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Khalid Raza，博士学位 Sandeep Kumar博士 年轻学者的见面（I-ISC-2024） 研究与实践（SICLC） 全国会议 公共关系办公室Jamia Millia ...
[68] Fumuiwa，S.O.，Ahmad，S.，Olufolabo，O.K.，Olanudun，E.A.，Bano，N.，Oguntimehin，S.A，S.A，Adesida，S.A。（2023）。研究了Momordia Charantia的三萜类乙烷类型的多糖尿病潜力：LC-MS，基于对接的MM \ GBSA和MD Simontion研究。生物分子结构与动力学杂志，T＆Fhttps://doi.org/10.1080/0739102.2023.2
文章 第 11 卷，第 6 期，2021 年，14688 - 14696 https://doi.org/10.33263/BRIAC116.1468814696 FDA 批准的抗分枝杆菌药物的再利用
摘要：结核病 (TB) 是最可怕和最致命的疾病之一，每年导致数百万人死亡。其病原体是一种称为结核分枝杆菌的细菌，主要侵袭肺部。根据临床表现的存在与否，结核病可分为潜伏性和活动性结核病。肺结核也称为活动性结核病，其特征是极度感染，而潜伏性结核病则没有感染或症状。在这项计算机研究中，我们重点关注基于分子对接的虚拟筛选，这些药物已用于治疗针对甲氧基菌酸合酶 4 (MMA4) 和环丙烷菌酸合酶 (CmaA2) 的细菌感染。耐药性结核病是抗结核药物设计和配制中最具挑战性的因素。菌酸在结核病的发病机制中起着至关重要的作用，因此可以成为非常有价值的靶点。根据对小鼠进行的研究，通过使 hma 基因（MMA4 和 cmaA）失活，没有观察到分枝酸的合成。与靶标对接的每个配体的结合能得分显示了对结核病的亲和力。
精确的钻孔对准系统手册
PBA用于造船厂，测量师或维护提供商，需要更高准确性才能使弹药，导航，雷达和视力系统，霍尼韦尔的精确无人驾驶对齐系统（PBAS）使用分步指导软件减少专家培训的需求，并减少完成工作时间50％。我们通过消除对视线的需求也是通过补偿船只运动和工作而无需升级的，同时为客户提供的解决方案，他们可以信任霍尼韦尔（Honeywell）在霍尼韦尔（Honeywell）世纪的经验工程高性能惯性解决方案来支持的解决方案，从而消除了对干对接的需求。PBA是海军应用程序的理想选择，海军应用程序在太空限制区域中运行，因为它会减少由运动造成的错误，设备设置时间（例如仪器级别，测量时间和相关成本），取决于应用程序，具体取决于应用程序。
Wnt/-Catenin抑制剂KYA1797K的潜在脱靶效应：PD-L1结合和检查点抑制
摘要简介：PD-1/PD-L1检查点的小分子抑制剂的追求与针对该免疫检查点的单克隆抗体的广泛发展并行。制定药物筛查策略是为了识别新型的PD-L1抑制剂。方法：已经进行了基于分子对接的纯筛选，该筛选已经进行了PD-L1蛋白二聚体，以识别新的粘合剂。使用微观嗜热（MST）As-说，已确定的配体与PD-L1的结合已通过实验验证。基于酪氨酸磷酸酶SHP-2的激活，证明了化合物的细胞效应，我们证明了荧光共振能量转移（FRET）测定。结果：我们已经确定有效的Wnt/β-catenin抑制剂KYA1797K是弱PD-L1粘合剂。分子对接表明，该化合物可以与Pd-L1二聚体的界面结合，几何形状可叠加到参考PD-L1抑制剂BMS-202的几何形状。源自天然
Cheetah-MS：使用串联交联质谱数据
摘要：蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）在许多生物过程中都是核心，但很难表征，尤其是在复杂的，未分离的样品中。化学交联结合质谱（MS）和计算建模正在成为蛋白质相互作用研究中可行的工具。在这里，我们介绍了Cheetah-MS，这是一种用于预测样品复杂混合物中PPI的Web服务器。它结合了MS与蛋白质 - 蛋白质对接的功率和分辨率分析复杂样品的能力和敏感性。它通过分析串联MS/MS数据（也称为MS2）来产生感兴趣的PPI的第四纪结构。将MS分析和建模结合起来提高了灵敏度，重要的是，促进了结果的解释。可用性和实现：Cheetah-MS可以作为Web服务器免费获得，网址为https://www.txms.org。联系人：hamed.khakzad@ens-cachan.fr或lars.malmsstrom@med.lu.se
分子对接单元5：QSAR统计方法Dr.D....
