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利用榄仁树的植物化合物对心血管疾病相关蛋白质进行对接研究
序号 化合物/药物 分子式 化合物 ID 1 阿朱尼汀 C 36 H 58 O 10 3052779 2 阿朱酸 C 30 H 48 O 5 15385516 3 阿朱醇酸 C 30 H 48 O 5 73641 4 阿朱酮 C 19 H 20 O 6 14034821 5 阿朱皂苷 C 30 H 48 O 6 12444386 6 β-谷甾醇 C 29 H 50 O, 222284 7 木麻黄苷 C 41 H 28 O 26, 13834145 8 鞣花酸 C 14 H 6 O 8 5281855 9 没食子酸乙酯 C 9 H 10 O 5 13250 10 没食子酸酸 C 7 H 6 O 5 370 11 木犀草素 C 15 H 10 O 6 5280445 12 槲皮素 C 15 H 10 O 7, 5280343 13 苦素酸 C 30 H 48 O 4 355369274 14 儿茶素 C 15 H 14 O 6, 73160 15 芦丁 C 27 H 30 O 16, 5280805 16 山奈酚 C 15 H 10 O 6, 5280863 17 白花青素 C 15 H 14 O 7, 71629 18 3-O-甲基鞣花酸 3'-鼠李糖苷
利用分子对接靶向 Mpro 和 ACE2 进行针对 COVID-19 的天然化合物计算机筛选
摘要。– 目的：目前，冠状病毒 COVID-19 正在全球范围内迅速传播，由于市场上没有有效的疫苗或药物，其控制非常困难。这种病毒可以感染动物和人，并引起呼吸道疾病。世卫组织已宣布冠状病毒为大流行病，全世界都在与冠状病毒作斗争。全球已有超过 199,478 人确诊感染 COVID-19。截至 2020 年 3 月 18 日，已有 167 多个国家受到影响，报告死亡人数超过 8000 人。受影响的主要国家是中国，其次是意大利、伊朗、西班牙、法国和美国。材料和方法：由于目前尚无针对冠状病毒的有效药物，我们对植物化学物质进行了虚拟筛选，以寻找针对这种病毒的新型化合物。因此，我们创建了一个植物化学库，其中包含来自 11 种植物的 318 种植物化学成分，这些成分已被报道具有抗病毒、抗菌和抗真菌活性。对植物化学库进行了虚拟筛选，筛选的分子靶点包括主蛋白酶 (Mpro) 和血管紧张素转换酶 2 (ACE2)。结果：从每个靶点中选出前 10 种化合物，这些化合物与参考分子相比具有更好的结合能，并且结合能明显更低。结论：根据结合能得分，我们建议对这些化合物进行抗冠状病毒测试，并用于开发有效的抗病毒药物。
研究分子对接和ADMET预测姜黄素衍生物作为2-α酪蛋白激酶抑制剂
酪蛋白激酶2-α蛋白是治疗白血病癌的靶标之一，它是调节白血病癌生生长的重要分子。姜黄素化合物被证明具有2-α酪蛋白抑制剂的活性，但仍没有研究将姜黄素衍生物化合物作为2-α酪蛋白酶抑制剂进行测试。这项研究的目的是根据酪蛋白化合物及其衍生物作为酪蛋白激酶抑制剂2-αIDGDP：3PE1：3PE1通过分子对接（基于最低的键合能（ΔG）和相互作用），并知道ADMET的预测。所使用的方法是带有自动库克工具1.5.7的分子张力。接下来是Lipinski对姜黄素化合物的五（RO5）测试及其衍生物的规则，并伴随着使用Swiss Adme和Admetsar进行ADMET筛选。获得的结果是三种测试化合物，具有最佳的游离键能（ΔG），即DI -O -O -ECETEDETEDEMETHOXY CURCUMIN = -10.13 kcal/mol，二甲氧基姜黄素= -9.93 kcal/mol/mol和Dimethyl Curcumin = -9,88 kacal/mol。氨基酸残基最大程度地形成氢键的是valine（Val 116）多达22种相互作用，其次是赖氨酸（Lys 68）（Lys 68）多达18种相互作用，而天冬氨酸（ASP 175）（ASP 175）多达17个相互作用。三种最佳测试化合物还符合RO5标准，并且在这些化合物中进行ADMET筛选显示了活性预测的结果，因为2-α酪蛋白抑制剂具有吸收参数，分布，代谢，排泄，毒性（ADMET）已经很好。基于从这项研究获得的数据，预计三种最佳测试化合物具有2-α酪蛋白抑制剂的潜力。
分子对接和ADMET研究，用于搜索针对SARS-COV-2的多靶向抗病毒化合物：一种计算方法
最近由SARS-COV-2引起的大流行是整个世界的主要健康问题。快速传播和这种疾病的死亡率对人类社会构成了严重威胁。通过研究其认真对待这种疾病的药物是当今的最大任务。在本研究中，计算方法用于寻找针对SARS-COV-2感染的有效化合物。1452具有潜在抗病毒活性的化合物从PubChem数据库中选择，以搜索潜在的抑制剂SARS-COV-2的治疗靶标。使用Maestro 12.4（Schrodinger Suite）进行了分子对接和吸收，分布，代谢，消除和毒性（ADMET）性质研究。所有选定的化合物被汇合到六种化合物，这些化合物被发现对SARS-COV-2的所有五个靶标有效。Among six compounds, compound C6 is exhibited excellent docking score -8.93, -8.21, -7.93, -6.73 kcal/mol with main protease (Mpro), angiotensin-converting enzyme-2 (ACE2), RNA dependent RNA polymerase (RdRp), and endoribonuclease (NSP15) target proteins respectively.
