1 二.物理研究所,Justus-Liebig-Universit¨at,35392 Giessen,德国 2 GSI Helmholtzzentrum f¨ur Schwerionenforschung GmbH,64291 Darmstadt,德国 3 TRIUMF,温哥华,不列颠哥伦比亚省 V6T 2A3,加拿大 4 曼尼托巴大学物理与天文系,温尼伯,曼尼托巴省 R3T 2N2,加拿大 5 波兰科学院核物理研究所,PL-31 342 Krak´ow,波兰 6 玛丽居里大学物理研究所,PL-20 031 Lublin,波兰 7 维多利亚大学物理与天文系,维多利亚,不列颠哥伦比亚省 V8P 5C2,加拿大 8 不列颠哥伦比亚大学物理与天文系,温哥华,不列颠哥伦比亚省 V6T 1Z1,加拿大 9 物理与爱丁堡大学天文学系,爱丁堡 EH9 3FD,苏格兰,英国 10 西蒙弗雷泽大学化学系,本拿比,不列颠哥伦比亚省 V5A 1S6,加拿大 11 麦吉尔大学物理系,H3A 2T8 蒙特利尔,魁北克省,加拿大 12 斯特拉斯堡大学,CNRS,IPHC UMR 7178,F-67 000 斯特拉斯堡,法国 13 约克大学物理系,约克 YO10 5DD,英国 14 卡尔加里大学物理与天文学系,卡尔加里,艾伯塔省 T2N 1N4,加拿大 15 胡阿里布迈丁科技大学物理学院,BP 32,El Alia,16111 Bab Ezzouar,阿尔及尔,阿尔及利亚 16 Academy of Sciences, BG-1784 Sofia, Bulgaria 17 Helmholtz Forschungsakademie Hessen fr FAIR (HFHF), GSI Helmholtzzentrum fr Schwerionenforschung, Campus Gieen, 35392 Gieen, German 18 郑州大学物理与微电子学院,郑州 450001,中国(日期:2021 年 7 月 20 日)
值得注意的是,本调查中引用的一些文献可能很难找到;但是,大多数文献可以通过 https://www.hd-computing.com/publications 上的在线出版物列表进行查找。Denis Kleyko 和 Dmitri Rachkovskij 对这项工作做出了同等贡献。DK 的工作得到了欧盟“地平线 2020”计划下玛丽居里个人奖学金 (839179) 的支持。DK 的工作还得到了 AFOSR FA9550-19-1-0241 和英特尔 THWAI 计划的部分支持。 DAR 的工作部分得到了乌克兰国家科学院(拨款编号 0120U000122、0121U000016、0122U002151 和 0117U002286)、乌克兰教育和科学部(拨款编号 0121U000228 和 0122U000818)以及瑞典战略研究基金会 (SSF,拨款编号 UKR22-0024) 的支持。作者地址:D. Kleyko,加州大学伯克利分校,美国加利福尼亚州伯克利市,邮编 94720,瑞典研究机构,瑞典希斯塔,邮编 16440;电子邮箱:denkle@berkeley.edu; D. Rachkovskij,国际信息技术研究与培训中心,乌克兰基辅,03680,吕勒奥理工大学,瑞典吕勒奥,97187;电子邮件:dar@infrm.kiev.ua;E. Osipov,吕勒奥理工大学,瑞典吕勒奥,97187;电子邮件:evgeny.osipov@ltu.se;A. Rahimi,IBM Research–Zurich,瑞士苏黎世,8803;电子邮件:abr@zurich.ibm.com。允许免费复制或复印本作品的全部或部分以供个人或课堂使用,但不得出于营利或商业目的而复制或分发,且复制件首页必须注明此声明和完整引文。必须尊重 ACM 以外的其他人拥有的本作品组成部分的版权。允许以署名形式发表摘要。以其他方式复制、重新发布、发布到服务器或重新分发到列表,需要事先获得特定许可和/或付费。请向 permissions@acm.org 申请许可。© 2023 计算机协会。