许多配体的灵活性使得这些计算变得困难，需要开发和使用特殊方法。以下两个例子说明了对此类工具的需求：蛋白酶抑制剂的设计和与特定 MHC 受体结合的肽抗原的分析和设计。我们回顾了从刚体对接扩展到柔性对接的计算概念，以及以下重要的柔性对接和设计策略：(a) 蒙特卡洛/分子动力学对接，(b) 现场组合搜索，(c) 配体构建，以及 (d) 位点映射和片段组装。讨论了使用经验自由能作为目标函数。由于方法学的快速发展，大多数新方法仅在有限数量的应用上进行了测试，并且可能会改进更传统的计算或图形工具获得的结果。
在人类癌症中靶向过表达的细胞周期蛋白依赖性激酶1（CDK1）：kamalachalcone A在硅docking研究中作为CDK1激酶的潜在抑制剂出现为潜在的抑制剂
受体分子的位点，然后生成对接参数文件（DPF）。这些文件用作网格映射和对接的输入文件。使用受体和配体的PDB文件用于生成PDBQT文件，以使用AutoDdock Tools 1.5.7执行对接研究。对每个配体进行了独立的运行，每个表观构象体以随机顺序对接到CDK1激酶的结合袋中。在扩展坞研究中，分配了遗传算法和lamarckian通用算法进行配体构象搜索。分析了从每个对接受体配体配合物的Autodock4对数文件（DLG）获得的数据[26]。随后，使用Ligplot+ V.4.5.3软件来计算结合位点中配体和CDK1激酶之间疏水和氢键的数量。通过Ligplot + 4.5.3软件鉴定了结合位点中存在的氨基酸的类型和数量[27]。
通过不平衡流程匹配的灵活对接
扩散模型已成为最近用于分子对接的成功范式。但是，这些方法将蛋白质视为刚性结构，或者迫使模型从非结构化噪声中折叠蛋白质。在这项工作中，我们专注于柔性对接，利用蛋白质的未结合分布来建模配体结合的精确效果。虽然流量匹配（FM）为这项任务提供了一个有吸引力的选择，但我们表明，流动匹配的天真应用导致了一项复杂的学习任务，性能差。因此，我们提出了不平衡的流量匹配，即流量匹配的概括，使我们能够通过放松边缘约束来以准确的准确性来定位样品效率。从经验上讲，我们验证了在柔性对接方面的框架，证明了蛋白质构象预测的强烈改善，同时保留了可比的对接精度。
目标 太空对接 里程碑 wi spadex 任务
什么是太空对接？ 太空对接是两个航天器或模块在太空中相互连接或附着的过程。这项技术允许航天器在轨道上对接，以实现特定目标。对接过程通常涉及一艘航天器（追逐者）接近另一艘航天器或空间站（目标）并与其对齐，以进行物理连接。 1. 空间站组装：对接是建造大型太空结构（如空间站）的关键，空间站中多个模块分别发射，然后在轨道上对接在一起。 2. 卫星维修：对接使航天器能够与卫星连接，以便在轨道上加油、维修或升级，从而延长卫星的使用寿命，而无需发射替换件。 3. 机组人员转移：对于载人航天任务，对接允许宇航员在航天器之间或航天器与空间站之间转移。 4. 资源共享：对接的航天器可以传输补给、电力和数据，支持深空探索等长期任务。太空对接是如何进行的
Nano Today 30 (2020) 100825 - 罗杰斯研究小组
三维（3D）功能结构因其在广泛应用领域中的潜在用途而备受关注，从具有非常规工程设计的宏观设备（例如可折叠太阳能电池板和可伸缩屋顶），到包含微/纳米级特征的更具挑战性和更复杂的设备[1–5]（例如光跟踪光电探测器[6,7]和功能性生物传感器[8–12]）。在这些应用示例中，结构的3D架构提供了独特且重要的功能，超出了平面系统可以实现的功能。例子包括可以感知三维空间中的电磁波并与之相互作用的光学设备[6,13]，由于3D结构的大表面积而具有高面积能量密度的储能设备[14,15]，以及与本质上的3D生物系统无缝对接的生物医学设备[9,11,12]。这种复杂的三维结构，尤其是纳米级结构，很难通过扩展传统二维（2D）微系统技术中使用的方法来实现，因为传统二维微系统技术是通过一系列