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World File Search System弧菌
一种简单的机制，用于整合圆霍乱中的法定人数传感和cAMP信号
摘要许多细菌使用法定人数传感来控制生活方式的变化。该过程由微生物衍生的“自动诱导剂”信号分子进行调节，这些信号分子积聚在局部环境中。单个细胞感知自动诱导剂的丰度，推断人口密度并相应地改变其行为。在纤维霍乱中，磷光灯传递到转录因子luxo中，群体感应信号被转导。未磷酸化的Luxo允许HAPR的表达，从而改变了整体基因表达模式。在这项工作中，我们绘制了V. Cholerae中Luxo和Hapr的全基因组分布。尽管Luxo有一个小的法规，但HAPR目标32位。许多HAPR靶标与调节对碳饥饿的转录反应的CAMP受体蛋白（CRP）位点一致。这种重叠（在其他弧菌物种中也很明显）是由每个因子结合的DNA序列中的相似性引起的。在共享位点，HAPR和CRP同时接触双螺旋，并通过两个因素的直接相互作用稳定结合。重要的是，这涉及CRP表面，通常接触RNA聚合酶以刺激转录。因此，HAPR可以通过CRP阻止转录激活。因此，通过在共享位点进行交互，HAPR和CRP整合了来自法规传感和cAMP信号传导的信息以控制基因表达。这可能会使V.霍乱在水生环境和人类宿主之间的过渡过程中调节基因子集。
细菌清除率和评估虾免疫刺激活性的新鉴别血细胞染色方法
摘要：开发了评估黑虎虾（Penaeus monodon）免疫刺激剂功效的新方法。试验虾饲喂 2% 或 4% 酵母提取物 (YE) 涂层饲料，而对照组饲喂无涂层饲料。喂养 4 周后，对单只虾进行总血细胞计数 (THC)、颗粒血细胞 (GH) 数量和细菌清除率评估。对于血细胞计数，在室温下用 50% 乙醇中的 1.2% 玫瑰红对福尔马林固定的血淋巴染色 20 分钟。一部分混合物用血细胞计数器进行 THC 计数，一部分涂在显微镜载玻片上晾干，然后用苏木精复染进行 GH 计数。通过这种技术，可以获得高质量的涂片以进行准确的分类计数。细菌清除试验用于评估体液和细胞防御机制的总体效果。每只虾肌肉注射 1 × 10 8 个哈维氏弧菌，注射后 0、15、30 和 60 分钟收集抗凝血淋巴，在 TCBS 琼脂上进行四次滴数计数（20 µl）。饲喂 4% YE 的虾的总血细胞计数显著高于（p < 0.05）饲喂无涂层饲料的虾。饲喂 YE 的虾的颗粒细胞百分比和细菌清除率高于饲喂对照饲料的虾。这两种方法可以简单快速地比较虾组抗菌防御能力的差异。
使用AI/ML技术监测北极降水
kandivali（东部），孟买，马哈拉施特拉邦，印度摘要：在气候变化和环境转变的背景下，监测北极降水已成为一个关键问题，尤其是在研究不足的地区，在数据稀缺的地区有效预测。本文通过采用先进的机器学习技术，包括随机森林（RF），XGBOOST和LOGISTIS回归提出了一种创新的方法来增强降水预测的准确性。结果表明，逻辑回归达到了98％的最高精度，而随机森林和Xgboost均表现出88％的精度。通过利用包含关键参数的全面数据集，例如日期，云覆盖，阳光，全球辐射，温度指标，降水水平和积雪深度，我们的模型旨在提供及时，精确的预测。该方法将这些机器学习算法整合在一起，以分析和解释气象因素之间的复杂相互作用，最终改善了预测结果。我们的发现表明，与传统方法相比，这种综合方法显着提高了预测准确性，这使其成为偏远北极地区实际应用的可行解决方案。通过促进早期发现和对降水模式的理解，这项研究有助于更好的资源管理，并为应对气候变异性带来的挑战而有助于理解决策，最终旨在减轻弱势弧菌生态系统变化降水动态的影响。关键字：降水预测，气候变化，机器学习，随机森林（RF），XGBoost，Logistic回归，气象数据分析。
使用CRISPR/CAS系统技术的高风险食物中毒细菌...
