胶质母细胞瘤(GBM)是最致命的癌症类型之一,对化学糖尿病和免疫疗法的难治性高度耐受。这种耐药性的主要原因之一在于肿瘤的异质性及其相关的微环境。细胞态的多样性,细胞组成和表型特征使得难以将GBM准确地分类为不同的亚型并找到有效的疗法。近年来测序技术的进步进一步证实了单细胞水平GBM的异质性。最近的研究才开始阐明GBM中存在的不同细胞态以及它们与对治疗的敏感性的相关性。此外,很明显,GBM异质性不仅取决于固有因素,而且在新的和经常性的GBM之间也有很大不同,以及幼稚和经验丰富的患者的治疗。理解并连接基于GBM异质性的复杂蜂窝网络是必不可少的,这对于解决这种致命疾病的新方法是必不可少的。在这里,我们介绍了GBM异质性多层的概述,并讨论了单细胞技术时代的新发现。
2型糖尿病(T2D)是一种异质性疾病,它通过不同的病理生理过程1,2和通常针对细胞3,4型特定的分子机制而发展。在这里,为了表征跨祖先群体对这些过程的遗传贡献,我们汇总了来自2,535,601个个体(39.7%不是欧洲血统)的全基因组关联研究数据,包括428,452例T2D病例。我们识别出1,289个独立的关联信号,该信号在全基因组显着性(p <5×10 -8)上,映射到611个基因座,据我们所知,其中145个基因座先前未报告。我们定义了T2D信号的八个非重叠簇,其特征是心脏代谢性状关联的不同曲线。这些簇在开放染色质的细胞类型特异性区域差异富集,包括胰岛,脂肪细胞,内皮细胞和肠内分泌细胞。我们在另外279,552个不同血统的个体中,包括30,288例T2D病例,并在另外279,552个个体中建立了特定于集群的多基因分数5,并测试了它们与T2D与T2D相关的血管结局的关联。特定于群集的多基因评分与跨祖先组的冠状动脉疾病,外周动脉疾病和终末期糖尿病性肾病有关,强调了与肥胖相关过程在血管癌症发展中的重要性。我们的发现表明,将多功能基因组研究数据与单细胞表观基因组学进行了整合,以解散驱动T2D发展和发展的病因异质性。这可能会提供一条优化全球访问遗传知情糖尿病护理的途径。
仅部分探索了生物技术兴趣的微生物中基因组多样性的隐藏层,并且需要更深入的研究,即需要克服物种水平分辨率。CO 2固定菌群易于进行案例研究等评估。采用了实验室规模的trick流式反应器,成功实现了对人工沼气和富含硫的沼气的同时实现生物泛滥和脱硫化,并还实施了氧气SUP培养。在微量自我条件下,硫化氢去除效率为81%,甲烷含量为95%。甲烷杆菌 dtu45主要出现,其代谢功能与硫分解代谢中的社区范围动力学相关。 gamaproteobacteria sp。中涉及基因组进化。 dtu53,被确定为微量清除液的主要贡献者。 发现了硫化氢氧化途径中变体的阳性选择,并将氨基酸变体定位在硫化物的硫化物入口通道上:喹酮氧化还原酶。 氧气中的SUP填充应变选择是驱动微生物适应的主要机制,而不是物种优势的转移。 选择性压力确定了新菌株的出现,例如在伽马普罗杆菌中。 dtu53,提供了微生物组内功能冗余的深度证据。甲烷杆菌dtu45主要出现,其代谢功能与硫分解代谢中的社区范围动力学相关。gamaproteobacteria sp。中涉及基因组进化。dtu53,被确定为微量清除液的主要贡献者。发现了硫化氢氧化途径中变体的阳性选择,并将氨基酸变体定位在硫化物的硫化物入口通道上:喹酮氧化还原酶。氧气中的SUP填充应变选择是驱动微生物适应的主要机制,而不是物种优势的转移。选择性压力确定了新菌株的出现,例如在伽马普罗杆菌中。dtu53,提供了微生物组内功能冗余的深度证据。
简单摘要:乳腺癌肿瘤被认为具有肿瘤内以及人表皮生长因子受体2(HER2),异质性。具有高肿瘤内异质性(ITH)的肿瘤表现出治疗性抗性。然而,关于癌症异质性作为乳腺癌预后因素的研究受到限制。因此,我们已经评估了HER2 ITH,这是由HER2荧光原位杂交扩增分布直方图(HER2 FISH分布)和HER2基因拷贝数在肿瘤样品中的形状所表现出来的。我们旨在确定高HER2异质性对于预后不良,因为对原发性乳腺癌中HER2靶向药物的术后辅助治疗的抵抗力是否具有临床意义。实际上,我们在此表明,高HER2异质性与HER2阳性乳腺癌患者的预后较差显着相关。这些结果表明,高HER2异质性是预测HER2阳性乳腺癌患者预后不良的一个因素。我们目前的观察似乎在临床上很重要,因为预计我们的HER2鱼类异质性分布分析可能是一种方便且临床上有用的方法,可用于预测HER2辅助治疗后患者的预测。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。根据作者/资助者提供了预印本(未经同行评审的认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2024年2月5日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2023.05.15.15.540723 doi:Biorxiv Preprint
