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早期结直肠癌的分子异质性
早期发作结直肠癌的分子异质性：高危人群中的途径特异性见解Cecilia Monge，M.D.，M.P.H.，F.A.C.P.1，Brigette Waldrup，B.S。 2，Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔（Enrique Velazquez-Villarreal），医学博士，博士，M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市，贝克曼研究所，综合翻译科学系，杜阿尔特，加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心，加利福尼亚州杜阿尔特。 *通信：evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标：早期发作结直肠癌（EOCRC）的发生率（EOCRC）定义为50岁以前的诊断，以惊人的速度上升，西班牙裔/拉丁裔（H/L）个人在发病率和死亡率中的发病率最高。 尽管人们对公共卫生的关注越来越大，但驱动EOCRC差异的分子机制仍然知之甚少。 致癌途径，例如Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS在结直肠癌（CRC）进展中至关重要，但是尚未对不同种群的EOCRC中的特定作用进行广泛的研究。 本研究试图通过比较H/L和非西班牙裔白人（NHW）个体中的EOCRC病例来鉴定这些途径中的分子改变。 此外，我们探讨了这些发现的临床意义，以为针对高风险人群而定的精确医学策略提供依据。 方法：为了研究与Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS途径相关的基因中的突变频率，我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析。1，Brigette Waldrup，B.S。2，Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔（Enrique Velazquez-Villarreal），医学博士，博士，M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市，贝克曼研究所，综合翻译科学系，杜阿尔特，加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心，加利福尼亚州杜阿尔特。 *通信：evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标：早期发作结直肠癌（EOCRC）的发生率（EOCRC）定义为50岁以前的诊断，以惊人的速度上升，西班牙裔/拉丁裔（H/L）个人在发病率和死亡率中的发病率最高。 尽管人们对公共卫生的关注越来越大，但驱动EOCRC差异的分子机制仍然知之甚少。 致癌途径，例如Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS在结直肠癌（CRC）进展中至关重要，但是尚未对不同种群的EOCRC中的特定作用进行广泛的研究。 本研究试图通过比较H/L和非西班牙裔白人（NHW）个体中的EOCRC病例来鉴定这些途径中的分子改变。 此外，我们探讨了这些发现的临床意义，以为针对高风险人群而定的精确医学策略提供依据。 方法：为了研究与Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS途径相关的基因中的突变频率，我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析。2，Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔（Enrique Velazquez-Villarreal），医学博士，博士，M.P.H。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市，贝克曼研究所，综合翻译科学系，杜阿尔特，加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心，加利福尼亚州杜阿尔特。 *通信：evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标：早期发作结直肠癌（EOCRC）的发生率（EOCRC）定义为50岁以前的诊断，以惊人的速度上升，西班牙裔/拉丁裔（H/L）个人在发病率和死亡率中的发病率最高。 尽管人们对公共卫生的关注越来越大，但驱动EOCRC差异的分子机制仍然知之甚少。 致癌途径，例如Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS在结直肠癌（CRC）进展中至关重要，但是尚未对不同种群的EOCRC中的特定作用进行广泛的研究。 本研究试图通过比较H/L和非西班牙裔白人（NHW）个体中的EOCRC病例来鉴定这些途径中的分子改变。 此外，我们探讨了这些发现的临床意义，以为针对高风险人群而定的精确医学策略提供依据。 方法：为了研究与Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS途径相关的基因中的突变频率，我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。2希望城市，贝克曼研究所，综合翻译科学系，杜阿尔特，加利福尼亚州。3希望之城综合癌症中心，加利福尼亚州杜阿尔特。*通信：evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标：早期发作结直肠癌（EOCRC）的发生率（EOCRC）定义为50岁以前的诊断，以惊人的速度上升，西班牙裔/拉丁裔（H/L）个人在发病率和死亡率中的发病率最高。尽管人们对公共卫生的关注越来越大，但驱动EOCRC差异的分子机制仍然知之甚少。致癌途径，例如Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS在结直肠癌（CRC）进展中至关重要，但是尚未对不同种群的EOCRC中的特定作用进行广泛的研究。本研究试图通过比较H/L和非西班牙裔白人（NHW）个体中的EOCRC病例来鉴定这些途径中的分子改变。此外，我们探讨了这些发现的临床意义，以为针对高风险人群而定的精确医学策略提供依据。方法：为了研究与Wnt，TGF-BETA和RTK/RAS途径相关的基因中的突变频率，我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析。研究队列由3,412例患者组成，包括302 H/L和3,110名NHW个体。患者根据年龄（EOCRC：<50岁；晚期CRC [LOCRC]：≥50岁）和人口组（H/L vs. NHW）进行分类，以评估突变患病率的变化。使用卡方检验进行了组之间突变率的统计比较，而Kaplan-Meier生存分析被用来评估与途径改变相关的总体生存差异。结果：与LOCRC相比，H/L患者之间在EOCRC和LOCRC之间鉴定了RTK/RAS途径的显着分子区别，EOCRC的RTK/RAS改变频率较低（66.7％vs. 79.3％，P = 0.01）。在此途径中，CBL（P <0.05）和NF1（P <0.05）的突变在EOCRC病例中的普遍性明显高于EOCRC病例（分别为5.8％，1.2％和11.6％和11.6％和3.7％），而BRAF突变在LOCRC中的频繁（5.1％VS.