摘要 - 病原细菌的快速准确检测对于包括公共卫生和食品安全在内的各种应用至关重要。但是，现有的细菌检测技术有几个缺点，因为它们不便，需要耗时的程序和复杂的机械。最近，与现有技术相比，CRISPR/CAS系统的精度和多功能性已利用为设计生物传感器，可提供更有效，准确的细菌检测方法。大量研究集中在基于CRISPR/CAS系统的生物群体上，该系统在有效检测病原细菌或病毒方面表现出了希望。在这篇综述中，我们提出了一种基于CRISPR/CAS系统的生物传感器，该生物传感器已被专门开发以过度限制这些局限性，并有效地检测到不同的致病细菌，包括弧菌parahaytictus，Salmonella，Salmo-Nella，E.Coli O157：H7：H7：H7和Listeria Monocytogenes。与先前的技术相比，该生物传感器利用了CRISPR/CAS系统的精度和多功能性，以更有效地检测细菌。生物传感器具有增强公共卫生并确保食品安全的潜力，因为生物传感器的设计可以彻底改变检测致病细菌的方法。它提供了一种快速可靠的方法来识别有害细菌，它可以有助于早期干预和预防措施，从而减轻细菌暴发及其相关后果的风险。在这一领域的进一步研究和发展将导致能够检测到更广泛的细菌病原体的更先进的生物生物的发展，从而显着受益于各种工业并帮助维护人类健康
构树叶提取物对免疫和肠道的影响
本试验旨在研究构树叶水提取物对环磷酰胺诱导的免疫抑制小鼠免疫力和肠道菌群的影响。40只雌性ICR小鼠随机分为5组（n=8）：空白对照组（BC）、环磷酰胺诱导的免疫抑制模型组（CTX）和低（BPL）、中（BPM）和高（BPH）剂量构树叶提取物治疗组。BPL、BPM和BPH组小鼠分别以2、4和8g/kg体重灌胃给予构树叶水提取物，每天1次，连续14 d。从第12天起，除BC组小鼠外，所有小鼠每天皮下注射50mg/kg环磷酰胺1次，连续3 d。与 CTX 组相比，施用纸叶提取物可显著提高白细胞、淋巴细胞、单核细胞、中性粒细胞、 IgG 和 IgM 的含量。纸叶提取物还通过降低乳酸杆菌、毛螺菌科 _ NK4A136 组、Roseburia、毛螺菌科_未培养、毛梭菌和 Anaerotruncus 的相对丰度，并增加拟杆菌目_S24-7 组 norank、脱硫弧菌、阿克曼菌、肠杆菌、 Blautia 和 Romboutsia 的相对丰度，恢复了环磷酰胺诱导的免疫抑制小鼠的肠道微生物组成。这些研究结果表明，纸叶提取物可用作肠道微生物的免疫调节剂，具有促进动物健康的潜力。
泰国东部两片红树林土壤中分离的产纤维素酶细菌的多样性和纤维素分解活性
摘要。Bamrungpanichtavorn T、Ungwiwatkul S、Boontanom P、Chantarasiri A。2023. 从泰国东部两片红树林土壤中分离出的产纤维素酶细菌的多样性和纤维素分解活性。生物多样性 24：3891-3902。东南亚国家拥有世界上最大的红树林面积。红树林是分离经济微生物酶的潜在来源。纤维素酶是一种广泛用于各种行业中纤维素降解的微生物酶。因此，本研究旨在从泰国东部两片红树林的土壤中分离、遗传鉴定和酶学表征产纤维素酶的细菌。分离了 26 种产纤维素酶的细菌，随后通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性 (PCR-RFLP) 分析 16S rRNA 基因进行基因分型。获得了 13 种不同的 RFLP 模式，并对其进行了遗传分析，分为 6 个细菌属，包括 气单胞菌 、 芽孢杆菌 、 金黄杆菌 、 赖氨酸芽孢杆菌 、 假单胞菌 和 弧菌 。芽孢杆菌属是研究地点产纤维素酶的主要细菌。此外，产纤维素酶的金黄杆菌和赖氨酸芽孢杆菌几乎从未被报道过。芽孢杆菌属菌株 RY08B 是活性最高的产纤维素酶细菌，CMCase 酶活力为 1.510 0.060 U/mL。确定了 CMCase 活性的最适温度和 pH 值为 50°C（pH 为 7.0），热稳定范围为 25-50°C（pH 为 7.0）。这种细菌可应用于多种对生产过程要求温和的环保行业。
抑制剂Na+泵送NADH-偶像氧化还原酶扮演多个角色以阻止酶功能
Na 1-倾斜的NADH-偶像酮（UQ）氧化还原酶（Na 1 -NQR）存在于许多病原细菌的呼吸链中，被认为是有前途的抗生素靶标。虽然已知Na 1 -NQR结构和功能的许多细节，但有效抑制剂的作用机理并不理解。阐明机制不仅可以提高药物设计策略，而且还可能提供有关末端电子从核黄素转移到UQ的见解。为此，我们使用了两个已知的抑制剂Aurachin和korormicin的光反应性衍生物进行了光性标记实验，该衍生物是在分离的弧菌cholerae na 1 -NQR上进行的。标记为NQRB亚基的细胞质表面结构域的抑制作用，其中包括突出的N末端拉伸，这可能是批评在相邻NQRA亚基中调节UQ反应的。标签被短链UQ（例如泛素酮-2。