我们开发了一个计算平台,包括机器学习和机械数学模型,以寻找在姑息治疗环境下施用铂类双药化疗的最佳方案。该平台已应用于晚期转移性非小细胞肺癌 (NSCLC)。玛丽亚居里国家肿瘤研究所格利维采分院接受姑息治疗的 42 名 NSCLC 患者是从 2004 年至 2014 年确诊的回顾性患者队列中收集的。对患者进行了为期三年的随访。收集的临床数据包括有关患者临床病程的完整信息,包括治疗计划、根据 RECIST 分类的反应和生存期。该平台的核心是数学模型,以常微分方程组的形式,描述铂敏感和铂耐药癌细胞的动态以及反映空间和资源竞争的相互作用。通过从联合概率分布函数中抽取参数值来随机模拟该模型。机器学习模型用于校准数学模型并使其与总体生存曲线拟合。模型模拟在三个层面上忠实地再现了临床队列:长期反应 (OS)、初始反应 (根据 RECIST 标准) 以及化疗周期数与两个连续化疗周期之间的时间关系。此外,我们研究了初始反应和长期反应之间的关系。我们发现这两个变量不相关,这意味着我们不能仅根据初始反应来预测患者的生存率。我们还测试了几种化疗方案,以找到最适合姑息治疗患者的方案。我们发现最佳治疗方案取决于肿瘤中各种亚克隆之间的竞争强度等。开发的计算平台允许在可接受的毒性范围内优化转移性 NSCLC 姑息治疗的化疗方案。该方法的简单性使其可应用于不同癌症的化疗优化。
7700 ARLINGTON BOULEVARD FALLS CHURCH VA 22042 批准日期:2025 年 3 月 BUMEDNOTE 5090 BUMED-N4 2024 年 3 月 22 日 BUMED NOTICE 5090 发件人:医学和外科局局长 主题:海军氡评估与缓解计划的海军医学支持 编号:(a) 23 年 5 月 9 日海军岸上设施氡评估与缓解计划计划指南(NOTAL) (b) 2021 年 6 月 OPNAVINST M-5090.1 (c) 2023 年 9 月 OPNAVINST M-5100.23 (d) 2022 年 2 月 1 日 ASD(R) 备忘录(NOTAL) (e) 2020 年 8 月 4 日 ASD(S) 备忘录(NOTAL)1.目的。根据参考 (a) 的实施要求,建立海军医学的角色和职责,包括风险交流、报告和在接触人员的医疗记录中记录氡超标测试结果。2. 范围和适用性。本说明适用于所有海军医学准备和训练司令部 (NAVMEDREADTRNCMD) 和海军医学准备和训练单位 (NAVMEDREADTRNUNIT)。3. 背景。国防部 (DoD) 要求识别和缓解国防部拥有和租赁的建筑物中的氡气。第 3(a) 和 3(b) 小段中的指导旨在协助 NAVMEDREADTRNCMD 和 NAVMEDREADTRNUNIT 按照程序正确传达和记录氡气超标测试结果,并描述了 TRICARE 受益人和联邦文职工作人员如何在他们的健康记录中记录超标情况。a. 参考 (a) 提供了实施指导,包括识别现有和新建筑物中的室内氡气水平;在现有建筑物中采取缓解措施;检查和维护氡缓解系统;在新建筑物中纳入预防措施,以防止海军占用或可占用建筑物中室内氡水平的累积大于或等于 4 皮居里/升 (pCi/L)。b. 参考文献 (a) 和 (b) 要求在氡采样和分析测试活动进行之前、期间和之后,安装氡计划经理(通常是公共工程环境人员)和医疗机构(公共卫生)之间进行密切协调。与员工和居民的沟通被明确确定为海军氡的关键要素
稿件收到日期为 2022 年 4 月 11 日;修订日期为 2022 年 6 月 30 日;接受日期为 2022 年 9 月 2 日。当前版本日期为 2022 年 10 月 17 日。Denis Kleyko 的工作部分得到了欧盟“地平线 2020”研究与创新计划(根据玛丽居里资助协议 839179)的支持,部分得到了美国国防高级研究计划局 (DARPA) VIP(超高清项目)和 AIE(HyDDENN 项目)计划的支持,部分得到了空军科学研究办公室 (AFOSR)(资助编号为 FA9550-19-1-0241)的支持,部分得到了英特尔 THWAI 计划的支持。 Pentti Kanerva 的工作部分由 DARPA 的 VIP(超高清项目)和 AIE(HyDDENN 项目)计划资助,部分由 AFOSR(拨款 FA9550-19-1-0241)资助。Bruno A. Olshausen 的工作部分由 DARPA 的 VIP(超高清项目)和 AIE(HyDDENN 项目)计划资助,部分由 AFOSR(拨款 FA9550-19-1-0241)资助,部分由英特尔的 THWAI 计划资助。Jan M. Rabaey 的工作部分由 DARPA 的 VIP(超高清项目)和 AIE(HyDDENN 项目)计划资助。 