空间服务、装配和制造 (ISAM) 解决方案
对接机制 Moog 线性执行器系统 (LAS) 是 NASA 对接系统 (NDS) 内的主要子系统。它为对接国际空间站和最终对接 Gateway 提供多轴独立机电负载控制。带和不带脐带（电气和流体）的半 ESPA 对接系统投资正在进行中。
在2型糖尿病的植物化学物质的硅分子对接中：网络药理学方法
iabetes mellitus是一种内分泌疾病。2型糖尿病被定义为碳水化合物，脂质和蛋白质的代谢缺陷，原因是胰岛素产生降低或胰岛素耐药性增加或两者的组合（1）。在2022年，根据国际糖尿病联合会（IDF）（https://idf.org/），5.37亿和9000万人分别在全球和东南亚患有糖尿病。在9000万个人中，有7,740万是印第安人，预计到2045年将超过1.34亿。根据IDF，印度人口中糖尿病的发生百分比为8.9。 根据世界卫生组织（WHO）数据，印度所有死亡的2％是由于糖尿病及其复杂的临床意义引起的，例如视网膜病，神经病，肾病，心血管疾病和皮肤疾病（https://wwww.who.int/）。 T2DM具有复杂的病理生理过程，涉及各种因素的一致作用，从而导致疾病发展（2）。 因此，靶向T2DM途径中多种蛋白质很重要。 必须在多野兽方法（3）中确定疾病不同途径中的高度互动蛋白。根据IDF，印度人口中糖尿病的发生百分比为8.9。根据世界卫生组织（WHO）数据，印度所有死亡的2％是由于糖尿病及其复杂的临床意义引起的，例如视网膜病，神经病，肾病，心血管疾病和皮肤疾病（https://wwww.who.int/）。T2DM具有复杂的病理生理过程，涉及各种因素的一致作用，从而导致疾病发展（2）。因此，靶向T2DM途径中多种蛋白质很重要。必须在多野兽方法（3）中确定疾病不同途径中的高度互动蛋白。
解锁传统植物的抗病毒潜力
图1：不同药物来源的各种化合物的比较对接得分。该图突出了源自传统药用植物和对照的化合物的结合效率（kcal/mol的对接得分），表明它们是抗病毒药的潜力。较低的对接得分代表更强的结合亲和力，具有诸如甘油丁素，amarogentin和withaferin a的化合物表现出了异常相互作用。颜色编码类别有助于源的视觉分化。
Araştırma Makalesı/研究文章 DOI：https://doi.org/10.35414/akufemubid.1432554 AKÜ FEMÜBıD 24 (2024) 041103 (798-810) AKU J. Sci。工程师。 24（2
© 阿菲永科卡特佩大学摘要 本研究以苯胺衍生物为原料，合成了一种新型的咪唑和喹啉基偶氮化合物 (MITPDQ)，该苯胺衍生物用作合成用于治疗白血病的尼洛替尼的中间体，并对其进行了表征，并用 NMR、FTIR、UV、FTIR 和 MS 等光谱技术阐明了其结构。使用 DFT (B3LYP) 方法和 6-311G (d,p) 基组进行理论计算，以获得 MITPDQ 的优化几何形状和光谱数据。将实验结果与理论结果进行了比较，发现它们是彼此兼容的。利用优化的 MITPDQ 几何形状，还与癌症相关蛋白质进行了分子对接研究。从对接结果来看，MITPDQ 和 2XIR 蛋白之间的最高对接得分为 -11.0 kcal/mol。此外，还计算了 MITPDQ 的 ADMET 属性。通过ADMET和分子对接研究，我们得出结论，经过进一步的研究，MITPDQ具有成为候选药物的潜力。关键词 咪唑；喹啉；量子化学计算；分子对接；ADMET
分子对接的艺术和科学
分子对接已成为结构性生物学和药物化学家工具包的重要组成部分。给定分子靶标的化合物和三维结构（例如，蛋白质）将化合物固定在靶标中，预测化合物的结合结构和结合能。对接可以通过筛选大型虚拟复合库来发现目标的新型配体。对接还可以为基于结构的配体优化或研究配体的作用机理提供有用的起点。计算方法的进步，包括基于物理学的和机器学习方法以及互补的实验技术，使对接成为更强大的工具。我们回顾了扩展坞的工作原理以及如何推动药物发现和生物学研究。我们还描述了其当前的局限性和克服它们的持续努力。
停机坪运营开始 - ADB Safegate
手动对接飞机，尤其是在恶劣天气下，会增加延误和事故风险。ADB SAFEGATE 提供优化登机口操作的解决方案。我们的 Safedock 高级视觉对接引导系统 (A-VDGS) 提供了一种自动停放飞机的方法，可加快对接过程并通过减少出错机会来提高安全性。与服务于停机坪的其他系统集成，可以共享关键数据以支持机场协作决策 (A-CDM)。运营商可以实时管理以减轻干扰并确保安全高效的登机口操作。