哮喘是一种慢性气道炎症性疾病,具有异质性致病原因和各种表型。不受控制的哮喘(UA)的表型对患者和社会造成了重大负担,并且在许多情况下是可以预防的。1 UA的潜在负面后果包括加重风险,2种口服皮质类固醇(OCS)的不良影响,3-5和降低的生活质量(QOL)。6有许多复杂的原因为什么哮喘仍可能无法控制,包括不适当的管理和评估,7-10对治疗的依从性较差,9,11-13不正确的吸入技术,14,15和治疗耐药性。因此,通过加强患者与医生之间的共同决策和沟通,患者教育和自我管理,风险评估,密切监测以减少哮喘患者的疾病以及适当的治疗干预措施,为克服UA而做出了努力。1作为临床医生,UA最有前途的解决方案之一是根据耐药UA的病理生理生物生理开发和应用新的治疗剂。在过去的十年中,严重哮喘的治疗结果(即,耐药的UA)通过各种靶向细胞因子的生物学剂和OCS使用降低来改善。使用这些生物制剂,哮喘的治疗目标已从“控制”转变为“缓解”。16然而,这些治疗量昂贵,仅适用于对当前标准治疗反应的严重哮喘患者。实际上,哮喘的定义最明确的内型是2型(T2) - 高哮喘,这与血液和/或痰液中的嗜酸性粒细胞有关。目前,生物治疗可用于T2-高哮喘,例如严重的嗜酸性或过敏性哮喘,因为它们靶向免疫球蛋白E,白介素(IL)-5,IL-5Rα和IL-5Rα和IL-4Rα。17考虑了严重哮喘治疗的突破,尤其是使用这些生物制剂的T2高内型,因此热切期待着非T2靶向治疗方案来克服耐药的UA。
玉米是一种在广阔地区,尤其是撒哈拉以南非洲,亚洲和拉丁美洲的全球种植的关键农作物,截至2021年,占地1.7亿公顷。已经设计了各种统计和机器学习模型,包括混合效应模型,随机系数模型,随机森林和深度学习体系结构,以预测玉米的产量。这些模型考虑了诸如基因型,环境,基因型 - 环境相互作用和现场管理等因素。但是,现有模型通常没有完全利用这些因素之间的因果关系的复杂网络以及农艺数据固有的层次结构。这项研究引入了一种创新的方法,将随机效应整合到贝叶斯网络(BNS)中,利用其通过定向无环形图对因果关系和概率关系进行建模的能力。植根于线性混合效应模型框架并为分层数据量身定制,这种新颖的方法表明了增强的BN学习。应用于现实世界的农艺试验,可产生一个改善解释性的模型,并揭示了新的因果关系。值得注意的是,提出的方法将玉米收益率预测的错误率从28%降低到17%。这些结果倡导BN在为层次农艺数据构建实际决策支持工具中的偏好,从而促进因果推断。
标题表明,我们的目的是研究异质性如何影响人口封闭的宿主人群流行病的各个方面。特别是,我们专注于基本的繁殖数r 0,马尔萨斯参数r,最终大小,峰值和发射率的大小。该论文由两个部分组成。在第一部分中,我们采用了自上而下的方法。我们首先引入一个相当通用的模型。由于其表述采用了特征空间的措施,因此它涵盖了离散和连续的特征。我们提出的各种结果本质上已经闻名了很长时间,但这可能并不是“众所周知”。接下来,我们考虑各种简化及其基本的解释和动机。这些使我们取得了最新的结果,例如受到命中率(Herd Immunity Threshold;参见第7节),这是由Covid-19的爆发引起的。一个重要但有时隐含的流行模型成分是对具有一定特征的人与其他具有指定特定的人接触的率的规范
我们采用半参数功能系数面板方法,允许具有经济利益的利益关系,以具有国家特定的异质性和一个共同的组成部分,并且在协变量中可能是非线性的,并且可能会随着时间而变化。估算了系数和部分导数(弹性)的共同成分的表面,然后通过功能主组件分解,并引入了基于自举的程序,以推断功能性主组件的负载。将这种方法应用于国家能量GDP弹性,我们发现弹性是由两组国家 /地区不同的共同组成部分驱动的,但具有共同的功能性主要组成部分。这些群体大致对应于经合组织和非OECD国家,但是我们利用一种新的方法来基于共同的能耗模式来重新组合国家,以降低组内的均方根误差。包含更多发达国家的群体的共同组成部分具有额外的功能性主要成分,可降低近几十年来最富有国家的弹性。