Dmitri A. Rachkovskij 的工作部分由乌克兰国家科学院资助,资助编号为 0120U000122、0121U000016、0122U002151 和 0117U002286;部分由乌克兰教育和科学部资助,资助编号为 0121U000228 和 0122U000818;部分由瑞典战略研究基金会 (SSF) 资助,资助编号为 UKR22-0024。Friedrich T. Sommer 的工作部分由英特尔的 THWAI 计划资助,部分由 NIH 资助,资助编号为 R01-EB026955,部分由 NSF 资助,资助编号为 IIS-1718991。 (通讯作者:Denis Kleyko。)Denis Kleyko 就职于美国加州大学伯克利分校红木理论神经科学中心,加利福尼亚州伯克利市 94720,同时还就职于瑞典研究机构智能系统实验室,瑞典希斯塔 16440(电子邮箱:denis.kleyko@ri.se)。
1 法国维尔瑞夫 Gustave Roussy 肿瘤内科系;2 巴塞罗那 HM Hospitales Delfos 医院 Clara Campal 综合肿瘤中心 (HM-CIOCC) 肿瘤内科系;3 西班牙巴塞罗那 Vall Hebron 肿瘤研究所 (VHIO) 和 Vall d' Hebron 大学医院临床研究项目;4 德国慕尼黑综合癌症中心和慕尼黑大学医院 III 医学系;5 荷兰鹿特丹 Erasmus MC 癌症中心肿瘤内科系;6 那不勒斯国家肿瘤研究所、G. Pascale 基金会和 IRCCS 细胞生物学和生物治疗部;7 意大利维罗纳大学 ARC-Net 研究中心和诊断与公共卫生系及病理学系; 8 纽约纪念斯隆凯特琳癌症中心医学系乳腺医学和临床遗传学服务部;9 休斯顿德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心研究癌症治疗学系;10 美国波士顿丹娜法伯癌症研究所和哈佛医学院肿瘤内科系;11 德国海德堡海德堡大学医院病理学研究所;12 巴黎萨克雷大学古斯塔夫鲁西生物统计学和流行病学系,维尔瑞夫;13 巴黎萨克雷大学 Inserm Oncostat U1018,标记为 Ligue Contre le Cancer,维尔瑞夫;14 巴黎笛卡尔大学居里研究所遗传学系,巴黎;15 法国维尔瑞夫古斯塔夫鲁西癌症园区医学生物学和病理学系癌症遗传实验室; 16 瑞士卢加诺欧洲肿瘤医学会科学与医学分会;17 美国纽约纪念斯隆凯特琳癌症中心病理学系;18 西班牙巴塞罗那 Vall dHebron 肿瘤研究所分子预筛选项目肿瘤数据科学组;19 法国国家卫生与医学研究院,古斯塔夫鲁西癌症园区,UMR981,维尔瑞夫;20 法国奥赛巴黎萨克雷大学
物理学副教授 - 米兰 - 比科卡大学材料科学系(意大利)时期:2022年12月 - 现任“纳米级动力学超快显微镜实验室”的主要研究员(Luminad)。欧盟资助的FET-OPEN项目智能电子(GAn。964591)的科学协调员 - www.smartelectron.eu。物理助理教授 - 米兰 - 比科卡大学材料科学系(意大利)期间:2019年12月至2022年11月,“纳米级动力学超快显微镜实验室”(Luminad)的首席研究员。欧盟资助的FET-OPEN项目智能电子(GAn。964591)的科学协调员 - www.smartelectron.eu。科学家 - ÉcolePolytechniquefédédéralede Lausanne(瑞士)时期:2016年2月至2019年11月;顾问:Fabrizio Carbone教授。超快电子衍射,显微镜和光谱实验在Lumes实验室进行的。任命由玛丽·斯克洛多夫斯卡·居里(Marie Sklodowska-Curie)共同创立的EPFL奖学金计划部分支持(H2020 - MSCA - Cofund 2016,GAN。665667)。博士后研究学者 - 加利福尼亚理工学院(美国)期间:2011年11月至2016年1月;顾问:Ahmed H. Zewail教授(诺贝尔·劳拉(Nobel Laurate in Chemistry) - 1999年)。研究活动的重点是研究纳米材料中原子级超快现象的性质。M.Sc. 在法国萨克莱(法国)法国原子能委员会(法国)期间实习:2007年3月至2007年9月;顾问:尼古拉斯·巴雷特博士。 研究相关钙钛矿材料的表面特性。M.Sc.在法国萨克莱(法国)法国原子能委员会(法国)期间实习:2007年3月至2007年9月;顾问:尼古拉斯·巴雷特博士。 研究相关钙钛矿材料的表面特性。在法国萨克莱(法国)法国原子能委员会(法国)期间实习:2007年3月至2007年9月;顾问:尼古拉斯·巴雷特博士。研究相关钙钛矿材料的表面特性。在FP6 Incems欧洲项目的框架内支持我的任命。教学经验
