[背景和目标] 原生生物是一类生物,占真核生物系统发育多样性的大部分,存在于地球的所有环境中,包括土壤、海洋和湖泊。在水生生态系统中,它们作为重要的初级生产者、初级消费者和分解者,在微生物循环中发挥着重要作用。此外,底栖和附生原生动物是鱼类和甲壳类动物的直接食物,因此对生态系统内的营养循环做出了巨大贡献。因此,了解原生生物群对于更深入地了解该环境中的整个生态系统至关重要。针对深海、南极洲和海洋等环境的原生动物生物群的详细分析已经有很多报道,但是对于涵盖陆地上所谓熟悉的普通环境(普遍环境)中的许多生物群的详细分析却知之甚少。霞浦湖是日本第二大海底湖,平均深度为4米,堪称普遍淡水环境的代表性湖泊之一。自 1976 年以来,日本国立环境研究所 (NIES) 一直在霞浦湖的 10 个点对水质和生物群落进行长期监测。然而,在其中两个地点,对原生动物生物群的调查仅限于使用光学显微镜进行的目视识别,尚未报告DNA水平的详细分析。此外,由于仅收集了地表水样本,对底栖原生动物和附生原生动物的研究不足。 在本研究中,除了在显微镜下进行形态观察外,我们还使用环境 DNA 分析来研究原生动物生物群,包括底栖生物和固着生物,目的是进一步增强对霞浦湖生态系统的了解的基础。 [方法] ○ 调查地点及抽样方法
环境DNA分析吸引了作为一种创新技术,可以补充生态研究的全面和复杂性。环境DNA是从活生物体释放到土壤,水和大气等环境的DNA碎片。通过分析从环境样本中收集的环境DNA,可以澄清居住的生物的类型,数量和多样性。在过去的几年中,使用环境DNA的生物调查迅速扩散,因为与以前的调查相比,人力资源和成本负担要低得多,并且对生态系统没有负担。其中,已经检查了用于获取样品,数据处理方法以及利用所获得的栖息地信息数据的各种方法的方法,并且在所有领域(例如环境评估)中积极执行应用程序,超出了研究范围。该报告将介绍MIFISH方法的原理和前景,该方法促进了环境DNA技术的传播,以及将环境DNA分析应用于环境研究的示例,并对其可能性产生了鸟眼的看法。
综合分析方法(MIFISH方法)metabar缩合分析等。物种识别等。物种特定检测实时PCR分析等。成本(每个样品)约20,000至40,000日元 *3约30,000至50,000至50,000日 *4 *1参见试验调查(环境环境部工作部)。 *2监测站点1000湖:请参阅《淡水鱼类调查手册》。 *3尽管主要重点是分析成本(阅读),但数量取决于分析公司(分析结果的检查是单独的成本)。对于特定于物种的检测,
,两栖登陆作战预计将夺回被占领的岛屿,战车的行动范围正在从先前假定的陆地区域扩大到水边和水面。与此同时,有必要评估战车的机动性和安全性,不仅在陆地上,而且在水边和水上。
Bluegill(Lepomis acrochirus;图1)是北美本地的淡水鱼,在日本最严重的入侵物种中排名。目前居住在日本的Bluegills仅源自18个人,这些人被捕获在密西西比河,该河流经过美国爱荷华州的古腾堡,并于1960年引入。在引入日本之后,它在几年内被移植到志加县,并在1965年被确认已定居在比瓦湖。先前的研究(Kawamura等人2006年分子生态学,doi:10.1111/j.1365-294x.2006.02823.x)表明,日本蓝g中发现的线粒体DNA的单倍型是从guttenberg人群中得出的五个物种。此外,以前的研究研究了日本蓝g种群的遗传相似性(Kawamura等人2010年分子生态学,doi:10.1111/j.1365-294x.2010.04886.x)表明,蓝g散布到各个位置,主要来自比亚瓦湖,在那里建立了蓝g湖。
第六次研讨会:“环境DNA研究和公司努力的前线”我们想向您的公司表示祝贺,因为它是初冬。我们要对您的持续支持表示衷心的感谢。山口大学于2018年7月建立了环境DNA研究中心,该研究中心促进了环境DNA研究,该研究近年来一直引起人们的关注,现在已进入第六年。作为该中心的第六次研讨会,在环境DNA研究的最前沿的研究人员将进行讲座,并讨论关联公司的努力及其对未来的期望。
Akiyoshidai被指定为特殊的天然纪念碑和自然公园,并且在适用地区进行的任何活动都可能受到限制,以保护稀有的学术资产和继承财产。研究活动也不例外,必须获得地方政府许可的申请。另一方面,在调查自然界时,每时每刻都会改变自然,尤其是动物,周围动物的情况从现场确认为应用到批准时发生了巨大变化。具体而言,由于水果和食物的植物耗尽,这些行为区域包括行为区域的变化。因此,这可能导致在具有罕见学术价值的领域无意间阻碍研究活动。 因此,在这项研究中,为了建立和提议在保护区内进行动物调查的快速和方便的筛查系统,我们与政府合作探索了测试方法,并证明了使用环境DNA对QPCR检测居民。检测是地面犀牛小鼠使用倒下的叶子和土壤中的水。 分析环境DNA时,我咨询了山口大学环境DNA研究中心的建议,并遵循标准方法。具体而言,从用蒸馏水冲洗的木质碎屑中提取DNA,形成环境DNA样品(图1)。当使用毛坯和组织DNA作为对照进行PCR进行过滤时,在某些部分中观察到了特异性扩增(图2)。从上面,我们成功地从环境样品中设计了高度特异性的PCR底漆,并认为它可以应用于动物监测和检查。