）。因此，可以合理地相信，隐私偏好而不是安全性的这种差异可能沿着性别尤其是妇女（尤其是妇女）存在。在一项小型样本调查中，Van Heek，Arning和Ziefle发现，面对较高的威胁，参与者更可能更喜欢安全而不是隐私，而与男性相比，更多的妇女倾向于将安全性估值而不是隐私。这些理论上的差异引发了一个问题，如果对男人和女人对日常生活中的安全措施的感觉有所不同，是否存在现实世界的影响。这对我的研究问题具有重要意义：性别如何影响监视技术的接受？
分子对接和动力学模拟
基质金属蛋白酶9（MMP-9）是锌，依赖钙的蛋白水解酶，参与细胞外基质降解。MMP-9的过度表达已在几种疾病中得到证实，包括癌症，阿尔茨海默氏病，自身免疫性疾病，有氧运动血管疾病和龋齿。因此，建议将MMP-9抑制作作为对抗各种疾病的治疗策略。肉桂酸衍生物在不同的癌症，阿尔茨海默氏病，心血管疾病和龋齿中表现出治疗作用。进行了一种计算药物发现方法，以评估选定的肉桂酸衍生物与MMP-9活性位点的结合亲和力。还检查了对顶级化合物的停靠姿势的稳定姿势。使用Autodock 4.0工具测试了12种草药肉桂酸衍生物可能抑制MMP-9。通过10纳秒模拟中，通过分子动力学（MD）评估了最有效的MMP-9抑制剂的停靠姿势的稳定性。在MMP-9活性位点中，在MD模拟之前和之后研究了本研究中最佳的MMP-9抑制剂与在MMP-9活性位点中掺入的残基之间的相互作用。cynarin，绿原酸和马链酸与MMP-9催化结构域具有相当大的结合亲和力（δg结合<–10 kcal/ mol）。在皮摩尔尺度上计算了cynarin和绿原酸的抑制恒定值，并将其分配为肉桂酸衍生物中最有效的MMP-9抑制剂。在10 NS模拟中，cynarin和绿原酸的根平方偏差低于2Å。cynarin，绿原酸和红氨酸酸可能是MMP-9抑制作用的候选药物。
在使用分子对接方法靶向SMDCD的植物化学物质筛查中
在使用分子对接链球菌突变的植物化学物质筛选中，使用分子对接方法hemlata pundir 1，Ramanand Pathak 2，Tanuja Pant 3，Manish Pant 4，Manish Pant 4，Subhash Chandra Chandra 3，Chandra 3，*和Sushma Tamta 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 S. botany，d.s.ss.b。校园，库马恩大学，北阿坎德邦263002，印度2植物学系，M.L.K。 北方邦西德斯大学272202，印度 北方邦272202电子邮件：scjnu@yahoo.co.in）收到：2022年9月21日，修订：2022年11月4日，接受：2022年11月11日，发布：2023年3月17日摘要校园，库马恩大学，北阿坎德邦263002，印度2植物学系，M.L.K。北方邦西德斯大学272202，印度 北方邦272202电子邮件：scjnu@yahoo.co.in）收到：2022年9月21日，修订：2022年11月4日，接受：2022年11月11日，发布：2023年3月17日摘要北方邦西德斯大学272202，印度 北方邦272202电子邮件：scjnu@yahoo.co.in）收到：2022年9月21日，修订：2022年11月4日，接受：2022年11月11日，发布：2023年3月17日摘要北方邦272202电子邮件：scjnu@yahoo.co.in）收到：2022年9月21日，修订：2022年11月4日，接受：2022年11月11日，发布：2023年3月17日摘要北方邦272202电子邮件：scjnu@yahoo.co.in）收到：2022年9月21日，修订：2022年11月4日，接受：2022年11月11日，发布：2023年3月17日摘要北方邦272202电子邮件：scjnu@yahoo.co.in）收到：2022年9月21日，修订：2022年11月4日，接受：2022年11月11日，发布：2023年3月17日摘要北方邦272202电子邮件：scjnu@yahoo.co.in）收到：2022年9月21日，修订：2022年11月4日，接受：2022年11月11日，发布：2023年3月17日摘要北方邦272202电子邮件：scjnu@yahoo.co.in）收到：2022年9月21日，修订：2022年11月4日，接受：2022年11月11日，发布：2023年3月17日摘要北方邦272202电子邮件：scjnu@yahoo.co.in）收到：2022年9月21日，修订：2022年11月4日，接受：2022年11月11日，发布：2023年3月17日摘要
通过分子对接，MM/GBSA计算，MD模拟和ADMET分析，从天然产物中鉴定自然产物的潜在人胰腺淀粉酶抑制剂
人胰腺α-淀粉酶（HPA）是碳水化合物水解的催化剂，是控制2型糖尿病的可行靶标之一。抑制α-淀粉酶低葡萄糖水平，有助于减轻高血糖并发症。在此，我们通过分子建模系统地从天然产物库中系统地筛选了潜在的HPA抑制剂。建模包括分子对接，MM/GBSA结合能计算，MD模拟和ADMET分析。This research identified new- boulaside B, newboulaside A, quercetin-3-O- β -glucoside, and sasastilboside A as the top four potential HPA inhibitors from the library of natural products, whose Glide docking scores and MM/GBSA binding energies range from -9.191 to -11.366 kcal/mol and -19.38 to -77.95 kcal/mol。基于模拟，其中newboulaside b被发现为最佳的HPA抑制剂。在整个模拟过程中，偏差为3Å（Acarbose =3Å），它与ASP356，ASP300，ASP197，THR163，ARG161，ASP147，ALA106和GLN63相互作用。此外，全面的ADMET分析表明，它具有良好的药代动力学特性，没有急性毒性，适中的生物利用和非抑制剂的性质，并且对细胞色素p450。所有结果表明，Newboulaside B可能是针对2型糖尿病的药物发现的有前途的候选人。
黑麦饮食纤维成分对接种益生菌微生物的发酵影响
摘要：Rye -fl我们被用作酸面包的主要成分，该面包具有技术和美食的好处，并增加了营养价值。在发酵和烘烤过程中观察到的转化可能使黑麦饮食纤维碳水化合物的转化或降解主要由阿拉伯木基群，果糖和β-葡聚糖建造。这项研究旨在确定与潜在益生菌微生物接种的酸面团中复杂碳水化合物含量变化的动力学，以及所得面包的多糖组成。sourdoughs被潜在的益生菌微生物糖果糖，lactiplantibacillus plantarum，lamansibarcillus rhamnosus和coagulans和coagulans和coagulans和自发性作用接种。的样品分析了单个饮食中的饮食纤维成分的含量。本研究表明，应用的处理有助于面包中阿拉伯木基人的总含量增加，而酸面团的接种具有潜在的益生菌菌株，可改善其在水中的溶解度。使用s.boulardii菌株的使用似乎是前瞻性的，因为它可以减少黑麦面包中的果糖。黑麦面团面包是饮食中纤维的有吸引力的来源，可以根据不同的营养需求进行修饰。