单位的特征 - 名称:细胞生物学和癌症 - 首字母缩写:CBC-标签和编号:UMR144-团队数量:13-执行团队组成:弗朗克·佩雷斯先生; Renata Basto-副主任;夏洛特·洛扎奇(Charlotte Lozach)女士 - 单位科学的管理员科学面板du Vivant et vivant et Environement sve3moléculesdu vivant,生物学内部(desgènesetgénomesaux aux auxsystèmes),生物学家族和生物学的纤维化纤维化仪式(COLLISE INTIRE INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER INTER)(CC)从单细胞到组织,器官和生物以及各种模型系统,使用多尺度方法以及各种模型系统的多尺度方法,以及各种模型系统的分子方面,特别关注肿瘤发生。该单元所针对的主要主题是隔室,细胞骨架动力学,分子电机的三维结构,细胞粘附,上皮极性和分化,发育过程中的形态发生,细胞分裂,细胞迁移和入侵以及与肿瘤进展相关的信号通路。单位的历史和地理位置unitémixtede recherche(umr)144名为Cell Biology and Cancer(CBC)属于三个监督机构:CNRS,CNRS,The Institut Curie and Sorbonne University。UMR144也通过PSL(巴黎科学莱特斯)与Institut Curie相关联。该单元由JP Thierry于1995年建立,最初称为复杂性和细胞动力学。该单元主要位于巴黎库里(Curie Paris)校园的Burg大楼,Rue d'ulm/Rue Lhomond(巴黎5)。从2004年到2019年,布鲁诺·古德(Bruno Goud)导演了UMR144,2019年,弗兰克·佩雷斯(Franck Perez)接任该单元的主管,该部门被重命名为细胞生物学和癌症(CBC),以表彰其对基本细胞生物学的历史依恋及其对研究,诊断和治疗癌症的承诺。只有8号团队位于Pierre Gilles de Gennes(IPGG),Rue Jean Calvin(巴黎5)。在Burg大楼进行翻新期间,团队4、6和12搬到了Trouillet大楼,而团队9搬到了BDD大楼。此外,其中一个平台是蛋白质表达和纯化核心设施,位于属于Curie医院的另一所建筑物中。该单元的研究环境CBC是由CNRS,Institut Curie和SorbonneUniveristé支持的研究单元。该研究所在三个地点(巴黎,奥赛和圣云)上共有3,700名研究人员,医生和医疗保健专业人员,从事三个任务:研究,护理,保护和知识的转移。研究中心由13个研究单元(86个团队)组成,涵盖了细胞生物学,遗传学,表观遗传学,免疫学,软物质物理学以及有机和药物化学等广泛的研究领域。研究单元得到了十九个最先进的技术平台的支持,并以curiecoreTech为组织,直接访问大型临床数据库和样本收集。医院与研究中心研究中心之间的关联使患者能够从临床试验和各种单位中受益,以开发临床研究项目,包括大量临床试验。作为巴黎大学科学莱特斯大学(PSL)的成员,居里研究所一直参与建立P s L.大学,因为居里研究所与巴黎大学的莱特雷斯大学(PSL)相关联,这是该大学的倡议带来的CBC益处。CBC在PSL大学的组织中发挥了作用,因为一位成员是PSL大学研究委员会的副总裁研究。此外,一个团队位于Pierregilles de Gennes(IPGG)研究所,该团队属于PSL。CBC也非常积极地建立一个“主要程序”,该计划将在2025年替换Labex。CBC是2018年创建的单元格(n)比例尺的主要组成部分,随后在Celtisphybio Labex上。单元格(n)量表包括31个团队,旨在将生物学家,物理学家和化学家聚集在一起,以开发创新的项目。单元格(n)量表提供初级PI(单位招募的两个)的启动软件包(€200k),在每3个月进行一次呼叫的薪水,博士学位论文扩展,研究助理的薪水,几个研究赠款(20K)(20k)(€20k),突破性项目(突破性k),支持外国人,班级<200-250 nigific offimic offific offerivic offimical divific of divicific of dividific dividific dividific dividific dividific dividific of Divitific dividific dividitific dividitific Spons,Spons