The photolabile group (2-aryl-5-carboxytetrazole (ACT)) of these inhibitors reacts with nucleophilic amino acids, so we tested mutations of nucleophilic residues in the labeled region of NqrB, such as Asp 49 and Asp 52 (to Ala), and observed mod- erate decreases in labeling yields, suggesting that these resi- dues are involved in与行为的互动。我们得出的结论是，抑制剂以两种方式干扰了UQ反应：第一种是阻止NQRA和NQRB之间的细胞质界面处的结构重排，第二个是在该界面区域内的UQ结合的直接阻塞。通常的竞争行为证实了我们先前的主张，即Na 1-NQR中可能存在两个抑制剂结合位点。
研究文章：新型PCR程序的良好肝脏肝脏坏死性疾病（AHPND）和突变体-AHPND快速检测的新型PCR程序的建立前的提取方法和DNA提取方法
在2009年中国急性肝癌坏死病（AHPND）的第一次爆发后，这种疾病仍被认为是虾类水产养殖业的全球危险疾病。当前，没有有效的方法来预防和治疗AHPND。因此，可以避免并控制这种疾病的快速检测方法被认为是最有效的策略。在2021年，建立了一种新的PCR反应，可以同时检测AHPND和突变体AHPND。为了开发PCR试剂盒，建立了包括富集前步骤和DNA提取方法的PCR程序以进行PCR反应。新的PCR程序被验证，检测极限为5.10 3 CFU/mL。此检测极限是当前用于检测AHPND的常规PCR方法的两倍。弧菌溶血性在37°C的肉汤中显示出最佳的生长，并伴有虾的肝癌。也修改了用虾组织中提取DNA的简单沸腾方法。PCR程序已在42个AHPND的样本上成功验证。使用PCR试剂盒快速检测AHPND和相关的突变体AHPND，用于快速诊断虾农场的AHPND和相关突变体-AHPND。关键字：AHPND，突变体-AHPND，DNA提取，PCR，Vibrio parahaayticus 1-分子和环境生物技术的部门，生物学和生物技术学院，生物学实验室，生物传感器，生物传感器，科学大学，Ho Chi Minh City，Viet Nam，生物传感器。2-越南胡志明市科学大学分子生物技术实验室。3-越南国立大学，林格·沃德（Linh Trung Ward），越南城，越南城，越南 *
Torrs两个成分系统调节颤音中的高静水压力响应TMAO还原酶的表达
高静水压力（HHP）调节的基因表达是微生物适应深海环境的最常见策略之一。以前我们表明，HHP诱导的三甲胺N-氧化物（TMAO）还原酶提高了深海菌株弧菌Fluvialis Qy27的压力耐受性。在这里，我们研究了HHP响应性调节TMAO还原酶Tora的分子机制。通过构建Torr和Tors缺失突变体，我们证明了两个组件调节剂Torr和传感器TOR是托拉的HHP响应性调节的原因。与已知的HHP响应性调节系统不同，HHP的丰度不受HHP的影响。在保守的磷酸化位点改变的δTOR突变体的互补表明，这三个位点对于底物诱导的调节是必不可少的，但仅位于替代递质结构域中的组氨酸与压力响应性调节有关。 总的来说，我们证明了HHP诱导TMAO还原酶是通过Torrs系统介导的，并提出了通过底物诱导的压力响应调节中信号转导的分叉。 这项工作提供了对压力调节基因表达的新知识，并将促进对微生物对深海HHP环境的适应性的理解。互补表明，这三个位点对于底物诱导的调节是必不可少的，但仅位于替代递质结构域中的组氨酸与压力响应性调节有关。总的来说，我们证明了HHP诱导TMAO还原酶是通过Torrs系统介导的，并提出了通过底物诱导的压力响应调节中信号转导的分叉。这项工作提供了对压力调节基因表达的新知识，并将促进对微生物对深海HHP环境的适应性的理解。
非O1/non ...
摘要：非O1和非O139弧菌霍乱（NOVC）会引起人类胃肠道感染。被污染的食物，尤其是海鲜，是人类感染的重要来源。在这项研究中，从零售海鲜中分离出的63个NOVC菌株的毒力潜力在基因型和表型水平上被表征。尽管没有菌株编码霍乱毒素（CTX）和毒素调节的pilus（TCP），但包括Hlya Hymolysin，cholix Toxin CHXA，热稳定的肠毒素STN，以及针对3型和6型分泌系统编码的基因。所有菌株均表现出针对人和绵羊红细胞的溶血活性：90％（n = 57）形成强生生物膜，52％（n = 33）在37℃时高度运动，只有8％（n = 5）和14％（n = 9）可以抗拒60％和≥40％的人类血清。生物膜形成和毒素调节基因。CGMLST分析表明，来自临床NOVC菌株的海鲜簇的NOVC菌株。抗菌易感性测试（AST）导致对五种菌株的鉴定，这些菌株针对β-内酰胺类（包括青霉素，碳碳素，碳酸苯甲酸酯和头孢菌素），多酰氧蛋白，多酰氧蛋白和硫酰胺和硫酰胺的物质产生了非wildtype表型（中和耐药性）。表型抗性模式可以部分归因于在计算机分析中通过鉴定的获得的耐药性决定因素。我们的结果表明，从零售海鲜产品中分离出的分析的NOVC的毒力潜力差异，可以考虑进一步的致病性评估以及对未来海鲜监测中NOVC分离株的风险评估。