使用牛津纳米孔测序的放大DNA异质性评估应用于细胞无细胞表达模板
摘要在这项工作中，将牛津纳米孔测序作为量化放大DNA异质性的可访问方法。此方法可以快速量化缺失，插入和取代，每个突变误差的概率及其在复制序列中的位置。放大技术测试的是传统的聚合酶链反应（PCR），具有不同水平的聚合酶保真度（OnETAQ，phusion和Q5），以及滚动圆扩增（RCA）和PHI29聚合酶。还评估了使用细菌扩增的质粒扩增。通过分析每个样本中大量序列中误差的分布，我们检查了每个样本中的异质性和误差模式。该分析表明，Q5和渗流聚合酶表现出在扩增的DNA中观察到的最低错误率。作为二级验证，我们分析了使用细胞游离表达与放大DNA合成的SFGFP荧光蛋白的发射光谱。易易受错误的聚合酶链反应证实了报道蛋白发射光谱峰宽度与DNA误差率的依赖性。所提出的纳米孔测序方法是量化其他基因扩增技术准确性的路线图，从而使它们被发现，从而实现了所需蛋白质的更无均匀的细胞表达。
1对人类的心脏成纤维细胞异质性建模...
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该预印本版的版权持有人于2023年10月22日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.10.22.563460 doi：Biorxiv Preprint
跨肿瘤类型的ROR1蛋白表达的异质概况
1美国德克萨斯州安德森癌症中心的转化分子病理学系，美国德克萨斯州77030，美国； enbarrientos@mdanderson.org（e.b.t.）; rnlazcano@mdanderson.org（r.l.）2美国德克萨斯州安德森癌症中心，美国德克萨斯州休斯敦市的安德森癌症中心研究癌症系； kwevans@mdanderson.org（K.E。）; yqrizvi@mdanderson.org（y.r。）; aakcakanat@mdanderson.org（a.a.）; fmeric@mdanderson.org（f.m.-b。）3 Boehringer Ingelheim RCV，奥地利维也纳1121； francesca.trapani@boehringer-igheim.com（f.t。）4 Boehringer Ingelheim，德国Biberach 88400； eva_johanna.madlener@boehringer-Ingelheim.com 5 Nbe-therapeutics AG，瑞士巴塞尔4057； lorenz.waldmeier@boehringer-Ingelheim.com 6病理学系，德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心，美国德克萨斯州休斯敦，美国德克萨斯州77030； alazar@mdanderson.org *通信：graso@mdanderson.org†这些作者对这项工作也同样做出了贡献。4 Boehringer Ingelheim，德国Biberach 88400； eva_johanna.madlener@boehringer-Ingelheim.com 5 Nbe-therapeutics AG，瑞士巴塞尔4057； lorenz.waldmeier@boehringer-Ingelheim.com 6病理学系，德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心，美国德克萨斯州休斯敦，美国德克萨斯州77030； alazar@mdanderson.org *通信：graso@mdanderson.org†这些作者对这项工作也同样做出了贡献。
使用基于模型的森林的观察数据的异质治疗效应估计
摘要估计异构治疗效应对许多学科引起了极大的兴趣，最值得一提的是医学和经济学。到目前为止，当代研究主要集中在连续和二元响应上，在传统上，即使在某些模型误差下，也可以通过线性模型估算异质的治疗效果，从而允许估计恒定或异构效应。更复杂的生存，计数或顺序结果的模型需要更严格的假设，以可靠地估计治疗效果。最重要的是，非挑剔的问题需要对治疗和预后效应进行联合估计。基于模型的森林允许同时估计协变量依赖性治疗和预后效应，但仅用于随机试验。在本文中，我们建议对基于模型的森林进行修改，以解决观察数据中的混杂问题。在特殊性中，我们评估了最初由Robinson（1988，Conemenice）提出的正交策略，该策略是针对广义线性模型和转化模型中异质治疗效果估计的基于模型的森林的背景。我们发现，该策略在具有各种结果分布的模拟研究中降低了混杂效应。我们通过评估Riluzole对肌萎缩性侧面硬化的进展，证明了生存和顺序结局的异质治疗效应估计的实际方面。
基于纳米管模板和分子的高级1D异质结构