Sakis Mantalaris 都柏林圣三一学院和 NIBRT 研究兴趣:Sakis Mantalaris 目前是都柏林圣三一学院药学与制药科学学院的 Don Panoz 主席,也是国家生物加工研究与培训研究所的首席研究员。此前,他曾任美国佐治亚理工学院 WH Coulter 生物医学工程系教授(2018-2023 年)和伦敦帝国理工学院化学工程系教授(2000-2018 年)。他于 2000 年获得美国罗彻斯特大学化学工程博士学位。他曾获得过多个奖项:IChemE 最佳论文 Junior Moulton 奖(2004 年)、美国医学和生物工程研究所院士(2012 年)、ERC 高级研究员奖(2013 年)、IChemE 唐纳德奖章(2015 年)和 2023 年 SFI 研究教授奖。Karen English 梅努斯大学研究兴趣:Karen English 是梅努斯大学的免疫学教授。在过去 20 年里,Karen 一直致力于从根本上理解基于细胞的治疗间充质基质细胞 (MSCs) 的作用机制。她的研究重点是将 MSC 疗法转化为各种炎症疾病的最佳临床应用。她还通过 MAGIC 项目与一个大型欧洲研究人员联盟合作研究肌营养不良症的基因治疗。她于 2008 年在梅努斯大学获得博士学位,并获得了竞争激烈的玛丽居里奖学金,在牛津大学进行博士后培训,研究移植排斥的 MSC 治疗。她发表了 70 多篇研究文章,她的工作吸引了 5000 多次引用。Karen 获得了大量竞争性研究资金,包括 IRC 桂冠奖和 SFI FFP 奖。2018 年,Karen 荣获爱尔兰研究委员会年度早期职业研究员奖和梅努斯大学三个学院的 MU 早期职业研究成就奖。她是《干细胞研究与治疗》的编辑委员会成员。Karen 是国际细胞治疗学会 (ISCT) MSC 委员会成员,并于 2024 年在温哥华 ISCT 的科学与创新会议上就 MSC 发表了全体演讲。
“一种用于研究可变剪接的 CRISPR-dCas13 RNA 编辑工具” Yaiza Núñez-Álvarez 1§*、Tristan Espie--Caullet 1,2,6§、Géraldine Buhagiar 2,6、Ane Rubio-Zulaika 3、Josune Alonso-Marañón 3、Elvira Perez-Luna 2,6、Lorea Blazquez 3-5、Reini F. Luco 1,2,6 * 1. 蒙彼利埃大学人类遗传学研究所,CNRS UMR9002,法国蒙彼利埃。 2. 巴黎萨克雷研究大学居里研究所,CNRS UMR3348,91401 奥赛,法国。 3. 西班牙Biogipuzkoa健康研究所神经科学系,20014圣塞瓦斯蒂安 4. 西班牙巴斯克科学基金会Ikerbasque,48009毕尔巴鄂5. CIBERNED,ISCIII(CIBER,西班牙科学与创新部卡洛斯三世研究所),28031 马德里,西班牙 6. 由抗癌联盟支持的团队。 § 这些作者贡献相同* 通讯作者::ynunez@biotech-foods.com 和 reini.luco@curie.fr 摘要 可变剪接允许从同一基因产生多个转录本,从而使蛋白质库多样化,并在编码基因组有限的情况下获得新的功能。它可以影响多种生物过程,包括疾病。然而,由于在生理背景下剖析每个剪接异构体的精确作用的局限性,其重要性长期以来一直被低估。此外,识别关键调控元件以纠正有害的剪接异构体也同样具有挑战性,这增加了解决可变剪接在细胞生物学中的作用的难度。在这项工作中,我们利用 dCasRx(一种靶向 CRISPR-dCas13 直系同源物的催化无活性 RNA),以经济高效的方式有效地切换内源转录物的可变剪接模式,而不会影响整体基因表达水平。此外,我们展示了 dCasRx 剪接编辑系统的一个新应用,用于识别特定剪接事件的关键调控 RNA 元素。通过这种方法,我们正在扩展 RNA 工具包,以更好地了解可变剪接的调控机制及其在各种生物过程(包括病理状况)中的生理影响。关键词 可变剪接; CRISPR-dCas13,dCasRx;剪接编辑;顺式调节 RNA 元件、RNA 基序。