一家学校理工学院，加拿大蒙特利尔b实验室C查尔斯·库仑（Charles Colomb） INP，CNRS，Univers de Toulouse，118 De Narbonne，31062 Toulouse，Cedex 9，法国H Karlsruhe技术研究所（KIT） 法国。 e-mail: etienne.gaufres@cnrs.fr k Humboldt-universita zu Berlin, Germany L Lumin, Universite Ét Paris Saclay, ENS Paris Saclay, Centrale Supelec, CNRS, Orsay, France M University of Montreal, Canada N University of Vienna, Austria o University of Paris, Ecole Normale Paris, PSL, PSL, Free University of德国柏林，Q工程和信息学系，意大利佩加索大学，意大利的佩加索大学。 请参阅do：https：//doi.org/10.1039/d3cs00467h一家学校理工学院，加拿大蒙特利尔b实验室C查尔斯·库仑（Charles Colomb） INP，CNRS，Univers de Toulouse，118 De Narbonne，31062 Toulouse，Cedex 9，法国H Karlsruhe技术研究所（KIT） 法国。e-mail: etienne.gaufres@cnrs.fr k Humboldt-universita zu Berlin, Germany L Lumin, Universite Ét Paris Saclay, ENS Paris Saclay, Centrale Supelec, CNRS, Orsay, France M University of Montreal, Canada N University of Vienna, Austria o University of Paris, Ecole Normale Paris, PSL, PSL, Free University of德国柏林，Q工程和信息学系，意大利佩加索大学，意大利的佩加索大学。请参阅do：https：//doi.org/10.1039/d3cs00467h
EXA2PRO：异质计算系统上高发展生产率的框架
摘要 - 预计即将进行的Exascale计算系统将是一个主要挑战。需要将这些系统的复杂性隐藏在应用程序开发人员中，以提高可编程性。EXA2PRO编程框架旨在提高针对目标异质计算系统的应用程序的生产率。它基于封装低级平台特定优化的高级编程模型和抽象，并且由处理异质节点上的应用程序部署的运行时支持。它支持多种平台和加速器（CPU，GPU，基于FPGA的数据流引擎），从而使开发人员能够充分利用异质的计算系统，从而使更多的HPC应用程序可以达到Exascale Computing。使用来自不同域的四个HPC应用程序评估EXA2PRO框架。通过应用EXA2PRO框架，对应用程序进行了自动部署和评估，并在各种计算体系结构上进行了评估，使开发人员能够在加速器上获得性能结果，测试MPI群集上的可伸缩性，并有效地研究每个应用程序可以从该程度上使用不同类型的硬件重复源。
通过增强学习探索异质无人机群的力量
- 眼机擅长看到和监督。他们可以飞行或粘在天花板上，使他们能够快速探索该区域并找到目标或有趣的物体。- 手机旨在拾起并移动位于墙壁，架子或桌子上的东西。他们可以使用绳索连接到天花板，从而爬上墙壁和障碍物。- 脚步机器人是带轮机器人，它们用来与其他脚步机器，携带手机或运输物体相连。本文还提到，脾脏的项目将移动群机器人技术的元素与HU manoid Robotics相结合，并且每种机器人类型的专业化是实现人形群的关键部分。此外，该论文说，它将在以下各节中介绍这些机器人的硬件功能，并提及模拟环境的开发，以使其更易于测试和原型机器人行为。
Photoferroelelectric全van-der-Waals异质结构用于多模神经型铁电晶体管
摘要：铁电范德华（VDW）异质结构的接口驱动效应为搜索替代设备体系结构提供了新的机会，以克服von Neumann瓶颈。但是，它们的实施仍处于起步阶段，主要是通过电气控制。在寻求新型神经形态体系结构时，制定其他光学和多态控制的策略是最大的兴趣。在这里，我们证明了铁电场效应晶体管（FEFET）的铁电偏振状态的电和光学控制。完全由Res 2/hbn/cuinp 2 S 6 VDW材料制成的FeFets达到的ON/OFF比率超过10 7，磁滞存储器窗口最大为7 V宽，多个寿命超过10 3 s。此外，Cuinp 2 S 6（CIPS）层的铁电偏振可以通过光激发VDW异质结构来控制。我们进行了波长依赖性研究，该研究允许在极化的光学控制中识别两种机制：带对波段光载体在2D半导体RES 2中生成2D半导体电压，并进入2D Ferroectric CIPS。最后，通过在三种不同的突触模式下操作FEFET来证明异突触可塑性：电刺激，光学刺激和光学辅助突触。模拟关键的突触功能，包括电气长期可塑性，光电可塑性，光学增强和峰值速率依赖性可塑性。模拟的人工神经网络表现出非常出色的精度水平，即接近理想模型突触的91％。这些结果为未来对光面性VDW系统的研究提供了新的背景，并将铁电VDW异质结构放在下一个神经形态计算体系结构的路线图上。关键字：神经形态计算，突触，光电子，铁电，二维材料■简介